Entry information : ScucPrx19(Salcuc_Sacu_v1.1_s0009.g004585 / Salcuc_Sacu_v1.1_s0434.g027378)
Entry ID 16604
Creation 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ScucPrx19(Salcuc_Sacu_v1.1_s0009.g004585 / Salcuc_Sacu_v1.1_s0434.g027378)
Name ScucPrx19(Salcuc_Sacu_v1.1_s0009.g004585 / Salcuc_Sacu_v1.1_s0434.g027378)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx278]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Basal Magnoliophyta
Organism Salvinia cucullata    [TaxId: 32188 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ScucPrx19
start..stop
S start..stop
ScucPrx27 521 0 1..299 1..301
AfiliPrx14 473 5.3e-170 3..314 4..320
AfiliPrx09 439 2.12e-156 4..314 12..323
AfiliPrx27 334 8.83e-115 22..314 53..346
Literature and cross-references ScucPrx19(Salcuc_Sacu_v1.1_s0009.g004585 / Salcuc_Sacu_v1.1_s0434.g027378)
Protein sequence: ScucPrx19(Salcuc_Sacu_v1.1_s0009.g004585 / Salcuc_Sacu_v1.1_s0434.g027378)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   314 (294)
PWM (Da):   %s   34089.01 (31886.7)  
PI (pH):   %s   4.43 (4.29) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-314
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLNIFLLFLL LSVHVIGAHA QLSADFYDTS CPNLLDTVNS TFQERASQNN VVSPSTLRLL VHDCFIQGCD GSILISSTPQ NSAERDYVDN DIPQQAFDTI AAIKAALEAT CPGVVSCADI  VVLAARQAVR FLGGPSWQVG LGRRDSRTSL ASNAIGNIPQ SNSTLDQLAS LFLSKGLDIV DLVALSGAHT VGFSKCRQFT FRVVDGDPFM NSSFVQTIEQ RCPQMDSNSF VPLDATSPFV 
FDSSYFKALQ NNQGLLFTDQ ILFFDPTTRE LVNEYASSEN SFFQTFMNSI IKLSSVGVLT GEDGEIRKVC SQIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Detected in 2 different scaffold. Incorrect predictions in both cases (splicing error).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGAACA TCTTTCTCCT CTTCCTCCTC CTCTCTGTAC ATGTCATCGG GGCTCACGCT CAGCTCTCCG CCGACTTCTA CGACACCTCC TGCCCTAACC TCTTGGACAC AGTCAACAGC  ACCTTCCAAG AGCGGGCGTC GCAGAACAAT GTGGTTTCTC CATCGACACT CAGGCTTCTC GTTCACGATT GCTTCATTCA GGTAAAAGAT ATATGTAGCT TCCTGGTGTT CTCAGAAGCT  AGGTTCGATC TTCATTTGTG TGATTTCAAT TCGTTGTGTT AATGTGCTTA ATTTGGGGGC CGGGCCGGGG TGCTTTTGCA GGGCTGCGAT GGCTCCATTC TCATCTCATC CACGCCGCAG  AACAGCGCAG AGAGGGATTA TGTGGACAAC GACATACCGC AGCAGGCGTT CGACACTATC GCCGCCATCA AAGCCGCTCT AGAGGCCACA TGTCCTGGTG TTGTTTCCTG TGCAGATATC  GTTGTTCTGG CTGCTCGACA AGCTGTCCGC TTCGTAAGAC TCCCCATACA TCCTTCTAGA AGCAGCGCTC CTTCTTAAAT ACGCACATGT ATCTACCGAG TTAGTTAGAA CTTTAGTACA  TACACGCGTA CCTATGTACC TATGCATGCA