Entry information : EferAPx[P]08(Eurfer_8_g26923)
Entry ID 16893
Creation 2020-12-21 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-21 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EferAPx[P]08(Eurfer_8_g26923)
Name EferAPx[P]08(Eurfer_8_g26923)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Basal Magnoliophyta
Organism Euryale ferox    [TaxId: 4414 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EferAPx[P]08
start..stop
S start..stop
EferAPx05 674 0 1..430 5..432
AtrAPx03 599 0 1..430 5..421
SaAPx07 594 0 84..430 106..451
VvAPx06 591 0 78..430 73..424
Literature and cross-references EferAPx[P]08(Eurfer_8_g26923)
Protein sequence: EferAPx[P]08(Eurfer_8_g26923)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   428
PWM (Da):   %s   46717.51  
PI (pH):   %s   7.14
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAATCFGGRF LPTAAAPTTK PSTLLPPSCS CSSTSSSLPK LRAFPVSMRT FQSLSSGSSY SSFLLRGKKR AVHTANSSST LPVRCVASDP EQLRKAREDI KELLKTTYCH PILVRLGWHD  AGTYNKKIQE WPQCGGTNGS *FFLELKHGA NAGLVNALKL LQPIKDKYSS VTYADLFQLA SATAIEEAGG PNIPMKYGRL DVTGPEQCPE EGRLPDAGPP SPGDHLREVF YRMGLNDKEI  VALSGAHTLG RSRPERSGWG KPETKYTExW QKDEPGAPGG *SWTVEWLKF DNLYFDVKER KDEDLLVFPT DAALFEDPGF NEYVERYAVD QDAFFKDYAE AHAKLSNLGA KFDPPEGFSI 
DQGSPAPEKF VAAKYSSGKA RELSEAMKQK IRAEYEAVGG SPDKPLQSNY FFNIMILVAV LAFLTSLLGN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction, large 5'end is missing. Stop in frame. Eurfer_8_2213075_2215901_g26923.t1_1_CDS_2836196207_22989
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCGA CTTGCTTCGG TGGGCGTTTC CTTCCAACCG CCGCCGCTCC CACCACCAAA CCTTCCACCC TCCTTCCTCC TTCTTGTTCC TGTTCTTCCA CCTCTTCTTC CCTTCCTAAG  CTCAGAGCTT TTCCTGTCTC TATGCGTACA TTCCAATCCC TCTCCTCTGG TTCTTCGTAT TCTTCCTTTC TCTTATCGGT ACGTTTTCGT CTTCATTTAG TCTGAAAGAA TGCATTTCAG  TTTCTAGAAA TTCAGTAGAA CGGCGAACTG ACTAAAGCCA ATTTCTTCTT TTGCTACTGG AAAAAGGATT GAGAAGTTAG TATTAACTAG TAGAACTAGT GTCTGTGTCC GAAGTGTCTA  TGGGGGATCA AGGCGTCGGA TTCCGACATC GGGCTGTTTG GTTGAAGGGA ATTGGTGAAA TCGTGTAACC GGGAAACAGA ATACGCCAAA GTCCTTTAGT CAAATGTATC TCAATTATTT  CCAAATTCTT CCTTTGAATT CTCTAGTTGG CAGAATGGAG AAAGCTAATA CGCCAAAGTC CTTTAGGGAC