Entry information : EferAPx-R02(Eurfer_14_g13213)
Entry ID 16894
Creation 2020-12-21 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EferAPx-R02(Eurfer_14_g13213)
Name EferAPx-R02(Eurfer_14_g13213)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Basal Magnoliophyta
Organism Euryale ferox    [TaxId: 4414 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EferAPx-R02
start..stop
S start..stop
EferAPx-R01 546 0 1..330 1..330
VvAPx-R 382 1e-133 63..328 64..328
AtrAPx-R01 380 3e-133 91..330 77..316
EglAPx-R 365 6e-127 73..328 82..340
Literature and cross-references EferAPx-R02(Eurfer_14_g13213)
Protein sequence: EferAPx-R02(Eurfer_14_g13213)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330
PWM (Da):   %s   35429.12  
PI (pH):   %s   7.61
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSAQLSFLSL HSSTAPPLIL SYSQSPVPSS FGGNGGIGTG RTSFLPNYHS LRPASLICHA YSGRRRFLYA TLLAVLLPVL HDPSSTSDVL AAEVIDDYSS SVRSEIRKVI SKAKAAGILR  LAFHDAGTFN VEDNSGGMNG SIVYELDRPE NAGLKKPVKV LQKAKVEVDK MFPISWADMI SLAGAEAVSI CGGPEIPVRL GRVDAGVPDP EGRLPEECLD ASGLKKSFMR KGLSTKDLVV 
LSGAHTVGGK GFGNPNAFDN SYFKILLEKP WKSSGAMASM IGLPSDHALV EDDECLRWIT AYASNEEKFF RDFKDSYVKL VNSGAHWQIS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect pediction, splicing error.
Eurfer_14_2790234_2794454_g13213.t1_1_CDS_2836105193_17534
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCCGCTC AACTCTCCTT CCTCTCGCTT CACAGCTCGA CAGCACCACC CCTTATACTG TCGTATTCAC AGTCACCAGT TCCTTCATCT TTTGGTGGCA ATGGTGGTAT TGGCACCGGA  AGGACGAGCT TCCTGCCCAA CTACCACTCT CTCAGACCGG GCAAGTGCCT CCTTGGTACT CGATTAGCTG GTGGTTCTTC GACCAGGATT GATGGTCGTG TGCTCTTCTT TATGTAGATC  TTAACAAGCT CATTTGCTTG GTCCTGCAGC TTCGCTTATT TGTCATGCTT ATTCGGGTAG AAGACGGTTC CTTTATGCGA CTCTGCTGCG GTTCTGCTTC CAGTTCTACA CGACCCATCT  TCAACATCTG ATGTTCTTGC GGCAGAGTAA GTTATCCTTG CTAAATAGCT GAAATTGCTG ATTTATGGAG CCCTTTCTAT TGTATGTTCT CAAGGACAAT TCTGCATGTA TATGAGTGGC  TTGAAGAACA AGCGATGAAA TTGGCTGGCA TGATTCTGCG TCTCGATTTT TAGGAAAACA TTACGTTTTT TGCTTGGGTG AGGTTGTATC CTTTATATTC ACGTATGGTT TGATCGGCTT  TCACTTTGTT GGCTGCTGAT TGCAAAATAG TTGTATAGTC ACCGTATTTG ATTTCCTTCG TCAGTCTTCT CTCAATAATT AGCTCATATG CTTGCATATT CATGATGGGT TATTTTTTTG  GCTTTGCGCG ATGGACTTCG GAAGGGTGAT AGATGACTAT TCTTCAAGCG TGAGGAGTGA AATAAGGAAA GTAATATCCA AAGCAAAGGC AGCTGGTATT CTTCGCTTGG CTTTTCACGA  TGCAGGGACA TTTAATGTGG AAGACAATTC GGGTAGTTCT GAAAGAAATT TATCAAATCA TAAGCTTTAT TTTCAGCTCG