CACATCTATA CGTATCTACG TATATGTACT GTATGCAAGA ACTTCAATCG AATGTAAGTA CGTATGCAAC ATGCGTGTAT AATATATATA  TATATATATA TATATGTCGA TGTAAGTTAC ATGTATGTAT GGTGCTAGTA TGCACATATC TATGTGTGTA CATGTATGTA AGGACTTCAC TAGTATGTAT GTATGTATGC AACATATATA  TCAATGTATA TTGTAAACAT GTATGTACTA GTATGTATGT ATATATATAT ATATATATAT ATATGCAATA CACATGCATG GCCATGTATG CATGTAGATT ATGTAGATGT AGTACTATAT  GTTCAAGGAC TATATGTATG TATGTACATT TTCAACTTCA AAGGATGGCT TCCTCTTTAT TCACATGTGA ATAAATTTCA GCTTGGGGGC CCCTCTTGGC AAGTTGGATT AGGAAGACGT  GATAGCCGAA CTTCCCTGGC TTCCAATGCC ATCGGAAACA TACCTCAATC GAACTCCACC CTTGACCAAC TCGCTTCCCT CTTTCTATCC AAAGGCCTTG ACATCGTTGA CCTTGTTGCA  CTCTCAGGTA TAATTGCTAC ATATATATGT ACTAGTTAGG TCATGTTCCA TGTCCATCCA TCCATCTTGT TGTGATGTAA ACTTTGTACA ACATTTGTGT TGTGTCCATT ACTTGTCCCT  CAATTGTGAG AGAGTAGTTC GTCTTGTATG TCAAATATCA TCTTTCATTG GCATTGGTGT GTGATCCTAG ATCATGAACC TTCCATTTCC TTCTTGCATA GGTGCTCATA CGGTTGGATT  TTCCAAGTGT CGACAATTCA CTTTTCGAGT CGTGGATGGA GACCCTTTTA TGAACTCATC ATTTGTTCAA ACCATCGAGC AACGATGCCC ACAAATGGAT AGTAATAGCT TTGTCCCATT  AGATGCTACA TCACCATTTG TGTTCGACTC CTCCTACTTC AAAGCTCTAC AAAATAACCA AGGTTTGCTA TTCACTGACC AAATTCTATT CTTTGATCCC ACAACAAGGG AGCTCGTGAA  TGAATACGCC TCTTCAGAAA ATTCGTTCTT CCAAACGTTT ATGAACTCCA TCATCAAGTT GTCATCTGTT GGTGTCCTCA CAGGAGAAGA TGGAGAAATA CGAAAAGTAT GTAGTCAAAT 
AAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGAACA TCTTTCTCCT CTTCCTCCTC CTCTCTGTAC ATGTCATCGG GGCTCACGCT CAGCTCTCCG CCGACTTCTA CGACACCTCC TGCCCTAACC TCTTGGACAC AGTCAACAGC  ACCTTCCAAG AGCGGGCGTC GCAGAACAAT GTGGTTTCTC CATCGACACT CAGGCTTCTC GTTCACGATT GCTTCATTCA GGGCTGCGAT GGCTCCATTC TCATCTCATC CACGCCGCAG  AACAGCGCAG AGAGGGATTA TGTGGACAAC GACATACCGC AGCAGGCGTT CGACACTATC GCCGCCATCA AAGCCGCTCT AGAGGCCACA TGTCCTGGTG TTGTTTCCTG TGCAGATATC  GTTGTTCTGG CTGCTCGACA AGCTGTCCGC TTCCTTGGGG GCCCCTCTTG GCAAGTTGGA TTAGGAAGAC GTGATAGCCG AACTTCCCTG GCTTCCAATG CCATCGGAAA CATACCTCAA  TCGAACTCCA CCCTTGACCA ACTCGCTTCC CTCTTTCTAT CCAAAGGCCT TGACATCGTT GACCTTGTTG CACTCTCAGG TGCTCATACG GTTGGATTTT CCAAGTGTCG ACAATTCACT  TTTCGAGTCG TGGATGGAGA CCCTTTTATG AACTCATCAT TTGTTCAAAC CATCGAGCAA CGATGCCCAC AAATGGATAG TAATAGCTTT GTCCCATTAG ATGCTACATC ACCATTTGTG  TTCGACTCCT CCTACTTCAA AGCTCTACAA AATAACCAAG GTTTGCTATT CACTGACCAA ATTCTATTCT TTGATCCCAC AACAAGGGAG CTCGTGAATG AATACGCCTC TTCAGAAAAT 
TCGTTCTTCC AAACGTTTAT GAACTCCATC ATCAAGTTGT CATCTGTTGG TGTCCTCACA GGAGAAGATG GAGAAATACG AAAAGTATGT AGTCAAATAA ACTAA 

Retrieve as FASTA