GAGAGAACTC TGCCAATTCC TTCAATCACA AATTCTTCTT AATAACCTCC  AAATAATTTT CCCCCAGTTT CTCCCAAGTG CCACATCCCG GAAGCAAGTT GAATCTTTCA GATACTTTCC AGATAGCAAA AGAGAGAAGG TCGAATTAGA TGGTTTCGTA TTTTTTTTAA  TATCAAGATG CGCCTTTGGT TCTCTTATCC TTCCTTTTCA TTTGCTCGAG CTTTATACTA TGGGGATTAT CTTCTGGTGT GTTGCTCTTA TTTGGTTTTT TCTTCATGAT TGAAGCGTGG  AAAGAAGAGG GCGGTACACA CTGCAAATTC CAGCAGCACC TTGCCCGTTA GATGCGTCGC ATCGGATCCT GAACAGTTGA GAAAGGCCAG GGAGGACATC AAAGAACTTT TGAAAACCAC  TTACTGCCAT CCAATTCTGG TAATCCTCAG CTAATTCATC ACTTCTGAGG ATACTATTTG AATATTTGCC TTTTCTCATA TGAAGTGCAC GTGAGGATGG TCTATTCTAT TTCTAACATT  TGGGCACCTT TTTTTGAGTT TCGAATACTG AATTTACAGA CAACGTGCTC TAAATTGAAC GCCTATGGAC AAAATGTAGG TCCGATTGGG ATGGCACGAT GCAGGCACCT ACAACAAGAA  GATTCAGGAA TGGCCACAAT GTGGTGGGAC TAATGGAAGT TAATTTTTTT TAGAGCTGAA GCATGGAGCC AATGCGGGTA TTGAGCTCTC CTGTCATACA TGATGGCTGG TTTCTAGTTG  ACAATATCCT CATTTATCTC ACGACACTTG AAGGCCTGGT TAATGCATTG AAGCTGCTTC AACCAATCAA GGACAAATAT TCCAGTGTTA CATATGCGGA CTTGTTTCAA CTGGCCAGTG  CCACAGCAAT CGAGGTTCTC TAGGATATTT GATTATTTAA TTCCGCCTTT TCATGAACAT AAATCTTTTC CTTCTTCTGT TCAATTTTCT TGGAGGCTGG AGGTCCCAAC ATCCCAATGA  AGTATGGGAG ACTAGATGTT ACAGGTCCTG AGCAGTGCCC GGAGGAGGGA AGACTTCCAG GTTATCTCAT ACGAGATTAT GAATTATGCT TATGTTAACT TGTCTGAGCT TCAAATTCTG  GCAAGATTTG GTTTGGTCGG TGTTACACAT CACGTGGCAG TTGAGGACTC TCTGTTCTCC TGACACAAAT CAACTGATAC ATCATTTATG TAACACCTCA TATGCGGTCC ATGTTTCTGC  AAAATGAACC AATTTCTCCA TGTCCAAAAC AAAGATTCTG TGAATTCTTG ACAACCCATT ATTAGTTGCT TGGCGTTAGC AGAGTTCATA TGGATTTGAA GGCTTATACT GAGATTTTTA  TTTCCAGATG CTGGTCCTCC TTCACCAGGG GACCATCTAC GTGAAGTTTT CTACCGGATG GGACTCAATG ATAAGGTACT TCATCTCTGC AAATTGAAAA TTTATAGCCT GCTTCTTGTT  ATGTTTTACC TTCTGACTTC AAATAGTTTC CACGTTTGCG CAGGAAATTG TGGCATTATC TGGTGCCCAT ACATTGGGAA GATCCAGGCC AGAGCGAAGC GGATGGGGAA AGCCAGAAAC  CAAGTACACT GAGTAAATAC GTCCTTTCCT AGCGATGCAG ATTATATCTA TAATTTCTTT TGATGATCTT TTATCACGTT GCTCTTTAGA ATTATCATAT TAGCATTTAG CAGTTCAATT  ACCTGGCTGT CTAATAACGT ACAGGCTTTT TCATTTATAA CACTACATAT AAAATAATTG CCTTCTACCG GATCCTCCTT TAAAGTTTCC TCTTCTGCTA AGCCTACTTC TCCACCACTA  AAAGGTTTAG TAGCCGTTAC TCTTTAACTG CAGTGAGCAT TTCGAAGCTC ATTTAAATCA AGCGTTTCAT AAAAACTAGC TAGGCAATTA