Entry information : OcPrx28(OcIN23r2_Chr17g0406221)
Entry ID 16188
Creation 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: OcPrx28(OcIN23r2_Chr17g0406221)
Name OcPrx28(OcIN23r2_Chr17g0406221)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Orobanche
Organism Orobanche cernua    [TaxId: 53590 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value OcPrx28
start..stop
S start..stop
ThasPrx18 386 5e-135 1..340 1..340
NtPrx31-1A 385 9e-135 38..340 27..327
GmPrx17 383 1e-133 25..340 28..337
CpapPrx45 382 2e-133 13..340 15..342
Literature and cross-references OcPrx28(OcIN23r2_Chr17g0406221)
Protein sequence: OcPrx28(OcIN23r2_Chr17g0406221)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   341
PWM (Da):   %s   37522.68  
PI (pH):   %s   6.49
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYSRKQNYLS AYLCVILYVT SSINAFPGTG GYNDEHDLRY DYYDTSCPNL RTIVGLGVWM AIQNETRMAA SLLRLHFHDC FVNGCDASVL LDDTQTFEGE QNALINQNSI RGLDIIDNIK  ADVERHCPLT VSCADILALA ARAAVFQIGG PFWEVSLGRL DGLTANKQSV MDQLPSTFAP LQKIIAQFAT KGLDIKDMVA LSGSHTIGFA QCFVFRGRLY NFNGTGKPDP CLAPSLLSSL 
RETCPENDRK SACNLVPLDP KSECKFDNKY YKNILKNEGL LQSDQALMSV RETAELVDHY SKNLHRFLKD FAESMVKLGS LGVITASGGG EVRKHCGCVN S 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGAGAATG TGGTGAAAAA GCATCCACTA TCCAAGACCA CTATCCAAGA CCACCAATCG ATTCATTAAA TTCATCAAAT GTCTTTGCTA TAAATTGAGC CAAAACCTCA ACCCTAGTAA  TAATCAAGAG AAGAGAAAGA AAAGAAAAGA AAGAAACACG ACATATACGA TAATAAGCAA AAAAAAAAAA AAAAAATCAT AAGCAATGTA TTCGAGAAAA CAGAATTATC TATCGGCTTA  TTTGTGCGTA ATCCTATACG TAACATCTTC GATCAATGCC TTTCCTGGTA CCGGAGGTTA TAACGATGAA CATGATCTTC GTTATGACTA CTACGATACG TCTTGTCCTA ACTTACGGAC  CATCGTAGGA TTGGGTGTTT GGATGGCAAT TCAAAATGAG ACCAGAATGG CTGCTTCTCT ACTAAGGCTG CATTTTCATG ATTGTTTTGT AAATGTAAGA TACTCCCATA TTATGCTTTG  TGATTTGAAC AATCAAATAG GACTAATTAC AGAAAATACC CTAAAGTTTA ATCTAATTAC AAAAAAACCC AGCTAGCTAT GCTTTATGGT CTGTGCACTG CACACTTATG TTCTCAGGCC  CGGCCCAGTA TATGAAGCAA ATGAAACATT TGCCTCAGGC CCCCAATTGG ATTAGAAAAT AGGGGCCCAG TTTTTTAAAT TTTTTTTACT TTTTATGTAC AAAAAAAATT AGAAAATGTA  AAATTAGGCC CAATTTTAAT ATGTTTTATA TTATTGGATT TGGTAAAAAG TTAAAAAAAA TGAGCCTCAA ATTTGAAATT GTTTAATTAT GTACATATAA AAAATTAATT AAACAAATTA  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Retrieve as FASTA  
CDS
