Entry information : AtrPrx48(AmTr_v1.0_scaffold00024.122)
Entry ID 16634
Creation 2020-11-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-11-10 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrPrx48(AmTr_v1.0_scaffold00024.122)
Name AtrPrx48(AmTr_v1.0_scaffold00024.122)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx48
start..stop
S start..stop
AcoPrx85 426 8e-151 11..327 5..326
EferPrx31 424 5e-150 21..327 22..329
BnPrx54-1_other 422 5e-149 11..327 18..335
LePrx54 419 3e-148 1..326 1..327
Literature and cross-references AtrPrx48(AmTr_v1.0_scaffold00024.122)
Protein sequence: AtrPrx48(AmTr_v1.0_scaffold00024.122)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332
PWM (Da):   %s   35056.03  
PI (pH):   %s   4.37
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSNKGVGLV FLGLVVGFFG VGRAQLSATF YDTTCPNVIS IVRNVVQQAA QSDARIGASL IRLHFHDCFV DGCDGSLLLD STSTIDSEKD AFPNQASARG FPVVDDIKTA LESQCSGVVS  CADILAIASE VAVVLAGGPE WSVLLGRRDG TTANRAGANS NLPGPRDGLS NITRMFSNQG LDTTDVVALS GAHTFGRAQC QFFNDRLYNF NSTGAQDSSM DSAYVTSLRG SCTNSTDDTT 
LFDLDPTTAD GFDNNYYTNL QSNRGLLQSD QELFSIDGAT VPIVQSFASS QSTFFDSFVN SIIKMGNISP LTGTSGEIRS NCRRVNGGQI QK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction from Phytozome (Exon was missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAAATATAA AATTGAAAAA TAATAAATGG TGGGGCGGGG TTGGCCAGTT CCCCGACATA ACTAACAGGA ACTGCCCTAT TCTCGTTATA TAGAGCGAAC TAGACCGGTC TCACTAATTT  TCAATCCGAA ATGAGTGATT TTCTATCTAA ATCGTCATTT TTCAAAAATA CTAGCCAGCA GTAGTCTTGT ATCTAAGAAA AAAAAGACCG AAAGTGATGT GTGCCTAACA ATTGAGCAAC  ATGGAATCAT GGGTAAAAGA AAAATCTTCC ATGCCAAAAT CGAGGACAGA AAAAATACAC AAGATTGTCA AAAAAAAAAA AAAAAATCCA GTTGGGTGTA GAATTACTTT ATTTTAAAAA  CCCTCATTTT TTGACCTCTC AAGCCTGTGG CACCAAAGTC AATACTCATT TTGAGGGGTT CGTCTCCTGT CTTTTAGGAA GTGGCCAAGC CGCCACACTT TTTGGTGGTC CGTGAGTGAA  GTATCTCCTT CCTTCTTTCA AACTTTTTTT TTTTTTGGTT TAAAAAATTC ATTATCTTAG GGTAATGAAT TTCCGAATAT TGACAATCAC TTGTTAAGAT TTATCATGAG CAACTTTATC  TCTAGCTTTA ACAGGGTTGG TAAGGGTATT TTGCGCATAA AGTTATATTT ATTTAAGTCT TGAAAAGAGT GATAGCTTAG AATAGAGGGC TCTTGTATTT TTTGGAGTTC TATGATAAAA  GAAATTATTG ATTATTTTCG CCCGTAAACG TAGTCACGTT AAACCAAATA AATCTTTATG TTTTCGATCT ATTTTTCTTT ATGTTTAATT ATGTGCTTTT GATACTTCAT CTTCAATTTC  ATATGAGGTT TTTCATTTAA TCTTGGCATT AAGATAAGGA TGCAGTTAGC ATGCAGCCAA GCCCACAAAT GTAGAAATGC GGGCTTGGCA ATAAATATAT CATCGAAATA TAATTTGATC  TTAATTGTTA GATAATATAT AATCTTTAAC ATGGAAATCA TGAATATGAA AAAATGAATA AAATTTGAAA ACCAGAAATA ATAATTATGT TAAGAAAACG TTTGGAGCAT TAGTTGCAAT  TGTTTTTAAA TGGACCGCTT ATTTGCATCT ATCTTTAAGA TGGATGTGGA TGCTTTTTAC CTTTGGAGGG GAGAGGGCCC TTTTCCGTGA TAGGAATTAA GCCTAGAACG TAATGTGGCA  AATCCTCAAG CACTAACCAG TTAAACCCGG ACTCTTTCCC