Entry information : CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Entry ID 16407
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Name CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaRboh04
start..stop
S start..stop
ClanRboh07 1768 0 1..947 1..949
CclRboh01 1516 0 1..948 1..947
CsRboh01 1513 0 1..948 1..947
DgloRboh04 1511 0 1..947 1..948
Literature and cross-references CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Protein sequence: CsaRboh04(Cucsa.107010/ Cucsat_evmmodelChr4594)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   947 (347)
PWM (Da):   %s   108099.5 (36568.6) Transmb domain:   %s   o391-410i469-488o528-550i571-593o597-614i750-767o
PI (pH):   %s   8.98 (4.26) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-365
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTTPEQECR WGSDDITQLD TMIFGSQFSN LTEEFVEVTL DVQENNTVVL RSVEPATIIN IDDGVSGGSA TPALTSPSTS RSTSVKRSSS HRFRQFSHEL KVEARAKAKH FSHELKTELR  KFSWSRSHVS KAFPASSSTV NSNGGVGAEQ NGMDSALAAR DLRRQRAKLD RTRSGAEKAL YGLRFISKKN KTTGVDSYSE LESNFNKLAK DGFLSRADFA QCIGMKDSKE FALELFDALS  RRRRLNNSDQ ISRDDLFEFW LQITDQSFDS RLQIFFDMVD KNEDGHVTEE EVKEIIMLSA SANKLSRLKE QAEEYAALIM EELDPERLGY IELWQLETLL LQKDTYMNYS RALSFTSQAL  SQNLQGIRQR SSIKRLGTKV LYFLRENWKR IWVLTLWIMV MVGLFIWKFF QYRNKNAFKI MGYCLTTAKG AAETLKFNMA LILLPVCRNT ITWLRKTKIG YYVPFDDNIN FHKIIAVAII  VGIILHAGNH LACDFPRLLK SSDADYAYVM DDFGKNKPSY MDLVKGCEGV TGILMVIFMA IAFILATRWF RRNLIKLPHP FDRLTGYNAF WYSHHLFILV YILLIIHGLF LYLVHRWYLM  TTWMYIAVPV LLYAGERILR FFRSGSYSVQ IQKVAIYPGN VLKLQMFKPP QFHYKSGQYM FVQCPAVSPF EWHPFSITSA PGDDYLSIHV RQLGDWTQEL KRVFSEVCEP SVPGKSGLLR  ADETTTKSLP KLSIDGPYGA PAQDYHKYDV LLLVGLGIGA TPFISILKDL LNNIVKVEEQ LDSPTDISSS GDINYLDKDC HAPKRKTNLK TTNAYFYWVT REQGSFDWFK GVMNEISELD 
QRGLIEMHNY LTSVYEEGDA RSTLITMVQA LNHAKNGVDI VSGTRVRTHF ARPNWKKVLS KITSKHCGAR IGVFYCGAPV LAKELGELCH EINQKGSAKL DFHKEHF* 

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Remarks Incorrect prediction from Phytozome
