Entry information : PsRboh04
Entry ID 16328
Creation 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PsRboh04
Name PsRboh04
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Pisum
Organism Pisum sativum (Garden pea)    [TaxId: 3888 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PsRboh04
start..stop
S start..stop
MtRboh09 1446 0 1..854 1..851
CarRboh07 1429 0 1..854 1..840
CcajRboh08 1375 0 2..854 3..851
LjRboh02 1368 0 1..854 1..846
Literature and cross-references PsRboh04
Protein sequence: PsRboh04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   854
PWM (Da):   %s   97061.35 Transmb domain:   %s   i294-313o372-394i433-455o475-497i665-682o
PI (pH):   %s   8.92
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSENQGKDE SSTWILESID IVADHVEVSK KDENNGSMVT KASDNEAFLD NGSNGSNVRQ RNNNNHNASK MVRVQSGAAR GLKGLRFLDR TVTGKEGDAW KSIEKRFFQH AVGGMLFKDK  FGQCMGMGAD SKEFAGELYD ALARRRNISV ESGINLSQVK VFWEDMTSKD LESRLQVFFD MCDKNGDGRL SEDEVKEVIV LSASANRLGN LKDQASVYAA LIMEELDPDH NGYIEMWQLE  TLLKEMVNAE DGTTRLSNRT ETLTRAMIPC KYRTPIRKFV SKTTEFVYDK WKKIWIFVLW LAVNLILFIW KFLQYKEKPA YEVMGSCVCF AKGAAETLKF NMGLIVLTMC RRTLTMLRGS  FLSQIIPFDD NIHFHIVIAI GVVIGTFIHV GVHVTCDFPR IISCPTEKFM ATIGPGFNYH QPDYLTLVKS TAGVTGIFIV LIMAFTFTLA TPHFRKSIVK LPSPLHHLAG FNSFWYAHHL  LIVAYFLLII HGYFLFLTKE WKNKTTWMYL IVPLMLYAFE RTHPSFRGKD HRVSIIKAII YTGNVLALYM TKPPGFKYKS GMYIFVKCPD ISSYEWHPFS ITSAPGDDYL SVHIRTLGDW  TTELRNIFAK ACAPESAQPR RGSLVRMETR ASSNYDHSKP SIKYPKILIK GPYGAPAQSY RHYDVLLLIG LGIGATPMIS ILKDILNHMK MESPQQTLSE IESFNSSRSS SDEDKKGPER  AYFYWVTREQ ASFEWFKGVM DDIAEYDRDG VIEMHNYLTS VYEEGDARSA LIGMIQKLQH AKNGVDVVSE SRIRTHFARP NWKKVFSQLA LTHQSSRIGV FYCGSPTLTK TLKTLCQEFS 
LNTSTRFQFH KENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Psat3g140480.1 (5'end) completed from p.sativum_CSFL_reftransV2_0008640
