Entry information : CcampPrx41(Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1/34.1)
Entry ID 16119
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx41(Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1/34.1)
Name CcampPrx41(Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1/34.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx41
start..stop
S start..stop
CcampPrx42 647 0 1..340 1..340
NtPrx24-1A 362 2e-124 30..340 115..429
NtPrx24-1B 359 4e-123 43..340 136..433
LpPrx05 360 1e-122 44..340 191..487
Literature and cross-references CcampPrx41(Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1/34.1)
Protein sequence: CcampPrx41(Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1/34.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   340
PWM (Da):   %s   37536.95  
PI (pH):   %s   6.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARILGIFVI TCMIYLFTRT SSSPLGDLLF NPFSPPQREG DDNEGGLQVG FYDQTCPRAQ EIVKDVMFKA FQNDSGLAAA MVRLQSHDCL VNGCDGSVLL DQVAGGGRVE KQAPANGKTV  RGFDLIDSAK EAVERECPGV VSCADILTFL SRDALVLSGL PEFDAPGGRR DGRVSREEDV VKSIASPNNT VDQLVRLFET KGLGVEDMVA LLGAHSIGVA HCSNFRYRLK DPKKEKEVEG 
SMKVVMGFQC LNRRHTVPMD SVTNYRMDSV FYRQLLKKKA LLESDQLLAS DSRTQPLVEK FAGDEAEWFR KFTESFIKMG QIQVLTGDQG EIRRNCRFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independant predictions: Cuscam_OOIL01000264.1_FGenesh33.1 (54) and 34.1 (3')).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGAA TTCTTGGAAT TTTTGTCATC ACCTGCATGA TATATCTGTT TACCCGGACA TCTTCTTCTC CCTTAGGAGA CCTTCTTTTC AACCCATTTT CTCCTCCCCA ACGCGAGGGA  GACGATAATG AAGGCGGACT ACAAGTAGGG TTCTACGATC AGACTTGCCC AAGGGCACAA GAAATTGTCA AAGACGTCAT GTTTAAGGCA TTCCAGAATG ACTCTGGCCT CGCCGCCGCC  ATGGTTCGCC TCCAAAGTCA TGACTGCCTT GTCAATGTGA GCCTTCTTCG TTTCAAATTG ATAATGCCAA TGCTAGCTTA AAACACTCAA ACATTCACCT AATGAAATGA AGAAAAAATA  AGATGAAATG GATAAATACA CGGGACAGAA TAAGTATAAT AATGCATTTG TCCTAATTGA TAGAATTTTT TATCGTGAGT TATAAATATT GCACAATAAT ACAAAAATCA GACTATTAAT  TAAAAAATTA ATCTATTGTA TTAATATGCG TTGTAATTTT TATTTAATTA CTCCGATCCC CTGACTAGAA TGTTTTTTTT GTGATTGACA TTCAAGATTT AATTCTTAAA TATAGGAAAT  CTATCTATAA AAAACTAAAC TATGAAATTT GTACCAAATT AAACCTTATT CTCCGTATGT TTTTACCTCA AATAAATATG AATATTGATA CTATAAAATC CTTGTTATTT TGTATTACTC  CGTATGTGTT ATCATTTCAT