TATAGACTAT TCCACTTCTG GACTTCACCA ATCATTGAAG ACCTTTCATA GAGGGTAAAA CATTATCAAC TAACAACTGT  AGGCTATAAG TCAAAAGGAC TTATCACTAA TCGTTTTCAC TAATAAATTG ATGCGTAGCT GTTGTTTTCT TAAGTAATAG ACTTTGGTAT GCATCAAAAG TAATATTATT GCCGAAACAG  AACAGCTAAA AGAATTCAAA AAAAGTACAA TTATTTATCA ACTACTATTT AGATTAATAC TATATATTTA TTATTATATA AAGGGAAAAG TTTATAGAGT GCCTAGACTC TAAACAATCA  AATTAGAGCC TATCTCAAAA CTTTCACTAG AAGAGGTTGT TTTGATGCTC AAATATCATC AAATTGATCA TCTCAACATC AAGATGCCTG GACATGAGAA AAAAATGGAT TTTAAGTTTG  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TTGGGAATAG GCCTGCTTTT TCCTTCACCC GTTTAGGAGA GAGAAATGGC CTTGCATGGT CTCCACTATT CATGAGGACT AAATTAATGG TCTTGACCTC CTTTTTTACC GATGTATTTA  AAATTGACTA TTTCAAAAAT GAATTTGACT ATTTAAAAAA TGGGTTGAAG CTTGTCAGCC CCACATACCC AAAAAAAAAA AAGAAATTGG CCCTCAAAAT GTCGTCCCCC TTAAAAAAAA  ATAATACAAA AAAAAAAAAA ATCTCTCTCC TGAGCAGATC CCTTGCATGT TCGAGTTATT TAGCTTTCCA AACGGGTCTT AATCTTAAGT CCTTTCTCTT TCTAATAATA TCCTAGTCTC  CATGAAATAC GTTTATATTT TTGATAATCC ATGTTTGCAT GAAAGATACT CCGGGATTGT TAGGACACGA TAATATACTC GTACTAGTAC AATATTGAGG TACTCTTATT TCATAGGGTC  TAATCGGTTG GATCAGACTT TAAAAAAAAT TAAAAAAACA GAGGTAATAG CTTAAGATTG CTTAACTTCA TTCAGCCGAT TGAACCGATT AAAACCAGCA AGTCTAATCA ACCAAATTGT  TTGACCTGTT TTTATCCAAA TCCCGTTATT ATTTTCAACC AGGCCGACAA GCATCAATCA AGGGCCCGAC CGGGCGAACT GCCAACCATA AAAGTGAACG ATAGCCCATC ATGTACAGTA  GATGTTGGTC TGAGTACCCT GTACAATATT TTCCTTATTC TATAATAATA GTGGGACCAG GGGCCTCAAT CTTGCTCTAA ATGATAGAGG ATACTTTGGT TTTGATTTAT TTCTCTAATT  TGTGATGTTA GGGTTGTGAT GGTTCGTTGT TACTGGATAG TACCTCAACC ATTGATAGTG AGAAGGACGC CTTCCCTAAT CAAGCCTCAG CAAGAGGTTT CCCTGTGGTG GACGACATAA  AGACTGCCTT GGAGAGCCAG TGTTCCGGAG TTGTGTCTTG TGCTGATATC CTTGCCATTG CTTCCGAAGT TGCAGTTGTT TTGGTATGTC CTCTCTCTCG CTATATATAT ATATATATAT  CTCTCTCTTT CTTGATGAAT AGTAATTCCC TCTTTTTATA TATATATATA TATATATCTC TTTCTTGATG AACAGTAATT CCCTCTCTTC AATGGTAGGT TGAATCTCTC TTTTTCTCTT  TTGAATAGAT ACTCTCTGCT AGGTAAAGTG ATAGTCGAAA TCACTATACC TTTGTGAGGG TATTATGGTT AAAAAAAAAG GTTTTTTTTG GGAGGCGAAA AAGAAGTGCT AAAGATCTCT  ATAACAAGAG GTCTAAAGAA AATATAATAC TTATTTTGTA AAGGTCGTCC CTTGTCGGGG TAAAAAGGAT GAGGTGGATT GAAGGAATTA TATGCGGTTG GGAGAGCGGG TTTAGAAAGG  AAGTTAGTGA GGTTATATCT AGAGAGAGGT ATATCTCATA TATTTCGTAT TTAGCCAACT ACATACACTA TTTTAGTTGG GATCTCGTTA TTTGAGATTC TTAATTATGT AAACGTGGGT  TCCGAGGACC ATACACACAC ACTCTCTCAC ATGATGTAGT AACTTGTCTC TCTCTCTTAC ACACTTTGTC TCTCTCTCTA ACTCTTCCTG AATAGTAACT CTCTCTCTTG AATGGTAACT  TGAATCTCTC TTTCTTTTGA ATAGCAACTC TCTCTCGTTT GGTTTACTTG AATCTCTCTC ATGTTCTCTC TCACTTTTGA GTAGTAATTT GAATCTCTCT CTCTCTCTTT ATACACGAAG  TTCAGAAAGA CTTCGATATA TGGTGTACAC AACACATGCA TAAGGATATA TTCTATGATC CACATGATCA CATCAAATAT GTGGTCATAA AGATCATCAC TGTCCAATTG ATGAGTTGGA  GAGTGATAGA