Entry information : PtaPrx25-3 (PTA00009052)
Entry ID 16897
Creation 2020-12-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx25-3 (PTA00009052)
Name (synonym) PtaPrx25-3 (PTA00009052)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx024]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx25-3
start..stop
S start..stop
PtaPrx25 636 0 1..329 1..329
PabPrx65 550 0 1..329 1..328
PabPrx211 529 0 1..329 1..327
PtaPrx05 514 0 1..329 1..328
Literature and cross-references PtaPrx25-3 (PTA00009052)
Protein sequence: PtaPrx25-3 (PTA00009052)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35466.77  
PI (pH):   %s   4.88
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDNHQIFLTI LLVALSSIPA LHAELAAALL SEDYYEKSCP FVVPIVSSEM HLATSKEARV AAYILRLHFH DCFVQGCDAS VLLDDTPTFT GEKTANPNVN SLRGYEVIDA IKERLEAVCP  GIVSCADIIT LAARDAVVLA GGPYWGVPLG RKDSRSASFS EANNNIPTPN SNIQTLIQKF LLQGLTATDM VALVGGHTIG QARCTNFRQR IYSGGNEGNE LYASGLRATC PPSGGDDNIS 
PLDHASPTLF DNSYYVNLVN GEGLLNSDQV MYSGGLGSVL TAYIVKDYAT DALEFAKQFA DSMVKMGNIV KPETFLTGEV RKNCRVINE* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACAACC ATCAGATATT CTTAACTATT TTGCTTGTCG CTTTGTCATC CATTCCGGCA CTTCATGCAG AGCTTGCAGC TGCGTTGTTG TCCGAAGATT ATTACGAGAA GTCATGCCCC  TTTGTAGTTC CCATTGTAAG TTCAGAAATG CATTTAGCGA CGTCGAAAGA AGCTCGTGTG GCAGCCTACA TACTTCGCCT CCATTTTCAC GATTGCTTTG TGCAGGTACT TTATTTTAAT  TTTCACAATC CAAAATCATA TGTTTTTATT GCTTTTGGAT TGAAATTGTG TCACCAAAGT TTTGCATGGC ATTGTTATAA TATTTAGGAT GTATATTCTA TTTTTTTATA TGGAGTTTAA  ATTTTAGGAA TATCTTGGAA TGTGATTGTT TCTAAAGAGA TTAAATATAT ATATTTTTTT CAGATTCTAA GATATTTTAG AAGTCTGCAA TCAAAATAAA AATGCCTCAT TCCGGATCTA  TTTATTATGA GACCATTATA CATTCTGCTC ATCTGATGGG GAAAAGTGAT GAATCAATTT TTTGACATTT TTAATATCAA ATAAATTCCC AGATATTCTT AAAATCTGCT ATCAATATAA  ATTCAAAATC CTCAAAATCA TGTCCACAAA AACTTATGAC CTAAACAAAA TTTTGATTAC ACAGTTTTTA CTGGCTTACT TCTGCTCTAA AATTATAACC ATGGTTAATA TTTTTTGTCA  TTGCAATAAT ATTTGGAATT AATGCAGGGA TGCGATGCGT CTGTGCTGCT GGATGACACG CCCACCTTTA CAGGGGAGAA AACAGCGAAC CCAAATGTAA ATTCGCTGAG AGGATATGAA  GTTATAGATG CCATCAAGGA AAGGCTAGAG GCTGTGTGCC CCGGTATTGT GTCTTGCGCT GATATAATTA CCCTGGCTGC TAGAGATGCA GTTGTGCTGG TACGTTATAC ATTTGTTTCT  TAGTTGATTT AATTGGATTG TATATTTTGA GGATATTTTG AAAGGGTAAC AATATTAGTT AACTCAATTA TTTAATTTCA CTCTCTAAGA TTCAATTATA TATTTTGAAA ATATTGTGAT  TAATATTATT TATCTGGTTT CTAATTTAAT GGTATATTTT GAAAATATTT ATGAAATGCG ATGATTATTA TTTAAATCAA TTATTTGATG TGACTTTATA