Entry information : CroPrx68(CRO_T001743)
Entry ID 16275
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx68(CRO_T001743)
Name CroPrx68(CRO_T001743)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx68
start..stop
S start..stop
CroPrx48 473 1e-169 40..341 14..315
VvPrx27 441 9e-157 12..341 13..332
VvPrx39 440 2e-156 14..341 5..322
NnPrx44 439 7e-156 12..341 14..339
Literature and cross-references CroPrx68(CRO_T001743)
Protein sequence: CroPrx68(CRO_T001743)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   341
PWM (Da):   %s   36763.68  
PI (pH):   %s   8.61
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDSQRYSQLG LVVLFCLILS HFESIEAYPA AAAPLPKLTV GYYYKTCPDA EAIVRKAVNK AVSRNPGIGA GLLRMHFHDC FVRGCDGSVL LDTVPGGPAA EKDHPANNPS LRGFEVIDEA  KAEIESLCPN TVSCADIVAF AARDSILKLG GITYSVPSGR RDGRISLSSD IPQNLPAPSF NTSQLEASFK RKGFSLDEMV TLSGAHSIGV SHCSSFSNRL YNFNATNPQD PDLNPVYAAY 
LKTKCPPLSN VIGVNPTVNN DFTTPNRLDN KYYSNLIIKS GLLSSDQTLM SRSSTSKLVL NNAKYGRIWA SKFAAAMVKL GTTDVIIGKN GEIRKNCHFV N 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequnce from gneomic
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCTC AGAGATATTC TCAGTTAGGT CTAGTAGTAC TATTTTGCTT GATTTTGTCA CATTTTGAAT CCATTGAGGC TTATCCAGCT GCAGCTGCTC CTTTACCAAA ACTAACAGTT  GGTTATTACT ACAAAACATG TCCTGATGCT GAGGCAATTG TTAGAAAAGC TGTGAATAAG GCCGTTTCGA GAAATCCAGG CATTGGTGCT GGCTTACTCA GGATGCATTT TCATGACTGC  TTCGTTCGGG TACGTTAAGA ATATCATTTC TCACATTATT AATGCATATA AGGAACCAAA AGGAGCGGAC ATCCACCCTC GACCCTCCAA CATTTCTTAA TTTTGACATT TCATTCTTAA  ATTTCATAAA AATTAAATTA TTTGTGAGAC ATGGTTCTAA AGTAAAAATT TTGTATGCGT TTTATCAGTA TAATTCCGTC TAAATGTTAA AATTATATTT TGCGCTTATT ACAAAATACC  ACTTAGAAGT AAGGGAGTAA GAGCATTTTA CTATCTAAAC TTAAAATATA TGCTCTTTAC CCTCTGAAAT CAATAGTAAA GAATCAATTT AAGTAAAATG TCCAAAATAC CTTTCATGTA  AATTATAATC TATTGCAAAA TAGTTCCGCA AAATTAAGTG TAAAGTGATT TTATTACCTA CCATAATTTA TAGTTATGAT TTATTACAAA CATTATACAA TGAAAGTTTA ACATTTTAGA  TCATAGATAT AAATATATAT GTGAGAAATC GAACCTTGCT AAATTTTTGT ATTGCTTATT TACTATTTTT CTTATTATAT ATTTTTAAGT TCTTCAATGT CCGTTCCTAA ACAAGCAGTT  GCAGAACCTT ATGTACTTTA ACCCCCAAAC TTCTCAAGTT ATTCTATCGA GGTATATATA AAAGTTTATA TAATTTCTAT TATGAGCCTA TTCATACTTT TATTTTTTCT TTGAAAAATC  ATTCCAAAGC CTCAAATGTT ATGAATTATC CTAAAAGGTA TATATTTTTT GTTTATACCC CAATACTCAT AATTCTAATT TCCCCATTAC