Entry information : PtaPrx61 (PTA00042703)
Entry ID 16901
Creation 2020-12-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-29 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx61 (PTA00042703)
Name (synonym) PtaPrx61 (PTA00042703)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx61
start..stop
S start..stop
PtaPrx16 607 0 7..336 2..331
PpPrx20 603 0 33..336 1..304
PabPrx88 601 0 1..336 1..333
PabPrx95 487 4e-176 80..336 1..257
Literature and cross-references PtaPrx61 (PTA00042703)
Protein sequence: PtaPrx61 (PTA00042703)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336
PWM (Da):   %s   36196.78  
PI (pH):   %s   5.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MENTMRASAS LSVVVIAVLL GMVQHRVEGA SGQLVYDFYR YSCPFVENMV SNVVRSAVQN DTRMAASLLR LHFHDCIVNG CDASVLLDDT DTITGEKSAL PNLNSARGFE VIDAIKTALE  NSCNATVSCA DILTLAARDS VYLSGGPYWQ VQLGRRDGTT ASKSAANANI PSPIESLDSL ISKFQGVGLS VRDLVVLSGA HTIGRAHCGT FSSRLFNFSA SNGPDPTIQP SLLQNLQSMC 
PNGNSDPNTL APLDAVTKDW FDNVYFKNLQ NNMGLLQSDQ VLFSTANAST AFFVNYYSSF PYAFTRDFPT SMVMMASIGV HTGSDGQIRK NCRFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, contains two ORFs coding for two CIII Prxs)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAATA CAATGAGAGC ATCCGCATCT TTATCTGTGG TAGTTATTGC AGTACTATTG GGCATGGTGC AGCATCGTGT TGAAGGTGCC AGCGGGCAGC TTGTGTACGA TTTTTACAGA  TATAGTTGTC CGTTTGTTGA GAATATGGTG TCAAACGTCG TTCGGTCCGC TGTCCAGAAC GATACCCGAA TGGCAGCTTC ACTGCTCCGT CTCCATTTCC ACGACTGTAT CGTTAATGTA  AGTCTACAAT GTTTTGTTAT CCTTAGTTGT TGCTGAGTAG CTGTAATAGG CAAATACTCA TGCTCACAGT GTAGAATTGT TCTTATTTTT CCCTTCAAAT TCCTTGCTCG TAGTGTAGAA  TTGTTCTTAT TTTTCCCTTC AAATTCCTTG CTCATAGTGT AGAATTGTTC TTAGTTTTCG ATGCTTCGAA ACACCACGAT CTGTTTTCTT TAATCAGTAA ATTGGGTCAC AGCTGGAGAC  TGGAACTGAA ATTAATTCAT AGTTACCAGG TTCCAATTTG AATATGGGAT AAAGAAATAC GAAAAAAATA GATAGTATAT ATTAAAATAT TTCATAATCT AGAAATAATC TGACTAAGGA  TGACTCTTAT TTAGATTTAA TATTTTTCAA TTCGAAAAAA ATTAACCAGT ATATATCAGA ATCTTTCATA ATCTACAAAT AATCTGACTA AGGTTAAATT AACCAGTATA TATCAGAATG  TTTCATAATC TACAAATAAT CTGACTAAGG TTGACTCTTA TTTTGGGTTG CCATGGTGAC TGCTACCACT CTCTGGGTTG TGATGAATAT AAGCAGCAAT TTATTAAATG TTCTTTTATG  GGGTGACCCT AAAACTCTTA AATCACTTTT ATTTCTTATC CTCATTTTTG AAGAGTAATA ATTAGGTATC AGATTTAATT