TATCAAATAG TGAAGATTTT  TATGGTTGTT TATATCCTAG AGAATTATAA GATTTTTAAT ATTTTTAGTA GACATTTTAC CTATCATCAA ACATCAAAAA CTAAAACTAC TCAAAATAAT AACAAGGATG AGTGGAATGT  CCACCAAAAA TAACAAACAA AATTAAAAAT TCTATACACA ATTTCATCTA AAATTCCTTC GCAAAACGTA AGAAAGAATC TTAATCAAAT TCTACTCGTA TAAAATTCAT AAATCCCTCT  TTTAAGTCTC TTCTTTGCTG CTTGCCAGGC CGGAGGCCCA TACTGGGGCG TCCCATTGGG AAGAAAGGAC TCAAGAAGCG CTAGTTTCAG CGAGGCAAAC AACAACATCC CCACGCCCAA  TTCAAACATC CAGACGCTCA TTCAAAAGTT TTTATTACAA GGCCTCACAG CCACAGATAT GGTGGCACTC GTTGGTCAGT GAATACCAAC TCTGGAGCAT GTTTGGATAT TGATTTTCGT  GGGCATTCAT TTTTATGTCT ATTTTAGATT CTCAGAATAT TTCTTACTGT TAAAAGAGGG TCTAATTGTT TGCCTTCTTT ATCGATGGTC ATAATCTTCC AGATATTTTC GGAATCTGCA  ATCTACATAT ATTTAACAGA TTTGTGAAGA TAAACTTTTG TTAAAATCTT TTAGAGTTTC CCCTTGCGCA GGTGGGCACA CAATTGGACA AGCTCGATGC ACCAATTTTA GGCAAAGGAT  TTATAGTGGC GGGAATGAAG GCAATGAACT TTATGCATCT GGACTGAGAG CAACTTGCCC TCCATCTGGT GGCGATGACA ACATATCCCC CTTGGATCAT GCAAGTCCAA CGTTGTTCGA  CAATTCATAT TACGTCAACT TAGTGAATGG GGAAGGGCTC CTCAACTCTG ACCAGGTTAT GTATTCAGGT GGCCTGGGGA GCGTACTAAC GGCGTATATT GTCAAAGATT ATGCTACTGA 
CGCTCTGGAG TTTGCCAAGC AGTTCGCGGA CTCAATGGTG AAGATGGGAA ATATAGTGAA GCCAGAAACT TTTCTGACCG GTGAAGTAAG GAAGAACTGC CGCGTAATCA ATGAATGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACAACC ATCAGATATT CTTAACTATT TTGCTTGTCG CTTTGTCATC CATTCCGGCA CTTCATGCAG AGCTTGCAGC TGCGTTGTTG TCCGAAGATT ATTACGAGAA GTCATGCCCC  TTTGTAGTTC CCATTGTAAG TTCAGAAATG CATTTAGCGA CGTCGAAAGA AGCTCGTGTG GCAGCCTACA TACTTCGCCT CCATTTTCAC GATTGCTTTG TGCAGGGATG CGATGCGTCT  GTGCTGCTGG ATGACACGCC CACCTTTACA GGGGAGAAAA CAGCGAACCC AAATGTAAAT TCGCTGAGAG GATATGAAGT TATAGATGCC ATCAAGGAAA GGCTAGAGGC TGTGTGCCCC  GGTATTGTGT CTTGCGCTGA TATAATTACC CTGGCTGCTA GAGATGCAGT TGTGCTGGCC GGAGGCCCAT ACTGGGGCGT CCCATTGGGA AGAAAGGACT CAAGAAGCGC TAGTTTCAGC  GAGGCAAACA ACAACATCCC CACGCCCAAT TCAAACATCC AGACGCTCAT TCAAAAGTTT TTATTACAAG GCCTCACAGC CACAGATATG GTGGCACTCG TTGGTGGGCA CACAATTGGA  CAAGCTCGAT GCACCAATTT TAGGCAAAGG ATTTATAGTG GCGGGAATGA AGGCAATGAA CTTTATGCAT CTGGACTGAG AGCAACTTGC CCTCCATCTG GTGGCGATGA CAACATATCC  CCCTTGGATC ATGCAAGTCC AACGTTGTTC GACAATTCAT ATTACGTCAA CTTAGTGAAT GGGGAAGGGC TCCTCAACTC TGACCAGGTT ATGTATTCAG GTGGCCTGGG GAGCGTACTA  ACGGCGTATA TTGTCAAAGA TTATGCTACT GACGCTCTGG AGTTTGCCAA GCAGTTCGCG GACTCAATGG TGAAGATGGG AAATATAGTG AAGCCAGAAA CTTTTCTGAC CGGTGAAGTA 
AGGAAGAACT GCCGCGTAAT CAATGAATGA 

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