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCATCAG AAAACCAAGG CAAAGATGAA TCATCGACAT GGATTCTTGA AAGCATTGAT ATTGTTGCTG ATCATGTGGA AGTTTCTAAA AAGGATGAAA ACAATGGAAG CATGGTCACA  AAAGCTTCAG ATAATGAAGC CTTTCTCGAC AATGGTAGCA ATGGTAGCAA TGTTAGACAG AGAAATAATA ACAATCATAA TGCAAGCAAA ATGGTTAGGG TGCAATCAGG TGCTGCAAGA  GGGCTTAAGG GTTTACGTTT TCTTGATCGA ACGGTTACCG GAAAAGAAGG CGATGCATGG AAGTCAATTG AGAAGCGTTT CTTTCAACAT GCAGTTGGTG GAATGCTGTT CAAAGACAAA  TTTGGACAAT GCATGGGTAT GGGAGCAGAT TCAAAGGAAT TTGCAGGGGA ACTGTATGAT GCATTGGCTA GGAGAAGGAA TATAAGTGTA GAAAGTGGAA TTAATTTGAG TCAAGTTAAA  GTGTTTTGGG AGGATATGAC TAGTAAAGAT CTTGAATCAA GACTTCAAGT GTTCTTTGAC ATGTGTGACA AGAATGGGGA TGGTAGGTTA TCAGAAGATG AGGTTAAGGA GGTTATAGTG  TTGAGTGCTT CTGCAAATAG ATTGGGAAAT CTCAAAGATC AAGCTTCTGT ATATGCAGCT TTGATCATGG AAGAGCTTGA TCCAGATCAT AATGGATATA TAGAGATGTG GCAGCTTGAA  ACTCTACTAA AGGAAATGGT TAATGCAGAA GATGGCACTA CGAGACTTAG TAATAGAACC GAAACACTAA CCCGAGCAAT GATACCATGC AAGTACAGAA CTCCGATTAG AAAATTCGTT  TCCAAAACAA CCGAATTTGT ATATGATAAA TGGAAAAAAA TATGGATATT CGTACTTTGG TTAGCCGTAA ACTTGATCCT TTTCATTTGG AAGTTTCTTC AATACAAGGA AAAACCAGCA  TATGAAGTAA TGGGATCATG TGTCTGTTTT GCAAAGGGTG CTGCCGAGAC TCTCAAATTC AACATGGGGC TAATCGTCCT TACAATGTGT AGAAGAACAC TTACGATGCT ACGAGGATCG  TTTCTTAGTC AAATCATCCC TTTTGACGAT AACATACACT TTCACATTGT TATTGCAATT GGTGTAGTTA TAGGGACTTT CATCCATGTA GGTGTTCATG TAACTTGTGA TTTTCCGAGA  ATTATTTCTT GTCCGACCGA AAAGTTTATG GCCACAATTG GACCCGGTTT TAATTACCAC CAGCCTGATT ACCTTACCCT TGTTAAAAGC ACTGCTGGTG TAACTGGAAT TTTCATTGTC  TTGATTATGG CTTTTACTTT CACTTTGGCA ACACCTCATT TCCGAAAAAG TATTGTCAAG TTGCCTTCAC CGTTGCATCA TTTGGCCGGC TTCAATTCGT TTTGGTATGC TCATCATTTG  CTTATTGTGG CTTACTTTCT CCTGATCATT CATGGCTACT TTCTATTTCT CACCAAGGAA TGGAAAAACA AGACGACATG GATGTACCTT ATAGTTCCAT TAATGCTCTA CGCATTTGAG  AGAACTCATC CATCTTTTAG GGGTAAAGAT CATCGCGTGA GCATCATTAA GGCAATAATA TACACAGGAA ATGTGCTAGC ACTATACATG ACGAAGCCAC CGGGATTCAA GTATAAAAGT  GGAATGTATA TTTTTGTCAA GTGTCCAGAT ATATCGAGTT ATGAATGGCA CCCTTTCTCG ATTACCTCTG CACCAGGAGA TGATTACTTG AGTGTTCATA TAAGAACCTT AGGAGATTGG  ACTACAGAAC TTAGAAACAT ATTTGCAAAG GCTTGTGCGC CTGAGAGTGC ACAACCAAGA AGGGGAAGCC TTGTGAGGAT GGAAACTAGA GCAAGTTCAA ATTATGACCA TTCAAAACCA  AGCATTAAAT ATCCAAAGAT TCTCATCAAA GGACCCTATG GAGCACCGGC ACAAAGTTAT AGGCATTATG