TAACAAGCGG CATCACTGTA AATTTAGGCC  CAACATCAAA TATACCATCA ACAGTTAAAG TTCTAATTCA TTCTATCAGT CTAGCTATGT ATTAATGACT CAACAAACTG AAAAATGTCT AATTGCAAAT TTTTTTCCAT TAATTTGCTA  ATCATGTTAT TGTTTTTTTG ATAAATTAAG GGCTGTGACG GTTCTGTGTT ATTGGACACA GTACCAGGAG GACCAGCAGC AGAAAAAGAC CATCCAGCTA ACAATCCAAG TCTACGCGGA  TTCGAAGTAA TTGACGAAGC AAAGGCCGAA ATAGAATCCC TATGTCCAAA CACCGTATCA TGTGCAGACA TTGTTGCCTT TGCTGCCCGT GACAGCATCC TTAAACTTGG AGGAATAACC  TATTCCGTCC CTTCTGGACG CCGAGATGGA CGTATTTCAT TAAGTTCCGA TATTCCCCAA AATCTCCCTG CTCCTTCATT TAATACCAGC CAACTTGAAG CCAGTTTCAA AAGAAAAGGA  TTTTCACTTG ATGAAATGGT TACCCTTTCT GGGGCACATT CAATTGGGGT CTCACATTGT TCTTCTTTTT CCAACCGGCT TTATAATTTT AATGCCACAA ATCCACAAGA CCCGGATTTG  AATCCGGTTT ATGCTGCTTA TTTGAAAACT AAATGCCCTC CATTAAGTAA TGTCATTGGT GTTAATCCAA CGGTGAATAA TGATTTTACA ACACCTAATC GATTGGATAA TAAATATTAT  TCCAATTTAA TAATTAAAAG TGGTTTATTG AGTTCTGATC AGACATTGAT GAGTAGGTCT TCAACTTCTA AGTTGGTTTT GAATAATGCT AAATATGGTA GAATTTGGGC TTCTAAATTT 
GCTGCTGCGA TGGTGAAATT GGGTACTACT GATGTGATCA TTGGTAAGAA TGGGGAGATC AGGAAAAATT GCCATTTCGT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCTC AGAGATATTC TCAGTTAGGT CTAGTAGTAC TATTTTGCTT GATTTTGTCA CATTTTGAAT CCATTGAGGC TTATCCAGCT GCAGCTGCTC CTTTACCAAA ACTAACAGTT  GGTTATTACT ACAAAACATG TCCTGATGCT GAGGCAATTG TTAGAAAAGC TGTGAATAAG GCCGTTTCGA GAAATCCAGG CATTGGTGCT GGCTTACTCA GGATGCATTT TCATGACTGC  TTCGTTCGGG GCTGTGACGG TTCTGTGTTA TTGGACACAG TACCAGGAGG ACCAGCAGCA GAAAAAGACC ATCCAGCTAA CAATCCAAGT CTACGCGGAT TCGAAGTAAT TGACGAAGCA  AAGGCCGAAA TAGAATCCCT ATGTCCAAAC ACCGTATCAT GTGCAGACAT TGTTGCCTTT GCTGCCCGTG ACAGCATCCT TAAACTTGGA GGAATAACCT ATTCCGTCCC TTCTGGACGC  CGAGATGGAC GTATTTCATT AAGTTCCGAT ATTCCCCAAA ATCTCCCTGC TCCTTCATTT AATACCAGCC AACTTGAAGC CAGTTTCAAA AGAAAAGGAT TTTCACTTGA TGAAATGGTT  ACCCTTTCTG GGGCACATTC AATTGGGGTC TCACATTGTT CTTCTTTTTC CAACCGGCTT TATAATTTTA ATGCCACAAA TCCACAAGAC CCGGATTTGA ATCCGGTTTA TGCTGCTTAT  TTGAAAACTA AATGCCCTCC ATTAAGTAAT GTCATTGGTG TTAATCCAAC GGTGAATAAT GATTTTACAA CACCTAATCG ATTGGATAAT AAATATTATT CCAATTTAAT AATTAAAAGT  GGTTTATTGA GTTCTGATCA GACATTGATG AGTAGGTCTT CAACTTCTAA GTTGGTTTTG AATAATGCTA AATATGGTAG AATTTGGGCT TCTAAATTTG CTGCTGCGAT GGTGAAATTG 
GGTACTACTG ATGTGATCAT TGGTAAGAAT GGGGAGATCA GGAAAAATTG CCATTTCGTC AACTAA 

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