Entry information : CcampPrx31(Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1/ 703.1)
Entry ID 16109
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx31(Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1/ 703.1)
Name CcampPrx31(Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1/ 703.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx31
start..stop
S start..stop
CcampPrx24 664 0 1..344 1..344
PpePrx21 359 1e-124 44..342 21..323
VvPrx82 329 1e-112 44..342 22..324
AhalPrx23 320 4e-109 18..342 8..338
Literature and cross-references CcampPrx31(Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1/ 703.1)
Protein sequence: CcampPrx31(Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1/ 703.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344
PWM (Da):   %s   36903.67  
PI (pH):   %s   5.9
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPSSRFRLS YLKMPHPSKS AFHAFFFTFL LLAGLVFSGD TGGGGGLSYG FYDRTCPQLE HIVRAATETF FLSDPTTGAA LLRLLFHDCQ VRGCDASILI DDSGQPEILS GKNLGIQKRG  VVNAIKSAVD AACPPQVVSC ADILVLAARD SVALYGGPVI EVPLGRRDSS EPPSFEMADS LLPPASTGVD QVLGLFAEKG FTVEESVAII GAHTIGATHC INVRRRLFDP EAQQGNEIPL 
DLRALLTLNC PLGSLTSNVS FVPNDWTSMT FDNRYYFNGG ATGVINIDAE MPLDPRTAGH VRRFAADQDA FFRAFSSAFV KLSSWEVLTG EKGVIRRNCN ALSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independent predictions: Cuscam_OOIL01000120.1_FGenesh704.1_FGenesh33.1 (5') and 703.1 (3'))
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCGTTT TCGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGT GCCTTCCATG CATTCTTCTT CACCTTTCTT CTCCTAGCCG GACTTGTCTT TTCCGGCGAT  ACCGGCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGT TTCTACGACC GCACCTGCCC GCAGCTCGAA CACATAGTCA GGGCCGCCAC CGAGACATTC TTTCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTTCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCATC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATTCTCTCC GGCAAGAATC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  GTGGTCAACG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCGGCGTGTC CCCCGCAAGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTGCTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGTTATC  GAGGTTCCGT TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGAT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC CGGAGTCGAC CAGGTGCTCG GCCTCTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATC GGTATGGACA CTTTGATTAT TAATATCTAT ATTTATGCAT TAATATATTT AATAAAAATT TAATATTTCA TAATTATGTT TCAAAATAAA  CTATTGATAT TATATTTATA CTAAAAGACA GTATATTTTT TACATATGGA AATCAAAATT TATAAATAGA GGAATTTACG TAAATAACAC TAAAACATAA TGACTTTCCC TAAATAGCAC  TGCATGTACT TTTTTCCCCA ATGTAGCACT TTTAGTCATT ATGCATTAGT CATTATTCAA GTAAATGTTT GTCATCACTG GTCATTATGG ACATTATTAA GTACTATTTA GGGAATAAAT  AATTTAAATG CTATTTATGT AAATGACTTA AGTTTTAATG CTATTTAGTA CAAATATTTC TTATAAATAT TAACCAAAAA AATTAAAATC AATTGGAAAT ATCATTTCTC GAGGGAGTAC  TCTATTATTC TATTTGCTCG TAGTACTGGA TTACTTACTA CCAAATTAAT TTTGTCTTTG ACTTATGTGG AATAAATGAA AGCCATGCTT GAAAAAGAAT TTGTAAAATT AATTTTTAAA  ATGTTAAATT TAAGTATTGG GTTCGGTTGA CAATGACCAG CAGTTCCACT AGCGGTGTCA CTGCATTTTT AGAGTATCTC TGATGTTCCG TTCAGAAATT TGATGGTTCC AACGGTGCCA  CTAGTGGTGT ATTGCATAAT AACCACGCAT AAGGATGTAG GCTTAGAGCG AGGCTGCGAT GGGGCTAAGG TGGGAAATTT AGGGGGTGGG ATAATGTGGG TAGGACCCAT CAAATTTCTG  AACGGTGCAT CAGAGGTGCT CCAAGAACAC AGTGACACCG CTAGTCGCTA GTGGTACTGT TGACACTTTT CAACGGGGGA GTGTCAACGG AACCGTGTTT TAAATATATT GTCACATGGG  GAGTAAGAAA AAGTTTGAAA AAAGTATTGA ATAGTAAATG TGAGGGGTAA ACAAGAGTAT TGGAGAATTT AACATTATTG TTGAAAAGCA AAATGGAATT TAAAATGAGT ACGTATAATA  TTTTCCTCCT CCCCAAATGA AAGTTAGAGA GAATTTACGA AGTAAATAAC CCTTTTAATT