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCACGA CTCCAGAGCA GGAGTGCCGA TGGGGATCGG ACGATATTAC ACAGCTTGAC ACGATGATTT TCGGATCACA GTTCAGCAAC CTGACGGAGG AGTTTGTGGA GGTGACGCTT  GATGTACAAG AAAACAACAC GGTTGTGCTT CGAAGTGTTG AACCAGCCAC TATAATCAAT ATCGACGATG GCGTCTCCGG TGGTTCTGCA ACGCCGGCCT TAACTTCCCC TTCGACTTCT  AGATCTACCT CGGTTAAGCG GAGTTCTTCG CATCGGTTTC GGCAGTTCTC TCATGAACTC AAGGTGGAAG CCAGAGCTAA GGCGAAGCAT TTCTCTCACG AATTGAAGAC CGAATTGAGG  AAATTCTCAT GGAGCCGGAG CCATGTGTCG AAAGCATTCC CCGCGTCATC TTCAACCGTG AACTCGAACG GTGGTGTTGG AGCAGAGCAA AACGGAATGG ATTCGGCATT AGCTGCTAGA  GATTTGAGAA GGCAACGAGC AAAGCTTGAT CGAACTCGTT CCGGGGCCGA GAAGGCTTTA TATGGATTAA GATTCATAAG CAAAAAAAAC AAAACGACTG GCGTCGATTC GTATAGTGAA  CTTGAGAGCA ATTTCAATAA GCTTGCCAAG GACGGATTTC TCAGCCGCGC CGATTTCGCG CAATGCATAG GTATAAACTA TAAACTTGGC CGTCAACACA GCTACTAATA ATTTCAGTAT  ATATTTTGGA GAAAATTTCA ATTGATTTCG TTTTTTTTTT TTTTTGGTTT TTGATTTGAA TTAAAGGAAT GAAAGATTCA AAAGAGTTTG CTCTGGAGTT GTTCGATGCT CTAAGTCGGA  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CDS
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ATGACCACGA CTCCAGAGCA GGAGTGCCGA TGGGGATCGG ACGATATTAC ACAGCTTGAC ACGATGATTT TCGGATCACA GTTCAGCAAC CTGACGGAGG AGTTTGTGGA GGTGACGCTT  GATGTACAAG AAAACAACAC GGTTGTGCTT CGAAGTGTTG AACCAGCCAC TATAATCAAT ATCGACGATG GCGTCTCCGG TGGTTCTGCA ACGCCGGCCT TAACTTCCCC TTCGACTTCT  AGATCTACCT CGGTTAAGCG GAGTTCTTCG CATCGGTTTC GGCAGTTCTC TCATGAACTC AAGGTGGAAG CCAGAGCTAA GGCGAAGCAT TTCTCTCACG AATTGAAGAC CGAATTGAGG  AAATTCTCAT GGAGCCGGAG CCATGTGTCG AAAGCATTCC CCGCGTCATC TTCAACCGTG AACTCGAACG GTGGTGTTGG AGCAGAGCAA AACGGAATGG ATTCGGCATT AGCTGCTAGA  GATTTGAGAA GGCAACGAGC AAAGCTTGAT CGAACTCGTT CCGGGGCCGA GAAGGCTTTA TATGGATTAA GATTCATAAG CAAAAAAAAC AAAACGACTG GCGTCGATTC GTATAGTGAA  CTTGAGAGCA ATTTCAATAA GCTTGCCAAG GACGGATTTC TCAGCCGCGC CGATTTCGCG CAATGCATAG GAATGAAAGA TTCAAAAGAG TTTGCTCTGG AGTTGTTCGA TGCTCTAAGT  CGGAGACGAA GACTCAATAA CTCGGATCAA ATTAGTAGAG ACGATTTGTT TGAGTTCTGG TTGCAAATTA CAGATCAAAG TTTTGATTCC AGGCTTCAGA TCTTCTTCGA CATGGTCGAT  AAGAACGAAG ATGGCCATGT CACGGAAGAA GAAGTAAAAG AGATTATCAT GCTAAGTGCG TCAGCCAACA AGCTGTCAAG ACTTAAGGAA CAAGCAGAGG AATATGCAGC CTTAATCATG  GAAGAATTAG ACCCAGAAAG ACTAGGTTAT ATTGAGCTAT GGCAATTGGA GACACTTCTG CTGCAAAAGG ACACATACAT GAACTACAGT CGTGCCTTAA GCTTTACCAG CCAAGCCTTG  AGCCAGAACC TACAGGGCAT TAGACAAAGA AGCTCAATTA AAAGACTTGG