Entry information : OcAPx01(OcIN23r2_Chr05g0116941)
Entry ID 16168
Creation 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-02-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: OcAPx01(OcIN23r2_Chr05g0116941)
Name OcAPx01(OcIN23r2_Chr05g0116941)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Orobanche
Organism Orobanche cernua    [TaxId: 53590 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value OcAPx01
start..stop
S start..stop
OcAPx02 92 6.24e-24 3..59 26..80
MguAPx01 92 1.19e-23 3..59 26..80
GhyAPx02 91 2.96e-23 3..59 26..80
CiAPx02 90 5.52e-23 3..59 26..80
Literature and cross-references OcAPx01(OcIN23r2_Chr05g0116941)
Protein sequence: OcAPx01(OcIN23r2_Chr05g0116941)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   136
PWM (Da):   %s   15853.95 Transmb domain:   %s   i95-112o
PI (pH):   %s   8.57
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRSHHNCAPI MLRLAWHDAG TYNVNTKTGG PNGSIRNEEE YNHRADVYFR LSVAIVYCNF YLRFDFTSYD VYAIDFCSIN CILGMKYFIL KNGKNLFDYL IASLMMLYFL YQDSFNLLFI 
KVFKNLILIS GKYVIH 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial and only small APX domain
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTTATTTT TCTCGTGTTG AAGCCGAATT ATACAAGCCG AATTATTTTT CTCTTATCTA AGCCCAAAAC AAATAGGGGG CCCATTTTTT TATCACCTAC AACCCCTACC CAATTTTTAA  AGAACTCTGC ATCCCACCAT TCCACCAAAA ACCAGCCGCT GAAGAAGAAT TGAAAAGGAT CCCCAAATTT CTTCAACAAA TAGAAGTACA GAACTGAGAA CAGAAAGCGC GACGGGATCC  ATCCATCTGC CATCGGTGCG CTGCCTCACC AAGAAGAAGA CAACGAAGAG TTGGAGCAGA GAAATAGCAA GGAAGGACGT GAACCATATG CGATACGCCG CCTCACCAAA CCCAAATGCG  AGCCATCCAC TCCACCGGAC AGCCGCGAGC CATCCGTCGC CGACAACAAT CATGTGCTTT TGTTCGCGAG TCTACTTTCT AGCTTTTGCT AATTGCTTTA GTGTTATTGT ATTTGGTTTT  GAGATGTACC CTAAAGGTAC AAATATAGTT CTGAAAAGCG GGAAAGAAAG AAAATTAAGT TGGACTTTGT TATGAAGATG ATTTGATGTT AGAAGTCGAT GAGCAGTTTA GCTACCTACT  GTACCGTTGT TGCAGCAGTG TTTTGAGGCT ATTAATCCCT TGTTTTGACT ATGATTTCGT GAGATAAGTT GTAGAATTTG GTTTCTAGTT TGTCTACGCG AAAACCTCGC GTCAAAGTAG  TAAACGAGTC AAAAGTTATG ACCGTTTTGG TCAAAGTTTG CGAAACTGAA ATTTCAGTGC TCCTGCTTGA GTTTGTTTCA ATTCGTTTTA TATGTTATAA AATGGTTTTG GATATGAAAT  TTTTATTAGA GACTGAATTG ATATTAAAGC TAAAATCTGC CAAATTTCGT GATTTAAGAA GCATTTTTTG ATTTATTAAA AATGTTTAAG TATAGTGTGT TTCGTAGAGT TGTTTTGAAG  GGGTTAAAGA CCTAATTTCA AGCTGGTCAA AAGATGAAAG TAGTTTATTT GTGGCTTGTC TAGTTGTGTA CCAAATATGG TATGCATTGA ATTTAAGAAT TTTGAGTTAA AGCTGTTTGT  AAATCTAGCC TGGTGGAATC TTGTGCATCT TTCTTTTCAT ATATGTTATG CTAGTTGCTA AAAATTGGTT GATAAAAATT TGCTTTTTAT CTTGTGATAT ATACTTCAAA TACAATTATG  