Entry information : NschRboh08
Entry ID 16385
Creation 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NschRboh08
Name NschRboh08
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nisssolia schottii    [TaxId: 105944 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NschRboh08
start..stop
S start..stop
CausRboh07 1426 0 3..847 2..841
LaRboh06 1394 0 3..847 2..855
CcajRboh08 1392 0 1..847 1..851
GmRboh11 1354 0 3..847 2..859
Literature and cross-references NschRboh08
Protein sequence: NschRboh08
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   847
PWM (Da):   %s   96551.42 Transmb domain:   %s   o291-308i425-447o473-495i661-678o
PI (pH):   %s   9.44
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSEEEEGHD ESSKLWILES VEVDPMVDVP LNNGTPEGVV LKSQYEGSFN KSGDSVRSRN NNNGNNNRMV RMQSGAARGL KGLRFLDRTV TGKEVDAWKS IEKRFAQNAV DGKLSKEKFG  TCMGMGPDSK EFAGELYEAL GRRRKIRTEE GIGIDEVRVF WEDMTNKDLE SRLQVFFDMC DKNGDGRLSE EEVKEVIVLS ASANQLGNLK QHASEYAALI MEELDPDHHG YIEMWQLETL  LKEMVSAEDG TKKINIKRQT LTRAMIPSRY RSPVTKFLNK TKEFAVDKWK RIWVVALWVA INSALFFWKF RQYRERAAFE VMGYCLCLAK GAAETLKLNM ALIVLTMCRR TLTKIRGSLL  GRIVPFDDNI NFHKMIAAAV VLGTLIHVVA HVACDFPRIQ SCPERKFLMI LGAGFNYKQP TYLEIVASVP GVTGIVMVLI MAFTFTLATH YFRKSLVKLP SPFHRLAGFN AFWYAHHLLI  LVYILLIIHG YFLFLTKDWR KKTTWMYLVG PLMLYASERT HTFFKGKDHR VSVIKAIVYT GNVLALYMTK PSGFKYKSGM YLFVKCPDIA KFEWHPFSIT SAPGDKYLSV HIRALGDWTT  ELRKRFAEAC EPQSAQPRRG SLVRMETKAY SGYDQSQERY PKILIKGPYG APAQNYKKYD VLLLIGLGIG ATPMISILKD ILNNMKAESP LDTRSEASFH SSPSDEDRKG PQRAYFYWVT  REQPSFEWFK GVMDDIAEYD NDGIIEMHNY LTSVYEEGDA RSALIAMVQK LQHAKNGVDV VSESRIRTHF ARPNWKRVFS QLASTHENSR IGVFYCGSPT LTKTLRNLCQ EFSLSSSTRF 
HFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Nissch_Nissc688S30180 . Incorrect splicing (GC instead of GT to conserved FFDM).