GATACAGAGT ATTTCTTCGC AATCTGGCAT TATGCTTTGA CATTATTTTA TAATATAAGT CCTATTTTGA TATAAAATAT TAAAAGTCCT ATTTTGATAT  AAGAAAATCA TATTTTTAAC ATGAGCTAGA CTTTTTTCCT TTCAAACGTA GACCACAATA TACAAAAAAT GTACGTATTT GAAAGGTAGT TTTAAAACAT CATATTTCCA AAATATGGCC  AAATAGCATT GGTACCACTC GTGGTTTGCA AAACAAGCAC CAATACTTCT TCTGTTTTCA AAACTCATTT CTAAAATCCC TATAGTTTCA AAATGTTGCA CTCGTGTCCC CTCTAATTAT  TTTCCGTCCA TTTTTCCGAC GAAGAGGGGG CATTGGTGCA TGTTTTTTAA ATCATAGGGG GTATCAGTAC TGATTTTTAT TTCTTGCATA TTTTTTGTTT TTTCCATTTT TTCCTTTTTT  TGTTTCATTT ATAATAAGTT TTTTTAAAAT TATTTTTATA AGGTTTCTTA AAATTTAAAG TTACTTTTGT TAGAAAAAAT TAACATATAA TGCATATGTA CGTCTCAAAT TAACAATTTT  TGATTTTTCT GAAAAAAAGT AAATTTTTTT GAGAACTTCA AGAAAATTAA GAATAAAATA AGAAACAAAA TAATGCAAAA ATTAAAATGA ATATCCTTTT TGGACATATT AATTATAAGG  ACTAGGCGTG TAATTTTTTT TGTATAAGAC TTTTTTTGCG TATTTTAATT TTTTCATTTT ATTTTTCCAT ATTTTTATTT TTTTATTCTT GGTTTTTTTT GAACTTTTCA AAAAATTATT  CTAAGTAACA AAAAGTGAAA ATGTTTAATT AGAGATAGAT TTAATGAATG TTAATTTTAT ATTTTTATTT TTATTTGAAG CATAAAATTT TAAAATTTTT GAAACATTAA AAAAAATTGA  AAATATATTT TCAAAAAAAT CTAGGAAAAG GAAAAAGAGA TAGAAAATAT TTTTAAAAAG GGAAGAATAA CAAACGAAAA TAAGAAATAA GCACGAATGC GCCCTATGAT TTAGAAATTA  TGCGCCAATG CTCTCTCTTC GCCGGAAAAT GGCCAGAAAA TGATCAGAGG GAGTGTGGGT GCAACATTTT GAAACCACGG GAATTTTGAA AACAGATGGG GTATTTATGC CAATTTTTCA  AACCACAGGG ATACGGAAGC TATTTGTTCT CCAAAATATA TATCTATGTC TAAATAGAGA CATTAATGAT CAAAATATAT CACCGTAAAC AAATAAAAAC ATTAATTTGA ACAAAAGGGC  AATGTTTAAC TCTAATTCCA TTTGACTAGA CAAATTTTAC GGAATGTGCA GGGATGTGAC GGATCTGTTC TGCTAGACCA GGTGGCCGGC GGAGGCCGGG TGGAGAAACA AGCTCCGGCG  AACGGAAAGA CCGTGCGGGG CTTCGATCTG ATCGACAGTG CCAAGGAGGC GGTGGAGAGA GAATGCCCCG GCGTCGTATC GTGCGCCGAC ATACTCACAT TCTTGTCCCG TGATGCCCTC  GTTTTGTCCG GGCTGCCCGA GTTTGACGCC CCCGGCGGGC GGCGCGACGG CAGGGTGTCC CGGGAAGAGG ACGTCGTGAA ATCCATCGCC TCCCCTAACA ACACCGTGGA TCAGCTGGTG  CGTCTATTTG AGACCAAAGG GCTGGGTGTG GAGGATATGG TGGCGCTATT GGGTGCTCAT TCCATTGGCG TTGCTCATTG CTCTAATTTC AGGCATGTTT TATAACATTA GGATATGTTC  TTCTATAACC ATTCTATTAA TATTTTCATC TGCGGAGTAT AATTTTGTCA TTGAATTAGT ACTCACAAGT TAAGGCTTGT TCATCGTTCC AAGACCAGAT CAAATCGAAC CAGACCGGAC  TCAAAATCAA ATTGCACAAA ACCATGGATC AAAGATCAGA CCTAAACGAA TTCAGTTTTT GATCGGATCG GACTAGACTG AAATACTTAA GACAAAACCG GTCCAAACTC ATTGACCAGT  