RedOxiBase: View Perox 16306

Entry information : AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)

Entry ID	16306
Creation	2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes	2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2020-05-23 (Christophe Dunand)

Peroxidase information: AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)

Name

AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)

Class

Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh001]

Taxonomy

Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons

Organism

Arachis duranensis [TaxId: 130453 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	AdurRboh06 start..stop	S start..stop
AipaRboh09	1871	0	1..973	1..971
CausRboh02	1534	0	13..973	14..937
NschRboh02	1526	0	1..973	1..930
AeveRboh01	1511	0	12..973	14..938

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	205..940	736	N° 2	1118..1280	163	N° 3	1393..1441	49	N° 4	1600..1713	114
N° 5	2052..2477	426	N° 6	2710..3093	384	N° 7	3622..3717	96	N° 8	3838..3953	116
N° 9	4090..4192	103	N° 10	4524..4597	74	N° 11	6168..6718	551	N° 12	7477..7586	110
join(205..940,1118..1280,1393..1441,1600..1713,2052..2477,2710..3093,3622..3717, 3838..3953,4090..4192,4524..4597,6168..6718,7477..7586)

Literature and cross-references AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)

Cluster/Prediction ref.	Genebank: 107463420

Protein sequence: AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	973
PWM (Da):	108780.01
PI (pH):	9.22

Sequence 1258
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MEKSDEDFYNRHHHRRDNSDIELVAGDRVPHSGPLSKRLARRSSKLNNNNNNEALVVHGNDDVITSTSSSCKQQVDHDDGGGQDYVEVTMDIHGGSVALHSVKDVSGNDLNEDDKLVLLGKGMEKKRSFGATVVRTASIKMKQVSQELKRLASISSKQTAPSSSSDAAAAARRGHYDRTKSAASSALKGLKFIAKGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGWHEVEKQFDVLTASTDGWLHRSLFGKCIGMSKESEAFAGVLFDSLARRRDIHGDSINKAQLKDFWDQISDQSFDSRLRTFFDMVDKDADGRITEEEIKIICLSATTNKLSNIQLQAEEYAALIMEELDPEETGFIMLDSLEMLLLHGPSHSTRGDSKYLSQMLSLKLKPTYEDSAVRRCYTNTKYFIQDNWQRTWVMALWICVMLGLFAYKFIHYRRRKDVYHVMGYCVCMAKGAAETLKLNMAIILLPVCRNTITWLRNKSKLGIMVPFDDNLNFHKVIAVAVAIGVGIHAIFHLSCDFPRLLRASPQKYKPMVQYFGPQPKSYWHFVKTWEGVTGIIMVVLMAIAFTLASPWFRRGRVKLPKPLNSLTGFNAFWYSHHLFVIVYASLIVHGIKLFMTKEWYEKTTWMYLAIPMTIYSLERLTRALRSSIKPVKILKVAVYPGNVLALHMSKPQGFRYKSGQYMFVNCAAVSPFEWHPFSITSAPEDNYLSVHIRTLGDWTRSLRTKFSVCQPPNNGKSGLLRAECMTGDCCPSTFPKVLIDGPYGAPAQDYKQYEVVLLVGLGIGATPMISILKDIVNNYKAMEEDELGSTMEEGGVTSSDNKSPKRRGNLVNFKTRRAYFYWVTREQGSFDWFKGVMNEVADADRRGVIELHNYCTSVYEEGDARSALIEMLQSLNHAKNGVDIVSGTRIKSHFAKPNWRSVYKRIALNHPHARGVFYCGPPALTKELRQLASDFSHNTTTKYDFHKENF