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCATCGG AAGAAGAAGA AGGCCACGAT GAATCATCGA AATTATGGAT TCTCGAGAGC GTCGAGGTTG ATCCCATGGT GGACGTTCCT CTAAATAACG GAACCCCAGA AGGCGTGGTG  CTAAAGTCTC AATACGAAGG CTCTTTCAAC AAGAGCGGTG ACAGCGTTAG GAGCAGGAAT AATAATAATG GAAACAATAA TAGGATGGTT AGGATGCAAT CGGGAGCAGC CAGAGGACTC  AAGGGCTTAC GGTTCCTTGA CAGGACGGTC ACCGGAAAAG AAGTCGATGC ATGGAAGTCC ATTGAGAAGC GCTTTGCCCA AAATGCCGTT GATGGGAAGC TCTCAAAAGA GAAATTCGGA  ACGTGCATGG GTACGTACGT ACATACATTG TTTAGTGTTT TTTTACATTT CTTCCCATGT CAAAAATGTT ACATGTGCAC CCAATTTCAT ACATGAGTTA AGTGCACAAA CATTACATGA  GTTAAAACAC AAACTTTATA TATATAAGTA CAAGGTATAT GTATGGTGTA TGGTTTTTGG TGTGTTGTAG CAGAACTCTA ATTTTTTAGT TGTTCTAATT GTTATGCGCA GGTATGGGAC  CAGACTCAAA GGAGTTTGCT GGGGAGCTGT ATGAGGCGTT GGGAAGGCGC AGGAAAATTC GTACAGAAGA GGGCATAGGC ATTGATGAAG TCAGAGTATT CTGGGAGGAC ATGACTAACA  AAGATCTTGA ATCCAGGCTT CAAGTGTTCT TTGACATGCA AGACCACTCA CTCTATTTAT CTACTATCAG AGCCTTCTTG CATCTTACAC TAATATTACT GAATGAAGTG GCATAATAAA  TGAACTGCTT TGTTTACTTC CAGGTGTGAC AAGAACGGGG ATGGTAGGCT ATCAGAAGAG GAGGTTAAGG AGGTGAGGAC TATAAGACCC CCCCCTTGAA TATTCCTTGT TTTTATAACC  ACTTTCCTTC TTTTTCCCCC CTCTCTTCCA TTTTTTCAAT ACAAACAGAA TTCTAAATGT TAATTGTGTA AAAGGTTATA GTGTTGAGCG CCTCCGCCAA CCAGCTAGGA AATTTGAAGC  AACATGCTTC CGAATACGCA GCTTTGATCA TGGAGGAGCT TGACCCTGAT CACCATGGAT ACATAGAGGT TACAAGTCTT TAAATTCTCA CTCCTCCTCT GACTGGATTT TTATTTACCA  AAATGCTACA TGTACACCCA ATTTTATACG CTCATACATA CACCATTAAT AATGTAAGGT AGCTTGAGAT GCAAGCTTCC CAATCCAAGT TGGGTAATTT AACTAACTTG ACAGCTAGCA  TATTTAACTA ACTTGACAGC TTGCACACAA CTTGCATAAC TGTCAACTAA TTTAGCCAAA GCTTGAAAAG CTTTGCTATT CTTACTCTAT TATAATGCAC AAACTTTATT CTCATGAGTG  CACAACATTA TGTATATAAG TATATGGTGT ATGTATGGTG TACCAGGACT CTTTTATTTA AACCTCCCAT GTTTTTATAT CCTCCTCAGT TCTCTGTTTC AAACAGATGT GGCAGCTAGA  AACTCTGCTG AAGGAAATGG TGAGCGCCGA AGACGGCACG AAGAAAATCA ACATCAAGAG GCAGACTCTG ACCAGAGCCA TGATCCCCAG CAGGTACAGA AGCCCCGTTA CCAAGTTTCT  CAACAAGACC AAGGAATTCG CAGTCGACAA GTGGAAGAGA ATATGGGTCG TCGCACTCTG GGTGGCCATA AACTCGGCGC TTTTCTTCTG GAAGTTTCGC CAATACAGAG AGAGAGCGGC  GTTCGAGGTC ATGGGCTACT GCCTGTGCCT CGCAAAGGGC GCCGCCGAGA CCCTCAAGCT CAACATGGCG CTCATCGTCC TCACCATGTG CAGGAGAACC CTCACGAAGA TAAGAGGGTC  GCTGCTCGGC CGAATCGTCC CTTTCGACGA CAACATAAAC TTCCACAAGA TGATTGCGGC GGCCGTAGTT