Entry information : FvRboh07(Fraves_FvH4_5g13850.1)
Entry ID 16430
Creation 2020-03-24 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-04-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: FvRboh07(Fraves_FvH4_5g13850.1)
Name FvRboh07(Fraves_FvH4_5g13850.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rosaceae Fragaria
Organism Fragaria vesca    [TaxId: 57918 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value FvRboh07
start..stop
S start..stop
DdruRboh09 1263 0 28..791 40..809
PpeRboh07 1253 0 26..792 36..811
ToriRboh11 1133 0 39..791 54..799
PandeRboh08 1118 0 58..791 79..804
Literature and cross-references FvRboh07(Fraves_FvH4_5g13850.1)
Protein sequence: FvRboh07(Fraves_FvH4_5g13850.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   791 (378)
PWM (Da):   %s   90139.67 (41501.4) Transmb domain:   %s   o261-280i401-423o443-465i609-626o
PI (pH):   %s   8.57 (5.60) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-399
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEAQPASLSP SSSSSCSTND NIMLPSFSSV WTESDKTEPL QAVNQEQAPI PMSDIGLLRF MELTANGGMR WEDVKDRFDR LSITLGQTEP VIKWSDFGLC IGMEQSQEFA NQLLRALRKS  KDRNFGIPKA ELQSYWSRMT DPCFSSRMQI FFDMCDRNME GRITEIDIKQ TITLSATTNK LFLTPEEAED YAALVMEVLD TEKRGYIELP QFETLIKMNL SKASFSHNHL SIRHDPYHNF  DQVQKPNSRI NILFRTYWRR AWIVLLWLII CSALFTWKFL QYRHRAAFQV MGYCLSSAKG AAETLKFNMA LILLPVCRNT ITWLRRNRSI NSIIPFNDTI NFHKLIAGGV VVGVILHGGC  HLACDLPRIS ESDHVIFGQT IAARFGYHQP SYFEILTTKE VASGIGMVIL MAVAFSLATR WPRRGSPSLP KSVRNVTGYN TFWYSHHLFI PVYALLIFHS IFLFLTNNVT EKTQTLMYIA  IPVLLYTGER VFRAIRSGFY EVEMSKASIY PGKVLSLKLH KPKGFKYLSG MYIFIQCPQI SPFEWHPFSL TSGPEDDYLS VHIRTTGDWS YQIYSLFQEA TLSGLNSYPK VHIDGPYGAP  SQDHIKYDII VLIGLGIGAT PFIGILKDIV NSAQNSSHCD HHSGCRECSS RKSPLKAYLF WVTREQSSFE WFRDIMKEIS DSKEKQSIVE MHSFLTSVYQ EGDARSVLIS AIQALLYAKN 
GIDFVSRTPV RTHFARPNWS SIFSELACRH RGARIGVFYC GASTLAEELQ GMCTKFSTKT STRFVFHKEN Y* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAC AGCCAGCTTC GCTATCACCA TCTTCATCAT CATCTTGCAG TACAAATGAT AACATTATGC TACCTTCTTT CTCTTCGGTT TGGACTGAAT CCGATAAAAC AGAACCACTC  CAAGCTGTGA ACCAGGAGCA GGCACCCATT CCCATGTCAG ATATTGGATT GCTGAGATTT ATGGAACTCA CTGCCAATGG TGGGATGAGG TGGGAGGATG TAAAGGACCG GTTTGACCGG  CTTTCCATCA CCCTGGGGCA AACTGAACCG GTTATAAAAT GGTCTGATTT TGGTTTGTGC ATAGGTGAGC AAACTTGTAT