CATATGTTGG ATTTATGAAC AATATTATTC ACTACTGAAT TTTATTTTAA TTACTCCTTG GTACACCAGA TTATAATTTG TTTTGATTTA TCAATGTTTA GGTGTATTAG GTAATTCTAG  TTTTAGCATG GATAAGAGCT GGTTAAATTT GGATCCAAGA AGCGAGGGGT ATCAAGGTAA AGTTAAGGAG TTTATCTTAA ACTCTAAGAG GTTTGCTATC ATTTCCCGGA GCTCCATAAC  TATCCTCATT TCTTGGAGTT CAAAACTGGT TATGAAAAGC TGCTATCATT CGTGTACTGG GTGTGCTTTT GTCATTTGCC AACACTATTA CCATTAGTGT TCCATCACTG AGAAGCTTTT  TGATTTTCCT TGCACTAATT TGAGGTGATT GTATGTAGTT TTTTGCTAAA TTAATCATAC TCGCGCATTA AGTTCTTTAT AGAGACATTT TCGGACTAAG GCTTGCAAAT GCTGATCTCA  TGTCAATCCC TGGCCTATAC CGATTTCTAC ATTTTAATCA TTTCTTGATA TCTTGGATTT TTGTTTTTTT CCTCTTTAGA AAAGTGGAAT TCATGGTTTA TGTACAAACA ATAGAAACTG  GAAATTCGAC ATGTCTTATC AACAAAATGG GAAATTTTAT TTCTGGATTA TAGCTTATAT CGCCACTGCC TTGGTATTCA AAGTTTCCTT GCATGTAGTT TGTTAGTCAT TACAGTAGCT  AATGGAGGTT ACCAACATTA GTGGTGCTCA TACTAGTTCT CTACTTTCAG ATTGTGGCAT TGGTTTAGGA GTATATATGG CGATTTAACT ATTCTTCCTT GCAATCTTTG TGTAATGATC  AACTCAAAAA AAAAAAATAA GATAACATAT CAGTGCTGCA GCCTCAAGGA GGCCTAATGT TTGTTTGTAT TTTTACATAA TATGTTGATT TATTTCTCCT CTTTGTTAGA TCATTTAATT  CCTAACCATT ACATGATTTC CTCTTCCTTT TTTTCTGGGG GGGATGAAAA AAACGACATG CAGGAGCTTA TCAAAGATCA GGTCGCTAAC ATGTATCTGT GGCCTAAGGG CGAATATCGT  TGACTCAGAG TACCTCAAGG AAATCGAGAA AGCTCATCGA GAACTATGCG CTCTCATCAT AACTGTGCAC CTATTATGCT TCGCTTGGCG TAATTTCTAT TTAACTTCCT GTTCTCTTTA  TTTTGTTTTT CGTTTTGTTT TTAATCTTAG TTTAATGAGT AGAGATTGGT CAGTCGTGAT GGTTTACTTG TTTTATCTGG ATTTTGTGAT TGATTAGTTG GCATGACGCG GGGACCTACA  ATGTGAATAC GAAAACTGGA GGTCCAAATG GTTCGATTCG GAACGAAGAG GAGTACAATC ATAGAGCTGA CGTCTACTTT CGATTGTCTG TTGCTATTGT GTACTGCAAT TTTTATTTGA  GATTTGACTT CACGAGTTAC GATGTCTATG CAATCGATTT CTGTTCTATC AATTGTATAC TCGGCATGAA ATATTTCATT TTAAAAAATG GAAAGAACTT GTTTGATTAT CTGATAGCAA  GTCTTATGAT GTTATATTTT CTGTACCAGG ATTCATTCAA TTTGTTGTTT ATCAAAGTTT TTAAAAATTT GATCTTGATC TCTGGAAAGT ATGTTATACA TTAAATAATT GTTTTGTTCA  TCATGTATGC CGAACAACTC ATTGCAAATG AAAAGGCTGC AGCAAGGAAG TTATTCTTTG GGACTATGTT TCTATACTTC CAATAAAATG GTTGATAAAA AAATACTTTA TGCATCGATC 
CCGTTTATAA CAGTTTTAGA AAACCTAAAT ACCACATCAA ACGTTGTAAG AATTCACAGA TGATAAATAT TTACCACATA CTCGAAAATG GTATCTGTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGCTCTC ATCATAACTG TGCACCTATT ATGCTTCGCT TGGCTTGGCA TGACGCGGGG ACCTACAATG TGAATACGAA AACTGGAGGT CCAAATGGTT CGATTCGGAA CGAAGAGGAG  TACAATCATA GAGCTGACGT CTACTTTCGA TTGTCTGTTG CTATTGTGTA CTGCAATTTT TATTTGAGAT TTGACTTCAC GAGTTACGAT GTCTATGCAA TCGATTTCTG TTCTATCAAT  TGTATACTCG GCATGAAATA TTTCATTTTA AAAAATGGAA AGAACTTGTT TGATTATCTG ATAGCAAGTC TTATGATGTT ATATTTTCTG TACCAGGATT CATTCAATTT GTTGTTTATC 
