Entry information : PtaPrx83(PTA00083040)
Entry ID 1686
Creation 2006-07-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-07-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx83(PTA00083040)
Name PtaPrx83(PTA00083040)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx099]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx83
start..stop
S start..stop
PabPrx158 642 0 1..338 1..338
PabPrx01 538 0 6..338 9..340
PsiPrx06 533 0 6..338 9..341
PabPrx17 493 2e-177 6..318 9..321
Literature and cross-references PtaPrx83(PTA00083040)
Literature Fossdal C.G., Sharma P., Loenneborg A. Isolation of the first putative peroxidase cDNA from a conifer and the local and systemic accumulation of related proteins upon pathogen infection. Plant Mol. Biol. 47:423-435(2001).
Protein ref. UniProtKB:   Q9SC55
mRNA ref. GenBank:   AJ250121
Protein sequence: PtaPrx83(PTA00083040)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338 (309)
PWM (Da):   %s   36613.86 (33431.1) Transmb domain:   %s   i13-30o
PI (pH):   %s   9.57 (9.90) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-339
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGTSGLRLQ FRPVLITGLA LMLWIQALHA QSSNGLTPNY YDKSCPEALS IIKSGVEDAV KQEARFAASL LRLHFHDCFV KGCDASILLD DTANFTGEKT AKPNLNSVRG FGVVDKIKSA  LEKKCPGVVS CADLLAVAAR DSVVISGGPT WEALLGRRDS RSASKSGANY NIPAPTSTHQ TLETKFKLKG LHSLDLVVLS GGHTIGLSRC TSFKARLYNN SGTAKPDPTL DTTYLKQLRI 
ECPQNGTDDN QTVPLDPVTP FKFDVNYYKN IVASKGLLNS DEILYSTNGS KTAAYVKFYT THTQAFFKQF ALSMIKMGNL SPLTGSQGEI RKNCRKMN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, contains two independant ORFs)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGGCA CTTCTGGCCT TAGACTGCAG TTTCGCCCTG TGCTTATCAC GGGACTGGCA CTGATGCTAT GGATCCAGGC ATTACATGCT CAAAGCTCTA ATGGTTTGAC TCCCAACTAT  TATGACAAAT CCTGTCCCGA GGCCTTGTCT ATCATTAAAT CTGGTGTTGA AGATGCTGTG AAACAGGAAG CAAGATTCGC TGCTTCTTTG CTTCGTCTGC ATTTTCACGA CTGCTTTGTT  AAGGTGAGCA GACATTGATA TTTCTGAATT ATTGTGTTTC TGGTAAACTA GCTATTCCAT TCTCTGAATT ACTATTCTCT TGAATGAATC ATCAATGTTA TATTTCTTGA TTTATATTTG  GAGTGATGGA ATACCCTAAG CTTTCTGTAA GAAGTCTTCT GATCGATGTC TCTTGAATGT ATCATCAATG TCAAATTTCT TGAATTATAT TTGGAGTGAT GGAATACCCT AAGCTTTCTG  TAACAAGTCT TCTGACCGAT GTCTCTCCAT CATCAAGAAT GATGGTATAG