CAGACCGAAT AAAAAAATAC TTTGTTATTA TTTTGATCCA TTAATTATAT TTTAGGGTTT TAAATTTATA CCGTGCAAAC AGGAAAAAAT AAAATAGAAA AACTAAAATA GATACCCATG  GACTGCTTCT ATGTATAATC ATCAAAAGTA GTGTGGAATT GTTTAAAAGA AACTTAATTA AAAACCTTGT TAATTAAATA AATTAAGATA TATATCAAAA TAAAGCATCA ACACATAATA  CCAAACTTAA AAGGTAGTGT TTTAGCATTT TGGCCTTTTA GGTCCAATAG TATTAAGTCC ATTCGGTCCA ATTGGTCGGA ACCTATATTA TTTCGAGTTT GGACAATACC AGATCGGAAT  CCGAATGCCT AATTCTTTTG GATCAAAGGC TGATCCAAAA TCCATTCGAT CCGATATAGT TTGGACCTTA CGGTCTGGTT CGATCATGTT TTTCGGTTTG GACCTAAACC TGGACAACCC  TGATCCCAAG TTCAATTCGG TCCCTGTAAG TTTTACTTGA CTCAAACTAG TCCCCGGAAC TAGAAAATGT GAATCAAAAT TAGTATGTAA TAATTTTGAA TCTTTGATTA ATCCTCCTCC  ACAGGTATAG GTTAAAGGAT CCAAAGAAAG AAAAAGAAGT GGAGGGGTCG ATGAAGGTGG TGATGGGATT CCAATGTCTG AACAGGAGGC ACACAGTCCC AATGGATAGC GTGACAAACT  ACCGAATGGA CTCCGTTTTC TACAGGCAGT TGCTGAAGAA GAAGGCGTTG CTGGAGTCCG ATCAATTGTT GGCCTCCGAT TCGAGAACGC AACCACTGGT GGAGAAGTTC GCCGGCGACG 
AGGCCGAATG GTTCCGCAAG TTCACGGAGT CTTTCATCAA GATGGGGCAG ATTCAAGTGC TCACGGGGGA TCAGGGAGAA ATCAGGAGGA ATTGTAGATT TGTGAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGAA TTCTTGGAAT TTTTGTCATC ACCTGCATGA TATATCTGTT TACCCGGACA TCTTCTTCTC CCTTAGGAGA CCTTCTTTTC AACCCATTTT CTCCTCCCCA ACGCGAGGGA  GACGATAATG AAGGCGGACT ACAAGTAGGG TTCTACGATC AGACTTGCCC AAGGGCACAA GAAATTGTCA AAGACGTCAT GTTTAAGGCA TTCCAGAATG ACTCTGGCCT CGCCGCCGCC  ATGGTTCGCC TCCAAAGTCA TGACTGCCTT GTCAATGGAT GTGACGGATC TGTTCTGCTA GACCAGGTGG CCGGCGGAGG CCGGGTGGAG AAACAAGCTC CGGCGAACGG AAAGACCGTG  CGGGGCTTCG ATCTGATCGA CAGTGCCAAG GAGGCGGTGG AGAGAGAATG CCCCGGCGTC GTATCGTGCG CCGACATACT CACATTCTTG TCCCGTGATG CCCTCGTTTT GTCCGGGCTG  CCCGAGTTTG ACGCCCCCGG CGGGCGGCGC GACGGCAGGG TGTCCCGGGA AGAGGACGTC GTGAAATCCA TCGCCTCCCC TAACAACACC GTGGATCAGC TGGTGCGTCT ATTTGAGACC  AAAGGGCTGG GTGTGGAGGA TATGGTGGCG CTATTGGGTG CTCATTCCAT TGGCGTTGCT CATTGCTCTA ATTTCAGGTA TAGGTTAAAG GATCCAAAGA AAGAAAAAGA AGTGGAGGGG  TCGATGAAGG TGGTGATGGG ATTCCAATGT CTGAACAGGA GGCACACAGT CCCAATGGAT AGCGTGACAA ACTACCGAAT GGACTCCGTT TTCTACAGGC AGTTGCTGAA GAAGAAGGCG  TTGCTGGAGT CCGATCAATT GTTGGCCTCC GATTCGAGAA CGCAACCACT GGTGGAGAAG TTCGCCGGCG ACGAGGCCGA ATGGTTCCGC AAGTTCACGG AGTCTTTCAT CAAGATGGGG 
CAGATTCAAG TGCTCACGGG GGATCAGGGA GAAATCAGGA GGAATTGTAG ATTTGTGAAT TGA 

Retrieve as FASTA