Entry information : AtrAPx-R01(AmTr_v1.0_scaffold00078.14)
Entry ID 16602
Creation 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrAPx-R01(AmTr_v1.0_scaffold00078.14)
Name AtrAPx-R01(AmTr_v1.0_scaffold00078.14)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrAPx-R01
start..stop
S start..stop
VvAPx-R 405 3e-143 34..314 44..328
EferAPx-R02 396 2e-139 44..316 52..330
EferAPx-R01 391 2e-137 44..316 52..330
CclAPx-R 389 1e-136 44..314 61..333
Literature and cross-references AtrAPx-R01(AmTr_v1.0_scaffold00078.14)
Protein sequence: AtrAPx-R01(AmTr_v1.0_scaffold00078.14)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316
PWM (Da):   %s   34602.93  
PI (pH):   %s   6.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGELPDVHPF NYIIIIFPVS AYPNRLVLLI QIGSQVIQNP ILDRKNSCNC HKRRALLLSS ILPLLLPLHH LPQSFDACAV EDNDSSLIRD ELRKVMSKAK AAGLLRLVFH DAGTFDLDDD  SGGINGSLVF ELDRPENAGL RKPLKVLAKA KTNIDKIVPV SWADMIALAG AEAVSLCGGP KIPVELGRLD ALVPDPEGRL PEESSDASSL KTCFQRKGLS TQDLVALSGA HTLGGKGFGN 
PTVFDNSYFK ILLEKPWNSS ADMSSMIGLP SDHALAEDDE CLRWITLYAE NEKRFFSDFV TAYTKLVNSG ARWQKS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGAGT TGCCTGACGT CCACCCATTT AATTATATTA TAATTATTTT CCCGGTTTCA GCCTATCCAA ATCGCCTGGT TCTACTGATC CAGATTGGTT CACAGGTGAT CCAAAACCCA  ATTCTGGGTA AAGTACTAAG AACCACTATA AATTCAGAAG TCTCTAATAT ATAGTAAACA TATGGACTTC CTTTTGTTAG GTATATTGAA CTTGATTCTT TCATTGCATG TAACTCTTGA  TGAATTCTAT ATTGTGCAGA TAGGAAGAAC TCCTGTAATT GTCATAAGAG GAGAGCACTT CTCCTTTCTT CAATTCTGCC ACTGCTGCTA CCTCTACACC ATCTGCCACA AAGTTTTGAT  GCCTGTGCTG TAGGTATTTT CAGATACCCA TTGTTTCTTC ATGGTTTTCC TGTGTTTTTA CTTCTACCAT TGTGAATCAT CTTGCATTTG CCAAACTCAT TGGGAATGCT GCTAGCAACT  TCACACATTT AGATTAGGAT TCTTACATAC AATTGAAGTT CTTATATATA TGTGATCTGC ATTGGGTATT TTAGTTATTT ACATGCAACC AAAATGATTC TGAATTGAAT TGCCCCTTCT  TGTCTTCTAA CATGTGTAGG AATAGGTCCA CTAGTATACT TTCGAAATTG ATCTGAATAA TTTTTGGTGC TCTCTGTGCA TGTTTTGTTG GCTAAACTTT ATGTTTTGGA TGGTGTATGT  TGGACGAGTA GAGGATAATG ATTCTTCACT TATAAGAGAT GAGCTAAGGA AAGTCATGTC CAAGGCCAAA GCTGCTGGTT TGCTACGCCT TGTATTTCAT GATGCAGGGA CATTCGACTT  GGATGATGAT