Entry information : CcampPrx17(Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh5.1 /2.1)
Entry ID 16094
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx17(Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh5.1 /2.1)
Name CcampPrx17(Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh5.1 /2.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx17
start..stop
S start..stop
CcampPrx27 640 0 1..329 1..329
CcampPrx[P]05 616 0 17..329 1..307
InPrx03 530 0 5..322 6..323
NtPrx08-1B 527 0 2..322 3..324
Literature and cross-references CcampPrx17(Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh5.1 /2.1)
Protein sequence: CcampPrx17(Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh5.1 /2.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   36483.21  
PI (pH):   %s   5.12
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MWLHLLFLLL NSGALAAEIA DLRRGFYKQT CPEAESVVRL VMEKSMRREA RSIASVMRLQ FHDCFVNGCD GSVLLDDTET MLGEKLSLSN INSLRSYEVV DEIKEELERA CPGVVSCADI  LIMAARDAVA LSGGPNWEVK LGRLDSLTAS QEDSDNIMPS PRANATYLID LFTKFNLSVQ DLVALSGSHS LGKGRCFSVV FRLYNQSGTG RPDPAMDYEF REKLDKLCPL GGDGNVTGDL 
DATPEVFDNQ YFVDLTRGRG FLNSDETLFT TPRTRGYVRL YSRDQKAFFD AFVEGMIKMG DLQSGRPGEV RRNCRVVNGH LPPRNSFAS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independant predictions: Cuscam_OOIL01000024.1_FGenesh2.1 (54) and 5.1 (3')). Large intron 2.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGCTGC ATCTTCTCTT CCTCCTCCTC AACTCCGGCG CCTTGGCGGC TGAGATCGCC GATCTCCGCC GCGGATTTTA CAAGCAGACC TGCCCGGAGG CGGAATCCGT GGTCAGGCTG  GTGATGGAGA AGAGCATGAG AAGAGAAGCC AGAAGCATAG CATCCGTGAT GCGCCTCCAG TTCCACGATT GCTTTGTTAA CGTAAATAAT TAATCCGCCA TTGTCATATT ATTTCGATCT  CAAATCTCAA GTTAATCTCA GATTAGCTTC GATTTCTGTC ACTTAATTAA TAATGTCTGA TTGCTAGCTC TGATCCATGA TTTCTTTTTA TTGAATGCGG ATTATTAGGG ATGTGACGGA  TCGGTACTGT TGGACGACAC GGAGACTATG TTGGGGGAGA AGCTGTCTTT GTCGAACATA AATTCACTGA GGTCATATGA AGTTGTTGAT GAAATTAAGG AAGAGCTGGA GAGGGCGTGT  CCGGGAGTTG TTTCGTGCGC TGATATCTTA ATCATGGCGG CCAGAGATGC TGTTGCTCTG GTAAGTCTAC TCCACTTAAT TCCTCTCTAA TCCTTCTCAA ATTAACTTAT CATGCTTTTA  GGCATTTTAT TTTAAATCAC ACTTTTTATC CTTTTTAAGT AAAGAATTGG GCGATCCAAA ACATTATTTT TATATTTGGC CAAATAGCTT TATGATATGT TTGGTAACAT GAATTTGGAT  TTTAAATCTA GATTTAGCTC AAATTCCATG TTTGGAAAAT TTAAAAATTT AGAATTTGGA TTTGAGTCAA ATTCTTCTCA TTCATAACAA AGCTTAATTT AAAATCCATG TACCTCTCCT  TGTCATTTGA AATTTAAAAT TTCAAATTTT GGAATTGAAA TGAAATGCGA GTTGCCAAAT ACTACCTTAG