Entry information : CausRboh02
Entry ID 16202
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CausRboh02
Name CausRboh02
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Castanospermum australe    [TaxId: 24962 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CausRboh02
start..stop
S start..stop
CcaRboh02 1677 0 1..937 1..941
CausRboh01 1640 0 1..937 1..928
CcajRboh05 1630 0 1..937 1..920
LjRboh01 1626 0 1..937 1..930
Literature and cross-references CausRboh02
Protein sequence: CausRboh02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   937
PWM (Da):   %s   104956.91 Transmb domain:   %s   o371-393i453-475o513-535i548-570o585-602i738-755o
PI (pH):   %s   9.4
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAGEAGGVS ADLHHRESDI ELVGGERVAH SGPLSGPLNK RVGRRSAKLS FSESGAGIDV GHGSGSHAQD QDEADYVEVT MAIQGDSVAL HSVKAVDGND LGEDQKLILL GKGLEKKRSF  GASVVRNASI RMKQVSQELK RFASFSKQAP SKRYDRTKSA ASHALKGLKF ISRTDGGAGW AEVEKQFDIL TATTDGYLHR SLFAKCIGMN KESEAFAGEL FDALARKRNI PGDSINKAQL  KDFWDQISDQ SFDSRLRTFF DMVDKDADGR ITENEIREII CLSATTNKLS NIQKQAEEYA ALIMEELDPD DTGFIMLDNL EMLLLHGPSH SARGDSKYLS QMLSQKLKPT YVDNPIRRWY  RDTNYFLQDN WQRAWVLVLW IGVMSGLFAY KFVQYRRKAA YEVMGHCVCM AKGAAETLKL NMALILLPVC RNTITWLRNK TKLGVMVPFD DNLNFHKVIA VAVAIGVGIH AIYHLACDFP  RLLHASDEKY KLMQPFFGDQ ASNYWHFVKS WEGVTGIIIV VLMAIAFTLA TPWFRRGRIK LPKPLNNLTG FNAFWYSHHL FIIVYALLIV HGIKLYLTKE WYKKTTWMYL AIPITIYALE  RLTRALRSSI KPVRILKVAV YPGNVLALHM SKPQGFRYKS GQYMFVNCAA VSPFEWHPFS ITSAPGDDYL SVHIRTLGDW TRSLRAKFSE VCQPPNNGKS GLLRAEYLQG DSSPSALPKV  LIDGPYGAPA QDYKQYEVVL LVGLGIGATP MISILKDIVN NFKAMEEEEG TAIEEGVISG LGGKSPRPTQ QKKAIFSNFK TRRAYFYWVT REQGSFDWFK GVMNEVAEED HRGVIELHNY 
CTSVYEEGDA RSALIAMLQS LNHAKNGVDI VSGTRVKSHF AKPNWRSVYK RIALNHPQAR VGVFYCGPPA LTKELRQLAS DFSHNTTTKY DFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Casaus_Castanospermum04089-PA
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCAG GCGAGGCTGG AGGAGTTTCT GCAGATCTTC ATCATCGTGA ATCGGATATA GAACTCGTCG GTGGTGAAAG GGTGGCTCAC AGTGGTCCAC TCAGTGGACC TCTGAACAAA  AGGGTTGGCA GGAGGAGCGC CAAGTTGAGC TTTTCTGAGT CCGGCGCTGG CATTGATGTT GGGCATGGCA GTGGCAGCCA CGCCCAGGAT CAAGATGAAG CAGACTATGT TGAGGTCACT  ATGGCTATTC AAGGTGACTC TGTTGCTTTG CACAGCGTTA AAGCTGTTGA CGGCAATGAT CTTGGAGAAG ATCAGAAACT AATTTTGCTT GGCAAGGGCC TCGAGAAGAA AAGATCCTTC  GGTGCCTCGG TTGTGCGAAA TGCTTCCATT CGCATGAAGC AGGTGTCTCA GGAGCTGAAG CGTTTCGCTT CCTTTTCAAA ACAAGCACCA TCAAAGCGCT ATGATAGGAC CAAGTCTGCA  GCGTCTCATG CTCTGAAGGG ACTCAAGTTT ATCAGCAGGA CCGATGGCGG TGCAGGGTGG GCTGAGGTTG AGAAGCAGTT TGACATTCTT ACTGCTACCA CTGATGGGTA TCTTCATCGT  TCTCTCTTTG CCAAATGCAT AGGAATGAAC AAGGAGTCTG AGGCATTTGC AGGGGAGCTG TTTGATGCCC TTGCTCGTAA GAGGAATATT CCGGGGGATT CCATTAACAA GGCCCAGTTG  AAGGATTTCT GGGACCAGAT TTCTGACCAG AGCTTCGATT CTAGGCTCAG AACATTCTTT GACATGGTTG ATAAAGATGC GGATGGCAGA ATCACCGAAA ATGAAATTAG AGAGATTATC  TGCCTTAGCG CCACTACCAA CAAACTCTCA AACATCCAGA AGCAAGCAGA GGAATATGCG GCTTTGATCA TGGAAGAACT AGACCCAGAT GACACAGGAT TTATCATGCT