CTAGGGACTC TGATTCACGT GGTAGCGCAC GTGGCTTGTG ATTTTCCGAG  GATACAATCG TGCCCGGAAC GAAAGTTTTT GATGATACTT GGGGCGGGGT TTAACTACAA GCAGCCTACC TACCTAGAAA TCGTTGCTAG TGTCCCCGGT GTGACCGGGA TTGTCATGGT  GTTGATCATG GCCTTTACCT TCACCCTAGC AACGCACTAT TTCAGAAAAA GCCTTGTCAA ATTACCTTCC CCGTTTCACC GTTTGGCCGG TTTCAACGCC TTTTGGTACG CCCATCATTT  GCTTATTCTG GTTTACATAT TACTGATCAT ACATGGCTAC TTTCTGTTTC TCACCAAGGA CTGGCGCAAG AAGACGGTAT GTATGGCTCT TAAGTTAATC ATTCAAACAA CCAAAAACAA  ACTACAACTT TTACCAAATG GATTTGTATT TAATTTATTG CTCACAACAT GCATCGTTCA ACTCTCCCAG CCCCTCATTT GTAGATTGTG TACTTAGTAT TAACAGGGGG TTGGTCCAAG  TGGTAAGCGG CTTGGTATCG CTTAAGCAAG GTCCCGGGTT CGAGACCTTG TGTACGCAGT TATCCCCGCT GGGAGACTCA CCCGCTATAG CTAGGTGCCC GACCCGGATT AGTTGAGGCA  AAGCCTTGGA TACCGGGCAG GCAACCTAAA AAAAAAAAGA ATTTTATACT TAGTAATTCG GCCCAAAAAG GCTTAGATTT TTTTAAAATC AATTGGCACA ATCTAATGGC ATTTTGTTGG  GCCACAATCT GAAAATGTTT ATAAATCGAT TGACGCCAGC TTTTCTTATC CATGCAGACT TGGATGTACC TTGTAGGTCC ATTAATGCTC TATGCTTCAG AAAGAACTCA TACATTTTTC  AAGGGCAAAG ATCATCGTGT AAGCGTCATT AAGGTCTGTA TCAGCAGCTT ATGCCGCCTT GTTTTACATG TTGAGAAGCA GGGAACTGAA GTAACTGAAT TGGAAATTTC AGGCAATAGT  TTACACGGGA AATGTTCTAG CACTGTACAT GACCAAACCC TCCGGATTCA AGTATAAAAG TGGAATGTAT CTTTTTGTCA AGTGTCCAGA TATAGCTAAA TTTGAATGGT AATAAACTAT  GATACCTTGA TTGCTGATTC TAATCAGAAT AAATTATTTT TGCTGCAACA TGAATGATGA ATGTATTCAT GTTATAGGCA TCCTTTCTCC ATCACCTCTG CACCTGGAGA TAAATACTTG  AGCGTGCATA TTCGAGCCTT GGGAGATTGG ACTACAGAGC TACGGAAAAG ATTTGCGGAG GTGATGCTTA TGTTTCAGTT GTGATCTCAA AGCTATGTGC TTTATTAGTT AAAGGATAAT  AATAATAATA AGAATAGGTG GTTGTAGCAT TTGTTAATTG AGAGCGTCTA GTTTTACTAA GACACTAGAA ATTAATGCAG GCTTGTGAGC CTCAGAGTGC ACAGCCAAGA AGGGGATCGC  TCGTGAGAAT GGAAACCAAG GCATATTCAG GCTATGACCA GTCACAAGAA AGGTGAATAA AATTCTCTTG GCTCTCAACT TTCCAAAATG AATATAAAAG ATGGTTCAGT ACGTGCGCAC  GAGGCTCCCA CTCGGTAGGG CTTGGAGAGG GTAAATGTTT ACCCCTATAA GTAAAGAGGT TGTTTCCAAG ATTCGAACTT GTGACTAGGT CACAGGGTAC AGCAACCTTA ACGTTGCGCG  GTTTCAAGAA TGAATATATT AGTGTCTTAC TTGTTCTTTT CTTTGCACTA GGTATCCGAA GATACTCATC AAAGGACCCT ACGGAGCCCC AGCACAAAAT