Entry information : AtrPrx22(AmTr_v1.0_scaffold00010.81)
Entry ID 16607
Creation 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrPrx22(AmTr_v1.0_scaffold00010.81)
Name AtrPrx22(AmTr_v1.0_scaffold00010.81)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx22
start..stop
S start..stop
AcoPrx73 464 2e-166 28..324 23..319
GmPrx64 463 1e-165 28..323 45..340
LjPrx50 457 3e-163 28..323 53..348
MtPrx100 454 4e-162 28..323 47..341
Literature and cross-references AtrPrx22(AmTr_v1.0_scaffold00010.81)
Protein sequence: AtrPrx22(AmTr_v1.0_scaffold00010.81)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324
PWM (Da):   %s   35525.3  
PI (pH):   %s   8.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MWCAICAVVV LLVVLAEAKH ATAMAPQEGL LSFDYYVKSC PQVESIIHNK VAAWINKDYT LAASLIRLHF HDCILRGCDA SILLNHAGSE RQAQASATLR GFNVIDDIKA AVEKQCPKTV  SCSDILTAAA RDATLKIGGP FWAVPFGRKD GVVSIAKETN VVPGGHENIT SLIELFQSRG LNVLDLVVLS GAHTIGRCKC GSVQNRLYNF NRTVKPDPTL SVSYRNYLKR KCRWASEEVE 
LDAITPTKFD SVYYMNLQKK MGLLSTDQLL QSDSRTAPIV VALGTQSGLF FQQFAVSMVN LGNTQVLTGP HEGQIRTNCN FVNR* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGTGCG CTATTTGCGC TGTGGTGGTC CTTCTTGTGG TCTTGGCGGA GGCAAAGCAT GCAACGGCGA TGGCGCCTCA GGAGGGCCTC CTGTCCTTTG ACTACTACGT TAAGAGCTGT  CCTCAGGTGG AGTCCATAAT CCACAACAAG GTCGCGGCGT GGATCAACAA GGACTACACT CTTGCCGCTA GCCTCATCAG GTTGCACTTT CACGACTGCA TTCTCAGGGT AATTAACCAT  TCCCATTACT CTCTCTCTCT TTCTCTCTTT GCAAACTCGG CGGATCTAAC TTAGAACTGG TGGGTCAAAC TAGAATCGGG GCACTGGCTG ATCCGATTTT GACTGCTTTT TGGTGGTCTA  CTAGAGTATT TTAAAAAAAT ATCAATATAT ATATAAAATC CCAAAAAATG AGGGATTTAT TTATAATCCT ATTTTTTAAA TATTTTTTTT ATTATTTTTG GCGAAAATTG GAAAGTGTTT  AGGCAATGAT TATTTATTTT TATATTTTTT TAATTTTTAA AAATTTAAAA AATACTTTGG GGGCACAAAT GGATTTTTGA AAAAATTATA GATACCCCAT TTAACTTTCT ATACATTTTA  CCCCAATACA TTTTCTATTG TATCCTAAAC TTCAACACTT TTTTTTTTTC CTCTTCATCT TTATTCTCTT TTCCCTATAG TTTTTCTATT ATACTCTAAA CTCAATACCA TTTTTTTTTT  GTATTTACCC CTGGTTAAAT ACTCAAAGCA TTTTGGAACC AAAATACTTC TTTTTTTTCT TTCTCTTCTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTCT TGTCCTTCAA GACATGTGAT CCTCTCTTGT  GTTCTTTCTT GACATCTCTC TACCCATCTT