CACCAAAGTA CTTTATTTTC TGCGAGAGAA TTGGAAGCGA ATTTGGGTTT TGACACTTTG GATTATGGTC  ATGGTTGGGC TTTTCATATG GAAGTTTTTT CAGTACAGAA ATAAAAACGC CTTCAAAATT ATGGGATACT GTCTCACCAC GGCAAAGGGT GCGGCTGAGA CCTTGAAGTT CAACATGGCA  CTCATTCTTT TGCCAGTTTG TAGAAATACT ATTACTTGGC TAAGGAAAAC CAAAATAGGT TACTACGTAC CTTTTGATGA CAACATCAAT TTTCACAAGA TAATTGCGGT GGCTATTATA  GTTGGTATCA TTCTCCATGC TGGAAACCAT CTTGCATGTG ATTTTCCAAG GCTGCTAAAA TCATCCGATG CTGACTATGC GTATGTAATG GATGACTTTG GTAAGAATAA GCCCAGCTAT  ATGGACCTTG TTAAAGGGTG TGAAGGTGTT ACGGGAATCT TAATGGTGAT CTTCATGGCA ATAGCTTTCA TACTTGCAAC ACGATGGTTT CGGAGAAACC TCATTAAGCT ACCCCACCCC  TTTGATAGGC TCACTGGATA CAATGCCTTC TGGTATTCAC ACCACTTATT CATTCTTGTT TACATATTGC TCATCATTCA TGGCCTGTTC CTGTATCTCG TGCACAGATG GTATCTTATG  ACGACATGGA TGTATATTGC TGTTCCAGTT TTGCTGTATG CTGGAGAGAG GATCCTGAGA TTCTTCCGCT CTGGATCATA TAGTGTTCAA ATCCAAAAGG TTGCCATTTA TCCTGGAAAT  GTTCTCAAGT TGCAAATGTT CAAGCCGCCC CAATTTCATT ACAAAAGTGG ACAGTACATG TTTGTTCAGT GTCCTGCAGT TTCTCCCTTT GAATGGCATC CATTTTCAAT TACCTCGGCT  CCTGGAGATG ACTACCTTAG CATCCATGTA CGGCAGCTTG GTGATTGGAC CCAAGAGCTT AAAAGGGTTT TCTCCGAGGT TTGTGAGCCT TCCGTCCCCG GCAAGAGTGG CCTTCTAAGA  GCGGATGAAA CTACAACTAA AAGTTTGCCA AAGCTTTCAA TAGATGGACC ATACGGTGCC CCAGCACAGG ACTACCATAA ATATGATGTG CTACTACTTG TTGGCTTAGG CATTGGGGCT  ACACCTTTCA TCAGCATTTT GAAGGATTTG TTGAATAACA TCGTGAAAGT GGAGGAGCAG CTGGATTCAC CTACTGATAT CAGTAGCTCT GGAGACATCA ATTATCTGGA CAAAGATTGT  CACGCTCCTA AAAGAAAGAC TAATCTGAAG ACCACAAATG CCTACTTTTA TTGGGTAACT AGAGAGCAGG GCTCCTTTGA CTGGTTCAAA GGCGTTATGA ATGAAATCTC CGAGCTGGAT  CAAAGGGGGT TAATTGAGAT GCATAACTAT CTGACTAGTG TGTATGAGGA AGGAGACGCT CGTTCAACTC TCATTACCAT GGTTCAAGCC CTCAATCATG CTAAGAATGG AGTAGATATT  GTATCTGGCA CCAGGGTGCG AACCCACTTT GCGAGGCCCA ACTGGAAGAA AGTTCTCAGC AAAATCACTT CCAAGCACTG TGGTGCCAGG ATAGGTGTCT TCTATTGCGG AGCTCCAGTT 
TTGGCCAAAG AACTTGGTGA GCTCTGCCAT GAGATTAACC AAAAGGGTTC AGCAAAGTTA GATTTTCATA AGGAGCATTT TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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TTGGCCAAAG AACTTGGTGA GCTCTGCCAT GAGATTAACC AAAAGGGTTC AGCAAAGTTA GATTTTCATA AGGAGCATTT TTAA 

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