Entry information : PtaPrx60 (PTA00031623)
Entry ID 16900
Creation 2020-12-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx60 (PTA00031623)
Name (synonym) PtaPrx60 (PTA00031623)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx194]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx60
start..stop
S start..stop
PabPrx165 630 0 1..346 1..345
PtaPrx55 596 0 27..346 1..320
PabPrx230 555 0 27..346 1..321
GbPrx54 457 7e-163 19..346 16..337
Literature and cross-references PtaPrx60 (PTA00031623)
Protein sequence: PtaPrx60 (PTA00031623)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346
PWM (Da):   %s   37925.83  
PI (pH):   %s   6.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEYIRSNSPI SIRNVTALAQ LLILLVMAGS AACSMNAFSN VGLRPDFYAF SCPNAFSIVK SVVEKAVERE TRMAASLLRL HFHDCFVQGC DGSVLLDDTP SFKGEKTAVP NNNSVRGFDV  VDEIKSELES ACPGVVSCAD ILAIAARDSV VLSGGLKWDV MVGRRDSRSA SFSGANHDIP APNSTLQTLL TKFKRHGLDV LDLVALSGSH TIGQSRCISF RQRLYMTTNA NFEESYSAEL 
RSRCPRSGGD NILSPLDVVS PTKFDNHYFT NLESSRGLLI SDQDLYGNQN GQDDQISSTT TALVTAFAED EEKFFQRFAE SMVRMGNIKP LTGSRGEIRE NCRRMN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGTATA TAAGGAGCAA CAGTCCCATA AGCATTAGGA ATGTAACTGC ATTAGCCCAG CTGCTTATTC TATTGGTAAT GGCAGGCAGT GCTGCCTGTA GCATGAATGC ATTTAGTAAT  GTTGGTTTAA GGCCAGATTT CTATGCTTTT TCCTGCCCGA ATGCTTTTTC CATCGTCAAG TCCGTGGTAG AGAAGGCCGT TGAAAGAGAA ACTCGGATGG CAGCTTCTTT ACTCCGTCTC  CATTTCCATG ACTGTTTCGT TCAGGTATTA TATCTATACA TATACTATGA ATATGGGCTC TACTTTCTCA GAATGAGGAT GAACAAATAT TAATCATGGT GTATGTACTG ATGACTGCAG  GGCTGCGACG GGTCGGTGCT GCTGGACGAT ACCCCGAGCT TCAAAGGAGA GAAGACAGCA GTACCCAATA ACAATTCTGT TCGAGGATTT GATGTGGTAG ACGAAATCAA AAGCGAACTA  GAGAGTGCAT GTCCAGGGGT TGTGTCTTGT GCTGACATCC TTGCCATTGC AGCCAGAGAT TCTGTGGTCC TGGTAATTAT TATATTGATG CTCTACATCA CTCTTCCAAA CAATGAATTT  CTATATACAT ATACCAGTAT AGGTTCGCTT TTATTATGGA TCTATCTGGC ACAGAGAGTG CAATTTTCAT TTTGAGTGAA AAATGAAATT ACATTTTAAG AAATTTAAAC TCTATATATA  TATATAATTT TTCATATTTA ATTTTTTTAA ATAGATAGTG TAAACTACAC ACTTTAAACC TGTAAGCTnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnCTTGC AAGGAGAAGG CCCATTTTGA GATAATCAAA CATACAACAT ATATCATTTC  AAGCAGGGTA TTCGAAATAA AGAAATGATA TTAATTATTA ACCAAACCAA CAnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTTTTTAAC CATATACAGT TTGAGCGGAT TCAATAGTTA AGAGTATGTT  TTTCTTTCAA AAAGTCATAT GTTCAAAACC AGAGGGAGGT AGACTATGTA TATCTGGGTA GATTTAGCAG TAAATTTAGT AGTCAAATAG