CTCTCTATAT GTCATCAAAG TTGGACTCAG GGGAGTCCCA TACCACTTGC AGAGAAAAAA AAAGAGAGAT AATAGGTGGA CAGAGGTAGA  GAAAAAAAAG TGAGAGAGGG TTGTGCGTCA AAAAAGACAG AAAAAAGGGG TAAAGAGAAA AACAAGGAAT TTTGGTTTAA AAATGCTGTG ACTTTTTGAT TGAGGGTAAA TATATAAAAA  AATATTGTTG GAGTTTAGGT ATATTAAAAA AGTATTGAGG GTAGAGGTAT CAATAATTCT CTAGATTTTT CAAAATTTAT TTTTTTCACT CTTTTCAACT TCATTTGGAC ACAAGCTGCA  CATATTGTTT TTTATACTAT ATTTTATTTT TTAACCCTTT TTGGATTGAC CTGGACCTGA CCCGTTGGGC TGGTTGAAGC GGCAGTTTAC CAATTACTCG GACCCAGCCC CTGGAACGTT  TTTGAGGCTG GTTCAATTTT TTTGAACACT GCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCATTT TGGGTTCAGT TCGAAGCTTC GAATCTATCT TGCATTGTTT ATCTGATGAT ACTAGGGCTG  CGATGCGTCC ATTTTGCTGA ACCACGCGGG GAGTGAGCGT CAAGCCCAGG CGAGCGCCAC ATTACGTGGC TTCAATGTGA TCGACGACAT TAAAGCAGCC GTTGAGAAGC AGTGCCCCAA  AACTGTGTCT TGCTCCGACA TACTCACTGC TGCTGCACGA GACGCAACGC TCAAGGTTGG TTCTCCATCT CTCCGTGAGG GTTATTCTTG CTGTTAGTTT TTGGTTGATG GAAGGAAGAG  AGGGGGAGTT ACTGGGTTTG ATTATAAAGT TGTTGAGGAT GTGCAGATTG GAGGTCCATT CTGGGCGGTT CCGTTTGGAA GGAAAGATGG AGTGGTGTCC ATTGCCAAGG AAACGAATGT  GGTTCCAGGC GGCCACGAGA ATATCACGTC GCTCATCGAG CTTTTCCAGT CAAGAGGTCT CAATGTCCTC GATCTCGTCG TTCTCTCTGG TACTTGCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCG TACGTCGTAC GTCGTACGTC GTACGTCGTA CGTACGTACG TACGTACGTA CGGTACGGTA CGGTACGGTA CGGTACGGTA GTACGGTACG GTACGGTACG  GTACGGTACG GTAACGGTAA CGGTTAACGT TAAACGTTAA ACGTTTAAAA CGTTTAAACG TTTAAAnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnACGT CGTCGTACTA TCGACGTTTT ACCGTTACGT  ACGTAAGACG GTACGTCTAC TACGTCCGTC GTACTCTCGT CGTTCGTCTC TCGTCTGTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTC AAGTGATACG GGACTCGCCT  GAGTCCAACT CTGATGAGGG GAGGGTGAGT TACTCTGAGC AGGGCACGGG ATACATAAAT TTTTTAAAAT AATTCTTAAA AATTATAAAT ATTTGCGATG GTTATATAAA TTTTCATATA  TAATTTGGAA TATTTGATAA ATATTGGTAA GTATTTTTTT GGCATAATCC TTTATTTATA TAGATTTAGG ATGTAAAGGA CATCTCAAAT CACTGGAAAT ACAGTTCAAC CATGGCCACA  AATCCATCTG TACATTTCCA AAAATGGTGC TAATTTGATG ATCTTTGAAG AAGTAAAATG AAGAGCAAAA CAAGGTTTTA GATATGGGTG AGGTTTGCAT AAGGTTGCAA CCTTAAATAA  TGAAAGCTGC ACATCCAAAT TTTATCATAA GATGCAATTT TGGTGTCAAA AGCTTTTAGG ATGGCTTGAG AATATATTTT