Entry information : CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Entry ID 16102
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Name CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx033]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx24
start..stop
S start..stop
CcampPrx31 654 0 1..344 1..344
PpePrx21 358 4e-124 42..342 19..323
VvPrx82 328 2e-112 44..342 22..324
SaPrx39 322 1e-109 27..342 8..326
Literature and cross-references CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Protein sequence: CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344
PWM (Da):   %s   36660.53  
PI (pH):   %s   5.85
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPSSHFCLS YLKMPHPSKS AFHAFFITYL LLAGLAFSGD TAGGGGLSYG FYDRICPQLE HVVRAATEAF FLSDPTTGAA LLRLLFHDCQ VRGCDASILV DDSGQPEILS GKNLGIQKRG  LVGAIKSAVD ATCPPQVVSC ADILVLAARD SVALYGGPAI EVPLGRRDSS EPPSFELADS LLPPASTGVD QMLSLFAEKG FTVEESVAII GAHTIGATHC INVRRRLFDP EAQQGNEIPL 
DLRALLTLNC PLGPLTSNVS FVPNDRTSMT FDNRYYANGG ATGVINIDAE MPLDPRTAGH VRRFAADQDA FFRAFSSAFV KLSSWEVLTG EKGVIRRNCN ALSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independent predictions: Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1 (5') and 523.1 (3')).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCATTT TTGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGC GCCTTCCATG CATTCTTCAT CACCTATCTT CTCCTAGCCG GACTTGCCTT CTCCGGCGAC  ACCGCCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGC TTCTACGACC GCATCTGCCC GCAGCTCGAG CACGTAGTCA GGGCCGCCAC CGAGGCATTC TTCCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTGCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCGTC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATCCTCTCC GGCAAGAACC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  CTGGTCGGCG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCCACGTGCC CCCCGCAGGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTACTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGCTATC  GAGGTTCCGC TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGTT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC GGGAGTCGAC CAGATGCTCA GCCTTTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATA GGTACGGACA ATTAATTATC TTCCCTATGT CCCTAGAAAT AGTTTTTTGT TTGACTTTTT ACTATCTTAT CTTTAATGTA ATACTTTGAT  CATTAATATC TATATTTATG TATAAATATA TTTAATAAAA ATTTAGTATT TCAAAATTAT GTTTAAAATA AACTATTGAT ATTATATTTA TACCAAAGGA CGCTGTATTT TTTACGTAAG  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AAGTCCTTAT GGTTTCAAAA TGCTGCACCC GTGCCCCCTC TGATCATTTT CCGGCCATTT TTCCGGCAAA GAAGGGGGGC TACATATTTA CCAAACCACA GGGGTATCAG TGCTGATATT  TATTTTTCGC TTATTTGTTT GTTTTTTTTC ATTTTTTCCT TTATTTGTTT CTTTTATTAA TAAAGGTTTT TTTAAAATTA TTTTTATAAT GTTCATAAAA TTTAAAGTTA TTTTTGTTTG  AAAAAATTAA CATATAATGT ATATGTACTT CTCAAATCAA CAATTTTTGT TTTTTCTGAA AAAAGTAAAC TTTTTTTTGA GAATTTCAAA AAAATGACGA ATAAAATAAG AAACAAAATA  ATAGAAAAAT AAAAATGAAT ATCTTTTTCG ATCTCAATTT TAAGGACTTT TTTAGGCTTG TCCGTTTTTT TGTATCTGAC TTTTTTCGTG TATTTTTATT TTTCATTTTA TTTTTCCATA  TTTTTATTTT TTTGTTCTAG GTTTTTCTTT TTGAACTTTC CAAATAAGTA CGTAACAAAA AGTGAAAATG TTTAATTTCA AATAGATGCA ATGTACGTTA ATTTTTTTAT TTTTATTTCA  AACACAAAAA ATTTTAAAAT TTTAAAACAT TATAAAAAAT TGAAAATAAA TTAGACAAAT ATCTAGGAAA AGAAAAAAGA AATAGAAAAT