CGTCTTTGTA GTTTCGAAAA TAAACATCAA TACACTATAT ATTCAAAATG  TTGCACGTGC ATCACTTCAA CTATTTTCCA TTCATTTTCC CCGTGAAGGA GGCATTGATA CCTAATTTTC AAACAATAGG GGCATTGGTA CCAATATCCT ATTTTCCCTT CATTTTTATT  TTTCTAAAAA TTGTTTTCTA TAATGTTTTA AAAATTAAAA TTGTTTGTGC TTTTCTCTTC TTTTTTTCAT TTCTTTTTTC ATTTATTTCT ATTTTATTTT AAGATAGATG AAGTATATGA  TAATTTATTT TTATTTCATT CATTTTTTAC TCCGTAATTT AAACATAAAT AATTTAAATT TTTAAAAATA TTTTAAAGAG CAAATAGAAA AATTAATGGA AAATAAGAAA ATGGGCTCCA  ATGCCACTCT TTGTTTGAAA AGTGAATAGA AAATAGAGGC AGGAGGTCTC CGTATAGCAT TTGAAACCAT AACAATTTTA GAAATAAGTT CTAAAAACAG AAACTATATT AGTCTCTACT  GGAGCAATTT TAACCTTTTT ATTTATCGTG ATATCACCCC GTATTCCTTA CCTCCCGCAA TAATGATCTC ATTTCCTAAA TAAAGGGAAT TGATATTTGA GCTCCACTTT TTGATAGGGG  CACTCCACCC TTGTAATATT TTACAAACAT GGACAATTAT GCCCTTTTAT TTGGAGTGGT GTTTTTTGTT TCCATTCTAC ATTGCTATAC TAGGTTGAGT AAAGAATTAT TAATATGAAA  AATACTAGTT CAACCAAGAG GGGCATAACT GTCTATTTTT GAAAAAAATT AAAAGGGTGG AGCGCCGGTA GTAAATGAAG GAGCATATAT ATAAACTTCC ATTTAGAATT GCTAGTACAA  AAAATGAATT AAAATTGGTG AATTCAATTC TATGAAATTG AATCCCATAG AATTTCAATT CCAATTAAAT TCTAATTCCA TTAATTTCGT ATACCAAACG GACCTTGATT GAATTTGAAA  GAGTTGGAAA AAACATCAAT GAGTTGAACG CGTTGAGAAA AATTAAAAGA TTTGAAAAAA ATATTATATT TTTGAAATTT CATATTTTTA TTAAAATAAT TTATCCTTCA TTTATTTTAA  TTTTTATCTC TTTTTAATTT TTTATGTCAC TAATTTTTTT CTTATACTAC TCCCCCGACC CATTTTTTCT TTTAGTTTTT TTATGTCACT AACTAATTTT CCAAAAATAG TACTTCCTTC  GTCCCATTTT ATATGGCAGG TGAAATTGTT ATTTTTTATT CAATTTATAA AACAATTGAG TAAACTTAAA TAATAATTGG GTAAAATAAA AAAATAAAAT TAAATATTTA AAACTACATT  AAATGTTTTA CGAAACAAGT GATAACATGA GTATATTATT TTATTAAAGG ATTAACAAAA ATAGGTGAAG AAAGTGAGAA ATAATTGACG ATGTGAATAA AGGAAAAACT TGACCATCTC  AAAATTTTGA GATGTCGTAT ATCTTAAATT TGGACTTACA GTATCATTTT ATTTTATCAT ACATATTTAC CAGTTATATA GTGATCATTT GAGACATTCA TTTCTTATAC ACATTTTGAG  TATACAAATC ATAAAAGTAG TACATTTTAG AATATTAATT TAATTGGAAA AAAACTTTTT ATTTAATCAC TAAACAAGCA AAAAAACATA TATCACGCTA TATCGTTAGT TTAAGATAAT  CTTACTTAAT AAAAATATAT TGTATGTTAC TCGATTTTAT TTTTTATAAT ATGTAATTAT ATACGGAGAA GATTATTTTA TTAAAAAGAT AGACAAATTC ATTTATAAAT ACTTTTAGAA  TATTGAGGAA TGTAGTCATT GACTCAATCT AGTATAGCAA TGTAGAATGG AAACCAAAAA CACCACTCTA CTTCGTACTC CAAATAAAAG GGCATAACTG TCCATGTTTG TAAATTATTT  CAAGGGTGGA TTGCCCCTAT CAAAAAGTGG AGCTCAAATA TCAATTCCCC TAAATAAATA TCTCATTTTA TTTTAATAAA AAGAATAGTA TTTTCCTCCG TACCTAACCA AAAGACCCGA  TTTGACCTCA CAAAAATTAA GACAATTTAA ATTAATATTA ACTTCTTAGT TTTGCCTAAC ACATGTGATG GACAATAAAT