RedOxiBase: View Perox 16344

Entry information : CcajRboh03(Cajca_10167)

Entry ID	16344
Creation	2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes	2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2020-05-04 (Christophe Dunand)

Peroxidase information: CcajRboh03(Cajca_10167)

Name

CcajRboh03(Cajca_10167)

Class

Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh001]

Taxonomy

Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons

Organism

Cajanus cajan [TaxId: 3821 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	CcajRboh03 start..stop	S start..stop
GmRboh02	1732	0	1..884	1..885
GmRboh15	1707	0	1..884	1..871
PvRboh02	1698	0	1..884	1..881
PauRboh04	1693	0	1..884	1..881

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	59..563	505	N° 2	1157..1316	160	N° 3	2543..2591	49	N° 4	3005..3118	114
N° 5	3310..3738	429	N° 6	3931..4317	387	N° 7	4423..4518	96	N° 8	4620..4735	116
N° 9	4839..4941	103	N° 10	5054..5127	74	N° 11	5360..5871	512	N° 12	5967..6076	110
join(59..563,1157..1316,2543..2591,3005..3118,3310..3738,3931..4317,4423..4518,4 620..4735,4839..4941,5054..5127,5360..5871,5967..6076)

Literature and cross-references CcajRboh03(Cajca_10167)

Protein ref.	GenBank: XP_020212169.1 KYP71208.1 [Incorrect prediction]
Cluster/Prediction ref.	Genebank: 109796787

Protein sequence: CcajRboh03(Cajca_10167)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	884
PWM (Da):	100511.79
PI (pH):	9.47

Sequence 1169
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MEIEESHEQEYAWSETESTGSRSTRVGFSGPMSGPLVVSNKKSTKKSARFKDDQDFVEITLDVRDDGVSLQNIKGGDPETALLATRLEKRPSSLSLRLRQVSQELKRMTSSKKFDRVDRTKSGAARALRGLKFITKNVGTEGWSQVEKRFDELAVESKLPKTRFSLCIGMHESKEFAGELFDALSRRRGITSGSITKDELREFWEQITDQSFDSRLQTFFDMVDKNADGRIAEEEVKIIALSASANKLSKIQERAEEYAALIMEELDPDNLGYIEIYNLEMLLLQAPAQSTHITTDSRIMSQMLSQKLVPTKEHNPIKRGLRALAYFVEDNWKRIWIIALWLAICAALFTWKFIEYKHRAVFHVMGYCVTSAKGAAETLKFNMALILLPVCRNTITWLRSKTKLGMAVPFDDNINFHKVIAFGIAIGVGIHAIAHLTCDFPRLLHATDEEYEPMKPFFGEERPNNYWWFVKGTEGWTGITIVVLMAIAYTLAQPWFRRGRLNLPKPLKKLTGFNAFWYSHHLFVIVYGLFIVHGYYLYLSKKWYKKTTWMYLAIPMILYACERLLRAFRSGYKSVKILKVAVYPGNVLALHMSKPQGFKYSSGQYIFVNCSDVSPFQWHPFSITSAPGDDYVSVHIRTLGDWTSQLKAVFAACQPASGDQSGLLRADMLQGNNIPRMPNILIDGPYGAPAQDYKNYEVILLVGLGIGATPLISILKDVLNNMKQQKDIEEGMVESGVKNKRKPFATNRAYFYWVTREQGSFEWFKGVMDDVAEYDKDGIIELHNYCTSVYEEGDARSALITMLQSLHHAKSGVDIVSGTRVKTHFARPNWRSVFKHTALKHPGKRGVFYCGAHALVGELKRLSLDFSRKTNTKFDFHKENF

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Remarks

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGAGATTGAAGAGAGCCATGAGCAGGAGTACGCGTGGTCGGAGACGGAGAGCACGGGGAGCAGGAGCACGCGAGTGGGCTTCAGTGGGCCCATGAGCGGCCCACTGGTGGTGTCCAAC
AAGAAGAGCACCAAGAAGAGCGCCAGGTTCAAGGACGACCAGGACTTCGTCGAGATCACGCTGGACGTGCGCGATGACGGCGTCTCCCTCCAGAACATCAAGGGCGGCGACCCCGAGACC
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GAAACACCATCACTTGGCTCAGAAGTAAGACCAAGTTAGGCATGGCCGTTCCCTTTGATGACAACATTAACTTTCACAAGGTACACTTACTTATAATAAAACTTACATATAGTTCTGTAA
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GACTTTTCATCGTTCACGGATACTACTTGTACCTTTCCAAGAAATGGTACAAGAAAACGGTATGCATGCTCTCACTATATTATATCCTCGTTTTCCTTTTATTTTTCTTCACATGAAATT
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CCCTTTGATTAGTATACTGAAAGATGTGCTAAACAACATGAAGCAACAGAAGGACATAGAAGAAGGGATGGTAGAGAGTGGAGTTAAGAACAAGAGGAAACCCTTTGCCACCAACCGGGC
CTATTTCTATTGGGTGACTCGTGAGCAAGGTTCCTTTGAATGGTTCAAGGGTGTGATGGATGATGTTGCGGAGTATGACAAGGATGGAATAATCGAGCTTCATAATTATTGCACAAGTGT
GTATGAGGAAGGAGATGCTCGATCGGCTTTGATCACAATGCTTCAATCGCTGCACCATGCAAAAAGTGGTGTGGATATAGTTTCGGGGACAAGGGTGAAGACACATTTTGCTAGACCAAA
TTGGCGCAGTGTTTTTAAACATACTGCACTTAAACACCCTGGCAAAAGAGTTGGTAAGAACTAGTACTGATTTTCTCTTAGTTAATTTAATTGTTGAATTCATGTCATCATGTCTTGCTT
AAGCTCACAATGCTTCAATCATTTCCAGGTGTTTTCTACTGTGGGGCGCACGCACTGGTTGGAGAACTTAAAAGGCTTTCTCTCGACTTTTCTAGAAAGACCAACACTAAGTTTGATTTC
CATAAAGAGAATTTTTAA

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CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

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