TCTTCCTTTC TGCCATGGCC TGTCGTGCTG TAGTTTTGGA  ATAAATTTAT ACTTTGAGAA TACGTCGGTA TGCTTTTATT TTTTAGCCCT GTTTTTCTTT TTAACATGGT TCAGATTTTT TTTGGTCAGT TCTATGAAAG GCCATTATGA TCCGCTTCTT  TTTAGTCAAA CTGTGATCGG ATTCAAATTT AGAACAGAAG CTTTGATATA TAAAACACTT TATAAGCTAT GTATATGTGA ACTTTTAGGC TCTATTTTCA GCTTAGTCCA GTATACTTCT  TTACACTTGA AGTTAGTAGT TTGATGGCTT ATGTGATTTT AGGTGGTATG AACGGATCCA TTGTTTATGA GCTTGACAGA CCTGAAAACG CTGGTCTCAA GAAGCCAGTA AAGGTGTGTA  TTTTCTTACT CGTGAGCTCT CTTTTGGCTC TTCATTTGGA TCCACACAAA CCCGTAACAT GGGTAGAGTA ATGATGTTTT CTTTTGCAAG AGAATAGAGT AACATAACAC AAATTTTTAT  ATATTTTTCT TGATACATGG GTGTCAAAGT AACCCAAGTG ATGGAATATA TATTGTCGAC ATCAATACAA CTGTGTGAGA ATAGTAACTG CTGAGGTATC ACGAGAGAGG GAGACCAACT  GAAGTGGCGC AATAGGTATT CTCGACATTA ATGTAACTAT GTGAGAATGG TGACTGTTGA GGTGTGTGTG TGTGCACGCA AGAGAGAGAG CGAGAGCGAG AGCCAACTGC CAATTTTGTT  TTTGGTCATA TAACCAATGA AATAATCTAT TCAATGGATT GGGCATGTCA GGTATTGCAG AAGGCCAAGG TGGAAGTGGA CAAAATGTTT CCTAGTATTT CAGCGGATAG CTTACTATGC  TCGTCCTTTA AGCTTCAACG TGCACGAAAT TGTGATTCTT ATCACATATT CTTTGATTTC TTTGTATCTT TTAGTTTCTT GGGCGGATAT GATCTCTTTA GCAGGGGCAG AGGCAGTTTC  GATTTGTGGA GGCCCTGAAA TTCCTGTTCG GCTAGGCAGG GTGGACGCAG GGTATAGGCA TTTATAAGGA GCATTTTCAT AATTCTGGAC TTCAAGCAGG TTATGCCTTC CAGCTTTGAT  GCATGAATTC TAAATGTTTT TTATGTATCA TTCAGGGTGC CTGATCCTGA AGGGAGGCTC CCTGAAGAAT GTCTGGATGC TTCTGGTTTG AAAAAGAGCT TCATGAGGAA AGGACTATCG  TGAGTTCACC ATAACCACAT AAAAATGCCT ATCCTCTTCC ATGAAATCCA TGGATATCTC TGCTATGTGT TTAATAAATG CACATTGGCC TGCTTTGACC ATATATGCTC ATATTTCAAT  TATTTCAAGT GCATGGTTTA TCTTGTTCAA GAAAAGAACA CTTCGCATAT ATAGATGCAC AAATAAATGT CAGATCTCTC TAAATTTAAT AACCCAACCG CATATATGTT TGTATTGTAT  GTTCTTGTGA CACGCACACT ACCTGAAGTA TGATGCAGAA ACATAGTGAG GACGAAATAC TGTTCGTTCA GATGATATGG TACAACGATA TAATTGAACT TCACTTGGTG AGGAGAGCTT  TTATAAAAGG CAGGTTCAAG TGAGAAAGAT TAAAGTGTTG GTTTCACATA AGCTCTTCTG ATTATCTTCC TTACTCTCAC CTTATTTTTC GTTCAACTCA TGCTTATAAA AGAACATGAT  CAAGAACCAA AAGGAAAAAG CACTGTGAAA GATGTATTGA GTCTGTCAGG CAAATGAAGC TCTTATTAGC TGACTGGAGC CAAAAGGAAA GGGAAGAAAC AAACAAAAAG AAAGTGAATT  GGTAATCTGC TTGATGCTGT GGAAAATGAA TATCCACCTC TCTTATCTTA ACCTAATCTA AAACACGGCA TAAACTGCTC GAACCAGCTG TAATATTAGA TTGTTACCAT TTTATTGGTA  ATAGTTTGCA GTGTGTGAAA ATGTCTTTGT ATTCTTTAGC ACTTGTTAAA GCTTCTTATT CTTTTCTATT TGCAGTAACG ATGTTTTATT GATCTGGAAT ATTTTGTAAT ATGGTTATTG  GCACGCAAGT TATTCCAACG TGTTTTGACT TATTTTTACA CACTTGGACA TAAGCGAGGG ATACTAACAT