CCACCAAATG ATCCGATTTA CAGAGCGGAT CGTAAGAACG  AAATTAAGAA CAAGAATTCA AGAATTGGAT GTGTATTACT AGCTTGATTT AGCTTGAGTT CTCCCCTTTC GGGTCCCTTC TATTTATACA CGAGCTCTCA ACAATTAAGG TGAAGCGTAA  CCGATGGAGT CTAGCCCGCC AAGGGCGCGA TCCCCTTTTC CCGGCTCCGT AACGGCCAAT CAGCTCCATC TCCTTCTCCG GACTGACTCT GCCAGCTGTG CTTGGCCTGA GGTTAACTAG  GCCCAGCTCC TTGGGCCGGC CCAGCTTGAG TATTTCACAG GTGCTTGACC CAAAGCTGTT TAAATGGTTC ATTTGGGCCG TCCACTGGAT ATCGGCCCAT CATAAGCCCC CCAACTCCTC  AGTCCTCAGC TGGGCCAAGC GGAGGAGTGG GGAGTTTGCA AAGTCCACGT GGACGCTCCA GCGGGGATCC AGGCCGTTCC TTGGGTTCCG CACGACACTT GGGCACGATC TCCACAAATA  AGTAATCATG GCCTGCCGAT TCGCCTTCCT GTTGTCAGTT AAAAACCGCC GCTGGACGCC ATCTCTTCCT TTCGCCTTCT TCACTACCAT TCGTCTGCAA CTCCGCTGCT CACCCGACTC  GTTCTTCATC ATGTCCAGGT CAGTTCCTTC TCTCGCCGCC ATGATTGTCT CGGATTCCGA TTCGGCTACC CCATCGCCCA ATTCTCGCCA AGCCGGCCAA TCGACCTCTG ACCGTAACCC  CGGCCACACT CCATCACCCC GGCCGTCGTC GTCGGCCGTG CCTGGCCACA GACAGCGTCG ATTGAGGAAG CAATACCCTT CCTCAACTCC GGTAGATGAG GGCTCAAGGG TTGAATTGGA  CGAAAACATC ATGGCGCTGT GCCATTGTCA AATTACTGAC CGGGGGTTCG CCGATGCCAC TGACATGGTT GGACCCTCCA TCGAGGTCAT GAGACCTACC CGTACTCAAA CTGCTTTAGA  CGCACCGTCG GGGTTCTTCA CGGTCCACTC CACCCGTTGT TGATCGAATT TCTCAACGTG GTGGACCTTC TCCCGTGCCA ACGGGTCCCC AACTCTCACC GGTACATCGC CGGTTACCTG  GTCCGGTGCA AAGATATAGG GGTGAATCCG ACCTTGGACC ATTTCATATT CACCTTCAAA CTGACCAAGG GCCATAAGGA TTGGGCGTCC TATGCCAGTC TTTCCCAGAG GTCCAGCAAA  CTCTTTGCTA GTGATAAGAA GGGGTCAACC AAAGATTGGA AGCCTTTCTT TGTCTTCGTT TCGACGGGGC CCGAATCTCC TTTCACGGGT TCAGGGCGCC CTTCCTTCCG TCGCATCCCA  CGCCCCCCAC CTGATGCCAC CCTTTTGTCT ATCACTCGCC AATTCTGCAA TAAGGGAGTT ATGAACATCA AAGAGGTGGT GACAGAGGAA ACCCTTGCCG GGTTGGGGTT TGAGTTTGTT  CAGGATGAGC TTCGCCACCA ACCCGACCTA CTGAGGGACA TCCCCGGGGG GCATCAGCCT GACCAGCTGA AGGACATTCC TGAGGAAGGT CTTGATTGTG GTCCTTTTGG TAGGTGACCC  TTTCTTTTGC CCAGATGTTT AGTTTATCTT TTCCCAAGGC TGACCATTTC CTTTGTTTCC AGTGGAATTA CAAGATTCAG GAGAAGAGAT GGACAGCGAT CTCCTGCTCA GTCGCTTCAC  CGCAGGGAGG AAAAGGAAGA GAGAGACGAn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nGAGAGGAGC GATCGGGTCC GCCATGCAGA GGGAGCGGTA GAATCCTTCA AGTCCTCTCC TGACTTCACG GTAGTCGCAA TGGAGCGGAT GGAAGAACTA  ACGGCCGCTT GGCTCAAAAC TGAACCTGGG GCCCAATGGA TGGTCAAGGA GGGAACCAAG TCCTTCAATT GCGGACTCTT CCATGCCCAA CAGGTCTTCC ACAACAGGCT GGCCCAGCTC  CCTAAAGGAT TCTCTCTCCC CGACCTTGGC TTCCCTTCTC CCTGCCGCTC CTTGGCCGAG TTCGACCCCA GTCCCTATCT GGACGGGGGG AGCTCGAGCG CGTCGGAAGA GGAGGAAGAA  GAAGAAGTGG AAGGTGGTCA GAGCGACCAG AGTCCAGGGG