Entry information : OcPrx30(OcIN23r2_Chr18g0422841)
Entry ID 16190
Creation 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: OcPrx30(OcIN23r2_Chr18g0422841)
Name OcPrx30(OcIN23r2_Chr18g0422841)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx026]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Orobanche
Organism Orobanche cernua    [TaxId: 53590 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value OcPrx30
start..stop
S start..stop
MguPrx13 581 0 1..341 1..347
VvPrx53 552 0 28..341 33..346
CclPrx92 551 0 3..341 20..356
CppPrx08 550 0 11..341 23..354
Literature and cross-references OcPrx30(OcIN23r2_Chr18g0422841)
Protein sequence: OcPrx30(OcIN23r2_Chr18g0422841)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   341
PWM (Da):   %s   37072.07  
PI (pH):   %s   9.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLTSTPIFT FISILLASHS LANAATKSNS TRRGYQLSVD YYAKTCPQVD QLVASITSQQ FKEAPISAPA TIRLFFHDCF VEGCDGSVLI SSKPGNKELA EKDAEDNKEL AVEAFESIKK  AKALVESKCP GTVSCADILA VAARDFVHLA GGPYYQVKKG RWDGKISMAS RVQSNLPRAN STVDELLKLF KSKGLTLEDL VILSGAHTIG FAHCRHFVSR LYDYKGTRQP DPSIDPRLLK 
ALKMSCPHSG GNADIVAPFD VATPFLFDNA YYGNLGAKMG LLASDQALFE DPRTNVLVQT MAKDKQKFLQ ALAVAMDKMG SIGVKRGRRH GEKRKDCSVH M 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
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GGAGGGAGTA CATTATAGGA TTAATTGCAA AAATTACCCC CTCAAGTTTT AGTACGATTA CAACAACAGC CACCCAGTTA TCTCTTAGAT TCTGAGGGGG TGATTTTTGT GATTATGCCA  AAATTAAAAG ATGAAACAAC TCTCACAAAA TGTGCATGTT TTCGATTTAT TACAAAACTC TAGACATCAC GAGAGTTGAT TCTCTCTATT TAATACTACA TACATCAACT TTTGTCCAAT  ACATTAGACA AAAGTTGGTT AAATTGTCCT AAAAGTTGAT CTCCAAGTCT ATATCCATCT CTGTCTCTCT CTCATGTCTC TCACCTCCAC TCCCATATTC ACCTTCATCT CTATATTGTT  GGCCTCTCAC TCTTTAGCAA ATGCTGCAAC AAAATCCAAT TCCACCCGGC GTGGCTACCA ACTATCTGTC GATTATTACG CGAAAACTTG CCCACAGGTC GATCAGCTTG TTGCTTCCAT  TACATCACAG CAGTTTAAGG AAGCACCCAT TTCCGCCCCT GCCACAATCC GCCTCTTCTT TCATGACTGT TTTGTAGAAG TAAGCATTTT TTATGATTGC CTAACAATTT TTTGTTATGC  AGACTTTTAA CATTTTTTAC AACAGTTTTA TGGGTTAATT ACCAAAATTA CCCAAAAATT TTGGCATAAT TACGAAAATA CCATCTTGAT TCTTGACATT TTGTTTCACT CTTACAAATG  AAGAGATGGG TGTTTGTTAA TTGTTAGGCA AATACAAACC TGATTGCAGT GGCTTGCAGT AGTACTCTAA GGGGTGGTAT TTGTATTTTG AAAGATAGCT GGAGTTTTTT CTTATTAAGA  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AATAAGAAAA AATGTGATTC T 

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CDS
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ATGTCTCTCA CCTCCACTCC CATATTCACC TTCATCTCTA TATTGTTGGC CTCTCACTCT TTAGCAAATG CTGCAACAAA ATCCAATTCC ACCCGGCGTG GCTACCAACT ATCTGTCGAT  TATTACGCGA AAACTTGCCC ACAGGTCGAT CAGCTTGTTG CTTCCATTAC ATCACAGCAG TTTAAGGAAG CACCCATTTC CGCCCCTGCC ACAATCCGCC TCTTCTTTCA TGACTGTTTT  GTAGAAGGGT GTGATGGATC AGTACTAATA TCATCTAAGC CTGGGAACAA AGAATTAGCA GAAAAGGATG CAGAGGATAA CAAGGAGTTG GCAGTGGAGG CTTTTGAGAG CATAAAAAAG  GCTAAAGCAT TGGTGGAGAG CAAGTGCCCT GGAACTGTGT CCTGTGCAGA CATTCTCGCC GTTGCTGCTA GAGATTTTGT CCATTTGGCT GGAGGTCCAT ATTATCAAGT TAAAAAAGGC  AGATGGGATG GAAAAATTTC AATGGCTTCA AGAGTACAAT CCAACCTCCC TCGCGCAAAC TCAACCGTGG ATGAGCTTCT GAAGCTCTTC AAGTCCAAAG GCCTAACACT TGAAGACTTA  GTTATCCTCT CAGGCGCTCA CACCATAGGC TTTGCTCATT GCAGGCATTT TGTGAGCCGA TTATACGACT ACAAGGGCAC GAGACAACCT GACCCTTCTA TCGATCCAAG ACTTCTTAAG  GCCCTCAAGA TGTCGTGTCC TCACTCCGGA GGGAATGCTG ACATCGTGGC ACCATTTGAT GTCGCGACCC CTTTTTTGTT CGACAATGCC TATTACGGGA ACTTGGGAGC TAAGATGGGG  TTGCTGGCCT CTGATCAGGC CCTCTTTGAG GATCCTAGGA CTAATGTCTT GGTCCAGACA ATGGCTAAGG ACAAGCAAAA GTTTCTTCAA GCACTTGCTG TGGCTATGGA TAAAATGGGA 
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cDNA
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AGTGTGCAAA CCTTTTTTTT TTTTGAAATA AGAAAAAATG TGATTCT 

Retrieve as FASTA