CTGTCAAGAA ATAGGTCCCT TGTCCTACAA  ACAAGGAGGT CTCATACACC ATATTGTTGT ATGGCTTACC TAGTGAAAGT GGTGTTATTG ATGTGTTATA TATATATATA TATATATATA CAACCTTATT TATTGTGATC AACCCTTGTC  TCACAAACAA AGAGGTCTCA TATACTAATT TGGTGTATAG TCCCTTGTCC CATAAACAAA GGGTCTCATA CACCAATTTG GTGTCTAGGT TACCTACTCA AAGTGATATT ATATATGTAT  GGTAATCAAT GTTTCCATTT TCAATTTTAT ATTATGAATA GATGAAATTA TACATCAGCC TCATTTTGAA TTGTAAAATA CGCCTCTCTA TTAATAATTG ATTGATTATA TTGTTGGCAA  TGGCAGAGCG GAGGACTGAA ATGGGATGTG ATGGTGGGAA GAAGGGACTC AAGAAGCGCG AGCTTCAGCG GAGCGAACCA CGATATCCCC GCCCCCAACT CCACTCTCCA AACTCTCCTC  ACAAAGTTCA AACGTCATGG CCTCGACGTC CTAGACTTGG TTGCACTTTC AGGTACCATT TACTACTATT ATCAATTCAT AATGCCAGTT GCTCTTAGTT GTTGATTCTA AAATATTGCA  ATGCAGGCAG CCACACCATC GGCCAGTCTC GGTGTATAAG CTTCAGGCAG AGACTTTACA TGACGACTAA TGCTAATTTT GAGGAAAGTT ATTCTGCTGA ATTGAGATCG AGATGCCCCA  GATCCGGGGG AGATAACATA TTGTCCCCCT TGGACGTTGT CAGTCCCACC AAATTTGACA ACCACTATTT CACCAACTTG GAGAGCTCTA GGGGACTTTT GATCTCCGAC CAAGATCTCT  ATGGCAACCA AAACGGCCAA GATGATCAAA TATCCTCCAC CACCACGGCT TTAGTTACTG CATTTGCGGA GGATGAGGAG AAATTTTTCC AACGCTTCGC AGAGTCTATG GTGAGAATGG 
GAAATATTAA GCCACTCACT GGATCCAGGG GAGAGATCCG AGAGAATTGC CGCCGTATGA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGTATA TAAGGAGCAA CAGTCCCATA AGCATTAGGA ATGTAACTGC ATTAGCCCAG CTGCTTATTC TATTGGTAAT GGCAGGCAGT GCTGCCTGTA GCATGAATGC ATTTAGTAAT  GTTGGTTTAA GGCCAGATTT CTATGCTTTT TCCTGCCCGA ATGCTTTTTC CATCGTCAAG TCCGTGGTAG AGAAGGCCGT TGAAAGAGAA ACTCGGATGG CAGCTTCTTT ACTCCGTCTC  CATTTCCATG ACTGTTTCGT TCAGGGCTGC GACGGGTCGG TGCTGCTGGA CGATACCCCG AGCTTCAAAG GAGAGAAGAC AGCAGTACCC AATAACAATT CTGTTCGAGG ATTTGATGTG  GTAGACGAAA TCAAAAGCGA ACTAGAGAGT GCATGTCCAG GGGTTGTGTC TTGTGCTGAC ATCCTTGCCA TTGCAGCCAG AGATTCTGTG GTCCTGAGCG GAGGACTGAA ATGGGATGTG  ATGGTGGGAA GAAGGGACTC AAGAAGCGCG AGCTTCAGCG GAGCGAACCA CGATATCCCC GCCCCCAACT CCACTCTCCA AACTCTCCTC ACAAAGTTCA AACGTCATGG CCTCGACGTC  CTAGACTTGG TTGCACTTTC AGGCAGCCAC ACCATCGGCC AGTCTCGGTG TATAAGCTTC AGGCAGAGAC TTTACATGAC GACTAATGCT AATTTTGAGG AAAGTTATTC TGCTGAATTG  AGATCGAGAT GCCCCAGATC CGGGGGAGAT AACATATTGT CCCCCTTGGA CGTTGTCAGT CCCACCAAAT TTGACAACCA CTATTTCACC AACTTGGAGA GCTCTAGGGG ACTTTTGATC  TCCGACCAAG ATCTCTATGG CAACCAAAAC GGCCAAGATG ATCAAATATC CTCCACCACC ACGGCTTTAG TTACTGCATT TGCGGAGGAT GAGGAGAAAT TTTTCCAACG CTTCGCAGAG 
TCTATGGTGA GAATGGGAAA TATTAAGCCA CTCACTGGAT CCAGGGGAGA GATCCGAGAG AATTGCCGCC GTATGAATTA A 

Retrieve as FASTA