CCAGCTTAGC CATGTCCAAA GCGGGTGGAC CCTCCGGCTC GGCCGTCTAA ATCCCCCATT GTTCCCCCAT AGCTTTACCA  ACGCTTGCCT TTCTCTTTTC CTTCGGAATG ATTTGTCGTT TTGATACAAT GCTCCTATGT TGTTTAATTT TCTAGATTCG CCATGTGTTT TCTCTCTTTG GCGCTTTACT TCAGCACTCT  CTTTTCTGAT TTAGCTGGTT AACATGTATG TTTTAGTTTG GGCCCAACTC CTAGTCCCGG CCCGTTTACC TGCCCGGGCT CAATCCCTGG ATTGGCCACC GTGCCGCCCA ATTGATCCAA  TGCCCTTCAC CGTTTCTGAT TGGACCTTCG CGCGGCTCAA GGCTGCTTTA TCGGTCCGGC TGCCTCGAGA CTTGACCGCC TCTTCGGTTC CTTCGCCCTG GCTTATTTAT AAGTCCCCCT  GGCCTCTATT CTGCTCCATC ACCAAATATC CCCCTTTTCT CCATTCTTGC CATGTCTGAA GGAATCCCTG TTTCTCTAGA TCTTTCCGAC GGGCTGGCTC CTTCTTCGCC GGAGCCTGCC  TCCTCCCATA AGTCAGTCAA TTCCAATGAC TGGGGGGGCT TGACCCTTAC GAATTCTGTC GCCGGTTGCC TCGCCGGCGG TGGCCGTCGG TGAAACCGCC GCCACCACCT CCAAACCCTT  AAAACTTTAG TGAGGCGTAC GAGGCCCTCT CCGCCAATCG CCTGCCTGAC GGGCGGATTG ACTGGGATGC TCCATGCCCC CTCCATTCCC TGCAATGTAT GGCTTGGGAG AGCTTTCAAG  ATGAGCACTT ACCCCTCCTG GAGCATGAGT GCGCATATTA CGCAAGTTTT GAGCGATGGA CTAGCGAAAG TCGCACCAGT TCGCCGGTGA GGCCTTCGGA GGAGGTTGTG TTAGGGGAAG  AACTCGGTTC TCCCCTACCT CGCCCCGCTT GCCATTCACC TCCCCAGAAA ACCCCTAGGC GACCTGAAGT AGCTCGGGCG GCTTCAGGAT CTCCGTCCTC GCCCAGGTGA TGCTGGTTGG  GGTTCACAGA GAAGTGAGCC GTCCCCCGTC CTTCCTTGGT AGGAGAAGGG CGGTGGGTTT TTGCCGAGGC TGGGGGCGAC CACTTCCGTT TCATGATGGG GAAGAAAGGT GGTCGTCGTG  GACGGCCGGT GATCGGAGTT TTGCTTGCCT ATACAGCCGC AGAACTACCT TTCAGACCTG CCTGTCCCCC CTAGACCTTC GCTTGCAAAG TCTTAGATTG TTGTTCTTCA TTGTAGGAGA  CGTATGGGGA AGTATCCTTT CTTACGTAGA GATTGTTCTC AACTGTACTG TAGTAGATGC AAGAGATTAT CCTCGAAATG TAATGAACAT TTCTGTGAAT AAGGTTGGCG GCATTCCACA  CTCGCGGAAC GTCGCCCCCG GTTGGAGTCT GTAATCTAAA TGTCCCATCG GCCAACATCT CCTTTATGAT ATATGGCCCC TCGAAGCTTT TAGCAAACTT TCCTCCATCG GTCGGCCGGC  TGACCTCCCT TTTCGGAAGG ACCCAGTCGC CCATCTTGAA CTGCCTTGGT CGCACCCGCT GGTCGTGATA TGACTTGACC TGCCGGCGGT AGTTTTCTGC CCGCATATAT GCCCTTTCCC  TTCGCTCATC AATGAGGTGC AGCTCTGCCC TCAGGTTCTC CTCATTTCCT TGAGCATCAA ACGTTTCTAC TCTATAACTT AGCAACGAGG TCTCCGCTGG AGCCCTTGCT TCAAATCCAT  ATGTGAGCGA GAAATGGGTT TCACCTGTTG CCTTCCTTGG GGTAGTTCTG TAGGTCCACA ATATATAGGG CACTTCTTCC ACCCAGGCAC TTTTGCATTC CATTACCTTC TTCTTGAGGC  CATCCATGAT GGTACGGTTG GTGTTCTCAA CCTGCCCATT GGTTTGGGGG TACCCGACCG CCGCATAGCT GTGTTTTATG CCCCAGCTCT GTAGAAACTC ATTGAACCCC CCGGCCTCGA  ATTGGGTTCC GTTGTCAGTG ATGATCTGCT GGGGCACCCC GAATCGGCAC AAGATTTGCT TGGAAACAAA CTTnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnGAAACTT CCTCGACCTC TTCCGCCGGC TCAGCTCGGG GTCGCCCCTC CTCCTTCTGG  