CTTCCCTAAA ATTTTGAACT CCAAAATTGG CTCAACTGAA  GCAGATCTAT AAATACATAA AAATATTGAA AATAGATGGT CCATATAATA TATTGTAAGT TGTATCATTT TTAGTACTCA AATTTTTTAT TTTTTTTCCA TATTCATGTA TCTCGATGTC  AAGATGAATA ATTAGATGGT TTTTCAATGT CAAAGTAGGC CTTTCTGATC GAGTTTTGAG GTGCACCTTA TTTCTACAAT TTAGGTTGTG AATCTTATGT ACACTTTTTC ATTTAGATAT  ACCATTTTAA ATTTAAACAT TTATTCATAT TTTCATATTG ATGATTGCAA TGGTCAAGAT CCCCAAAAAT TTTGGATCCC ACACCCAACT CTAAGATGAA CTTTGAAGGG GGATACATAT  AAACAGGGGC TCTAGCTGAA GCACAGTTGA ATTTTCAGGT GCACACACAA TCGGAAGGTG CAAGTGTGGT TCAGTACAAA ACAGACTCTA TAACTTCAAC CGAACTGTCA AGCCCGACCC  GACCCTATCC GTGAGTTACC GGAACTACTT GAAGAGGAAA TGCAGGTGGG CCTCAGAGGA GGTTGAGCTT GATGCCATCA CCCCAACAAA GTTCGACTCC GTCTACTACA TGAACCTCCA  AAAGAAGATG GGACTTCTCT CTACTGATCA GTTGCTCCAG TCTGACTCAA GAACTGCACC CATTGTTGTG GCCCTTGGAA CGCAGTCAGG GCTCTTCTTC CAGCAATTTG CTGTGTCCAT 
GGTGAACCTT GGCAACACCC AAGTGCTCAC TGGGCCTCAT GAAGGCCAGA TCAGAACTAA TTGCAATTTT GTCAACCGTT AA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGGTGCG CTATTTGCGC TGTGGTGGTC CTTCTTGTGG TCTTGGCGGA GGCAAAGCAT GCAACGGCGA TGGCGCCTCA GGAGGGCCTC CTGTCCTTTG ACTACTACGT TAAGAGCTGT  CCTCAGGTGG AGTCCATAAT CCACAACAAG GTCGCGGCGT GGATCAACAA GGACTACACT CTTGCCGCTA GCCTCATCAG GTTGCACTTT CACGACTGCA TTCTCAGGGG CTGCGATGCG  TCCATTTTGC TGAACCACGC GGGGAGTGAG CGTCAAGCCC AGGCGAGCGC CACATTACGT GGCTTCAATG TGATCGACGA CATTAAAGCA GCCGTTGAGA AGCAGTGCCC CAAAACTGTG  TCTTGCTCCG ACATACTCAC TGCTGCTGCA CGAGACGCAA CGCTCAAGAT TGGAGGTCCA TTCTGGGCGG TTCCGTTTGG AAGGAAAGAT GGAGTGGTGT CCATTGCCAA GGAAACGAAT  GTGGTTCCAG GCGGCCACGA GAATATCACG TCGCTCATCG AGCTTTTCCA GTCAAGAGGT CTCAATGTCC TCGATCTCGT CGTTCTCTCT GGTGCACACA CAATCGGAAG GTGCAAGTGT  GGTTCAGTAC AAAACAGACT CTATAACTTC AACCGAACTG TCAAGCCCGA CCCGACCCTA TCCGTGAGTT ACCGGAACTA CTTGAAGAGG AAATGCAGGT GGGCCTCAGA GGAGGTTGAG  CTTGATGCCA TCACCCCAAC AAAGTTCGAC TCCGTCTACT ACATGAACCT CCAAAAGAAG ATGGGACTTC TCTCTACTGA TCAGTTGCTC CAGTCTGACT CAAGAACTGC ACCCATTGTT  GTGGCCCTTG GAACGCAGTC AGGGCTCTTC TTCCAGCAAT TTGCTGTGTC CATGGTGAAC CTTGGCAACA CCCAAGTGCT CACTGGGCCT CATGAAGGCC AGATCAGAAC TAATTGCAAT 
TTTGTCAACC GTTAA 

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