GGTAACCAAT GGGACGAAAA ATGGATGATC  CAATGCGACG GCCATGACTC AAAGATTAAC GTCAAATATA CCAGAGTCCA TCTGACTCAA AGATTGGCTT GATAGTTTAT AAGTTCATTG ACTATTTCCT ACTTGTCCTG CACCGATGCC  ACTATTTTTT TGCTGATATA AAGCAACATG GCTCCAAGGA TGTGGATTCA TCATCTTTGG TTTTTCATGA AAATTTTAAA TTCACCCGCC TATTAGATCA TACTCTATGT TTATGCGTTA  AACTTTTATA TTTCAAAATA TTAATACGAC TTCTTAAAAG GGATAACATA AAGCATTTTT GTTTTTCTTT TGGCAGAAAG ACGAACCTGG GGCACCTGGA GGATAATCCT GGACTGTGGA  ATGGTTGAAG TTTGATAATT TGTACTTCAA AGTAAGGAGG CAATTTCTGG CTTTTGAATC TTTAGCTTTT GCTCTATTTT TGGCATGCTA CTTATTTTGC ATGTAAAATA TCTAGGATGT  AAAAGAGAGA AAGGATGAAG ATTTGCTGGT TTTTCCAACA GATGCTGCTT TATTTGAGGA TCCAGGATTC AATGTATGCT TAAGATGTTT CTTTCAATTT GTCATTCTCG AACTATGGTC  TTATGTTGTT GGAAGTGAAT CATCTGCTTT TTCCACTATT GTCTTTCACA GGAATATGTA GAAAGATATG CTGTTGATCA AGATGCATTC TTCAAGGACT ATGCTGAAGC TCATGCAAAA  CTTAGCAACC TGGGAGCAAA ATTTGATCCA CCAGAGGTCT GTCAATTTCT TCTGCTCTCT AGATTAACTG AAGGATAAGA CTTATTAATT ATTATAGTTA GAGTGGCTCC TACCAAGCCA  TACATAGGAT CATCATTGTT ATTATATAAG ATTTCTCTGC AGATTTTCTC TATGGAATAA GCTATTTGGG AAAAGGGCAA GCCTAGGGAC TGCTCATGTC TGAAAAAGTA GAAATACGAT  AAAAGAAGTT ATGATTTATC AAGAGCAGGT CCGATGATAT CCTTCTTGCA ATAATTCAAG GGACAAGCAG TAAAATATAT ATAAAGTAAC ATATGTTGAA GAACGTAGAA AACATTTCTC  TGGAAGGAAA CCTATTAGAG TAGTGATAAC CCTAGATGAA TCTTTCTATA TTTGGTTGAT TTTTCTATCT CATGTTTCCA AATATTGTTG GATAACAAGA AATTAATATT TCTTGGTTCA  ACATATCTGA TCATGAGAAA ACCTAACTTG TCACAGGCTT TTTGCTAGAT AAACTGTAGA GGTCATATAT ATATATAGTT TCGGTTAAAC AAAAAGCGCA TCAACCATGT TGGTGATCTC  TGTTCCTTTT ATAATTACCA AGTCCAAAGA ATACTGATCT ACGGCTTTTT ATCATTCTCA CTGGTTTCTG ACACAGAAGA CGCTTTTCTT TTCTTGTGGT GTAGGGTTTC TCAATAGATC  AAGGAAGTCC TGCTCCTGAG AAATTCGTGG CAGCAAAATA TTCGTCTGGA AAGGTCAACA TCCTAGAGCA CTTCAAGTTA CCCTGCTTTC TGGAAACTTA ACTTGCATAA TAGATTGTTC  ATTGATTTGC AGGCCTAAAG TAAACAAAGA AATCCTATTT TCCACTGGTA TCCTTTTTAG TAACAGGAGG AAGATTTTGA AACACAATAA AGCTCAACTT TAGAGTCATG GTATTAGGAG  ACGCAAGGAA GCAATAAATA AGTGTTGGTT GTTGCATATT TGACTGCAGA GAGAGCTCTC AGAAGCAATG AAGCAGAAAA TCCGTGCAGA ATATGAAGCA GTTGGTGGCA GCCCTGACAA 
ACCTCTACAA TCAAATTACT TCTTCAACAT TATGATCCTG GTTGCTGTTT TGGCGTTCCT GACATCTTTG CTCGGGAACT GA 

Retrieve as FASTA