CGAAAATCGA AAAAAATTAG CTAGTGTATA TCAAAATATT  TCACAATCTA CAAATAATCT GACTAAAGTT TACTCTTATT TTGGGTTGCC ATGCTGACTT CTACCACTAT CGGGGTTGTC ATGAATATAA GTAGCAATTT ATTAATGTTC TAAAATTTTT  ATTnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnA ATATTATTAT CATAACTAAT ATATAACTAA  TAATTTAAAA TTTATTTTAT TTTGGTCTCA TCTTTGTATC ATTTTATATT TATTTCAACC AATTTAAAGA TTATTTTAAT TTGACCTATT TTTGTATTTG TGTGTTATTT TCTATTTATT  TATTTTTTAG GTTGTGTTCT CTTTGTTTGA TGATTCCTTG CTCATGTTTT TTTTCACCTC TTAAATTTAT TTTTAGTTTT GCAATTAGAG GCGCATTTTA CAGCCCAATA TGAAGGGGAT  GTGTAAGTTT ATCCCTTGAC CAGTAAATAA AAATAGAAAA AAATAATGTT TGCCCTAAAC AAGAATGAAA ATAACCCTAT AGATAAAAAA AAAAAATTAC AATACAATTA TTTCATGTCT  TTAATAGTTC TTTGATCATA TAGGTTGAAT TTGAATGGTT CATAATTTTA CCTTCAACAA AAAAATTTAC CACATTAAAA TTCCAAATTA GTTAAAATTT TAAACATTTT ACTCCACTCC  CATTTCTTAA ATCAAAGTAA GAAGTTAATT CAACCCAAAT AATTTTTTGA TATTTCTTTT AATTAAATAT TTGTAAATTA AATGTTTAAA AGGAAATTAA TATCCTATGG ATATATTAAA  ATGCCTAAAG ATAAATATTT TGACCTCAAA ATTCTAATAT TTGAAAATTT TGTTATTATG CCATTTTTTT TAATCTAATA TTAATATTGA AAGATTAATA TTATTATTAA ATTTAACAAC  TTTGGATTAA TACAATATTA AATTTAACAT ATTATAGTAT ATATTAATAT ATGTGGGCCT AATGGTTAAG AGCATGTGTT TCCTCCTAAA AGTTCACAAG CTCAAAATCA GAGGGGGCAG  AGTATGTATG CCCTTGTCGC TGCAGGGAGG TGGATCCCTT ATCTCACAAA CAAGGGGGTC TCATACACCA ATGGCTTGGC TGTGACTTTA AAATTGAATA ATAATAATAA TATTAACTCT  AGATATATAT GAGAGGGAAG AAAAAGGACA TAGAGTGATA GAGGTAGGGA GCCAAAATGA GAGAGAGGAT GAGAGAGGGG AATTGAGAGA GAGGAGGAGA GAGGGAAAGA TAGGTAGATG  GAGTTGGAAG GAGAAAGAGG GATAGAAGAA GAAAGACATG GTGAGATCAA ATCCTTGGAG GTGCAAACTT TCTCTTTGGA GTGTAGAATT TGAATGTAGA ATTTGTAACA GATTGTTTGA  CTGTGATATT ACATTGCAGA TTTAAAAAAT TAATGGAGTA TGTGACTGTA ACATCAAATT GTAATATTAC ATCGCAGAGA ATACCAAGAG TTAACTCAGT TTGAGTTCCT CTGGCTAAAT  ACCTCACCAA TAGAAAAATA AAAAAATCAA AACCTTTGAT ATTTTTGGTT AAATCTTGCT AATTTGACAA ACAAGTCTAC CAAAATTTTC CTTTCAATGT AACAGCCAAC GAAAACATAA  CATTGTAAAT TTAAAAAATC CTGTGTTTTT CCAAATCACT TGATTATTGT AACTGGGTTG TACAGGGATG CGACGCTTCA GTGTTGCTTG ATGATACGGA TACCATTACA GGAGAGAAGA  GTGCTCTTCC GAATCTCAAT TCAGCCAGAG GGTTTGAGGT CATCGACGCT ATCAAGACAG CCCTCGAGAA TTCTTGCAAC GCCACAGTTT CTTGCGCAGA TATTCTCACT CTTGCAGCGC  GGGATTCAGT ATACCTTGTA ATATATACAT ATATATATAT TTTGCATTTT CCATATAAAG TTCATGTCCT CCAACAACAT