Entry information : ScucPrx25(Salcuc_Sacu_v1.1_s0075.g017373)
Entry ID 16610
Creation 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ScucPrx25(Salcuc_Sacu_v1.1_s0075.g017373)
Name ScucPrx25(Salcuc_Sacu_v1.1_s0075.g017373)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Basal Magnoliophyta
Organism Salvinia cucullata    [TaxId: 32188 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ScucPrx25
start..stop
S start..stop
AfiliPrx35 480 1e-172 16..324 14..327
GbPrx82 318 9e-109 29..321 10..303
SmPrx52-2_1 308 2e-104 12..324 31..346
SmPrx52-1_16 306 2e-103 12..324 31..346
Literature and cross-references ScucPrx25(Salcuc_Sacu_v1.1_s0075.g017373)
Protein sequence: ScucPrx25(Salcuc_Sacu_v1.1_s0075.g017373)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324
PWM (Da):   %s   34712.62  
PI (pH):   %s   6.38
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPNMGSSRE GALFVLVCPL LVGFCVAHSQ LSTDFYATSC PNAETIVRRI VAANAAINPI ASAGLLRLFF HDCQVQGCDA SILLDSQPGI VSERESPSNV AIRGIWLIDI IKRSLELECP  GTVSCADVIV LAAREAVRVT GGPTIQDVPL GRRDAITASS LEALHQIPSS TTGFREFLQV FSSKGMTLEE SVAILGAHTL GVGHCGSVVN RLYPAKDANM GFFFYNLLTL RCPALYNPRT 
VISNDPTPMV FDTQYFTQSL AKRGLFQVDS DVATNPSTSP IVNTFSLDPA AFFQAFSSAF IKLSLTNVSV GNQGEIHRNC HFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction from SymDB (exon 4 was missing)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCGA ATATGGGTTC TTCCCGTGGT GGGTTCGTGT TCTGTGTGCT CTATTCCTTG CAAAAATGAT GGGGTCATCT CATTCTGGAT GTTCTTGCAG AGGGTGCCCT GTTTGTCCTG  GTTTGTCCTC TGCTGGTTGG GTTCTGCGTT GCCCATAGCC AGTTGAGTAC TGACTTCTAT GCCACGTCCT GCCCAAACGC GGAGACCATC GTCCGCAGAA TTGTGGCTGC CAACGCCGCC  ATCAACCCCA TTGCATCTGC TGGCCTGCTC CGCCTCTTCT TCCATGATTG CCAAGTTCAG GTGCTGTAGA ACCAATTCAA ATTATCCGAG AAATAGTGAG AGATATTGAG AGAGAGAGTC  TGAAAATGCA ATGTATGTAG ATCTTGTGGC TAATTATCTG AATGTATGGA AGAGATTGAT ATAATGCATT ATCAGTTCTT CTCACAGAAT AAAGAATTAA CCAAAAACAA GAATAAATAA  TTAATATGTG TGCTTCGCAG ACATCAAAAT GATAAAGAAT GTGTGAACAA TATCTGTATG ATAAATAGTA TGCGCTTCTC AGGGTTTTTT TGGGTGCAGC CACTTCTCCT TGCATGATGA  GGTACTTGGC GGGTAAGGCT GTTGTTTTTC CTTCTTTCTA CAGTCCCCTG CGTTGTTGTA GCTGTTTGGC AGTTGCCCAT TAATGCTAAG GTCTAGTTCT TGTTCTGAGA AAATGACAGA  CCTATGCTTC TTAGATCATG TATTGGATTC GTTTAGTTTA GAGAGAAAGA GAGAGAGGCA TTGTGACTTG TGAATGATGC AAATGATGAA GAAAGATGCA TATTTGAACT AGGAATGGGC  CATATTAAAA ATATGAAGCC ATTTGATGGA GAAAAATAAA ACTGTTGCAA GCACAATCTT CATGACAATA TAAACGACTC TTCATGTAAG CATGATTGAA TTGATCTGTT TGTCCTTTCT  GTTAGGTCAA AGATATGTGT GTTAACCATC CATTGGGTCT AGTAACACTT TTGATTATGT GTGGACATTT TTGTAACTGA TGTTGATATT GAAGGAGCAA AATATGTAGG GATGCGATGC  ATCGATCTTG TTGGATTCTC AGCCAGGGAT AGTGTCCGAA AGGGAGTCTC CATCCAATGT TGCCATTAGG GGCATTTGGT TGATTGATAT TATAAAAAGG