ATGTACTCTT ACTCATAGGA CTTGGAATCG GCGCGACACC TATGATCAGT  ATTTTAAAAG ATATCTTGAA CCATATGAAG ATGGAAAGTC CCCAGCAAAC ACTTTCTGAG ATAGAATCCT TCAATAGTAG TCGCTCCAGC TCCGACGAAG ATAAGAAAGG TCCTGAAAGA  GCATATTTCT ATTGGGTAAC CAGGGAACAA GCTTCATTTG AATGGTTCAA AGGTGTCATG GATGATATTG CCGAATACGA CCGTGATGGT GTTATAGAAA TGCATAACTA TTTGACTAGT  GTCTACGAGG AAGGCGATGC AAGGTCTGCA CTTATCGGCA TGATTCAGAA GTTGCAACAC GCCAAAAATG GAGTAGACGT AGTTTCAGAA AGCCGGATAA GAACACATTT TGCAAGACCA  AACTGGAAAA AAGTCTTCTC CCAGTTAGCT TTAACGCATC AAAGCTCTCG CATCGGTGTG TTTTATTGTG GAAGTCCTAC TCTTACGAAA ACATTGAAGA CCCTTTGTCA GGAGTTTAGC 
TTAAACACAT CGACACGATT TCAGTTTCAT AAAGAGAATT TTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGCATGTAG TTAATTGGTT AGAGACCATT GTATTATTAT CAACCAATTT TCCTATAATT AGCAAACCAA TAACACAACA AAATTTACAT ACTCTTCTTT CTCTCTCCCT CTCTCAAATT  CCTACTTTGA CTGATTCATC TTTCCCTCTA ATACCCTTTC TCTCAAATTC ACCTAATTAA ACAAACCTTT CTGCACAATC TTTTTCGTTG ATGTCATCAG AAAACCAAGG CAAAGATGAA  TCATCGACAT GGATTCTTGA AAGCATTGAT ATTGTTGCTG ATCATGTGGA AGTTTCTAAA AAGGATGAAA ACAATGGAAG CATGGTCACA AAAGCTTCAG ATAATGAAGC CTTTCTCGAC  AATGGTAGCA ATGGTAGCAA TGTTAGACAG AGAAATAATA ACAATCATAA TGCAAGCAAA ATGGTTAGGG TGCAATCAGG TGCTGCAAGA GGGCTTAAGG GTTTACGTTT TCTTGATCGA  ACGGTTACCG GAAAAGAAGG CGATGCATGG AAGTCAATTG AGAAGCGTTT CTTTCAACAT GCAGTTGGTG GAATGCTGTT CAAAGACAAA TTTGGACAAT GCATGGGTAT GGGAGCAGAT  TCAAAGGAAT TTGCAGGGGA ACTGTATGAT GCATTGGCTA GGAGAAGGAA TATAAGTGTA GAAAGTGGAA TTAATTTGAG TCAAGTTAAA GTGTTTTGGG AGGATATGAC TAGTAAAGAT  CTTGAATCAA GACTTCAAGT GTTCTTTGAC ATGTGTGACA AGAATGGGGA TGGTAGGTTA TCAGAAGATG AGGTTAAGGA GGTTATAGTG TTGAGTGCTT CTGCAAATAG ATTGGGAAAT  CTCAAAGATC AAGCTTCTGT ATATGCAGCT TTGATCATGG AAGAGCTTGA TCCAGATCAT AATGGATATA TAGAGATGTG GCAGCTTGAA ACTCTACTAA AGGAAATGGT TAATGCAGAA  GATGGCACTA CGAGACTTAG TAATAGAACC GAAACACTAA CCCGAGCAAT GATACCATGC AAGTACAGAA CTCCGATTAG AAAATTCGTT TCCAAAACAA CCGAATTTGT ATATGATAAA  TGGAAAAAAA TATGGATATT CGTACTTTGG TTAGCCGTAA ACTTGATCCT TTTCATTTGG AAGTTTCTTC AATACAAGGA AAAACCAGCA TATGAAGTAA TGGGATCATG TGTCTGTTTT  GCAAAGGGTG