TTACTTTTAA GGTTTCTGAT ACAAAATGAG GAGCCTTGGC  ATACATGAAC AAGTGACTGG TATATTACTT ATGACAATCA TATTATTGAT CGAATTTGTG CTCAGTTTTC TATCTTTTTT TTTCTTTTCT TTTTTGAAAA GAGTTTTCTA TCTTTTATGC  ACACTTGACT TTTGGTAGGG ATGGAACAGT CGCAAGAGTT CGCTAATCAG CTACTAAGGG CTCTAAGGAA AAGCAAGGAT CGGAATTTTG GTATACCAAA AGCTGAACTG CAGAGTTACT  GGTCTCGTAT GACCGACCCT TGCTTCAGTT CAAGGATGCA GATATTCTTT GACATGTAAT GATCATTTGT ATTATAAAGT TCTATATCCT TTCTGCAAGA ATAGTAAACT CCATTTCTAA  ATTTTTGTAA TTCTTTTCAG GTGTGACAGA AACATGGAGG GAAGAATAAC AGAAATAGAT ATCAAGCAGG TAATTTGTGT CTCTATATTT CCTAGATTTA GGTTTATAAG GGGCTGTGCA  TCAGTTTTGT GCTGGTGTTT ACTTGTTTCC TTGGAATTTG GGATTTTCAG ACTATTACAC TAAGTGCTAC TACAAATAAG TTATTTTTGA CACCTGAGGA AGCAGAAGAC TATGCTGCTT  TGGTCATGGA GGTGCTTGAC ACTGAAAAAA GGGGCTACAT TGAGGTACCT TTCAAAAGTA GAAAAATGGA TTCTTCAAAA AACAATAAGA TACAAATTGA CTTCTGAATG TTTGTGACTA  TCTTGCAGCT TCCACAATTT GAGACCCTCA TCAAAATGAA CTTATCAAAG GCCTCTTTCT CACATAACCA CTTGTCAATC AGACATGATC CCTATCACAA TTTTGACCAA GTTCAAAAGC  CAAATTCCAG GATAAATATT TTGTTTCGAA CTTATTGGCG ACGAGCATGG ATAGTTTTGC TGTGGTTGAT CATATGTAGT GCACTCTTCA CTTGGAAATT TCTACAATAT AGGCATAGAG  CAGCTTTTCA AGTAATGGGG TACTGCCTAT CCTCTGCCAA AGGTGCTGCT GAAACCCTCA AATTCAACAT GGCTCTAATT CTCCTCCCTG TCTGTCGTAA TACAATTACA TGGCTGCGAA  GGAACCGTTC AATCAACTCA ATCATTCCAT TTAATGACAC TATCAACTTC CACAAGGTAA TGTGGCTTAT ACTCATAGCT TAACTCTAAT AGTAGAAACT TCCTCCACAA GAAATGTTTT  AAGCTACTAC TGACACAGAT GCTTACCTTG TCTATGTATA GCTCATAGCA GGAGGGGTAG TGGTAGGAGT TATCCTACAT GGTGGTTGTC ACCTAGCCTG TGATTTACCA AGAATTAGTG  AGTCAGATCA TGTAATATTC GGGCAAACAA TAGCTGCCCG ATTCGGGTAC CATCAACCAT CATACTTTGA AATATTGACC ACAAAGGAAG TGGCATCAGG AATTGGTATG GTGATACTAA  TGGCCGTAGC ATTCTCACTT GCAACACGAT GGCCACGCCG GGGGTCACCT TCACTGCCAA AGTCAGTCCG GAATGTCACA GGATACAATA CCTTTTGGTA CTCACACCAC TTGTTCATTC  CTGTATATGC ATTGCTCATT TTTCACTCTA TATTCCTCTT CCTTACAAAC AACGTAACTG AAAAAACGGT AAGCCGTTCA ATTAGTCCTT GTGTATATGG AATATTAACT TCATATACTG  TCTGTCATGA TGCTAACAAT GTGCTTCAGC AGACATTGAT GTACATTGCC ATTCCAGTTC TGTTATACAC CGGAGAACGA GTGTTTCGAG CCATAAGATC TGGATTCTAT GAGGTGGAAA  TGTCAAAGGT AATATGCCAA TACCATCACC ATCCTTGTTA ATTTGAAGCA GTGACTCAGT GAGGTTAAAG TTTTGTCTAC TTCCTTCTGT GCAGGCAAGT ATTTATCCTG GAAAAGTTTT  GTCCCTCAAA TTGCACAAAC CAAAAGGTTT CAAGTACCTG AGTGGCATGT ACATATTCAT TCAATGCCCT CAGATTTCGC CATTTGAATG GTAAGTATGT