Entry information : PtaPrx21-2 (PTA00009024)
Entry ID 16895
Creation 2020-12-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx21-2 (PTA00009024)
Name (synonym) PtaPrx21-2 (PTA00009024)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx21-2
start..stop
S start..stop
PtaPrx21 635 0 1..323 1..323
PabPrx139 563 0 1..323 9..328
PgPrx05 560 0 1..323 9..328
PtaPrx123 481 8e-173 1..323 1..323
Literature and cross-references PtaPrx21-2 (PTA00009024)
Protein sequence: PtaPrx21-2 (PTA00009024)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323
PWM (Da):   %s   34293.7  
PI (pH):   %s   9.3
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALTLVKSLV LFAFLQPILA KSGLRVGFYN TKCPQAESIV RGVVTSFFNA DKSIPAGLLR MHFHDCFVRG CDASVLIDPV GNMVPEKAAF PNLSLRGFNI IDAAKTAVEK RCPGVVSCAD  IIALATRDGV ALAGGPQYSL PTGRRDGTIS SINDVNLPGP SSLVSDAAAA FSAKGLSISE MVTLLGAHTV GNALCSFFSD RLYSFQGSGT ADPSMDPTLV VKLKKVCPSP TSTSTQDPNV 
FLDQNTSFIF DNSYYKQLQL KRGILQIDQE LTSDKTTKNI VTSFATNGNA FSKSFVAAIK KMGNIQVLTG NNGQIRKNCR AVN 

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Remarks Complete sequence from genomic ( incorrect prediction, PTA00009024 contains two ORFs) and 3 ESTs (?).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACTCA CACTCGTAAA ATCCCTTGTC CTCTTCGCTT TTCTGCAACC CATACTGGCA AAATCCGGGC TCCGGGTGGG ATTTTACAAC ACCAAGTGTC CGCAAGCAGA ATCCATCGTG  CGGGGAGTAG TCACAAGTTT CTTTAATGCA GACAAATCTA TTCCTGCTGG ACTACTGCGC ATGCATTTTC ATGACTGTTT TGTAAGGGTA AGATGCTAAT TATGGTCTGC GTCTTTCATT  TAAACATATT AAGTTACTCG TTAAAATAGA ATCCTTACAA AGGTTCACTG GTTTTGCTAA TGAATAACGT TGATTTACGC TGTCAATTAA AGGGCTGCGA CGCATCAGTT CTGATTGATC  CTGTAGGCAA TATGGTACCA GAGAAAGCGG CATTCCCAAA TCTATCGCTG AGAGGATTTA ATATAATCGA TGCAGCAAAA ACGGCTGTCG AAAAAAGATG CCCGGGCGTT GTCTCTTGTG  CTGATATAAT TGCGCTTGCT ACCAGAGACG GTGTTGCCCT GGTATAAATT TCCTTCAAAT TTTCCATTTA AAACAGCTAA TCTTATTTAC AGTTTGAACT TTCATAAATC TAATGATTAG  ATATATAGAA TAGAAAAGTG TTTGTCTTCA ACTAACACAG TAGTATAAAT GCAGATAAGG GTATAGTATA ATTAAGCAGA TAAAAAAATT ATGCATAGTC TAACCAGGTT GTTTTCTTTG  GCCTGGAAAG GAAATTTTGT CAAAATTTTA ATAAAATCTG GCATGGAATT TTGTAAATCT AAGTTGTAGT TTTCAAACTT CAAGGTTTGG GTACCTCCTA AGTTTTTGAG GGTACTCAAT  TTATTTCTAG CATCAAAAAC ATGATCACCA TCAAAAATCA CCAATAATGA AAGAATTTTT TATTTTAGAA TTTATAAAAA AAATTGCCAT GCCACTTTTC ACTGTCCCTG CAATTCCTCC  ACCTGAGTAA ACACTTCCAA AAATGATGAA TGGTTTAGAT TTACTAATTT GAAAATATGT TTTTATTATA GATAATGTGG AAATCTTTGA TTTCTAAAAT ATTTTCATTA TAAATATTTT  GATTAACATC ATTATTTATT GATTATTTAA TTTATATAGC AATACTCATT ATAATTGATA TAAATAATAA ATATATTAAT ATTATTTCTC AATGAATATT TAATTTTTTT AATGnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnTTTTTT TAATGGGTAA GTGTATTTGT GAAGTTTAGT TTCTATTAAA TCATAAGTTT AAAATTTATG AGGAAGAGTT AGAAGATAGA AACTATTTTT TTGGAAAATA  AACCATACCA AAGCATGTCC AAGCTCCACC ATCTTAGTGA TACTCTCTGT CTCCACTTCC CAATGATAAC TTCCTACCAT AAAAAAAATT ATTATTCCAT GCAACATTAA ACCCTTATTT  AATTCCAATT AAATATAATA AATTCACATA CATATAAAAC GCTAAATAAT TATAACTATA AACTTAGCTT TATGGGATGC AATAACATAA GCATTCTAAC TTGGTTGAAG CTTTTACAGG  CAGGAGGGCC ACAATACAGT CTACCAACGG GAAGAAGAGA TGGAACCATA TCTTCAATAA ACGATGTGAA TTTACCCGGT CCTAGTTCAC TCGTTTCTGA TGCAGCTGCA GCATTCTCTG  CCAAGGGTTT GAGCATCTCA GAAATGGTCA CTCTGCTAGG TAAGTAGTAT TAATTATACT AGATATATAT CATTTAAGCG TTTTGAAGCA TTTTTCATGA TTAGCTTGTA TCTTACCCAC  CCAATTAATT TAGGTAAAAT TGAATTAATT TTCAATAGAG TAATGTAAAT AGGTCACGAA TTCCCTTAGA AAATAGTGGA AATTTTTGTA TGTGATTTTT TTTTCCTAAA TTCTTAGTGG  AAATCTGGGT TACCATTTTC AAACTTAAGT GAATTTTGTG CAACTCCAGG CGCTCATACC GTTGGGAACG CGCTCTGCAG TTTCTTTAGC GATCGACTCT ACAGTTTCCA AGGAAGCGGG  ACTGCGGATC CTTCCATGGA TCCAACCTTA GTGGTGAAGT TGAAGAAAGT CTGCCCATCT CCGACGTCGA CTTCAACACA GGACCCCAAC GTATTTCTGG ACCAGAACAC TTCGTTTATC  TTCGACAACA GCTACTACAA ACAACTTCAA TTAAAGCGTG GAATTCTTCA AATTGATCAG GAACTCACAT CTGACAAAAC AACCAAGAAC ATTGTCACGA GCTTTGCCAC CAATGGAAAT 
GCGTTTAGTA AGAGCTTCGT CGCCGCCATA AAAAAAATGG GAAACATCCA AGTATTAACT GGCAACAACG GACAAATTCG AAAGAATTGC AGAGCCGTGA ATTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACTCA CACTCGTAAA ATCCCTTGTC CTCTTCGCTT TTCTGCAACC CATACTGGCA AAATCCGGGC TCCGGGTGGG ATTTTACAAC ACCAAGTGTC CGCAAGCAGA ATCCATCGTG  CGGGGAGTAG TCACAAGTTT CTTTAATGCA GACAAATCTA TTCCTGCTGG ACTACTGCGC ATGCATTTTC ATGACTGTTT TGTAAGGGGC TGCGACGCAT CAGTTCTGAT TGATCCTGTA  GGCAATATGG TACCAGAGAA AGCGGCATTC CCAAATCTAT CGCTGAGAGG ATTTAATATA ATCGATGCAG CAAAAACGGC TGTCGAAAAA AGATGCCCGG GCGTTGTCTC TTGTGCTGAT  ATAATTGCGC TTGCTACCAG AGACGGTGTT GCCCTGGCAG GAGGGCCACA ATACAGTCTA CCAACGGGAA GAAGAGATGG AACCATATCT TCAATAAACG ATGTGAATTT ACCCGGTCCT  AGTTCACTCG TTTCTGATGC AGCTGCAGCA TTCTCTGCCA AGGGTTTGAG CATCTCAGAA ATGGTCACTC TGCTAGGCGC TCATACCGTT GGGAACGCGC TCTGCAGTTT CTTTAGCGAT  CGACTCTACA GTTTCCAAGG AAGCGGGACT GCGGATCCTT CCATGGATCC AACCTTAGTG GTGAAGTTGA AGAAAGTCTG CCCATCTCCG ACGTCGACTT CAACACAGGA CCCCAACGTA  TTTCTGGACC AGAACACTTC GTTTATCTTC GACAACAGCT ACTACAAACA ACTTCAATTA AAGCGTGGAA TTCTTCAAAT TGATCAGGAA CTCACATCTG ACAAAACAAC CAAGAACATT  GTCACGAGCT TTGCCACCAA TGGAAATGCG TTTAGTAAGA GCTTCGTCGC CGCCATAAAA AAAATGGGAA ACATCCAAGT ATTAACTGGC AACAACGGAC AAATTCGAAA GAATTGCAGA 
GCCGTGAATT GA 

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