Entry information : ClanRboh08
Entry ID 16358
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: ClanRboh08
Name ClanRboh08
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Citrullus
Organism Citrullus lanatus (watermelon)    [TaxId: 3654 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value ClanRboh08
start..stop
S start..stop
CsaRboh09 1362 0 38..774 78..810
DgloRboh08 1047 0 47..774 66..795
ToriRboh11 1045 0 58..774 87..799
DdruRboh09 1031 0 46..774 79..809
Literature and cross-references ClanRboh08
Protein sequence: ClanRboh08
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   774 (230)
PWM (Da):   %s   89089.63 (25116.8) Transmb domain:   %s   o249-268i383-405o431-453i594-613o
PI (pH):   %s   9.61 (8.04) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-256
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIHLERKTE QKLSVSSSSS PSSLSTSSSS CSSSSFHKNA YTSSGLRFID FLRDNEREWK LAEKRFDQLS WTSAGSEPAV KWSNFPFCIG MSETQEFAYQ LLRALRRRKN WKIEITKSEF  HILWCQLTHS SVNSRTTTLF HLCDRNMDGR VTEKDIKQMI MLTASTNKLS MTQEEGEDYA ALIMEELDEE KQGYLELPQF EKLFKISSPE AVSPLNKQSS NTHIRHRHDP FQESIYEAEM  LLRSRWRRAW MVALWLIICL ALFTWKFIQY RHRKAFEVMG YCLSIAKGAA ETLKFNMALV LLPVCRNTIT WLRRNSSLNS VIPFNDNLNF HKLVAGGIVA GVVLHGGTHL VCDFPRISGC  EKSIFQKTIA TQFNYHQPSY VEILATTETL TGIIMVILMA IAFLLAMKWP RRKSTSLPRS IQQVTGYNTF WYSHHLFIFV YALLIVHSIF LFLTDKATEK TTWMYIAIPV SLYTGERIFR  AIRSCLYEVN VLKARTYSGK VLFLKLSKPE RFKYQSGMYV LIQCPQISPF EWHPYSLTSA PQDTHLSVHI RNLGDWSYEL YSLFHEGISP TSKDYPKIFI DGPYGAASQD HVKYNRVVLI  GLGIGATPFM SILKDVLIRF TRKCDSQAYN GKGSQSTSKT YLYWVTREQS SFDWFKDFMK DLTGSDQTQL AVEMHNFLTS IYHEGDVRSV LIRAIQALHY TRRGIDIVSK TSVRTHFGRP 
NWINILSSLG HRHRGERIGV FYCGPLALAR ELEGLCTKFS AKTSTRFVFH KENY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Citlan_Cla019057
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATTC ATTTGGAGAG AAAGACAGAG CAGAAGCTCT CTGTCTCTTC ATCATCGTCG CCGTCGTCGT TATCAACTTC TTCGTCTTCG TGCTCTTCCT CTTCTTTCCA CAAAAATGCA  TATACTTCTT CAGGACTTAG ATTTATCGAC TTTCTTCGTG ACAATGAAAG GGAATGGAAA TTGGCAGAGA AGCGGTTCGA TCAGCTTTCT TGGACTAGTG CTGGCTCTGA ACCGGCCGTG  AAATGGTCTA ATTTTCCCTT CTGTATAGGA ATGTCAGAGA CTCAGGAGTT TGCTTATCAA CTGTTAAGGG CACTGAGAAG AAGAAAGAAT TGGAAAATAG AAATCACCAA