TCAGGTAATC GTCCAGAGGA TATGTGGTTA GAAGACCTTT ACAATGGTAT CTTATGTATT TCGAACCACT TTCTCTTATG GATCCAATTT GTGTAAGAAA GAAGGATGGG  TTTGCTTAAT GGCATTGAGT CTGTGTCTCA GCTTGTAGGT TGCAGCTTTG AAAGTCATCG TTATTAGTGA AGGAATTGGC ATGCAATACT ACAATAGTAC ACATGTGTAT ACACAACACA  AAACTTCTTC TTGCAGTAAT TATCTTGTAA AAAGCTTTCA AAGTCAATAT ATGATTCTAA AGAGTTGCTT CCTTGGCGTT AAAAGACTGA GACCAGTGGA ACCAGCAGAA GGCTTTCTCT  TGATAGTTGA AACCACTTTA CAAATGCCAA TGCACAATCA TAGAACCACT AGGGTTAGGG CTACGAAGAT AGGGACAAGT CCCATAACAA TTTTTACTTT TTTCAAGAAC TCTGAGTTGA  AATGGACTCG ATGAATTCAC CTCTATTCTA CTCTGCACCA ACTTAGCACT CAAGATCTGC ACATGCGAAT GAAATACAAT GCTAATGTCA CGTGCATTAA ATTACCACAA CTTTGCTTGT  AATTCAGACT TTACTTCAAG AAATGTGTCT ATTACCAAGT AAAAATGATT TTTTATACTG AAATGATTGT GCATGGCGTT ATGAAGTTCT GAATGTCTGA GGAGCAAATT GTACACTTGC  TTCCTCGGGC AAAAGACCTA CTTATGAGAA TTTTCTCAAT CCCATTAGAA TCACTACATG AATATTTTCC AAGACAAAAA AAAAGAAAAA AAAAGACAGG ATTTTGAGTT CCTATGAACT  TAGATCTGAC CATCCAAAAA TTGGATCGTC TCTTATCAGT TCTGGGGCAT TATTTTTTTC AGGCACATAT ATAGTCCATG TGTTTTTCTT TTTCTTTTTT GTTTTAATTT TTTGTCGTTG  ATCAGTAGGT CAATAAGGTT ACGTCCCCAA AACTTGGGGT CCTAAAAAAA CTCCTAGATA TGGTTTTACC CATGGGAGTG AATGGGCAAT CGGCTCCCAT GGGAGCATAT AAACCTTTGG  CATTAGTTTT ATCATTACTA ATGCTAGTAG TACAACAATA AGTATTACAG TTATTTCCTT TATCAAGTTT ACAATAAGTA TTCTATGGTT CATCCTTTAA CCTTTCATTT TGACCACATG  TCACTGTTCC TCATCAAATC TGGTTTCATC AGTTTGAATT TCTAATCATT TAAAGAAAAG AAAATAAAAG AAGAAAACTT GATCCTTATT ATCGTGTCTC TGGTCTCAAC AGAGTTAGAA  TGCATTTCAG TTATTAAATC AGTATATTCT ATTTTATTTA TTTATTCTTT TAAGATATAC GGTGTTTTCT GTTTACACGA ACTGCCATTT TATTCACTCA ACAAATAACC AAACGGCAGA  CCTAGTAGCA TGCGTTAGTT AGTCTAACAT ATGATACAAA GTTATAAGCT GTGGATAAAT AGTTCCTATT TTGTGAGCTT GTTACCTATT TTAATACTTT TGCTTAAAAT ATATCATGCA  TGGGTTCATT TTCCTTCCAT GCTCTGTCCA TGAAATATTT CTTGACCAGT TATTTCAAAT AATTCTTCTT TATCAAATTT ACTCATCATG TTTCGACTGA AGAAATACCT GCGGAAATGA  GCTTGAACCT CTTATTGCTC CATAAACTTG TTCTCGGCGT TTGAAGCAGT GCATGTTTTT CATCATAATG CATTACTTCA TTGTTTGAAA TTCAGAACAT TGTTAATGTT GAACCACAGA  AGTTTCTTCA TTTTGAAGTT CCCCCTACTA CTTTTTTCTT TGTAGGTGGC ATAAATGGTT CCCTAGTATT TGAGCTTGAC