TACTGTTATG TTTGTCGCAA TATTTGATTG CGTTGCTTCG TTTCATTTCA TTCTAGAGCT GGACAAATGT  TTTCTGCAGC ATCTGGATAA CTTTGTTCTC TACTTTCCAG CAGCGGCCGG GAAGTACGAA CACAATCAAA TGCCTCATTG CCTATAACTC TGATAGATAC TAAAATTTCC TTGTGAGACT  AATGAATCCA ACATTTTGCA ATCTCAATGT TTCAATAGCT ATGCCACTGT TGAAGGTTAT CATGCCATTT ATAAGATTGT CTGAAACTTT CAAACACATC CCAAAGTTCA ATCTAGTTAT  TTTGATGATT ATCAAAGTTG GGTTAAAAAT GTCCTTCCAA ATATTAGGCA AGTTCAATGC AGTTATTTTG CTGTTTATCA AAGTTGGGTT AGAAATGTCT TTCCAAATAT TAAGCACCGT  ATAGTAAGTA AATTAATGGA CTTACTACAT CAGGTAAGGA TGTAAATCAA GGCCTATTAA GCACCGTATA GTAAGTAAAT TAATGGACTT ACTACATCAG GTAAGGATGT AAATCAAGGC  CCAGTGGCAG TGAATCAATG ATTGACCTAC TGCATAATGT TTAGTATTTC CTCTATTAAC TTGCAACCCT TAATATTTCT GTAGTTATTT CGTGATGATT GGGTCAGAAA TGTCATTGCA  AATATTACTA CTTTAAGTTA CCCATGGACT TACTGCATTA AGTTAGGATG TAAATCAAGA TCTAAGGTTA ATGAATCAAT CATCCATTTA TTGCATAATA CTTAGTATTT TTTTTTACTA  AGTTGTAATG TTTACTACAT AATACGTAAT ATTTCTGGCA ATGTAGTTAT TTTGTGATGT AATGGTGTGT CGGACAACAA TGAAAGCATT GTTTTAAATA CAAGGAACCT GCCTACTTGT  CCATTTGTGA AGAAATTTGG ATCGTAGGGT ATGACATAGT TCAGAAATTT AATTGATAAA AAATATTCCA TTGCATTGGT TCAGGGTTGT GATGCTTCGA TTCTGCTTGA TGACACTGCC  AACTTCACGG GGGAAAAGAC AGCAAAACCT AACCTGAATT CGGTCAGAGG GTTTGGAGTG GTGGATAAGA TCAAAAGTGC ACTGGAGAAA AAATGCCCCG GAGTGGTGTC ATGCGCTGAT  CTTCTTGCTG TAGCAGCCCG TGACTCTGTA GTTATTGTGA GTACATGTTT CCAGCCATGA AAAAATTGTG TAAATTTTAT GTTTTTGTTT AGATCAATGC TATGAAAGAT TGATTTTTGG  GCAAGCTTTT CGGTTTAATT TCTAGTTTAT TGTGAATTAA TGCATAAAGT ATGTTACGCC TGTCTTCGAG GTTTGGGTGG GTTTATTATG GATGAATATA CTGGAGGTTT AAGTTTGATG  GGCGTACAAC TTTTGTGTTT GTTGACCAGA GTACTTGTCT GGTCAGAGTT GTTCAATCGT CCAAGCAATT AAAGTAACTG AACAATGGTC GGTTTGGCTT TAGTGGATAC CATACAGGCT  GAGCTTTTGT GTGTTGAGAA AGTATTTGTC TGGGCATAGT TGTTCAAGTG TCCAAGCTGT TAAATTAATA GAAGACTGAT AGGTTTGACT TTAGTGGATA CCATACAAAT GGCTAAGGGA  GTTTATTGAG GAGGGATGTG AATGTGATAT TTTACCACTC ATTATTCATT ATTATTGATT AATATGCAAA TAATTTGTAA ACATTTCAAA TGATTTTAAT TAATTAATnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnGGTTT AGTTTGCATC ACATTACAAG TTTAATTTTA TGAAAAATAG  TTGAGAATGA GAGTTATCTT TGAGAGAATT AAACTATCTC AAAGGCATCA AACTTTAACC CATCTTAGCA CAATTTTGGT GATAGCATCT TATTGGCAAG TAAATTTTTT TCCTATTCAA  CATTACAATT AACCTAGGCT CAATTTAAAT ATATATGGAT GGAATTATCT AATTTTTTAT