ATCGCCGCAC AGATCGTGCT AACATTCTCG TCGACTCGGG CTTGGCTTTT GGTCGCCCTG ACATAGCACG ACCGTGACAG GCTCTGGTTC CCCTTTGCTA CTCCCACCCC TGTGGGAGTG  TTGAACTTTA GGCATAAGTG GACGGGGGAG ATTACGCACT CCAGGTTCTC CAACCCTGGT CGTCCCAGAA TCAGATGGTG GGCACAGTCG AGCTGTACTA CCATAAATTC CATGTCGACC  CAGAGTCGGT GGGTGCCATC TCCTACCCCG GCCTTTACCG TGATAGTTCC TTCTGCTTCG ATCGTATCCC CTGTAAATCC TGACAGCGGC GTATGGATTG GCTTCAGGTC GCTTCGGGAC  AATCCCAACT CCTTAAAGGT GTTGCTGTAC ATTACGTTGA CCGAGCTGCC CGTATCGACC AAGGTTCGGT GGACGGCCAC ATTATTGATC TCCACTCTTA TCACCAGAGC GTCCCTGTGA  GGACTGAGGA CTAGGGGATA ATCCTCGTCT AAAAAGATCA GAGGTTCCTT CTTCTTTCGC TAGGCAGCGG TGGCCTTTGT ACCTCGGCCA GGTACACCAT GTTCTTCCAC TTCTTCCGGG  AGGATACCGA ATCTCCTCCA GTGTTTCCTC CCATGATGAA CCGACACCCC AGGTGTCGGC GACCTTACCT CTCCTCCTCA TCTAGGTCAT CACAATCTCG CCCTAGGTGC CGCCGTCCAT  CTTCTTGCCC CTCTCCTGCT GTGATCGCTG TCGTGGGGGC TGGCGGCCTC CTCCAGGTCC GGTTACTTGT GGACGGTCGT TCTGACCGAG GAGGTGGCCC TCTAGCGATC AGCTGATCCA  TCTCCTTCTT CAGCGTAACG CACTCCGACG TGTTATGGGT GCTGTTACGG TGGTACTCGC AGTATTTGGG TGCATCTTGC ACACCATAGC TTTCCCGACC ATGAGGAGGG GCTGGCAACG  ACTGTACCGC GTGAACGGGA TGCCTGTTCG CATGATACCC GGTGGGGTTC GGCCCCTTAC CATATTCCTT CCTCTTCTTT CCTTCTGCCA CCGGTGGTCC GCTTTTCTTC TCCTTCCGGA  CTGGTGGCTC ATCATCTTTC TCTTCCAGCG CCAGGTACTT CGCCCTGGCC AACATCTCTT GATAGGTCGA GAGAGGATTC CGTCGCAGCT CCTTACGCAC ATCCCCTTGG GGGAGTGCAG  CTTGGAGCAT GGCGATCAGG GCTTGGTCGT CCGCCCCTTG GACATCCCTA GCCTCCTTCT CCCACCTATT AATGAACTCC CGGAGCTGTT CCCCCTTCCG GATCTTCACn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnTT GATCTGGGGA GTCTTGAAAT TATCTGGGAG AGGGCAGGAC ATTATCCTCC TGGAGAAGGG CGTTACCTCA CTGAAGACCG  CCTGGCGATA GGGGTTCTGG GCATCCAGCC GCTTCTCCAG TTGTTCGTAC ATTTTCCACA GCTCGGCTGC ACCCTTATCC CCGACTGTCG TCCGTCGCTC CTCAGAACCG ACCTTGGAGG  TCGCTGAGGA CTCCCCTCTC TTCTCCTTGA GCGTGTCTCT CAAGTCGCCT TTTCGGGCCG ACCGAGTGTC CTGCAACCTT TCGAACGCAG AGGTCCGAGG TTTCTTCGAC TTGGGATCTC  CCAAACGGTC AAAAGCAGAC ATCCGCTCGA AGGAGGACGA CTCGTCCTCT TCTTCCAGCC TGGAGAGCGC ATCTGCCATC ACAGCCTTCC CATTGGGTTT GGTCGTCTTC TTCTTCTGGG  ACCACCTCAC TTTTTTCTTT TTTCCTTGGG AGCCCGCCGG TCCAGCCTTC TCGCCTGTGG GTCCCCCTGC CACATCTCCC ACCACTACCT CGCGGTTGGG CGCAAGTGCG GCCAGCACCT  CCTTGAATTG TTCGGTCGTG AATTGGCCTG AGGTTAACTA GGCCCAGCTC CTTGGGCCGG CCCAGCTTGA GTATTTCACG GGCGCTTGAC CCGAAGCTGT TTAAATGGTT CATTTGGGCC  GTCCACTGGA TATCGGCCCA TCAATATGGT TGGAATATGA GAGAAGATAG AGATGAATCG ATTGAAATAA GAAAGTAAAA AAATGATTAA AAAAACTATA AATAGTGGCA TTATGAGAAT  ATTAGTAGAT TGGTTATGCC