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Entry information : AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)
Entry ID 16306
Creation 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)
Name AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Arachis duranensis    [TaxId: 130453 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AdurRboh06
start..stop		 S start..stop
AipaRboh09 1990 0 1..973 1..971
CausRboh02 1534 0 13..973 14..937
NschRboh02 1526 0 1..973 1..930
AeveRboh01 1511 0 12..973 14..938
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 205..940 734 N° 2 1118..1280 161 N° 3 1393..1441 47 N° 4 1600..1713 112
N° 5 2052..2477 424 N° 6 2710..3093 382 N° 7 3622..3717 94 N° 8 3838..3953 114
N° 9 4090..4192 101 N° 10 4524..4597 72 N° 11 6168..6718 549 N° 12 7477..7586 108
join(205..940,1118..1280,1393..1441,1600..1713,2052..2477,2710..3093,3622..3717, 3838..3953,4090..4192,4524..4597,6168..6718,7477..7586)


exon

Literature and cross-references AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)
Cluster/Prediction ref. Genebank:   107463420
Protein sequence: AdurRboh06(aradu.Aradu.JTK38.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   973
PWM (Da):   %s   108780.01 Transmb domain:   %s   o412-431i492-514o552-574i587-609o
PI (pH):   %s   9.22
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEKSDEDFYNRHHHRRDNSDIELVAGDRVPHSGPLSKRLARRSSKLNNNNNNEALVVHGNDDVITSTSSSCKQQVDHDDGGGQDYVEVTMDIHGGSVALHSVKDVSGNDLNEDDKLVLLG
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YWVTREQGSFDWFKGVMNEVADADRRGVIELHNYCTSVYEEGDARSALIEMLQSLNHAKNGVDIVSGTRIKSHFAKPNWRSVYKRIALNHPHARGVFYCGPPALTKELRQLASDFSHNTT
TKYDFHKENF

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAAAATCTGATGAAGATTTTTATAACCGTCACCACCACCGTCGTGATAATTCCGACATAGAACTCGTCGCCGGTGATAGAGTTCCTCATTCTGGCCCTCTAAGCAAAAGACTGGCA
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TGTATAGTTAGATTTTGATATTTATAAAAGTGTTGTTTTTATTTAAAATGTCATTAAATAAATAATCACACTTTTAAACAAAGTATCTTCGTGAAAAGATGTTTTTGCCATCTTCATTTG
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TAATTGATGGTCCATATGGAGCCCCAGCACAAGACTACAAACAATATGAAGTGGTTCTATTGGTAGGGTTGGGAATTGGGGCCACCCCTATGATCAGCATACTGAAGGACATAGTGAACA
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CTTACTTCTATTGGGTGACAAGGGAACAAGGTTCATTTGATTGGTTCAAAGGTGTAATGAATGAGGTTGCTGATGCTGATCGTAGAGGAGTGATTGAGTTACATAACTATTGCACTAGTG
TTTATGAAGAAGGTGATGCTCGTTCAGCCCTAATTGAAATGCTTCAATCCTTAAACCATGCTAAGAATGGTGTTGACATTGTTTCTGGGACAAGGATTAAGTCTCACTTTGCCAAACCTA
ATTGGCGAAGTGTTTACAAGCGTATTGCACTAAATCATCCACATGCTCGCATTGTGGTGAGTTTTCTTTGCAAAATTTATAGAATTTTTATACCTATATTTCTTTATTCTTTGCTTTTTC
CAAAATTTTAAAGGAAAAAAAAATTAAAGTTAAAAGAAAACTAAAATCAGAAAAATTAAACAAATCAAAATTTTTCTCCTTATTTTCTAAAGAGTAAATAACAATTTTGACACTTAAAAA
AATTTTAAGACAAAATAGACTTCGATTTTTGTTTTTGACAAAATAAATTTTTAAATATCAGTTCTGTCTGACAAAATAGACTAATTATTGATCCATCATTTTAGACATTTAGACTGTTTT
ATTAAACCGAACTAATATTTTAAAGTTTATTTTATCAAAAATAAAAGTTAAAATCCATTTATCAAAACAAAATTGTGTTGAGTGCTGAAATAATTATTTACTCTTTCCTAAATAAAGTTG
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TACAACCAAACCTTTTTCCTTCTTTCTTTTATAAACAATGCCTTTTTTCCACAGATGACCATAATTCACATAGAGGCCCATTTAATTAAAGAACATTTATGTTTATGAATCATTGTCTTC
CAAAAAGTTGGAGTAATAATGCCTAACATCTGCCTAATAATGTCTGCATCATAACAAAAAGCATAATGTTTCGTGTTTGCAATAATGTATGTAGGGGTTTTCTATTGTGGTCCACCAGCA
CTAACAAAGGAGCTTCGTCAGCTAGCTTCAGATTTTTCACACAACACAACGACCAAATATGATTTCCATAAGGAGAATTTCTAA