AAGTGAATTT  CATATCCTTT GGTGCCAGTT GACTCATTCC AGTGTTAATT CAAGAACAAC AACTCTATTT CACCTTTGTG ATAGGAACAT GGATGGAAGG GTAACTGAGA AAGATATCAA ACAGATGATA  ATGTTAACTG CTTCTACCAA TAAGTTATCC ATGACCCAAG AAGAAGGAGA AGATTATGCT GCTTTAATCA TGGAAGAGCT AGATGAAGAA AAGCAGGGCT ACCTTGAGCT ACCTCAATTT  GAGAAGCTCT TCAAGATAAG CTCACCAGAG GCAGTCTCCC CTCTAAACAA ACAATCATCA AATACACACA TTCGACATCG CCATGATCCA TTTCAAGAGT CCATATATGA GGCTGAAATG  CTGCTTAGAT CTCGATGGAG ACGAGCATGG ATGGTGGCGT TGTGGTTGAT CATATGCCTT GCATTGTTTA CCTGGAAATT CATTCAATAC CGCCATCGGA AGGCGTTCGA AGTCATGGGT  TACTGCCTCT CAATTGCCAA GGGGGCAGCA GAGACTTTGA AATTTAACAT GGCTCTAGTC TTGCTTCCTG TTTGTCGAAA CACAATTACA TGGCTCCGCA GAAACTCGTC CTTGAACTCG  GTCATTCCTT TCAACGACAA TTTAAACTTC CACAAGTTAG TTGCAGGAGG CATTGTAGCA GGAGTTGTCC TTCATGGAGG AACCCATCTT GTTTGTGATT TTCCAAGAAT TAGTGGTTGT  GAGAAGTCAA TTTTCCAGAA AACTATTGCT ACTCAGTTCA ACTATCATCA GCCATCATAT GTTGAAATCT TGGCCACAAC TGAGACTTTA ACAGGCATTA TTATGGTCAT ATTGATGGCC  ATTGCATTTT TGCTCGCTAT GAAATGGCCA CGTCGTAAAT CGACCTCGCT TCCGAGGTCT ATACAACAAG TCACAGGATA TAATACCTTT TGGTATTCTC ACCATTTGTT CATATTTGTC  TATGCATTAC TCATTGTTCA CTCCATATTC TTATTCCTAA CTGACAAAGC AACAGAAAAA ACGACTTGGA TGTATATAGC AATTCCAGTT TCATTATACA CTGGAGAGAG GATTTTTAGA  GCAATTAGAT CTTGTTTATA CGAAGTGAAT GTTTTGAAGG CAAGGACTTA TTCAGGAAAA GTTTTATTTC TCAAATTGAG CAAACCAGAG AGATTCAAGT ATCAAAGTGG GATGTATGTA  TTAATTCAAT GCCCACAAAT CTCCCCGTTT GAATGGCACC CATATTCATT AACTTCTGCA CCACAAGATA CCCATCTCAG TGTACATATC AGAAATTTGG GAGATTGGAG TTATGAGCTG  TACAGCCTGT TCCATGAGGG AATATCTCCT ACATCAAAAG ATTACCCGAA AATATTCATT GATGGGCCCT ATGGTGCTGC TTCTCAAGAT CATGTCAAGT ACAACCGTGT GGTACTAATC  GGTCTAGGTA TTGGAGCCAC ACCCTTCATG AGCATCCTAA AAGATGTTCT AATCAGGTTT ACTAGGAAAT GTGATAGTCA AGCTTACAAT GGAAAAGGCA GCCAAAGTAC ATCCAAAACC  TATCTTTATT GGGTTACAAG AGAGCAAAGC TCCTTTGATT GGTTTAAAGA TTTTATGAAG GATTTAACAG GTTCTGATCA AACTCAGTTA GCTGTGGAGA TGCACAATTT CCTCACTAGT  ATATATCATG AAGGGGATGT AAGGTCTGTT TTGATAAGAG CAATTCAAGC CTTGCATTAT ACTCGACGGG GCATCGACAT CGTCTCGAAG ACTTCGGTAC GAACTCATTT TGGTCGGCCA  AATTGGATAA ACATCTTATC GAGTTTAGGT CATAGGCATA GAGGAGAAAG AATTGGAGTT TTCTACTGTG GTCCTTTGGC TTTGGCAAGA GAACTAGAGG GACTATGCAC CAAATTCTCC 
GCCAAAACCT CAACTAGATT TGTATTCCAT AAGGAGAACT ACTAG 

Retrieve as FASTA