GTTACTTTTC TCCAACCATA  TATTCATCAG CCTAAGATTA AAGCTAAGCA ATGTAATATA TTCTTCAGTC TTTACCATGT TCTTTTCTCA TTTCAGGCAC CCGTTTTCGT TAACTTCAGG ACCAGAAGAT GACTACCTAA  GTGTGCATAT TAGAACTACT GGGGACTGGA GTTACCAAAT ATACAGTCTT TTCCAAGAGG TGAAGTGGAA AATATTGTTG GGGAAAATGA ATGAAAAGAC TCAATTCTAA CTCTCACTTA  AACTTTTTTT ATGAAATTCT GCAGGCAACA TTATCAGGGC TTAACAGTTA CCCTAAAGTA CACATTGATG GACCTTATGG TGCTCCATCT CAAGACCATA TCAAGTATGA TATCATTGTT  CTAATCGGTC TAGGCATAGG CGCTACACCT TTCATTGGCA TCCTCAAAGA TATTGTCAAT AGTGCTCAAA ACTCATCACA TTGTGATCAT CATGTATGGT TCTTAGTTTT TACTTTTCAC  TTGAGAAATT TGAAAAATAC TCAAAAATCC TTCTGATGGC TATATTCGAA ATAGTCTGGT TGCAGAGAAT GCAGCTCAAG AAAGTCTCCA CTAAAAGCCT ATCTTTTTTG GGTCACAAGA  GAACAGAGCT CCTTTGAATG GTTTAGAGAC ATCATGAAGG AAATATCAGA TTCAAAAGAA AAGCAGGTAA AAGCCTGCAA AGGTTATACT TTCATTGCAA CTGTTCATTA ATGAAGTAAG  GTTTACCAGT CTGCAATGTG CACTCTAATA ACTTGTGGTG ATCATTCTTT AGTCTATTGT AGAGATGCAC AGTTTCTTAA CTTCTGTTTA TCAAGAGGGA GATGCGCGTT CGGTTCTGAT  AAGTGCAATA CAAGCATTGC TTTATGCCAA AAATGGTATT GACTTTGTCT CCCGGACTCC GGTAAGTACT GCATCATAAA CCCTTTGGTT GTACATCACT CATCAATTGG TTAGCACGGT  GCATTTGGGG TATCTATATA CTAGACTCTT TGCCTCACTG AGTGAAGGTT TCTCTAGGAA AGCATTCTGA TCTTATTTGC GACGAAATTT TCAGGTAAGA ACACATTTTG CCCGGCCAAA  CTGGTCCAGC ATCTTCTCAG AATTGGCTTG TAGACACAGA GGAGCACGGA TTGGTAAGGA ACTCTTGGAA AACAATGAGA TATTCTGTAG ATTGGTCATT GCCATAGCTA ATTTGGAGAG  TTGGGTTTTT TCTTGGACAG GGGTTTTCTA CTGTGGGGCT TCAACCTTGG CAGAAGAGTT GCAGGGAATG TGTACCAAAT TTTCGACCAA AACTTCCACA AGATTTGTAT TTCACAAGGA 
GAATTATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAC AGCCAGCTTC GCTATCACCA TCTTCATCAT CATCTTGCAG TACAAATGAT AACATTATGC TACCTTCTTT CTCTTCGGTT TGGACTGAAT CCGATAAAAC AGAACCACTC  CAAGCTGTGA ACCAGGAGCA GGCACCCATT CCCATGTCAG ATATTGGATT GCTGAGATTT ATGGAACTCA CTGCCAATGG TGGGATGAGG TGGGAGGATG TAAAGGACCG GTTTGACCGG  CTTTCCATCA CCCTGGGGCA AACTGAACCG GTTATAAAAT GGTCTGATTT TGGTTTGTGC ATAGGGATGG AACAGTCGCA AGAGTTCGCT AATCAGCTAC TAAGGGCTCT AAGGAAAAGC  AAGGATCGGA ATTTTGGTAT ACCAAAAGCT GAACTGCAGA GTTACTGGTC TCGTATGACC GACCCTTGCT TCAGTTCAAG GATGCAGATA TTCTTTGACA TGTGTGACAG AAACATGGAG  GGAAGAATAA CAGAAATAGA TATCAAGCAG ACTATTACAC TAAGTGCTAC TACAAATAAG TTATTTTTGA CACCTGAGGA AGCAGAAGAC TATGCTGCTT TGGTCATGGA GGTGCTTGAC  ACTGAAAAAA GGGGCTACAT TGAGCTTCCA CAATTTGAGA CCCTCATCAA AATGAACTTA TCAAAGGCCT CTTTCTCACA