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ATGTATTCGA GAAAACAGAA TTATCTATCG GCTTATTTGT GCGTAATCCT ATACGTAACA TCTTCGATCA ATGCCTTTCC TGGTACCGGA GGTTATAACG ATGAACATGA TCTTCGTTAT  GACTACTACG ATACGTCTTG TCCTAACTTA CGGACCATCG TAGGATTGGG TGTTTGGATG GCAATTCAAA ATGAGACCAG AATGGCTGCT TCTCTACTAA GGCTGCATTT TCATGATTGT  TTTGTAAATG GATGTGATGC ATCAGTGCTT CTTGATGACA CACAGACTTT TGAAGGAGAG CAAAATGCTC TTATAAACCA GAACTCGATT AGGGGACTCG ACATTATCGA CAACATAAAG  GCGGATGTCG AGAGGCATTG TCCATTAACT GTATCATGTG CAGACATATT GGCTCTTGCA GCTAGAGCTG CTGTTTTTCA GATTGGTGGA CCTTTTTGGG AAGTTTCACT AGGCAGGCTG  GATGGGCTAA CTGCAAATAA ACAGTCAGTA ATGGACCAGC TTCCTTCTAC TTTTGCGCCT CTTCAGAAAA TCATTGCCCA GTTTGCAACA AAGGGTCTTG ATATCAAGGA CATGGTAGCT  CTATCAGGGT CTCATACTAT TGGCTTTGCT CAATGCTTCG TCTTCCGGGG CAGGCTCTAC AACTTCAACG GCACCGGAAA GCCGGACCCT TGCCTTGCCC CTTCACTACT CTCAAGCCTG  CGAGAGACGT GCCCGGAGAA TGACAGGAAG TCGGCATGTA ATTTAGTCCC TTTGGACCCT AAGAGCGAAT GCAAGTTCGA CAACAAGTAT TATAAGAACA TCTTGAAAAA CGAGGGGCTT  CTACAATCGG ACCAAGCGTT GATGTCGGTC CGAGAGACTG CCGAACTGGT CGACCACTAT AGCAAGAACT TGCATAGATT CTTGAAAGAT TTTGCGGAAT CAATGGTGAA GCTCGGGAGT 
CTAGGCGTTA TTACGGCATC AGGAGGAGGA GAGGTCAGAA AGCACTGTGG CTGTGTAAAC AGCTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGAGAATG TGGTGAAAAA GCATCCACTA TCCAAGACCA CTATCCAAGA CCACCAATCG ATTCATTAAA TTCATCAAAT GTCTTTGCTA TAAATTGAGC CAAAACCTCA ACCCTAGTAA  TAATCAAGAG AAGAGAAAGA AAAGAAAAGA AAGAAACACG ACATATACGA TAATAAGCAA AAAAAAAAAA AAAAAATCAT AAGCAATGTA TTCGAGAAAA CAGAATTATC TATCGGCTTA  TTTGTGCGTA ATCCTATACG TAACATCTTC GATCAATGCC TTTCCTGGTA CCGGAGGTTA TAACGATGAA CATGATCTTC GTTATGACTA CTACGATACG TCTTGTCCTA ACTTACGGAC  CATCGTAGGA TTGGGTGTTT GGATGGCAAT TCAAAATGAG ACCAGAATGG CTGCTTCTCT ACTAAGGCTG CATTTTCATG ATTGTTTTGT AAATGGATGT GATGCATCAG TGCTTCTTGA  TGACACACAG ACTTTTGAAG GAGAGCAAAA TGCTCTTATA AACCAGAACT CGATTAGGGG ACTCGACATT ATCGACAACA TAAAGGCGGA TGTCGAGAGG CATTGTCCAT TAACTGTATC  ATGTGCAGAC ATATTGGCTC TTGCAGCTAG AGCTGCTGTT TTTCAGATTG GTGGACCTTT TTGGGAAGTT TCACTAGGCA GGCTGGATGG GCTAACTGCA AATAAACAGT CAGTAATGGA  CCAGCTTCCT TCTACTTTTG CGCCTCTTCA GAAAATCATT GCCCAGTTTG CAACAAAGGG TCTTGATATC AAGGACATGG TAGCTCTATC AGGGTCTCAT ACTATTGGCT TTGCTCAATG  CTTCGTCTTC CGGGGCAGGC TCTACAACTT CAACGGCACC GGAAAGCCGG ACCCTTGCCT TGCCCCTTCA CTACTCTCAA GCCTGCGAGA GACGTGCCCG GAGAATGACA GGAAGTCGGC  ATGTAATTTA GTCCCTTTGG ACCCTAAGAG CGAATGCAAG TTCGACAACA AGTATTATAA GAACATCTTG AAAAACGAGG GGCTTCTACA ATCGGACCAA GCGTTGATGT CGGTCCGAGA  GACTGCCGAA CTGGTCGACC ACTATAGCAA GAACTTGCAT AGATTCTTGA AAGATTTTGC GGAATCAATG GTGAAGCTCG GGAGTCTAGG CGTTATTACG GCATCAGGAG GAGGAGAGGT  CAGAAAGCAC TGTGGCTGTG TAAACAGCTA GGCTGAGCAA TTTGGTTTGC CTTTAAGGTT TCTTGGAACA CCTCTAATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT  ATATTACTAT TAATGGAGTA ATAGTAATAT TTATCCTTTT GCTGTAATAA AATAAAGTAG ATTTTATCTG CTAAGACTTT GTTTTTGGTT GTGAATTGCC TAATATTAGT GTACTGAAAT 
ACTTATAATA TTAATCAATT TACTGATTAA TCGATTTTTT ATTTTATCGG TATATATTAG TAATTTGTTA GCTGTTAGTA GTTAGTTCAC AAAAACCGAA TACTCCAAGA CTT 

Retrieve as FASTA