TCTCATTGAA TTAATCTGAT CAACCAACTG AAATATACTT  ACTGCGTATA TACTGTGTGT TTATACAAGA GCGGTGGTCC TTACTGGCAG GTGCAACTGG GGAGAAGAGA TGGCACCACT GCCAGCAAAA GTGCTGCAAA CGCTAACATC CCTTCTCCTA  TTGAGTCGCT TGATTCACTC ATATCCAAAT TCCAAGGTGT TGGGCTTTCT GTTCGAGATC TTGTAGTACT CTCAGGTACA ATTAACACTT AATTTACATA TTCTAAATGA TTAGATAGTC  ATTTTTATTG AAATTGCATT ATTTTTCAAA TTTAGAGTTC CTAATTATTA AGTGTGGGTC ATAATTAAGA TTTAAAATAG ATATCTAAAT TTTGATGATA ATGAACCATA CTCAATAGTT  CGCTTCAATT TGAAATGTGA TTTACCTAAA AATTATCTTG AAAAAATATT TAGAAAATGT TAAATTATAA AAGTGAAATT ATGTAACTTT CAGGGGCTCA CACCATCGGG CGTGCCCACT  GTGGCACTTT CAGCTCACGC CTCTTCAATT TCAGCGCCTC CAACGGTCCG GACCCAACAA TCCAGCCATC TCTACTCCAA AACCTACAAA GCATGTGTCC AAATGGAAAC AGTGATCCAA  ATACATTGGC TCCCCTTGAT GCTGTGACCA AAGACTGGTT CGATAATGTG TATTTCAAAA ATCTTCAGAA CAATATGGGG CTTCTCCAAT CGGATCAGGT TCTCTTCTCC ACTGCAAATG  CATCCACTGC CTTTTTTGTG AATTACTACA GCAGCTTTCC ATATGCCTTC ACCAGAGACT TTCCCACTTC TATGGTGATG ATGGCCAGCA TAGGTGTGCA TACTGGATCA GATGGACAAA 
TCAGGAAAAA TTGTAGGTTT GTCAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAATA CAATGAGAGC ATCCGCATCT TTATCTGTGG TAGTTATTGC AGTACTATTG GGCATGGTGC AGCATCGTGT TGAAGGTGCC AGCGGGCAGC TTGTGTACGA TTTTTACAGA  TATAGTTGTC CGTTTGTTGA GAATATGGTG TCAAACGTCG TTCGGTCCGC TGTCCAGAAC GATACCCGAA TGGCAGCTTC ACTGCTCCGT CTCCATTTCC ACGACTGTAT CGTTAATGGA  TGCGACGCTT CAGTGTTGCT TGATGATACG GATACCATTA CAGGAGAGAA GAGTGCTCTT CCGAATCTCA ATTCAGCCAG AGGGTTTGAG GTCATCGACG CTATCAAGAC AGCCCTCGAG  AATTCTTGCA ACGCCACAGT TTCTTGCGCA GATATTCTCA CTCTTGCAGC GCGGGATTCA GTATACCTTA GCGGTGGTCC TTACTGGCAG GTGCAACTGG GGAGAAGAGA TGGCACCACT  GCCAGCAAAA GTGCTGCAAA CGCTAACATC CCTTCTCCTA TTGAGTCGCT TGATTCACTC ATATCCAAAT TCCAAGGTGT TGGGCTTTCT GTTCGAGATC TTGTAGTACT CTCAGGGGCT  CACACCATCG GGCGTGCCCA CTGTGGCACT TTCAGCTCAC GCCTCTTCAA TTTCAGCGCC TCCAACGGTC CGGACCCAAC AATCCAGCCA TCTCTACTCC AAAACCTACA AAGCATGTGT  CCAAATGGAA ACAGTGATCC AAATACATTG GCTCCCCTTG ATGCTGTGAC CAAAGACTGG TTCGATAATG TGTATTTCAA AAATCTTCAG AACAATATGG GGCTTCTCCA ATCGGATCAG  GTTCTCTTCT CCACTGCAAA TGCATCCACT GCCTTTTTTG TGAATTACTA CAGCAGCTTT CCATATGCCT TCACCAGAGA CTTTCCCACT TCTATGGTGA TGATGGCCAG CATAGGTGTG 
CATACTGGAT CAGATGGACA AATCAGGAAA AATTGTAGGT TTGTCAACTG A 

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