AAGGGAGTGG GGTGTGACAA TTTATGTTAT GTGGTGTCAG GTTTGGCATG ATCCACTCTT AGTTCAAGCT CTAAGGCCCA GCAAATTCCT CTTAATACTA GATAGATTCA  TGGATGATTA TGAAAATTTT CCAAATAGTC CTGCATATTC AAAGTATAAG ATTTCCTATG TTCAGAAAAT GACGATTTTA CTGGTGGCCG GTTGCTCATG ACTACACAGG CTGGAGGTCC  AGAATGGAGT GTTCTACTTG GGCGAAGGGA CGGCACTACG GCGAACAGAG CTGGGGCTAA CAGCAACCTT CCGGGCCCCC GGGACGGCCT TAGCAATATT ACCCGCATGT TTTCCAACCA  AGGACTTGAC ACCACTGATG TCGTAGCCCT CTCCGGTAAT AATCTGCATC CGTTCCTTCA GGCTAAGTTA ATACCTTTAT TGGATCAATC GAATAAACAA TTGGTTGTTA GTGACCGAGA  GGTTAGCATC CTTTAGTTCA TATAAATATA ATAGGTGGAA AAAAAAAATT TATGAAAAAA ATAGGTTTCT TGGACATGTG AAAATTATTT ACCACTAAAT GACCCTCATA GGAAAAGAAT  TCACTACCTT ATGAGATGGG GAGAAAATTA CAGACCCAAA TTAGAAAATT AAAAACCATA TAATTTTTTT TTGTATGTGC CCCTCTTCTC CAAATCAATA GATCTAAATG CCCCTTCAAA  TCCACTTCTG CCCCAGAAAG ATGGATTTGG AGCTCTTAAA ATAGTGCAAA TCAGATTGAC TGCGAGTCTA ATGAATTGCA CACACAAACA GAGGTGGAAG CAAATATTTT TTTATTTTTT  ATTTAGGCAT GTATATTGGA GCATGGTTTA AATTTAATTT TTCAAATTGA TCTAATAATC GGTTGATGAT TAAGAAGTAC TCTGCCCACA TTTTCTCCTT TCCCAGGAGC ACACACGTTT  GGGCGAGCCC AGTGCCAATT TTTCAACGAT CGCTTGTACA ACTTTAACAG TACCGGAGCA CAAGACTCCA GTATGGACTC TGCATATGTG ACAAGCCTAC GCGGTTCCTG CACCAACTCT  ACAGATGACA CCACTCTATT TGACCTAGAC CCTACCACTG CAGATGGATT CGATAACAAC TACTATACCA ACCTCCAGAG CAATCGTGGC TTGCTCCAGT CTGATCAAGA GCTTTTCTCC  ATAGACGGTG CCACCGTCCC TATCGTACAG AGCTTTGCTA GTAGCCAGAG CACTTTTTTC GATAGCTTTG TGAATTCCAT AATAAAAATG GGTAACATAA GCCCATTGAC AGGAACCAGT 
GGCGAAATAC GATCGAATTG CAGGAGGGTC AATGGTGGTC AGATTCAAAA ATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCCA ACAAAGGAGT GGGGCTTGTT TTTCTAGGCT TAGTTGTAGG GTTTTTTGGG GTGGGTAGGG CACAATTGAG TGCCACCTTT TATGATACCA CTTGCCCTAA TGTGATTAGC  ATTGTGCGCA ACGTTGTTCA ACAAGCTGCC CAATCAGATG CGCGCATAGG AGCCAGTTTG ATTCGTCTCC ATTTCCATGA TTGCTTTGTT GATGGTTGTG ATGGTTCGTT GTTACTGGAT  AGTACCTCAA CCATTGATAG TGAGAAGGAC GCCTTCCCTA ATCAAGCCTC AGCAAGAGGT TTCCCTGTGG TGGACGACAT AAAGACTGCC TTGGAGAGCC AGTGTTCCGG AGTTGTGTCT  TGTGCTGATA TCCTTGCCAT TGCTTCCGAA GTTGCAGTTG TTTTGGCTGG AGGTCCAGAA TGGAGTGTTC TACTTGGGCG AAGGGACGGC ACTACGGCGA ACAGAGCTGG GGCTAACAGC  AACCTTCCGG GCCCCCGGGA CGGCCTTAGC AATATTACCC GCATGTTTTC CAACCAAGGA CTTGACACCA CTGATGTCGT AGCCCTCTCC GGAGCACACA CGTTTGGGCG AGCCCAGTGC  CAATTTTTCA ACGATCGCTT GTACAACTTT AACAGTACCG GAGCACAAGA CTCCAGTATG GACTCTGCAT ATGTGACAAG CCTACGCGGT TCCTGCACCA ACTCTACAGA TGACACCACT  CTATTTGACC TAGACCCTAC CACTGCAGAT GGATTCGATA ACAACTACTA TACCAACCTC CAGAGCAATC GTGGCTTGCT CCAGTCTGAT CAAGAGCTTT TCTCCATAGA CGGTGCCACC  GTCCCTATCG TACAGAGCTT TGCTAGTAGC CAGAGCACTT TTTTCGATAG CTTTGTGAAT TCCATAATAA AAATGGGTAA CATAAGCCCA TTGACAGGAA CCAGTGGCGA AATACGATCG 
AATTGCAGGA GGGTCAATGG TGGTCAGATT CAAAAATAA 

Retrieve as FASTA