TCTCTCGAGT TGGAATGTCC  TGGCACTGTA TCATGTGCAG ATGTGATAGT GTTGGCAGCA AGAGAGGCGG TTCGGGTCAC TGGGGGGCCT ACCATCCAAG ATGTGCCCTT GGGTAGGCGG GATGCCATCA CAGCTAGCAG  TCTTGAAGCT TTGCATCAGA TCCCATCTTC CACCACTGGC TTCCGTGAAT TCTTACAAGT TTTCTCCTCC AAAGGGATGA CTCTTGAGGA AAGTGTGGCA ATATTAGGTG CCCTCTCTTT  CTCATCTCTT GATTTGTTTG GATTATATTT TGACTTCAAT AAGGTCCTTT TGTTTTCTAA AGTGTGCATT TCCGTTAGTC AAGGAAAACT ACGACCAACG GCTTACAAGA AGATCATTGG  TGGCCTGCAA TAAGGAACTT TGGTTTCCAT AAAATACTTC TTTTCTCAAG CTTTGACTTT TCCTACGCTT CAAATTCTTC TCTCAATCCT CTAGAAGTTA AAGATTTACA CACGTTTTGA  CTTTACCTTT GGTTTCAGCT TCTAGAGCTC TCCATATCCT CTATAAATAA AATATTTATT TATCCTTTGA CTTCATCTTT GGTTCCAGCA TCTGCCCCTT CTAATGATTG TCCATTTTAT  CTCATTGAGA CTCTTTTAGT TTGGTGACAC GAATGTAACA TCATTTGAAT GTAAAATATA GGTTGATCAT GCAAAAGTTG TGTGACAAGT AAAGTTCTCC AAACATTGGG AAGTGCTATC  AATCTTTTTC CTATATTAAT TCAATATGCT GATTATTTGC ATGGAAAGTA TAAGAGCTGA TAGCTATGCT AATCGAATAT TTAGTTCAGG GAAGACTATG TGCCATCCTA CTTGAGCCAT  AAATGTAGTT GCATGTGATC CTTGAATCCA ATCCATCTGT AGTATGCATG GAAAAAGAAA ATGAAAATTT GAGTATAATA TGAAGCTCAT TTTAGAATGG AAGCTTTATC GTGCTAAATT  TGACTTCGTA GGAGCACATA CACTTGGAGT GGGACATTGT GGAAGTGTTG TGAATAGACT GTACCCTGCA AAAGATGCGA ACATGGGCTT CTTCTTCTAC AATCTCTTAA CACTAAGGTG  CCCAGCACTT TATAATCCGC GAACGGTAAT TTCTAATGAC CCGACACCAA TGGTTTTCGA CACTCAATAT TTCACACAAT CTCTAGCTAA GAGGGGCCTC TTTCAAGTGG ATTCTGATGT  TGCAACAAAT CCTAGCACAA GCCCCATTGT AAACACGTTT AGCTTGGACC CTGCAGCCTT TTTTCAAGCC TTCTCTTCTG CATTCATCAA GCTGTCTCTC ACAAATGTTT CAGTTGGCAA 
CCAAGGGGAA ATCCATCGAA ATTGCCACTT TGTTAATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCGA ATATGGGTTC TTCCCGTGAG GGTGCCCTGT TTGTCCTGGT TTGTCCTCTG CTGGTTGGGT TCTGCGTTGC CCATAGCCAG TTGAGTACTG ACTTCTATGC CACGTCCTGC  CCAAACGCGG AGACCATCGT CCGCAGAATT GTGGCTGCCA ACGCCGCCAT CAACCCCATT GCATCTGCTG GCCTGCTCCG CCTCTTCTTC CATGATTGCC AAGTTCAGGG ATGCGATGCA  TCGATCTTGT TGGATTCTCA GCCAGGGATA GTGTCCGAAA GGGAGTCTCC ATCCAATGTT GCCATTAGGG GCATTTGGTT GATTGATATT ATAAAAAGGT CTCTCGAGTT GGAATGTCCT  GGCACTGTAT CATGTGCAGA TGTGATAGTG TTGGCAGCAA GAGAGGCGGT TCGGGTCACT GGGGGGCCTA CCATCCAAGA TGTGCCCTTG GGTAGGCGGG ATGCCATCAC AGCTAGCAGT  CTTGAAGCTT TGCATCAGAT CCCATCTTCC ACCACTGGCT TCCGTGAATT CTTACAAGTT TTCTCCTCCA AAGGGATGAC TCTTGAGGAA AGTGTGGCAA TATTAGGAGC ACATACACTT  GGAGTGGGAC ATTGTGGAAG TGTTGTGAAT AGACTGTACC CTGCAAAAGA TGCGAACATG GGCTTCTTCT TCTACAATCT CTTAACACTA AGGTGCCCAG CACTTTATAA TCCGCGAACG  GTAATTTCTA ATGACCCGAC ACCAATGGTT TTCGACACTC AATATTTCAC ACAATCTCTA GCTAAGAGGG GCCTCTTTCA AGTGGATTCT GATGTTGCAA CAAATCCTAG CACAAGCCCC  ATTGTAAACA CGTTTAGCTT GGACCCTGCA GCCTTTTTTC AAGCCTTCTC TTCTGCATTC ATCAAGCTGT CTCTCACAAA TGTTTCAGTT GGCAACCAAG GGGAAATCCA TCGAAATTGC 
CACTTTGTTA ATTAG 

Retrieve as FASTA