CTGCCGAGAC TCTCAAATTC AACATGGGGC TAATCGTCCT TACAATGTGT AGAAGAACAC TTACGATGCT ACGAGGATCG TTTCTTAGTC AAATCATCCC TTTTGACGAT  AACATACACT TTCACATTGT TATTGCAATT GGTGTAGTTA TAGGGACTTT CATCCATGTA GGTGTTCATG TAACTTGTGA TTTTCCGAGA ATTATTTCTT GTCCGACCGA AAAGTTTATG  GCCACAATTG GACCCGGTTT TAATTACCAC CAGCCTGATT ACCTTACCCT TGTTAAAAGC ACTGCTGGTG TAACTGGAAT TTTCATTGTC TTGATTATGG CTTTTACTTT CACTTTGGCA  ACACCTCATT TCCGAAAAAG TATTGTCAAG TTGCCTTCAC CGTTGCATCA TTTGGCCGGC TTCAATTCGT TTTGGTATGC TCATCATTTG CTTATTGTGG CTTACTTTCT CCTGATCATT  CATGGCTACT TTCTATTTCT CACCAAGGAA TGGAAAAACA AGACGACATG GATGTACCTT ATAGTTCCAT TAATGCTCTA CGCATTTGAG AGAACTCATC CATCTTTTAG GGGTAAAGAT  CATCGCGTGA GCATCATTAA GGCAATAATA TACACAGGAA ATGTGCTAGC ACTATACATG ACGAAGCCAC CGGGATTCAA GTATAAAAGT GGAATGTATA TTTTTGTCAA GTGTCCAGAT  ATATCGAGTT ATGAATGGCA CCCTTTCTCG ATTACCTCTG CACCAGGAGA TGATTACTTG AGTGTTCATA TAAGAACCTT AGGAGATTGG ACTACAGAAC TTAGAAACAT ATTTGCAAAG  GCTTGTGCGC CTGAGAGTGC ACAACCAAGA AGGGGAAGCC TTGTGAGGAT GGAAACTAGA GCAAGTTCAA ATTATGACCA TTCAAAACCA AGCATTAAAT ATCCAAAGAT TCTCATCAAA  GGACCCTATG GAGCACCGGC ACAAAGTTAT AGGCATTATG ATGTACTCTT ACTCATAGGA CTTGGAATCG GCGCGACACC TATGATCAGT ATTTTAAAAG ATATCTTGAA CCATATGAAG  ATGGAAAGTC CCCAGCAAAC ACTTTCTGAG ATAGAATCCT TCAATAGTAG TCGCTCCAGC TCCGACGAAG ATAAGAAAGG TCCTGAAAGA GCATATTTCT ATTGGGTAAC CAGGGAACAA  GCTTCATTTG AATGGTTCAA AGGTGTCATG GATGATATTG CCGAATACGA CCGTGATGGT GTTATAGAAA TGCATAACTA TTTGACTAGT GTCTACGAGG AAGGCGATGC AAGGTCTGCA  CTTATCGGCA TGATTCAGAA GTTGCAACAC GCCAAAAATG GAGTAGACGT AGTTTCAGAA AGCCGGATAA GAACACATTT TGCAAGACCA AACTGGAAAA AAGTCTTCTC CCAGTTAGCT  TTAACGCATC AAAGCTCTCG CATCGGTGTG TTTTATTGTG GAAGTCCTAC TCTTACGAAA ACATTGAAGA CCCTTTGTCA GGAGTTTAGC TTAAACACAT CGACACGATT TCAGTTTCAT  AAAGAGAATT TTTGAAGGGA CAATTCACAG AACAATTGCA TCAGTCAAGA ATTATTCGGT GTCATCTTGA TTCATCAAGC AACATAAGAT TGTAGAATAT TTTTGTATAC TCATAGTGTA 
ATGTTGATAA GTTTTGTGTA TGTAGCAATA TTTCTTAAAA TTTGTGTTGG TTTTGCCTAA ATCTTCATAG TGTTGTTCAT CATTTTTATT CCTTTCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA 

Retrieve as FASTA