CTTTTTTTAA AAATTAGCAT AGAAACTTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT ATATATATAT  ATATATATAA TTAAATCAAA AGTTATACGG AGTACAAAAC AAGTTCATAA TAATCTATCC TCTATGTTAT TTTATCGATT TCATGATCAA TAATAAAAAT GCAATGATGT TATATATATA  TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATAAC ATCATTGCAT TTTTATAGTT ATATATATAT ATATATATAA CTATATATAT TTTTTCTATA ATTTGTGATC  AAAGTGTTGT ACAATTTGGA GCAATTTGGA GAAAAAAAGG TAAAGTATGA ATAAAACATT GAAAATATTC TAAAATAGAA GTTTCGTATT AAATTACCAA TCATTACTAT ATACATTACG  TAAAATGCAC ATGTACATTG TCACATTACA AAATCAGATT TAGAGAATAC AAACAAACAT ATAACTCATA CTTTGATACT TTTTTTCTAT TTTTAGTCTT ATTTAAAGTG ATATCTTTAT  ATTTTAACTA AAAAAATGAA GTTGTGGTAG GGAGTAATAT TTTTGGAAAG AAATAGTATA ATGATTTACA AGTGTGCATG CACGTGTACA AGTATGGCGA ACATTGTGGT CTTGCCCACA  TATGCTCTGA ACTCTGAACT CTATGAAGTC TTAACGGACG AGAAATTTAA GGATGAGCCA TGAATGAAAA AAGATAAATT AAACTTTAAT CACAGATTGA TAGTAAGGAC TAGAGCATGC  AACTTGGTAT GGATAAGAGA TTTAAAGTTT TAGGGTAGGT GGACCTAGTT AACATTCCCT CCGCCCCTAT TTAGTTTGTT TTATGTGTCA AATATTTGAC TAGTTATATA TAATAAAAAT  ATTTTTAATA TTTTTTTGGT ATCGAAATTA TACAAAAGTA CAATGAAACT TGGTATCGAA ACATATACAA TGAATTAAAA TATGAAAATT ATACAAATTC TTGGTATTAA AAAATACGTT  AAATCTAATA TTTTAACATT TTTTGTTTAT ATATTTTAAG AGATATTGTT CGTCACACTT TAAATTCGAA AAACAAATCG GATAGTTAAA TATATATGAA TAGAGGGGTA ATAATCACCC  CTTCCAAAAA ACATTTGCCG TTTAAATTTG GTGGTCAAAT TTTACATACT ATGACCATTA TTGAATAGAT CAATAATTTT TTTTTAATAA TTTTGCCAAA TGTAATATTA TGACATTGGA  CTCTTATTAC ACTCTATTCG TAAAATAGAT TGTTCATCCC CTAATCTCTG GTCCCAAATC GGCACCTTCC GCCTTGATCG TCGATTTGAC ATTATTTCTG TCAAATCGAT GACCTGAAAA  AGGAGATGAG ATGGAAACAT CGGTAGGAAA CATTAATATA CTCCTTCCGT CTCAAAAATT CCTTTACCTT TTTTTTCTTA TCACACCCTA TTTAATTCGA ACAATATCGA GTAAAATATT  AGTGTGATGC AGGAGCCCAT ACAATCGGAG CAACACACTG CATTAACGTC CGAAGACGTC TGTTCGACCC AGAGGCTCAA CAAGGAAACG AAATTCCGTT AGATTTACGG GCGTTGCTGA  CGTTAAACTG TCCGTTAGGA TCGTTAACGT CCAACGTCTC CTTTGTCCCA AACGACTGGA CGTCCATGAC GTTCGACAAC CGTTACTATT TTAACGGCGG CGCGACGGGA GTGATAAACA  TCGACGCCGA GATGCCGCTC GACCCCCGCA CCGCCGGGCA CGTGCGGCGG TTTGCGGCGG ATCAGGACGC GTTTTTCCGG GCGTTCTCCT CCGCCTTTGT CAAGCTGTCT TCTTGGGAGG 
TTCTGACGGG GGAGAAGGGT GTGATTAGGA GGAATTGCAA TGCCTTGTCA TCATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCGTTT TCGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGT GCCTTCCATG CATTCTTCTT CACCTTTCTT CTCCTAGCCG GACTTGTCTT TTCCGGCGAT  ACCGGCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGT TTCTACGACC GCACCTGCCC GCAGCTCGAA CACATAGTCA GGGCCGCCAC CGAGACATTC TTTCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTTCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCATC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATTCTCTCC GGCAAGAATC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  GTGGTCAACG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCGGCGTGTC CCCCGCAAGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTGCTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGTTATC  GAGGTTCCGT TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGAT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC CGGAGTCGAC CAGGTGCTCG GCCTCTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATC GGAGCCCATA CAATCGGAGC AACACACTGC ATTAACGTCC GAAGACGTCT GTTCGACCCA GAGGCTCAAC AAGGAAACGA AATTCCGTTA  GATTTACGGG CGTTGCTGAC GTTAAACTGT CCGTTAGGAT CGTTAACGTC CAACGTCTCC TTTGTCCCAA ACGACTGGAC GTCCATGACG TTCGACAACC GTTACTATTT TAACGGCGGC  GCGACGGGAG TGATAAACAT CGACGCCGAG ATGCCGCTCG ACCCCCGCAC CGCCGGGCAC GTGCGGCGGT TTGCGGCGGA TCAGGACGCG TTTTTCCGGG CGTTCTCCTC CGCCTTTGTC 
AAGCTGTCTT CTTGGGAGGT TCTGACGGGG GAGAAGGGTG TGATTAGGAG GAATTGCAAT GCCTTGTCAT CATAA 

Retrieve as FASTA