TTATTTAATA TATGATTGGA ATAAAAAATG GATATATATT GGAAATGCTT TTATTAGTTT  GGAATGATTT AATTTTATTT AAATTTGATA AAGATTTCTA AGAGTTTAAA TTGTTTAAAT TTGTTGAATT TGACTGTTAT ATAAAATTTT CAATAACAAT GAAAAATGAT TAGATAATTG  GTTTTGCTTT TGCTGAATGC ACAGAGTGGA GGACCTACTT GGGAGGCTCT ATTGGGCAGA AGGGACTCCA GAAGTGCAAG CAAGAGCGGT GCAAACTACA ACATTCCTGC CCCCACATCA  ACCCATCAGA CACTAGAAAC CAAATTCAAA CTCAAAGGCC TCCATTCACT TGACCTGGTT GTTCTCTCAG GTAACTTAAT CAAGTCACTT TGGTACCTAT TCTGATTAAT GAGACACAAG  AATAGATTAA TCTAAGGAAT AAAAAGAAAC ATTATCACAG GGAATTTTCT TTTGATGGTC TCCATGAAGT TAATGATTAC TGAAAACAAA TTCCAACAGG GGGGCATACA ATAGGTTTAT  CGCGATGCAC AAGCTTCAAG GCAAGGCTGT ACAATAATAG TGGAACTGCG AAACCTGACC CAACATTGGA CACCACGTAC TTGAAGCAGC TGAGAATCGA GTGTCCCCAA AATGGCACCG  ACGACAATCA AACTGTACCG TTGGATCCGG TCACTCCTTT TAAATTCGAC GTAAACTACT ACAAGAACAT TGTGGCCAGT AAAGGGTTGC TCAATTCAGA TGAGATTCTT TATTCCACCA  ATGGAAGTAA AACAGCAGCC TATGTAAAAT TCTACACAAC CCACACCCAA GCTTTCTTCA AGCAATTCGC TCTTTCAATG ATAAAGATGG GCAACCTCAG TCCTCTCACT GGGTCCCAGG 
GAGAAATTAG GAAGAACTGT CGTAAAATGA ATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGGCA CTTCTGGCCT TAGACTGCAG TTTCGCCCTG TGCTTATCAC GGGACTGGCA CTGATGCTAT GGATCCAGGC ATTACATGCT CAAAGCTCTA ATGGTTTGAC TCCCAACTAT  TATGACAAAT CCTGTCCCGA GGCCTTGTCT ATCATTAAAT CTGGTGTTGA AGATGCTGTG AAACAGGAAG CAAGATTCGC TGCTTCTTTG CTTCGTCTGC ATTTTCACGA CTGCTTTGTT  AAGGGTTGTG ATGCTTCGAT TCTGCTTGAT GACACTGCCA ACTTCACGGG GGAAAAGACA GCAAAACCTA ACCTGAATTC GGTCAGAGGG TTTGGAGTGG TGGATAAGAT CAAAAGTGCA  CTGGAGAAAA AATGCCCCGG AGTGGTGTCA TGCGCTGATC TTCTTGCTGT AGCAGCCCGT GACTCTGTAG TTATTAGTGG AGGACCTACT TGGGAGGCTC TATTGGGCAG AAGGGACTCC  AGAAGTGCAA GCAAGAGCGG TGCAAACTAC AACATTCCTG CCCCCACATC AACCCATCAG ACACTAGAAA CCAAATTCAA ACTCAAAGGC CTCCATTCAC TTGACCTGGT TGTTCTCTCA  GGGGGGCATA CAATAGGTTT ATCGCGATGC ACAAGCTTCA AGGCAAGGCT GTACAATAAT AGTGGAACTG CGAAACCTGA CCCAACATTG GACACCACGT ACTTGAAGCA GCTGAGAATC  GAGTGTCCCC AAAATGGCAC CGACGACAAT CAAACTGTAC CGTTGGATCC GGTCACTCCT TTTAAATTCG ACGTAAACTA CTACAAGAAC ATTGTGGCCA GTAAAGGGTT GCTCAATTCA  GATGAGATTC TTTATTCCAC CAATGGAAGT AAAACAGCAG CCTATGTAAA ATTCTACACA ACCCACACCC AAGCTTTCTT CAAGCAATTC GCTCTTTCAA TGATAAAGAT GGGCAACCTC 
AGTCCTCTCA CTGGGTCCCA GGGAGAAATT AGGAAGAACT GTCGTAAAAT GAATTGA 

Retrieve as FASTA