GATAGCATAG GTACATCTTG AACTCACCTG CAAGCTGTCG TAAGTTTGTT  ATTTGTGCCT CAGTCGTATT TTGCTTGATA GGGTCAGTAC TGATCATTTT AAAGTGTCCA TAAAAATCAT TCTGAATATA AGATTGGCAG AAATATTAAA TGATGAAAAT GATATTTGCT  TCTCTGCTGA AAATTCTGCA GACTCTGAAT TTTCAGTTCC GATATTACGT GAGTAGCATG TTATTTGCAA ACATAACTCT ATTTCATATC TTTGTTGCGT GTATTCTGTA CCTTTGTTAT  ACCCGAGTGC CTTGCCAACT GATTTAGTCA TTTAAATTAG CTGCAAGGTG GGAAAAGTCT TATTCACGAT CCATGTTTGT CTTCCCCATG AAGAGGTGGG CACTCAGTCA TCCATAGCCA  TATGCAAATC AAGAAAACCA TCTGCTCAAA TCTCTTTTTA TGCAGTCAAT GTCTCTGACT TCATTGCTTT TCTCTAGCCT GCAGTAACTA CCATCACGAT TATGATTGAT TTCTACTGTG  GCTTTTGTCT CTGTTCTTTC TTTTTTAAAT CTTATTAGAT GTAGGGATTG GTGTTCCCAA TTATTTCCCT GGCCTAAGAT GTGTCATGTG TGTTTGATGG TTTCATTGTT GATCGCAGGA  CAAAAGATCT GGTAGTGCTG TCAGGAGCGC ATACTGTTGG GGGTAAGGGC TTTGGGAATC CTAATGCTTT TGACAACTCC TACTTCAAGA TACTGCTGGA GAAACCATGG AAGTCTTCAG  GTAAAGTTGT AAAAAGACAG GTAAAAATGA CCTACATGTG TGATTCTGCT GCACTAACAC AACTATGATC CATGTAGCGA GCACGCAGAT TAATTTTTCA TCTATTTACT CGTTTTGCTA  CCTTTTTTTT TTTGCATCTA GGGGCCATGG CGAGCATGAT TGGGCTTCCA TCAGATCATG CACTAGTTGA AGATGACGAG TGCTTAAGGT TTCACTTGCT GCTTAAACTA TTAATGCTAG  ATTCTATTTT CTGTATTGAA GCCTTGTAAT CCCTCCAGGT GGATCACAGC GTATGCAAGT AATGAAGAAA AGTTCTTTAG AGATTTCAAG GACTCTTACG TCAAGCTTGT GAACAGTGGA 
GCACATTGGC AAATATCATA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCCGCTC AACTCTCCTT CCTCTCGCTT CACAGCTCGA CAGCACCACC CCTTATACTG TCGTATTCAC AGTCACCAGT TCCTTCATCT TTTGGTGGCA ATGGTGGTAT TGGCACCGGA  AGGACGAGCT TCCTGCCCAA CTACCACTCT CTCAGACCGG CTTCGCTTAT TTGTCATGCT TATTCGGGTA GAAGACGGTT CCTTTATGCG ACTCTGCTGC GGGTGATAGA TGACTATTCT  TCAAGCGTGA GGAGTGAAAT AAGGAAAGTA ATATCCAAAG CAAAGGCAGC TGGTATTCTT CGCTTGGCTT TTCACGATGC AGGGACATTT AATGTGGAAG ACAATTCGGG TGGTATGAAC  GGATCCATTG TTTATGAGCT TGACAGACCT GAAAACGCTG GTCTCAAGAA GCCAGTAAAG GTATTGCAGA AGGCCAAGGT GGAAGTGGAC AAAATGTTTC CTATTTCTTG GGCGGATATG  ATCTCTTTAG CAGGGGCAGA GGCAGTTTCG ATTTGTGGAG GCCCTGAAAT TCCTGTTCGG CTAGGCAGGG TGGACGCAGG GGTGCCTGAT CCTGAAGGGA GGCTCCCTGA AGAATGTCTG  GATGCTTCTG GTTTGAAAAA GAGCTTCATG AGGAAAGGAC TATCGACAAA AGATCTGGTA GTGCTGTCAG GAGCGCATAC TGTTGGGGGT AAGGGCTTTG GGAATCCTAA TGCTTTTGAC  AACTCCTACT TCAAGATACT GCTGGAGAAA CCATGGAAGT CTTCAGGGGC CATGGCGAGC ATGATTGGGC TTCCATCAGA TCATGCACTA GTTGAAGATG ACGAGTGCTT AAGGTGGATC 
ACAGCGTATG CAAGTAATGA AGAAAAGTTC TTTAGAGATT TCAAGGACTC TTACGTCAAG CTTGTGAACA GTGGAGCACA TTGGCAAATA TCATAG 

Retrieve as FASTA