GGACAACCTG  GAGATGCTCT TGTTGCATGG ACCCAGCCAT TCTGCAAGAG GAGATAGTAA GTACCTGAGC CAAATGCTAA GCCAAAAGCT TAAGCCTACA TATGTCGACA ATCCTATTAG GAGGTGGTAC  AGAGATACCA ACTACTTCCT GCAGGACAAT TGGCAGAGAG CTTGGGTATT GGTACTGTGG ATTGGTGTGA TGTCAGGTCT ATTTGCCTAT AAATTCGTGC AGTATAGAAG AAAAGCTGCG  TATGAGGTGA TGGGCCATTG TGTATGCATG GCCAAAGGTG CAGCTGAGAC ACTTAAATTG AACATGGCTC TTATCTTGTT GCCTGTTTGC CGGAACACCA TCACCTGGCT CAGGAATAAG  ACCAAGCTAG GCGTTATGGT TCCTTTTGAT GACAACCTTA ACTTCCACAA GGTGATAGCT GTGGCAGTAG CAATTGGTGT TGGGATACAT GCTATTTATC ATCTTGCTTG TGACTTTCCT  CGCCTTCTTC ATGCAAGCGA TGAAAAGTAC AAGCTCATGC AACCTTTTTT CGGAGATCAA GCATCAAATT ATTGGCATTT TGTCAAATCA TGGGAAGGAG TAACAGGGAT TATAATAGTT  GTGCTAATGG CAATAGCCTT CACGCTGGCC ACCCCTTGGT TCAGGAGAGG CAGGATCAAA CTACCCAAAC CCCTCAACAA TCTCACTGGT TTCAATGCCT TTTGGTATTC CCATCACCTC  TTCATAATTG TCTATGCCCT GTTGATTGTG CATGGAATCA AGCTTTACTT GACTAAGGAA TGGTACAAGA AAACGACCTG GATGTATCTG GCTATTCCCA TCACCATTTA TGCATTGGAA  AGACTCACTA GAGCACTCAG ATCTAGCATC AAGCCTGTGA GAATATTAAA GGTGGCTGTT TATCCTGGAA ATGTGTTAGC TCTTCACATG TCAAAGCCTC AGGGGTTTAG ATACAAGAGT  GGACAATACA TGTTTGTCAA TTGTGCTGCT GTGTCTCCAT TTGAATGGCA TCCATTTTCT ATAACCTCCG CCCCTGGTGA TGACTACCTT AGCGTTCACA TCAGAACATT AGGTGATTGG  ACCCGGAGTT TGAGAGCCAA ATTCTCAGAG GTGTGCCAGC CACCCAACAA CGGGAAGAGT GGACTTCTAA GAGCTGAATA CTTGCAGGGA GATAGCAGCC CAAGTGCTCT TCCCAAAGTT  CTGATTGATG GTCCTTATGG AGCGCCGGCA CAAGACTACA AGCAGTATGA GGTGGTTTTG CTGGTGGGGC TGGGAATTGG GGCTACCCCA ATGATCAGTA TACTGAAGGA CATAGTGAAT  AATTTCAAGG CCATGGAAGA GGAGGAAGGG ACCGCAATAG AGGAGGGAGT AATAAGTGGG TTAGGTGGTA AGTCACCAAG ACCAACCCAA CAAAAGAAAG CCATTTTCAG CAACTTTAAG  ACTAGGAGGG CCTACTTCTA CTGGGTGACC AGAGAGCAGG GTTCCTTTGA CTGGTTTAAA GGGGTGATGA ACGAGGTTGC CGAAGAAGAC CACAGGGGAG TGATTGAGCT CCACAACTAC  TGCACCAGCG TCTATGAAGA GGGTGACGCG CGCTCTGCAC TCATTGCCAT GCTGCAATCT CTGAACCATG CAAAGAATGG CGTGGACATT GTCTCTGGCA CGCGCGTCAA GTCCCACTTT  GCCAAACCCA ATTGGCGCAG TGTCTACAAG CGCATTGCTC TCAATCATCC ACAAGCCCGC GTTGGGGTAT TTTACTGTGG ACCACCCGCG CTCACCAAAG AGCTTCGTCA GCTAGCTTCG  GATTTCTCTC ACAACACAAC CACCAAATAC GACTTCCATA AAGAGAATTT CTGATAAAAT GGACATTATT GAGGGAACAG GAGAAGCTGG TCATGTGGGA ACGAGCTGGT CTTCCACCTT  GATCCCCCCA TCATGACGAT TCCACCATGT CCATGTACAG TCTCTTGTTG CTAATACCAA CACGTGTGTG AGTAACATTA GTTAATAGCT TTGTAAAACG ACGAACGTTG AGGTAGGTTA  AAAGGTTCAG TGGTGAGTTG GCCACCAAGT ACCAAAGGTG TGGTTGGATG GTCAGGGCGC GATCCAAACA ATTCAAGCAG CAATAGCTTG AGAAGGGGAT TGGCAGAAAA TAGAAGTGGA  GGGGGAAATA ATCTGTCCAA CCAGAACGTG CCCAGTAACT ATATTTTAGG GGATATATAT TCTCGGGTTG GGTTGAGTTA ATTTGCAGGG GAGTTACATT AGTAAACTTT ACCCGAACCA  ATTCAACTTC ACTGTAAGTT TTGACTTTAA AAAAAAAAAT TTCAGATATG TGCCTGATAC CTGATTTTAC GAGCTTATGA GCACAGCAGA GAAAGAAAGT AAACCTCCAC TCACTTCAGA  AAGCAAAAGT AATTTTTGTC AGCCTTAACC ACACAGATCA AACACACCGT TTCTATTATT TTTTTCCCTC CCCTCATCTT GCACTCTCAC ATCTCTTCAT GGTATCCCTT TTTTTTTCAA 
TCTCTCTCTT TTGAAGCCTT TGGTCTTGTG TGTAGCTGTA GCTCAAAGAG TTAGATTGAA TGCTTTGCTC TATTTGATTT GCCTTGAACT TTAATTCAAC CGTAGCTTTG TCCACTTTA 

Retrieve as FASTA