AGACCTGAAA ATGCAGGTCT AAGGAAACCT TTGAAGGTAT  TACTCCACCT TCAGAATTTT CATATTTTTA AATTTTGATA TATGGATTAG GTGCTTTAGC TCCTTCGATG TGCATGGGGT ATGTTAGAAC TTACAAGATA TGCAAGCCAC ACCATATTTA  CCATTCCCTT ATTTGCTCAG TCATAATTTC GATGAATGAA TAGAAGAATC ATATCAACAC TGATTCTCAC TGAATTTCTG TTAACATGAG GCAGCATAAA TGGTGCGTCA AGCCTCCTAT  CAACTTGGAC AAGAAGATAG GTACAAGAGT TCCCCATGCT CGCCTTAAGG GAAAAGAAAT CAGTTGCCAC ACAGGAACAC CTCCCTTTTG GTGGAATTTC CATGTCAATG CCATGACTGT  GGTTTTCGTC TGTGTTAATG GAACCAAGCT TGCAGTTTGC TAATGTTATT AGTATAAATT GACAATTGAA TTCTGGAATT TGCACTAATT TCAAAAGTAC ATTTATCCTT ATAATGTTTT  TTACCGGAAC TTTAAAGTTC AATTTCTAGA AATTAAGGCT TCTAACATTC TCTAAATCCT CATCATGCTT TCTCTTTGAC ATGGCCATAT CTTTTATATT GGCTCTGTAA GAGGTCACCC  CATCTGCAAA CTGCAATTTA CCCAAAAAAA AAATTCAAAA TAAAAGGTTT TCCCTCTGCA AGCTCTGCTT ATGTCATGTT CAAAATGCAT GTCAATGCCA TTGGAAACAA ATCATCTGGC  TCTATAAATG ATGAAAACGC TTGTCATGTG GGTATGTTCT GAATTCCATC TACACCTCTT TTCTTCAGTC TTCTATTGCT AGACTTATGT GCTTCTTTAG CATATCTTTG TTTCAGGTCT  TGGCGAAGGC AAAGACAAAT ATCGATAAGA TTGTTCCAGG TAGGTACTGG AAAATGTTCT ACTAAGTTTA AGTTTAAATT CCTATTTGTT TTAACTGATT GAATATTTTG TTTTTGTTTT  AGTATCCTGG GCAGACATGA TTGCTCTAGC AGGAGCTGAA GCAGTTTCCT TATGTGGAGG CCCTAAAATT CCAGTAGAAC TAGGAAGGCT CGATGCTTTG TAGGTTCTCA TAAATTTTTA  GTTTTGGTTC TAATAAGTAG TGGTTCAATT TGAAAATTAA TATTTTCTAT GTGCCTTTTA GAGTACCTGA TCCAGAAGGT AGGCTTCCTG AAGAGTCTTC TGATGCTTCT AGTCTGAAGA  CATGTTTTCA GAGAAAAGGC CTCTCGTAAG TTCCTTGTCA TTGAAAAAAT GAAGTTTGGG ATCCCTCCCT TAACTAGTTG GAGTCGATGA TTTTTTTAGT TTATTGAAAG AACTATAAAC  AATGATCATA GGCATATTTT TGAGGACTTA CCTGAGATAT TTTTATGGGT TCATATATGC AGTGAAGTTT CTGTAGAAAA ATATCACATC ACCCTAGCCA TTCAATGTCA CCAAGGGATG  CTAGGGTGTC TTGTTCATCT GCTCAAAGTT CCTTGAAAAT CTTGATGCAC TTTGAGGGGA ACTACAGTCC TCAGCCATCC CTTCTTGACA TCTAACGGCT GGGGTTGTGT GAAGTTTCCC  ACAGAACTTT CACTGCATCA TTATAAACAC TTGACCCTTT TTTTTTTTTC TTTCGTTTAC TGATCAAACT CTCTTTTGAC CTCCTAGTAA ATTTTGAAAA TGTATTTAGT TTTCTCAAAC  TCACTTTCAG ATATTGTAAA TTTTGTTAAC TTGGATTGTG TCTTATTGGA CTCGAATTTA TGTAGCATGA GCTGACTAAT GGTATTTTGG CAATGGCAGC ACACAAGATC TTGTCGCGTT  ATCTGGAGCA CACACCTTGG GTGGCAAAGG