ATTTTAAAAA AGAAAAACAC AAATAATAAA  CGAAAAATAA AAAATGAGCA CGAATGCCTC CTATGGTTTA AAAATTATGC GCAAATGCCC CCTCTTCGCC GGAAAATGGC CGGAAAATGA TCAGAGGAGG CACGGGTACA TCACTTAGAA  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ATGTGATGGA TTGAGTATTA GAGAAAAAGT ATGATGTGAT AGGTAGGGTA TGAAAAAGTA ATGGTAAAAG TGGTTTTTTA ATAGAAAGTG GCAGTGTTTT GTTGGAAGTA AAAAAAATGA  AAGAGAAAGA GTTTTTAAGA ACGGAGGAAA TACTTTTTTT CATAATTTGT GATCAAAGTA TTGTACGATT TGACTAAAGA ATTCAAATTG TAGTAAGACT TTTGGGAAGA AATATAATGA  TTTACAAGGG TGCGTGCACG TGTACAAGTA TGGCGAACAT TGTGGTCTTG CCCACATCTG CTCTGAACTC TGATAATGAA GTCTTAACGG ATGAGAAATT TAAGGATGAG CCCATCCCCT  TGTGAAATAC GGAGTATTTG TGATTTTCAG CACAAAGAAT TGGGATTTAT ATTTGGACCA ATTTTTTTAA TTCAAAGCTA ACTCAATTAT AAATCTACAC TCATCATCGT ATCATTTACA  AATTCAAATT TAACTTTTCT CTAATTTAAA ATTTGCAATT AAAAATTGAT TTCCCCTTAT ATAATAACAA TTGCATACAT ATCAACCTGC TTTTGTTATC GTCTTTGCCG ATTTTAAAAT  TCAAATTCTA GAATTAAAAT TATATAATTC TCCAAATAAC ATTTGGAATT TGAAATTATG AAATTTCAAA TCTTAGAATT AAAATCTAAT ATTTCAAATG AAATTTAGTA CCCAAACACT  ACCTTAATTA AATACTCCCT CCGTCCACCT AAGATCTTCC CATTACGCGT TACGAGGTTT GACCGACTTT ATTTTTAATT CAATTTAATT GATTATATGA ATAAAATTTT AAAATAAAAT  TTATATAGTA ATAAATTAAA TGAAAAGTTC TACAAAACTA GAAGTGACAA GACTATATTA TTTTACAAAA TAACTAGTAA AAATGAGTAA ACAAAGTGAG TGAAATTTGA CCCTGTGAAT  AGTGATTGAG AAGATCTATG GTCGACAGAG GGAGTAATTA AAAGTATTAT TGTGATGTAG GAGCCCATAC AATCGGAGCA ACACACTGCA TTAACGTCCG AAGACGTCTG TTCGACCCAG  AGGCTCAACA GGGAAACGAG ATTCCGTTAG ATTTACGGGC GTTGCTGACG TTAAACTGTC CGTTAGGGCC GTTAACGTCC AACGTCTCCT TTGTCCCGAA CGACCGGACG TCCATGACGT  TCGACAACCG TTACTACGCT AACGGCGGCG CGACGGGAGT GATAAACATC GACGCCGAGA TGCCGCTCGA CCCGCGCACC GCCGGGCACG TGCGGCGGTT CGCGGCGGAT CAGGACGCGT 
TTTTCCGGGC GTTCTCCTCC GCCTTTGTCA AGTTGTCTTC TTGGGAGGTT CTGACGGGGG AGAAGGGTGT GATCAGGAGG AATTGCAATG CCTTGTCATC ATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCATTT TTGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGC GCCTTCCATG CATTCTTCAT CACCTATCTT CTCCTAGCCG GACTTGCCTT CTCCGGCGAC  ACCGCCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGC TTCTACGACC GCATCTGCCC GCAGCTCGAG CACGTAGTCA GGGCCGCCAC CGAGGCATTC TTCCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTGCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCGTC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATCCTCTCC GGCAAGAACC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  CTGGTCGGCG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCCACGTGCC CCCCGCAGGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTACTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGCTATC  GAGGTTCCGC TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGTT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC GGGAGTCGAC CAGATGCTCA GCCTTTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATA GGAGCCCATA CAATCGGAGC AACACACTGC ATTAACGTCC GAAGACGTCT GTTCGACCCA GAGGCTCAAC AGGGAAACGA GATTCCGTTA  GATTTACGGG CGTTGCTGAC GTTAAACTGT CCGTTAGGGC CGTTAACGTC CAACGTCTCC TTTGTCCCGA ACGACCGGAC GTCCATGACG TTCGACAACC GTTACTACGC TAACGGCGGC  GCGACGGGAG TGATAAACAT CGACGCCGAG ATGCCGCTCG ACCCGCGCAC CGCCGGGCAC GTGCGGCGGT TCGCGGCGGA TCAGGACGCG TTTTTCCGGG CGTTCTCCTC CGCCTTTGTC 
AAGTTGTCTT CTTGGGAGGT TCTGACGGGG GAGAAGGGTG TGATCAGGAG GAATTGCAAT GCCTTGTCAT CATAA 

Retrieve as FASTA