TAACCACTTG TCAATCAGAC ATGATCCCTA TCACAATTTT  GACCAAGTTC AAAAGCCAAA TTCCAGGATA AATATTTTGT TTCGAACTTA TTGGCGACGA GCATGGATAG TTTTGCTGTG GTTGATCATA TGTAGTGCAC TCTTCACTTG GAAATTTCTA  CAATATAGGC ATAGAGCAGC TTTTCAAGTA ATGGGGTACT GCCTATCCTC TGCCAAAGGT GCTGCTGAAA CCCTCAAATT CAACATGGCT CTAATTCTCC TCCCTGTCTG TCGTAATACA  ATTACATGGC TGCGAAGGAA CCGTTCAATC AACTCAATCA TTCCATTTAA TGACACTATC AACTTCCACA AGCTCATAGC AGGAGGGGTA GTGGTAGGAG TTATCCTACA TGGTGGTTGT  CACCTAGCCT GTGATTTACC AAGAATTAGT GAGTCAGATC ATGTAATATT CGGGCAAACA ATAGCTGCCC GATTCGGGTA CCATCAACCA TCATACTTTG AAATATTGAC CACAAAGGAA  GTGGCATCAG GAATTGGTAT GGTGATACTA ATGGCCGTAG CATTCTCACT TGCAACACGA TGGCCACGCC GGGGGTCACC TTCACTGCCA AAGTCAGTCC GGAATGTCAC AGGATACAAT  ACCTTTTGGT ACTCACACCA CTTGTTCATT CCTGTATATG CATTGCTCAT TTTTCACTCT ATATTCCTCT TCCTTACAAA CAACGTAACT GAAAAAACGC AGACATTGAT GTACATTGCC  ATTCCAGTTC TGTTATACAC CGGAGAACGA GTGTTTCGAG CCATAAGATC TGGATTCTAT GAGGTGGAAA TGTCAAAGGC AAGTATTTAT CCTGGAAAAG TTTTGTCCCT CAAATTGCAC  AAACCAAAAG GTTTCAAGTA CCTGAGTGGC ATGTACATAT TCATTCAATG CCCTCAGATT TCGCCATTTG AATGGCACCC GTTTTCGTTA ACTTCAGGAC CAGAAGATGA CTACCTAAGT  GTGCATATTA GAACTACTGG GGACTGGAGT TACCAAATAT ACAGTCTTTT CCAAGAGGCA ACATTATCAG GGCTTAACAG TTACCCTAAA GTACACATTG ATGGACCTTA TGGTGCTCCA  TCTCAAGACC ATATCAAGTA TGATATCATT GTTCTAATCG GTCTAGGCAT AGGCGCTACA CCTTTCATTG GCATCCTCAA AGATATTGTC AATAGTGCTC AAAACTCATC ACATTGTGAT  CATCATTCTG GTTGCAGAGA ATGCAGCTCA AGAAAGTCTC CACTAAAAGC CTATCTTTTT TGGGTCACAA GAGAACAGAG CTCCTTTGAA TGGTTTAGAG ACATCATGAA GGAAATATCA  GATTCAAAAG AAAAGCAGTC TATTGTAGAG ATGCACAGTT TCTTAACTTC TGTTTATCAA GAGGGAGATG CGCGTTCGGT TCTGATAAGT GCAATACAAG CATTGCTTTA TGCCAAAAAT  GGTATTGACT TTGTCTCCCG GACTCCGGTA AGAACACATT TTGCCCGGCC AAACTGGTCC AGCATCTTCT CAGAATTGGC TTGTAGACAC AGAGGAGCAC GGATTGGGGT TTTCTACTGT 
GGGGCTTCAA CCTTGGCAGA AGAGTTGCAG GGAATGTGTA CCAAATTTTC GACCAAAACT TCCACAAGAT TTGTATTTCA CAAGGAGAAT TATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAC AGCCAGCTTC GCTATCACCA TCTTCATCAT CATCTTGCAG TACAAATGAT AACATTATGC TACCTTCTTT CTCTTCGGTT TGGACTGAAT CCGATAAAAC AGAACCACTC  CAAGCTGTGA ACCAGGAGCA GGCACCCATT CCCATGTCAG ATATTGGATT GCTGAGATTT ATGGAACTCA CTGCCAATGG TGGGATGAGG TGGGAGGATG TAAAGGACCG GTTTGACCGG  CTTTCCATCA CCCTGGGGCA AACTGAACCG GTTATAAAAT GGTCTGATTT TGGTTTGTGC ATAGGGATGG AACAGTCGCA AGAGTTCGCT