ATTTGGGAAC CCCACCGTTT TCGACAATTC TTACTTCAAG ATACTACTCG AGAAACCATG GAATTCTTCT GGTACAGACA CTTGTACTTC  TCTCTCTTAT AAAATTTTGA TGGTATTGTT AGTGTATTTC CATGGGTTAT GTATCCCAAA AATCTCCATC ATTTTTAGAA AGAACACAAA ATTCGCATGC ATTGCGTAAT AATATTGATA  TGCATACAGC TGACATGTCT AGTATGATTG GGCTCCCTTC GGATCATGCA CTTGCTGAGG ATGATGAATG CCTAAGGTGA AGAACCTCTC CTCTCTTTTC TTTGGTTAAC CTCCTCTTGA  TTTTGAAGAG TTTTTTTAAC TTTTTTTCCT CTAGTCTAGT GAGGTTTTGC ATGGGAACCC CGCTCATTGT ATTAATCTCA TATGTAAATT AAGCCCAAAA CTATGGTTTT CAGCAGTGAT  ACAAAAACAG GAAACCTGAG TTGGATCTTC ATTTCCGATC TGGATTGCTT GATTCAGGTG CATAGATGGT GAAGGAATTT AAAAGAGAAA GAGGATATTG GGAAAATTGG GGGGAATTCC  AGGATTCCTC AAATTGGAAT TGCCCAAATA CTATTCCCAG TCTTACTTGG GTGATTCCAA GTTGGATCGG TGATTTTTCA AACGCTGGTT TATAGCCTAG GTATAAGTAT GAATGGAGTG  TAGTATTGGT TTTCCTTTGT ATTCAATGCA ATCTGAGATC AACATTGGTT GGTGTGGTCT CTCTCTCTCA GGTGGATCAC ATTATATGCT GAGAATGAGA AGAGATTTTT CAGCGATTTC 
GTGACTGCAT ACACTAAGCT CGTGAATAGC GGTGCTCGAT GGCAGAAGTC TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGAGT TGCCTGACGT CCACCCATTT AATTATATTA TAATTATTTT CCCGGTTTCA GCCTATCCAA ATCGCCTGGT TCTACTGATC CAGATTGGTT CACAGGTGAT CCAAAACCCA  ATTCTGGATA GGAAGAACTC CTGTAATTGT CATAAGAGGA GAGCACTTCT CCTTTCTTCA ATTCTGCCAC TGCTGCTACC TCTACACCAT CTGCCACAAA GTTTTGATGC CTGTGCTGTA  GAGGATAATG ATTCTTCACT TATAAGAGAT GAGCTAAGGA AAGTCATGTC CAAGGCCAAA GCTGCTGGTT TGCTACGCCT TGTATTTCAT GATGCAGGGA CATTCGACTT GGATGATGAT  TCAGGTGGCA TAAATGGTTC CCTAGTATTT GAGCTTGACA GACCTGAAAA TGCAGGTCTA AGGAAACCTT TGAAGGTCTT GGCGAAGGCA AAGACAAATA TCGATAAGAT TGTTCCAGTA  TCCTGGGCAG ACATGATTGC TCTAGCAGGA GCTGAAGCAG TTTCCTTATG TGGAGGCCCT AAAATTCCAG TAGAACTAGG AAGGCTCGAT GCTTTAGTAC CTGATCCAGA AGGTAGGCTT  CCTGAAGAGT CTTCTGATGC TTCTAGTCTG AAGACATGTT TTCAGAGAAA AGGCCTCTCC ACACAAGATC TTGTCGCGTT ATCTGGAGCA CACACCTTGG GTGGCAAAGG ATTTGGGAAC  CCCACCGTTT TCGACAATTC TTACTTCAAG ATACTACTCG AGAAACCATG GAATTCTTCT GCTGACATGT CTAGTATGAT TGGGCTCCCT TCGGATCATG CACTTGCTGA GGATGATGAA 
TGCCTAAGGT GGATCACATT ATATGCTGAG AATGAGAAGA GATTTTTCAG CGATTTCGTG ACTGCATACA CTAAGCTCGT GAATAGCGGT GCTCGATGGC AGAAGTCTTG A 

Retrieve as FASTA