TACAAGAAGT ATGATGTCCT  CTTGCTAATA GGTCTAGGAA TTGGGGCCAC GCCAATGATC AGTATTCTCA AAGATATCTT GAACAACATG AAGGCAGAAA GCCCTCTAGA TGTAAGTCAA AAGATTAACA AAATTTTATT  TGCCTTTTTT TTTTTTTCTT TTGTGGTATA ATGATATTTT TTTAGAGTTC ACATTATTCA TCGGAGGTTA ATTAACATAG CAGACAAGAA GTGAAGCCTC CTTCCATAGC AGTCCATCAG  ATGAAGATAG GAAGGGCCCT CAAAGAGCAT ACTTTTATTG GGTAACAAGA GAGCAGCCTT CGTTTGAATG GTTCAAAGGT GTCATGGATG ATATTGCAGA ATATGACAAC GATGTGAGAA  TAATGAGAAC CAAGCCAATC AATTCTTTTT CTACTCTTGT TTCCTCCTTC TACATAATGT TATTAAACTA TATACTAAAA TTTTGGCATG TCTAAATGAT GCAGGGTATT ATAGAAATGC  ACAACTACTT GACTAGCGTC TATGAGGAAG GCGATGCACG GTCTGCGCTG ATTGCCATGG TCCAGAAGCT ACAACACGCT AAAAATGGAG TTGATGTGGT TTCAGAAAGT CGGGTATTGA  TTTAGCACTC ATATATAGAG TGAACATTTT TAAGCATCAA CTACCATAAC ACCCACGTTG CGTAATTGGC CTCACATCTT TATAATAATG TTGCCATTAT GCTAGATACG AACTCATTTT  GCAAGGCCTA ACTGGAAAAG GGTCTTCTCT CAATTGGCAA GCACACATGA AAATTCTAGG ATAGGTATGC AAAATTGTTA ATGCTTTGTG AAATTATTCT AAATGATGTT TGAGAAAAGA  AAATAAAGAT TTCAACGGTG GAAAATGAAA AACGTGCGAG GTGTTGTTGG TTGTTGGTGC AGGTGTATTC TACTGCGGAA GTCCTACACT CACAAAAACA TTGAGGAACC TTTGTCAAGA 
GTTTAGCCTA AGCTCATCCA CCCGCTTTCA TTTTCACAAG GAGAACTTCT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCATCGG AAGAAGATGT CATCGGAAGA AGAAGAAGGC CACGATGAAT CATCGAAATT ATGGATTCTC GAGAGCGTCG AGGTTGATCC CATGGTGGAC GTTCCTCTAA ATAACGGAAC  CCCAGAAGGC GTGGTGCTAA AGTCTCAATA CGAAGGCTCT TTCAACAAGA GCGGTGACAG CGTTAGGAGC AGGAATAATA ATAATGGAAA CAATAATAGG ATGGTTAGGA TGCAATCGGG  AGCAGCCAGA GGACTCAAGG GCTTACGGTT CCTTGACAGG ACGGTCACCG GAAAAGAAGT CGATGCATGG AAGTCCATTG AGAAGCGCTT TGCCCAAAAT GCCGTTGATG GGAAGCTCTC  AAAAGAGAAA TTCGGAACGT GCATGGGTAT GGGACCAGAC TCAAAGGAGT TTGCTGGGGA GCTGTATGAG GCGTTGGGAA GGCGCAGGAA AATTCGTACA GAAGAGGGCA TAGGCATTGA  TGAAGTCAGA GTATTCTGGG AGGACATGAC TAACAAAGAT CTTGAATCCA GGCTTCAAGT GTTCTTTGAC ATGTGTGACA AGAACGGGGA TGGTAGGCTA TCAGAAGAGG AGGTTAAGGA  GGTTATAGTG TTGAGCGCCT CCGCCAACCA GCTAGGAAAT TTGAAGCAAC ATGCTTCCGA ATACGCAGCT TTGATCATGG AGGAGCTTGA CCCTGATCAC CATGGATACA TAGAGATGTG  GCAGCTAGAA ACTCTGCTGA AGGAAATGGT GAGCGCCGAA GACGGCACGA AGAAAATCAA CATCAAGAGG CAGACTCTGA CCAGAGCCAT GATCCCCAGC AGGTACAGAA GCCCCGTTAC  CAAGTTTCTC AACAAGACCA AGGAATTCGC AGTCGACAAG TGGAAGAGAA TATGGGTCGT CGCACTCTGG GTGGCCATAA ACTCGGCGCT TTTCTTCTGG AAGTTTCGCC AATACAGAGA  GAGAGCGGCG TTCGAGGTCA TGGGCTACTG CCTGTGCCTC GCAAAGGGCG CCGCCGAGAC CCTCAAGCTC AACATGGCGC TCATCGTCCT CACCATGTGC AGGAGAACCC TCACGAAGAT  AAGAGGGTCG CTGCTCGGCC GAATCGTCCC TTTCGACGAC AACATAAACT TCCACAAGAT GATTGCGGCG GCCGTAGTTC TAGGGACTCT GATTCACGTG GTAGCGCACG TGGCTTGTGA  TTTTCCGAGG ATACAATCGT GCCCGGAACG AAAGTTTTTG ATGATACTTG GGGCGGGGTT TAACTACAAG CAGCCTACCT ACCTAGAAAT CGTTGCTAGT GTCCCCGGTG TGACCGGGAT  TGTCATGGTG TTGATCATGG CCTTTACCTT CACCCTAGCA ACGCACTATT TCAGAAAAAG CCTTGTCAAA TTACCTTCCC CGTTTCACCG TTTGGCCGGT TTCAACGCCT TTTGGTACGC  CCATCATTTG CTTATTCTGG TTTACATATT ACTGATCATA CATGGCTACT TTCTGTTTCT CACCAAGGAC TGGCGCAAGA AGACGACTTG GATGTACCTT GTAGGTCCAT TAATGCTCTA  TGCTTCAGAA AGAACTCATA CATTTTTCAA GGGCAAAGAT CATCGTGTAA GCGTCATTAA GGCAATAGTT TACACGGGAA ATGTTCTAGC ACTGTACATG ACCAAACCCT CCGGATTCAA  GTATAAAAGT GGAATGTATC TTTTTGTCAA GTGTCCAGAT ATAGCTAAAT TTGAATGGCA TCCTTTCTCC ATCACCTCTG CACCTGGAGA TAAATACTTG AGCGTGCATA TTCGAGCCTT  GGGAGATTGG ACTACAGAGC TACGGAAAAG ATTTGCGGAG GCTTGTGAGC CTCAGAGTGC ACAGCCAAGA AGGGGATCGC TCGTGAGAAT GGAAACCAAG GCATATTCAG GCTATGACCA  GTCACAAGAA AGGTATCCGA AGATACTCAT CAAAGGACCC TACGGAGCCC CAGCACAAAA TTACAAGAAG TATGATGTCC TCTTGCTAAT AGGTCTAGGA ATTGGGGCCA CGCCAATGAT  CAGTATTCTC AAAGATATCT TGAACAACAT GAAGGCAGAA AGCCCTCTAG ATACAAGAAG TGAAGCCTCC TTCCATAGCA GTCCATCAGA TGAAGATAGG AAGGGCCCTC AAAGAGCATA  CTTTTATTGG GTAACAAGAG AGCAGCCTTC GTTTGAATGG TTCAAAGGTG TCATGGATGA TATTGCAGAA TATGACAACG ATGGTATTAT AGAAATGCAC AACTACTTGA CTAGCGTCTA  TGAGGAAGGC GATGCACGGT CTGCGCTGAT TGCCATGGTC CAGAAGCTAC AACACGCTAA AAATGGAGTT GATGTGGTTT CAGAAAGTCG GATACGAACT CATTTTGCAA GGCCTAACTG  GAAAAGGGTC TTCTCTCAAT TGGCAAGCAC ACATGAAAAT TCTAGGATAG GTGTATTCTA CTGCGGAAGT CCTACACTCA CAAAAACATT GAGGAACCTT TGTCAAGAGT TTAGCCTAAG 
CTCATCCACC CGCTTTCATT TTCACAAGGA GAACTTCTAA 

Retrieve as FASTA