AAAGTTTTTA AAAATTTGAT CTTGATCTCT GGAAAGTATG TTATACATTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTTATTTT TCTCGTGTTG AAGCCGAATT ATACAAGCCG AATTATTTTT CTCTTATCTA AGCCCAAAAC AAATAGGGGG CCCATTTTTT TATCACCTAC AACCCCTACC CAATTTTTAA  AGAACTCTGC ATCCCACCAT TCCACCAAAA ACCAGCCGCT GAAGAAGAAT TGAAAAGGAT CCCCAAATTT CTTCAACAAA TAGAAGTACA GAACTGAGAA CAGAAAGCGC GACGGGATCC  ATCCATCTGC CATCGGTGCG CTGCCTCACC AAGAAGAAGA CAACGAAGAG TTGGAGCAGA GAAATAGCAA GGAAGGACGT GAACCATATG CGATACGCCG CCTCACCAAA CCCAAATGCG  AGCCATCCAC TCCACCGGAC AGCCGCGAGC CATCCGTCGC CGACAACAAT CATGTGCTTT TGTTCGCGAG TCTACTTTCT AGCTTTTGCT AATTGCTTTA GTGTTATTGT ATTTGGTTTT  GAGATGTACC CTAAAGGTAC AAATATAGTT CTGAAAAGCG GGAAAGAAAG AAAATTAAGT TGGACTTTGT TATGAAGATG ATTTGATGTT AGAAGTCGAT GAGCAGTTTA GCTACCTACT  GTACCGTTGT TGCAGCAGTG TTTTGAGGCT ATTAATCCCT TGTTTTGACT ATGATTTCGT GAGATAAGTT GTAGAATTTG GTTTCTAGTT TGTCTACGCG AAAACCTCGC GTCAAAGTAG  TAAACGAGTC AAAAGTTATG ACCGTTTTGG TCAAAGTTTG CGAAACTGAA ATTTCAGTGC TCCTGCTTGA GTTTGTTTCA ATTCGTTTTA TATGTTATAA AATGGTTTTG GATATGAAAT  TTTTATTAGA GACTGAATTG ATATTAAAGC TAAAATCTGC CAAATTTCGT GATTTAAGAA GCATTTTTTG ATTTATTAAA AATGTTTAAG TATAGTGTGT TTCGTAGAGT TGTTTTGAAG  GGGTTAAAGA CCTAATTTCA AGCTGGTCAA AAGATGAAAG TAGTTTATTT GTGGCTTGTC TAGTTGTGTA CCAAATATGG TATGCATTGA ATTTAAGAAT TTTGAGTTAA AGCTGTTTGT  AAATCTAGCC TGGTGGAATC TTGTGCATCT TTCTTTTCAT ATATGTTATG CTAGTTGCTA AAAATTGGTT GATAAAAATT TGCTTTTTAT CTTGTGATAT ATACTTCAAA TACAATTATG  CATATGTTGG ATTTATGAAC AATATTATTC ACTACTGAAT TTTATTTTAA TTACTCCTTG GTACACCAGA TTATAATTTG TTTTGATTTA TCAATGTTTA GGTGTATTAG GTAATTCTAG  TTTTAGCATG GATAAGAGCT GGTTAAATTT GGATCCAAGA AGCGAGGGGT ATCAAGGAGC TTATCAAAGA TCAGGTCGCT AACATGTATC TGTGGCCTAA GGGCGAATAT CGTTGACTCA  GAGTACCTCA AGGAAATCGA GAAAGCTCAT CGAGAACTAT GCGCTCTCAT CATAACTGTG CACCTATTAT GCTTCGCTTG GCTTGGCATG ACGCGGGGAC CTACAATGTG AATACGAAAA  CTGGAGGTCC AAATGGTTCG ATTCGGAACG AAGAGGAGTA CAATCATAGA GCTGACGTCT ACTTTCGATT GTCTGTTGCT ATTGTGTACT GCAATTTTTA TTTGAGATTT GACTTCACGA  GTTACGATGT CTATGCAATC GATTTCTGTT CTATCAATTG TATACTCGGC ATGAAATATT TCATTTTAAA AAATGGAAAG AACTTGTTTG ATTATCTGAT AGCAAGTCTT ATGATGTTAT  ATTTTCTGTA CCAGGATTCA TTCAATTTGT TGTTTATCAA AGTTTTTAAA AATTTGATCT TGATCTCTGG AAAGTATGTT ATACATTAAA TAATTGTTTT GTTCATCATG TATGCCGAAC  AACTCATTGC AAATGAAAAG GCTGCAGCAA GGAAGTTATT CTTTGGGACT ATGTTTCTAT ACTTCCAATA AAATGGTTGA TAAAAAAATA CTTTATGCAT CGATCCCGTT TATAACAGTT 
TTAGAAAACC TAAATACCAC ATCAAACGTT GTAAGAATTC ACAGATGATA AATATTTACC ACATACTCGA AAATGGTATC TGTA 

Retrieve as FASTA