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CDS►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAAAATCTGATGAAGATTTTTATAACCGTCACCACCACCGTCGTGATAATTCCGACATAGAACTCGTCGCCGGTGATAGAGTTCCTCATTCTGGCCCTCTAAGCAAAAGACTGGCA
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CCTTCTTCTTCTTCTGATGCTGCTGCTGCTGCAAGAAGAGGACACTACGATAGGACTAAGTCCGCGGCTTCGAGTGCTCTCAAGGGACTTAAGTTCATCGCTAAGGGTGGCGGCGGCGGC
GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAGGGTGGCATGAAGTGGAGAAGCAGTTTGATGTTCTTACTGCTTCAACTGATGGATGGCTTCATCGTTCTCTC
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CTCTTATTGCATGGACCAAGTCATTCTACAAGAGGTGATAGCAAGTACCTAAGCCAAATGCTAAGCTTGAAACTGAAGCCTACATACGAAGACAGTGCTGTTAGGAGGTGCTATACAAAC
ACCAAGTACTTCATACAGGACAACTGGCAAAGAACTTGGGTTATGGCACTGTGGATTTGTGTGATGTTAGGTTTATTTGCCTACAAATTCATACACTATAGAAGGAGAAAAGATGTATAT
CATGTTATGGGGTATTGTGTATGCATGGCCAAAGGTGCAGCTGAGACACTTAAATTGAACATGGCTATTATCTTGTTACCAGTTTGCCGGAACACTATTACTTGGCTGAGGAATAAGAGC
AAGCTTGGCATCATGGTTCCTTTTGATGACAACCTTAACTTCCACAAGGTGATAGCTGTGGCAGTAGCAATTGGTGTTGGAATACATGCAATTTTTCATCTTTCTTGCGACTTCCCTCGC
CTCCTTCGTGCAAGCCCTCAAAAGTACAAGCCAATGGTACAGTATTTTGGACCTCAACCAAAAAGTTATTGGCATTTTGTGAAAACATGGGAAGGAGTCACAGGGATTATAATGGTTGTT
CTAATGGCAATAGCATTCACATTGGCCTCACCTTGGTTCAGGAGAGGCAGGGTTAAGCTTCCTAAACCACTCAACAGTCTAACTGGCTTCAATGCATTTTGGTACTCACATCATCTCTTT
GTCATTGTCTATGCCTCGTTGATTGTTCATGGAATCAAACTTTTCATGACCAAAGAGTGGTACGAGAAAACGACTTGGATGTACTTGGCAATTCCCATGACCATTTATTCATTGGAAAGA
CTAACTAGAGCACTAAGATCTAGTATCAAACCTGTAAAAATATTAAAGGTGGCTGTATACCCTGGGAATGTGTTGGCTCTTCATATGTCAAAGCCTCAGGGATTTAGATATAAGAGTGGA
CAATACATGTTTGTTAATTGTGCTGCTGTATCACCATTTGAATGGCATCCATTTTCTATAACATCAGCCCCTGAAGATAACTATCTTAGTGTTCACATTAGAACATTAGGGGATTGGACC
AGAAGTCTCAGAACAAAATTTTCAGAGGTGTGCCAGCCACCCAACAATGGCAAGAGTGGACTTCTAAGGGCTGAGTGTATGACAGGAGATTGCTGTCCAAGTACCTTCCCTAAGGTCCTA
ATTGATGGTCCATATGGAGCCCCAGCACAAGACTACAAACAATATGAAGTGGTTCTATTGGTAGGGTTGGGAATTGGGGCCACCCCTATGATCAGCATACTGAAGGACATAGTGAACAAT
TATAAGGCCATGGAAGAGGATGAATTAGGGTCCACCATGGAAGAAGGAGGAGTAACATCAAGTGATAACAAATCACCAAAAAGGAGGGGTAATTTGGTAAATTTCAAGACTAGGAGGGCT
TACTTCTATTGGGTGACAAGGGAACAAGGTTCATTTGATTGGTTCAAAGGTGTAATGAATGAGGTTGCTGATGCTGATCGTAGAGGAGTGATTGAGTTACATAACTATTGCACTAGTGTT
TATGAAGAAGGTGATGCTCGTTCAGCCCTAATTGAAATGCTTCAATCCTTAAACCATGCTAAGAATGGTGTTGACATTGTTTCTGGGACAAGGATTAAGTCTCACTTTGCCAAACCTAAT
TGGCGAAGTGTTTACAAGCGTATTGCACTAAATCATCCACATGCTCGCATTGGGGTTTTCTATTGTGGTCCACCAGCACTAACAAAGGAGCTTCGTCAGCTAGCTTCAGATTTTTCACAC
AACACAACGACCAAATATGATTTCCATAAGGAGAATTTCTAA

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