AAATAAGAAA ATGAGTATTT TGATTTGGGA CGACCAATTT GAAAATTGCG TCTTTTACTC TTTTTGTTTG GAACAGAGCA AATATTTCAT ATAAATTCTC  AATTTTCCAT CAAATTTAGT CACACACTTT TTTTTTACAA TATTTCTCTT CGTTTCACTT TCATGTCCAT TCCAATTTTT TTCAACTCTA GATAGAGAAT TGGTAGGCTA TAATTTTTTT  AATCAGATTT TAAATACCTA CTTTTTTGAA AACATTCTTT CATTAAATTC TTAAATTTAA ATTATGCCAA TTATTTCAAA AAATGAAATG CTACATTGCT ACAAAAATCA AATTGGGACA  ATTTTTCAAC CATACAACTT TCCGGGGACG AGATTATTAT TTTTCACCCC TGGGAATATT TTTTTGTCCC GGTGTATTTT TTTTACCCGG CCTCCCAAAG AGGCCCACTA TGGAAAAAGT  TTGGCTTTCG ACTGTTTTTC TTTTTCTTTT CCGTATTCTT TAGCGAAATG ATAAAGTCAA ATACGAAAGT AACAAAATAC ATAAATTTGT TATTTATGTA TTTTTTTAAT TATTTAAAAT  CATTTTATTT TTTGGGTGGT GCACAAATAG TAAAAATATG TATTTTTCAT TCTTTAAATA AAAAATAAAC TAGATCAAAA AATTTTTAAA ATGGACAAAT TGAGTTTATA TTATTAAATG  AATTTTTAGT TTCCACTTAT CATTAAAATA GTTTTTCAAA TGGCCAAATA GAACCAGTAT CTCCCATGAT TTGGAAAATC GGCACAAATA TCCGTTCTGT TTTCAAAACT TATTTCTAAA  GTCCTTGTGG TTTCAAAATG TTCCACCCAC ACCCCATGTG ATCATTTTCC AGACATTTTT CCGGTGAATA AGGGGGCATT GGTGCCCATT TTCAAAGCGT AGGTGCTTAT TTCTTATTTT  TCATTTATTT TTTTGTTTTT CCCTTTTTTC CTTTTTTTTC TTTTATTAAC CAAGAGTTTT TTAAATTTCT TTTTAAAAGT ATTTTTAAAT GTGCCTAAAA TTTAAAATTA TATTTGTTTG  GAAAACGATA ATTAACATAT ACTGCGATGC ATTTGTACAT CTTAAATTAA CAATTTTTAT TGTTTGTTTT CCAAAATCAA AAAGTAAAAA CTTTTTTTTT GAACTTCAAA AAATGAGGAA  TAAACTAAGA AATAAAATAA AACAGGAAAT AAAAGTAAAA TTTGCATTAT ATAGAACTAA AACAAATGTC ATTTTCCAAT GTAGTACTTA TACTTTTTTA TTCCCTATAT AGTACTTGGA  TAATGTGTAG TGGCAAGAAC AATGTTCAGT GATGGTGGAC ATTTCGTTTG AACAATGTCC TGTGGCAGTG AATATTTACT TGAACAATAA CCAATGGACA ATGACCAGTA GTACTACATT  GTTAAATTTA GACATATGCT ATTATATTGG GAAAGTCACT ATGTTTTAAT ACTATTTAGG TAAATTTTCC AAAATAAAAA TGAATCCTTT TTGGACATTC CAACTCTAAA GACTTTTTTA  GGCGATTTAA AAACTCTTTT TTGTATAAGA CCCTTTTTTG CATGTTTCAT TTTTTAGTTC ATTTTTTCAT ATTTTTATTT TTATTTTTTT CTTCGGGCTA TTTTTTGAAC TTACCAAAAA  AATTCTAGAA AAAAAGTAAA AATGTTTAAT TTGAGATAGA TGGAGCATAT GTTACGGAGT ATTTTTTTAT TTTTATTTCA AACATAAAGA ACTTTTTATC TTTAAGAAAA TATAAAAAAT  TGAAAAGAAA TTTTAAAAAA CTTTTAGGGA AAAATATGAA ATGAGCATGA GTGCTCCCTA TATTTTAGAA ATTAAGCATC AATGCCATCT CTTCGCCGGA AAATGATCAA AAAGGGTGTG  AGTGCAATAT TTTGAAACCT CATAAACTTT ATAAATAAAT TTTGAAAAAC ATAAGAGATA TTGATGCCAC TTTTTCAAAC CACAAGGTAT TATTTGGCCT TTTTCAAATA GTTTTGTCAT  GTAATAGTTC TTAAATCTAT GTAGAGGATC ATGAATACAA TAGTTCTTCG AAATGGACTA TACTGTATAT AAGAATTCCA ACGTTTTAAA GGATATTTTT AGGAAATTAC TCTTGTAAAA  ATATGATTAC TTTGACCAAA AAACTACTTT CCACATTTGC ATTTTACTCG CATTTCAAAG GGGAAACAAC AAGAATCCGA TTAGATCGTA CGAAAATAGC ATTTGGAGAT AGGATGTTTA  CGGATTTTAC CCATATTCAA GAGTAGAGCG GTAAAAAAAG TAAAATTATG AAATTGATCA ATAATTGTTT TATTTGTAAT AATTACTCTG TACTTTATAT ATACTCCCTT GCTTCGTAGA  AATGTTTCAG AGTTCAATCG ACACTAGTCT AAACTTGTGT TTGGTTGAGT GGAAAAATTG AGAGAAAAAT TAATAATGAA ATAGGAAAAA ACACTAAAGT TTGAGTAAAA ATTTAAAATA  TGCTAAAATA AGATCTCCAT GTTTTTATTC TTGAAATAAG AATTAATATG TATTTACATT ATCAATCATG ACCATGTACG TTACCAAAAA AATATAATAA AATGTCCACG TACAGTGTCA  CATTACCACA GTACGAACTC CTATTTAGTT AATAAAAACA TAGAACTCCT ATTTTGGTAA TTTCTCAATA TTTTACTCCT ATTTAGGATG ATTTCTTAAA GAAGAAATAT TCCGTAATCC  GTGTTAGACA ATAATACTAA TAGTACTTCT TGTAGTATTG GTTATGGTAG TGTTTCATTA TTAGTGAGCT TTCTGATCCT ATTTGTGGTA TATGTTGTAT TTTAGTTAGA CTTCATTCTT  TATTCCTAGT TGTGTTAGTA GTCTCTCCTA TATATACTCT ATCATGTACT CCATAATTCA TTGAGCAATA TTATTATTCC AATATTTCAA CATGGTATCG GAGCCACCGC TCTTGGTGAC  CTAAAAAAAG ATCTTTGCTC CCACGTCCCA CTGCCGCCGC CGGTATTTCC GGCGACGGCG GCTCCACCTT ATTCACATCT TTTTTTTCCC TTCTTTTATT CTCAAATTAA CTTCTCCATT  CAAAAAAAAG AAAAAAAATT CCTGTGTTGA AATCACAAAA AAAAATCCGT CAAAGGAGGA GCTTCCCTCT TGCCATCTCC ATGTTCTTCA AAAAAAAACT CAACTCCTCA CAAACTCTCT  CAGATCATCC TATCTTCTCA AAAAAAAGGA AAAAATAAAT GATTGTTGTT TCTCTCTAAT TCACCATATC AAAATCTTAG ACCCAACTTT TTTTTTCCAT CACCAATTCT TAACCTACTT  TTTCTCTCTA AAATCACTCA TTCTAATCAT CAACCTCCCT GCTCTTTCTT TCTGTTGAAC CAATAAAAAT CTAAAGTAAA TCAGCACAAA ACCAAAGCCA AGAGTGGAAG TAGTGAAAGA  GGAAATAAGA CCTCTATAAC TCACCCCTTC AAAAAGGAAA TAGGGCATTG CCCGGATCCA AGAAAAAAAC AAAAAATGTC AAGGATCTTC ACTCAAACAG GCACCTCCAG TAGCCTTCTC  TATTCTTCTC CGACGTCAGC AGCTACAAGC GCACGCCAAC CTTCTCTCTT CTTCATCGAC GTCAGCAGCT ACTAGCGCAC GTCAATTTCT CTCTTCTCCA ACGATGTGAG CAGCTACCGG  CGCATGTCAG ACTTCTCTCT TCTCAAAGTT TCCTGTTTCC AGCTAGTGTC CAAGCTTCCT CTTGCTTCAG CCAGAGTTCA GCTTGAGGGG GGATGTTAGA AAATAATACT AGTAGTACTT  CTTGTAGTAT TGGTTATGGT AGTGTTTCAT TATTAGTCAG CTTTCTAATC CTATTTGTGG TATATGTTGT ATTTTAGTTA GACTTCATTC TTTATTCCTA GTTGTGTTAG GAGTCTCTCC  TATATATACT CTATCATGTA CTCCATAATT CATTGAGCAA TAGTATTATT CCAATATTTC AACAATCCGT ATATGGGAAA AAAATGAAAA TGAAAGAAAT TAGATGGATT TTGAATTTTT  TGTGGAATGC TTCCTTGATA GACCTTTGAC CACAATATCA CATATGAAGT CTACAAAAAA TTGTGGACCT TAGGTCCACT ATCCACATGA CCACATAGCG TTTACCATAG TGGTTGAAAA  AAAATCACAT TACATATTAG GGAGATGCTA GGGTACACCA AAAGGTGTAT CGCATTTGTA CACCACCCCC TCCATAACTA TTCATTTATT TTTTATTTTT ATTTACTTAA TTTTTTTTAA  ATTTCTTGTC TATTTAAGTG GTAATGGAGG AAGTGGGGGA CAAATAGCAT TTTCCTACAT ATTAATATGC CAACACTAGT TTCAACCATG TGTTTTAACA AGCCCATACA TAGTCTAAAA  TTTTTAAAAT ATAAAATATT ATTTAAATTT TAAAATACAC TCATACAACA ACAACTATTT TAATTTTCTA ATAATGTACA GAATATCGCA TATCTTACCA ATTTAAAGTT ACCATTACAA  ACATAGATAC AATTAAATAG AGAAAAATCT TCGAAACACA TTATACATTC CACCGCACGT TAGAAGTTTT AAACGCCTCA TACCTCCTAA AATCCCAACA CACCGCACAT TAGAAGTTTG  AAATGCCGCA CACGTCCTAA AATTAAGCTT GTTCGTTTTT CTTCGAAATT AAGAAAAATA CCGGAAGTGA ATCGGTAAAA TTTATGGAGA AAGATGATCA AACAATTTGA ATGGCATATA  GTTAATTTCA TAAATGGAAA ATGGATAACT TTATTTGGGA AGTATCAAAA GTAATATGAA AACTGATCTT TACCATGCCG GTCTTGTAAT GTGTTTTGTG CAAATGTAGA GTGGAGGACC  AAATTGGGAG GTGAAGCTGG GAAGGCTGGA CAGCTTAACA GCAAGCCAAG AAGACTCAGA CAACATAATG CCAAGCCCAA GAGCAAATGC AACATACCTC ATAGACCTCT TCACCAAATT  CAACCTCTCA GTGCAAGACC TGGTTGCCCT TTCAGGCTCC CATTCCCTTG GCAAGGGAAG GTGCTTTTCC GTCGTCTTCC GCCTCTACAA CCAATCAGGG ACCGGGAGAC CGGACCCCGC  CATGGACTAT GAGTTCCGAG AGAAGCTCGA CAAGTTGTGC CCCCTCGGGG GCGACGGGAA CGTCACGGGG GACTTGGACG CGACGCCCGA GGTGTTTGAC AACCAGTACT TTGTGGACTT  GACTAGGGGA CGAGGGTTTC TAAACTCGGA CGAGACACTG TTCACTACCC CGAGAACCCG GGGGTACGTC CGGCTGTATA GCCGAGACCA AAAGGCATTC TTTGATGCAT TCGTCGAGGG 
GATGATTAAG ATGGGCGATC TTCAGTCGGG CCGGCCCGGA GAGGTCAGAA GAAACTGCAG AGTTGTCAAT GGCCACTTGC CCCCAAGGAA CTCCTTTGCT TCCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGCTGC ATCTTCTCTT CCTCCTCCTC AACTCCGGCG CCTTGGCGGC TGAGATCGCC GATCTCCGCC GCGGATTTTA CAAGCAGACC TGCCCGGAGG CGGAATCCGT GGTCAGGCTG  GTGATGGAGA AGAGCATGAG AAGAGAAGCC AGAAGCATAG CATCCGTGAT GCGCCTCCAG TTCCACGATT GCTTTGTTAA CGGATGTGAC GGATCGGTAC TGTTGGACGA CACGGAGACT  ATGTTGGGGG AGAAGCTGTC TTTGTCGAAC ATAAATTCAC TGAGGTCATA TGAAGTTGTT GATGAAATTA AGGAAGAGCT GGAGAGGGCG TGTCCGGGAG TTGTTTCGTG CGCTGATATC  TTAATCATGG CGGCCAGAGA TGCTGTTGCT CTGAGTGGAG GACCAAATTG GGAGGTGAAG CTGGGAAGGC TGGACAGCTT AACAGCAAGC CAAGAAGACT CAGACAACAT AATGCCAAGC  CCAAGAGCAA ATGCAACATA CCTCATAGAC CTCTTCACCA AATTCAACCT CTCAGTGCAA GACCTGGTTG CCCTTTCAGG CTCCCATTCC CTTGGCAAGG GAAGGTGCTT TTCCGTCGTC  TTCCGCCTCT ACAACCAATC AGGGACCGGG AGACCGGACC CCGCCATGGA CTATGAGTTC CGAGAGAAGC TCGACAAGTT GTGCCCCCTC GGGGGCGACG GGAACGTCAC GGGGGACTTG  GACGCGACGC CCGAGGTGTT TGACAACCAG TACTTTGTGG ACTTGACTAG GGGACGAGGG TTTCTAAACT CGGACGAGAC ACTGTTCACT ACCCCGAGAA CCCGGGGGTA CGTCCGGCTG  TATAGCCGAG ACCAAAAGGC ATTCTTTGAT GCATTCGTCG AGGGGATGAT TAAGATGGGC GATCTTCAGT CGGGCCGGCC CGGAGAGGTC AGAAGAAACT GCAGAGTTGT CAATGGCCAC 
TTGCCCCCAA GGAACTCCTT TGCTTCCTAA 

Retrieve as FASTA