Retrieve as FASTA

Remarks

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGAAAAATCTGATGAAGATTTTTATAACCGTCACCACCACCGTCGTGATAATTCCGACATAGAACTCGTCGCCGGTGATAGAGTTCCTCATTCTGGCCCTCTAAGCAAAAGACTGGCA
AGAAGAAGTTCCAAGTTGAATAATAATAATAATAATGAAGCTCTTGTTGTTCATGGAAATGATGACGTCATCACTTCAACTTCTTCTTCTTGTAAGCAACAAGTGGATCATGATGATGGA
GGAGGACAAGACTACGTTGAAGTCACAATGGACATTCATGGCGGTTCCGTTGCGCTTCACAGCGTCAAAGACGTTTCAGGTAACGACCTTAACGAAGACGACAAGCTTGTTCTTCTCGGT
AAAGGAATGGAGAAGAAGAGATCCTTTGGTGCTACTGTCGTTAGAACCGCTTCCATTAAAATGAAGCAGGTTTCTCAAGAACTCAAACGACTCGCTTCGATTTCTTCGAAACAAACAGCA
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GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAGGGTGGCATGAAGTGGAGAAGCAGTTTGATGTTCTTACTGCTTCAACTGATGGATGGCTTCATCGTTCTCTC
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CCTTTCCTAGCTTTGCATTTTGTTCCCATGAGAATAGGAGTTTCCTTGATCACAAATGATCAATTCTGTTTTCAGATCATCTGCCTTAGTGCCACAACAAACAAACTCTCAAACATACAG
CTGCAGGCTGAAGAATATGCAGCTTTGATCATGGAAGAACTAGACCCTGAAGAGACAGGATTTATCATGGTATTTACATCATCCTATTTCATATCGTTTTGGTATAAAACTTATCAAAAT
TAAGTAAAATTAGTCACTATTACAGTTTCACATACAGATAAGTACTAATATTTCAAATCATAAGTAAGAAGTTGATTTATATGTAAGATGATGAGAGGGACTGATTTCACTTGTATTTAG
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ATCTCATTTATTTGGCCAATTGGTGATTATTATTACTGCTTCATCAGCTGGATAGCCTAGAGATGCTCTTATTGCATGGACCAAGTCATTCTACAAGAGGTGATAGCAAGTACCTAAGCC
AAATGCTAAGCTTGAAACTGAAGCCTACATACGAAGACAGTGCTGTTAGGAGGTGCTATACAAACACCAAGTACTTCATACAGGACAACTGGCAAAGAACTTGGGTTATGGCACTGTGGA
TTTGTGTGATGTTAGGTTTATTTGCCTACAAATTCATACACTATAGAAGGAGAAAAGATGTATATCATGTTATGGGGTATTGTGTATGCATGGCCAAAGGTGCAGCTGAGACACTTAAAT
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TTTTCACTTGCACCAAATCTTTGTTGGGACTTGTGTGTTTTCACAAGTCAAATTGTCAAAAGGGTATGAAGAATATTTGGAGTGTTTCATGATTTAGAAGTGGCAAATTTGCTTCTCAAG
GAACATATTGTTTCTCAAGATTCCCTTGCTGAATAAATGTGTCACCATTTAAATAAAGTTAGTAGTACAAATAAAGTGAGGGTATATATGTTGTTGTTCTTGCAGGTGATAGCTGTGGCA
GTAGCAATTGGTGTTGGAATACATGCAATTTTTCATCTTTCTTGCGACTTCCCTCGCCTCCTTCGTGCAAGCCCTCAAAAGTACAAGCCAATGGTACAGTATTTTGGACCTCAACCAAAA
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AAACCACTCAACAGTCTAACTGGCTTCAATGCATTTTGGTACTCACATCATCTCTTTGTCATTGTCTATGCCTCGTTGATTGTTCATGGAATCAAACTTTTCATGACCAAAGAGTGGTAC
GAGAAAACGGTTAGTAACTTCGATCCCTTTTCCTTTGTATAAATTGCACTGACACTTTCCTGAGGTTAAAGTTAAATTATATACAACACTTTATTTTTTTAATGTTTGCATTGACTTTGT
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AAACTAATTCAATATTTAATAAAGATTGAGTTAGTTTGACAAAATTACTTAATGAATTATCCAATTTTAGTTTACATCTTTGTTGGTTATTAGAAATGATAGTTTATTTTTATTTGTTAT
CTTTTATTTATCTTTTTTACCCTGCAAAATTTGATGTTGTATGAATATGTTTTGTAGACTTGGATGTACTTGGCAATTCCCATGACCATTTATTCATTGGAAAGACTAACTAGAGCACTA
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AATTGTGCTGCTGTATCACCATTTGAATGGTATGATGAATAATTTGGAGAAACCTAAGTAACTTTTTTGTTATATAGAAATTTTGCTTCTTAGTTTCTTTCATATAACTTTTAGTAGTAT
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TAAATCTTAATAATCAAAGTGACCAAATCTAATAAATGTTAATAATGATTGTTAATGAAAACATGTGGTTAGTTGTTATTCGGATCTTGGAAGGTTGATAAGGACTCCAGTTGAAAATCC
TTGCCTGTGTGTGGTAGGTAGTCAAACCAATCAAATTTCTGTATTCATGAAATAGTTGAATCAATCAATGCGTAACTAATTATAATAGAGAAAGCTGTGTAGAAGTAGAACTGTAGCTTG
TGATGAAATAGTTGAGTAGATTGACATTTTCTTCTTGAACTACAATCAAGATTTTATAATTGTTTTTATGTGAATTTTTTTTAATTTTTGGATCATAGATTGTATAGTTAGATTTTGATA
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GATGAATTAGGGTCCACCATGGAAGAAGGAGGAGTAACATCAAGTGATAACAAATCACCAAAAAGGAGGGGTAATTTGGTAAATTTCAAGACTAGGAGGGCTTACTTCTATTGGGTGACA
AGGGAACAAGGTTCATTTGATTGGTTCAAAGGTGTAATGAATGAGGTTGCTGATGCTGATCGTAGAGGAGTGATTGAGTTACATAACTATTGCACTAGTGTTTATGAAGAAGGTGATGCT
CGTTCAGCCCTAATTGAAATGCTTCAATCCTTAAACCATGCTAAGAATGGTGTTGACATTGTTTCTGGGACAAGGATTAAGTCTCACTTTGCCAAACCTAATTGGCGAAGTGTTTACAAG
CGTATTGCACTAAATCATCCACATGCTCGCATTGGTGAGTTTTCTTTGCAAAATTTATAGAATTTTTATACCTATATTTCTTTATTCTTTGCTTTTTCCAAAATTTTAAAGGAAAAAAAA
ATTAAAGTTAAAAGAAAACTAAAATCAGAAAAATTAAACAAATCAAAATTTTTCTCCTTATTTTCTAAAGAGTAAATAACAATTTTGACACTTAAAAAAATTTTAAGACAAAATAGACTT
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AAGTTTATTTTATCAAAAATAAAAGTTAAAATCCATTTATCAAAACAAAATTGTGTTGAGTGCTGAAATAATTATTTACTCTTTCCTAAATAAAGTTGCATAGAAAGAAGAATATGTCTA
AAAGATTTTTGATAGATATAGAGATTATCTCTAGATGAGATAAGCATGATCATTAGATGACATTAGCAATAAACACATATTATATGATTCTAACAACTTACAACCAAACCTTTTTCCTTC
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CTAACATCTGCCTAATAATGTCTGCATCATAACAAAAAGCATAATGTTTCGTGTTTGCAATAATGTATGTAGGGGTTTTCTATTGTGGTCCACCAGCACTAACAAAGGAGCTTCGTCAGC
TAGCTTCAGATTTTTCACACAACACAACGACCAAATATGATTTCCATAAGGAGAATTTCTAA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA