Entry information : CsaRboh02
Entry ID 16405
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CsaRboh02
Name CsaRboh02
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh02
start..stop
S start..stop
ClanRboh02 1803 0 1..889 1..895
AgluRboh03 1521 0 1..889 1..883
PandeRboh01 1509 0 10..889 17..905
DgloRboh03 1505 0 1..889 1..893
Literature and cross-references CsaRboh02
Protein sequence: CsaRboh02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   889 (302)
PWM (Da):   %s   101047.07 (32756.8) Transmb domain:   %s   o345-364i485-507o527-549i709-726o
PI (pH):   %s   9.61 (5.07) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:24-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MESQENKPMD SCSDTESIGS SKRVGFSGPL TGASVAYKRT NSYSSSTRST MRIKDDDQYV EITLDVRDDT VSVQNIRGGD SETAMLASRL ETKRPTLGSQ LSFKLKQVSQ ELRRMTSSKS  FNRIDRTKSG ASRALNGLRF MTKSVGSEAW SEIENRFDQL AINGELPKSL FARCIGMNES SEFAGELFDA LARRRGISSN SISKGELREF WEQIIDESFD ARLQIFFDMV DKNADGRISG  KEVKEIIALS ASANKLSKIK DDAEEYAALI MEELDPDNLG YIELYNLEML LLQAPNQATA PNRVTDSRVL SQLLSQKLVP TKEYNPIKRT YRSLHYFVED NWKRIWVFSL WLAICAGLFA  WKFIQYRNRA VFHVMGYCVT TAKGAAETLK FNMAIILLPV CRNTITWLRS KTKLGSVVPF DDNVNFHKVI AVGIAVGVLL HAGAHLTCDF PKLLHATDAE YEPMKPFFGE VRPNNYWWFV  KGTEGWTGVV MVVLMIIAFT LAQPWFRRNR LNLPKIIKRL TGFNAFWYSH HLFVIVYVLF IIHGYYLYLS KKWYKKTTWM YLAVPVLLYA CERLIRAFRS GYKTVRISKV AVYPGNVLAL  QMSKPHGFKY TSGQYIFVNC SAISPFQWHP FSITSAPGDD YLSIHIRTVG DWTSQLKTIF SKVCQPPSVN QSGLLRADIG QSSNKIRLPR LLIDGPYGAP AQDYKQYDVL LLVGLGIGAT  PLISIVKDVL NNIKDQKDIE NGVGDKQAKP FVTKRAYFYW VTREQGSFEW FRGVMDEVAE NDRDRVIELH NYCTSVYEEG DARSALITML QDLNHAKNGV DIVSGTRVKT HFARPNWRNV 
LKHVAVNHPD QRVGVFYCGA QGLVGELRRL SQDFSRKTTT KFDFHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Cucsat_evmmodelChr12597
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAGTC AAGAAAACAA ACCTATGGAT TCATGTTCAG ATACAGAGAG CATAGGAAGT TCCAAAAGAG TCGGCTTCAG CGGTCCATTA ACAGGAGCTT CTGTCGCCTA CAAAAGAACA  AACAGCTACA GTAGTAGCAC AAGAAGCACC ATGAGAATCA AAGACGATGA TCAGTACGTG GAGATTACCT TAGACGTTCG TGACGACACA GTCTCCGTTC AGAACATCAG AGGAGGAGAT  TCAGAAACAG CAATGCTAGC AAGCCGATTG GAAACAAAAC GCCCAACGCT AGGCTCTCAA TTATCATTCA AATTGAAACA AGTTTCGCAA GAACTAAGAC GAATGACTTC CTCTAAAAGC  TTCAATAGAA TCGACCGAAC CAAATCCGGT GCAAGTCGTG CCTTAAATGG CCTACGATTC ATGACCAAAA GCGTCGGAAG TGAAGCTTGG TCAGAGATTG AGAATCGATT CGATCAACTC  GCTATTAACG GAGAGCTTCC AAAGTCGTTA TTCGCAAGAT GCATAGGCAT GAACGAGTCG AGTGAGTTTG CCGGTGAGTT GTTCGACGCG TTGGCTAGAA GAAGAGGGAT AAGTTCAAAC  TCCATAAGTA AAGGGGAACT GCGTGAATTT TGGGAGCAAA TTATTGATGA AAGCTTCGAT GCAAGGCTTC AAATCTTCTT CGATATGGTG GACAAGAATG CTGACGGTCG CATTTCCGGA  AAAGAAGTCA AAGAGATTAT TGCATTGAGT GCTTCAGCAA ATAAGTTGTC AAAAATTAAA GATGATGCTG AAGAATATGC TGCTCTAATT ATGGAAGAAT TGGACCCTGA TAACCTTGGA  TACATTGAGC TATACAACTT GGAAATGCTA TTGTTGCAAG CTCCAAACCA AGCAACGGCG CCGAACCGTG TCACGGACAG TCGAGTGTTG AGCCAACTTC TAAGCCAAAA GCTAGTGCCC  ACAAAGGAGT ATAACCCCAT CAAGCGGACG TACCGTTCAC TCCACTACTT TGTTGAAGAC AATTGGAAGC GCATTTGGGT TTTCTCTCTA TGGCTTGCCA TTTGCGCTGG CTTATTCGCT  TGGAAGTTCA TTCAGTATCG TAATCGAGCT GTCTTCCATG TTATGGGTTA CTGTGTAACC ACTGCTAAAG GCGCTGCCGA GACCCTTAAG TTCAATATGG CTATTATTCT TCTCCCTGTT  TGTAGGAACA CTATTACTTG GCTCCGGAGT AAGACCAAGC TTGGCTCTGT TGTCCCTTTT GATGATAATG TCAATTTCCA TAAGGTAATT GCTGTTGGCA TCGCGGTTGG AGTCCTTTTA  CATGCGGGAG CACATCTTAC CTGTGACTTT CCAAAGCTAC TCCATGCGAC GGATGCGGAA TATGAACCAA TGAAGCCGTT TTTCGGTGAA GTGCGACCGA ATAACTATTG GTGGTTTGTG  AAGGGGACGG AAGGGTGGAC TGGGGTGGTG ATGGTGGTGT TAATGATTAT AGCATTCACC TTAGCTCAGC CGTGGTTCCG CCGCAACCGC CTGAACTTAC CAAAAATCAT CAAGAGACTC  ACAGGGTTCA ATGCCTTCTG GTACTCTCAC CATCTCTTTG TCATTGTCTA TGTCCTCTTC ATCATCCATG GCTACTACCT CTATCTCTCC AAGAAATGGT ACAAAAAGAC GACATGGATG  TATCTAGCTG TCCCAGTTTT GTTATATGCA TGTGAAAGAT TGATTCGTGC ATTTCGATCA GGCTACAAAA CAGTGAGGAT CTCAAAGGTT GCTGTTTATC CTGGAAATGT TCTGGCATTG  CAAATGTCAA AGCCCCATGG ATTCAAATAC ACAAGTGGCC AATACATATT TGTGAACTGT TCTGCTATCT CTCCCTTTCA ATGGCATCCA TTCTCGATTA CTTCGGCTCC AGGGGATGAT  TACTTAAGCA TTCACATTCG CACTGTAGGA GATTGGACTT CCCAACTCAA GACCATTTTC TCAAAGGTAT GTCAGCCTCC ATCTGTTAAT CAAAGTGGTC TTTTGAGGGC TGATATTGGC  CAAAGCAGCA ACAAAATCAG ATTGCCAAGG CTATTGATAG ATGGACCTTA CGGAGCTCCA GCACAAGATT ACAAACAATA CGACGTTCTT CTTCTCGTAG GGCTGGGGAT CGGCGCCACC  CCACTGATCA GCATCGTCAA GGATGTACTC AACAACATCA AGGACCAGAA AGACATCGAA AATGGCGTTG GTGATAAGCA AGCCAAACCT TTTGTCACCA AGCGAGCTTA CTTCTACTGG  GTGACAAGAG AGCAAGGCTC ATTCGAATGG TTTAGAGGTG TCATGGATGA AGTCGCAGAG AACGATAGAG ACAGAGTGAT TGAACTGCAC AACTACTGCA CCAGCGTTTA CGAAGAAGGT  GATGCTCGGT CTGCCCTCAT TACCATGCTT CAAGATCTCA ACCACGCCAA GAACGGCGTC GATATTGTGT CCGGGACAAG GGTGAAGACT CATTTCGCTA GACCCAACTG GCGAAATGTC  TTGAAGCATG TTGCTGTTAA CCACCCTGAT CAAAGAGTTG GGGTGTTTTA CTGTGGAGCA CAAGGACTAG TAGGAGAGCT AAGGAGATTA TCACAAGACT TTTCTAGGAA AACAACCACC 
AAATTTGATT TCCACAAGGA GAACTTTTAG 

Retrieve as FASTA