AATCAGCTAC TAAGGGCTCT AAGGAAAAGC  AAGGATCGGA ATTTTGGTAT ACCAAAAGCT GAACTGCAGA GTTACTGGTC TCGTATGACC GACCCTTGCT TCAGTTCAAG GATGCAGATA TTCTTTGACA TGTGTGACAG AAACATGGAG  GGAAGAATAA CAGAAATAGA TATCAAGCAG ACTATTACAC TAAGTGCTAC TACAAATAAG TTATTTTTGA CACCTGAGGA AGCAGAAGAC TATGCTGCTT TGGTCATGGA GGTGCTTGAC  ACTGAAAAAA GGGGCTACAT TGAGCTTCCA CAATTTGAGA CCCTCATCAA AATGAACTTA TCAAAGGCCT CTTTCTCACA TAACCACTTG TCAATCAGAC ATGATCCCTA TCACAATTTT  GACCAAGTTC AAAAGCCAAA TTCCAGGATA AATATTTTGT TTCGAACTTA TTGGCGACGA GCATGGATAG TTTTGCTGTG GTTGATCATA TGTAGTGCAC TCTTCACTTG GAAATTTCTA  CAATATAGGC ATAGAGCAGC TTTTCAAGTA ATGGGGTACT GCCTATCCTC TGCCAAAGGT GCTGCTGAAA CCCTCAAATT CAACATGGCT CTAATTCTCC TCCCTGTCTG TCGTAATACA  ATTACATGGC TGCGAAGGAA CCGTTCAATC AACTCAATCA TTCCATTTAA TGACACTATC AACTTCCACA AGCTCATAGC AGGAGGGGTA GTGGTAGGAG TTATCCTACA TGGTGGTTGT  CACCTAGCCT GTGATTTACC AAGAATTAGT GAGTCAGATC ATGTAATATT CGGGCAAACA ATAGCTGCCC GATTCGGGTA CCATCAACCA TCATACTTTG AAATATTGAC CACAAAGGAA  GTGGCATCAG GAATTGGTAT GGTGATACTA ATGGCCGTAG CATTCTCACT TGCAACACGA TGGCCACGCC GGGGGTCACC TTCACTGCCA AAGTCAGTCC GGAATGTCAC AGGATACAAT  ACCTTTTGGT ACTCACACCA CTTGTTCATT CCTGTATATG CATTGCTCAT TTTTCACTCT ATATTCCTCT TCCTTACAAA CAACGTAACT GAAAAAACGC AGACATTGAT GTACATTGCC  ATTCCAGTTC TGTTATACAC CGGAGAACGA GTGTTTCGAG CCATAAGATC TGGATTCTAT GAGGTGGAAA TGTCAAAGGC AAGTATTTAT CCTGGAAAAG TTTTGTCCCT CAAATTGCAC  AAACCAAAAG GTTTCAAGTA CCTGAGTGGC ATGTACATAT TCATTCAATG CCCTCAGATT TCGCCATTTG AATGGCACCC GTTTTCGTTA ACTTCAGGAC CAGAAGATGA CTACCTAAGT  GTGCATATTA GAACTACTGG GGACTGGAGT TACCAAATAT ACAGTCTTTT CCAAGAGGCA ACATTATCAG GGCTTAACAG TTACCCTAAA GTACACATTG ATGGACCTTA TGGTGCTCCA  TCTCAAGACC ATATCAAGTA TGATATCATT GTTCTAATCG GTCTAGGCAT AGGCGCTACA CCTTTCATTG GCATCCTCAA AGATATTGTC AATAGTGCTC AAAACTCATC ACATTGTGAT  CATCATTCTG GTTGCAGAGA ATGCAGCTCA AGAAAGTCTC CACTAAAAGC CTATCTTTTT TGGGTCACAA GAGAACAGAG CTCCTTTGAA TGGTTTAGAG ACATCATGAA GGAAATATCA  GATTCAAAAG AAAAGCAGTC TATTGTAGAG ATGCACAGTT TCTTAACTTC TGTTTATCAA GAGGGAGATG CGCGTTCGGT TCTGATAAGT GCAATACAAG CATTGCTTTA TGCCAAAAAT  GGTATTGACT TTGTCTCCCG GACTCCGGTA AGAACACATT TTGCCCGGCC AAACTGGTCC AGCATCTTCT CAGAATTGGC TTGTAGACAC AGAGGAGCAC GGATTGGGGT TTTCTACTGT 
GGGGCTTCAA CCTTGGCAGA AGAGTTGCAG GGAATGTGTA CCAAATTTTC GACCAAAACT TCCACAAGAT TTGTATTTCA CAAGGAGAAT TATTAA 

Retrieve as FASTA