Entry information : PtaPrx65(PTA00082981)
Entry ID 16904
Creation 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx65(PTA00082981)
Name PtaPrx65(PTA00082981)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx65
start..stop
S start..stop
PtaPrx64 618 0 1..318 1..318
PabPrx79 597 0 1..318 1..318
PabPrx125 587 0 1..318 1..318
PtaPrx43 560 0 1..318 1..318
Literature and cross-references PtaPrx65(PTA00082981)
Protein sequence: PtaPrx65(PTA00082981)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318
PWM (Da):   %s   33725.6  
PI (pH):   %s   7.84
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MACSTPMRFL VCIVLVLCSA NAYAQLSSTY YDTSCPKALS TVKAAVKQAV AKEKRMGASL LRLHFHDCFV NGCDGSVLLD DSSTLTGEKT AVPNNNSARG FDVIDTIKSQ VEAVCSGVVS  CADILAIAAR DSVVELGGPT WIVMLGRRDS RTASLSAANT NIPAPTSNLS ALISSFQAKG LSTKDMVALS GAHTIGQARC TNFRTRIYNE SNIDAALATS LKTNCPSTGS DDNLSPLDPL 
TPTTFDNNYY SNLRNQKGLL HSDQQLYNGG STDSMVTTYS TKQNTFFTDF AAAMVNMGNI NPLTGTSGEI RTNCRKPN 

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Remarks complete sequence from genomic (incorrect prediction, PTA00082981 contains 3 ORFs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTGCT CTACACCGAT GAGATTTCTC GTTTGTATTG TTTTGGTTTT GTGTTCGGCA AACGCGTACG CCCAGTTGAG CTCAACGTAT TATGATACGT CGTGTCCCAA GGCCCTCTCG  ACGGTGAAGG CCGCTGTGAA GCAAGCGGTG GCCAAAGAGA AGCGCATGGG GGCATCACTC CTTCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGTAATCT AATTTTTTTC TTTGTCAGTT  CCTCGTTTGA AATTCCATTT GTTGTTTTTT TTCAGATTGG TAGACCTAGA TTTCGGTATT TCCGTGATTG TGAAAAACAA GAGTTTTTGC AGGGTTGCGA TGGGTCTGTG CTGCTGGACG  ACTCTTCGAC TCTAACTGGA GAAAAGACCG CCGTTCCCAA CAACAATTCG GCAAGGGGTT TCGATGTGAT AGACACCATC AAGTCTCAAG TGGAAGCAGT TTGCAGTGGA GTTGTGTCAT  GCGCAGATAT TTTGGCTATT GCTGCTAGAG ATTCTGTTGT CGAAGTAATT ATCAATTGCT TTTGTCATCC TTATTTCCAT GGTATATTTT GGAAATTTTC AGAATTTGAA AGGCGGAAAG  AATCATAGAC AAGCTTGAAA GAACTAGGTG AAATCAAAAG GAAATTAATT TTGAAATTAA ATTCAGTTTA CTGTCTAGTT AGATTTAAGC GGTATTTTTA TGTGTAAATT GATTTAACAG  ATATTTTTAG GTCGATTGTT GATTGCTTAA ATATTTCACA CTGCCTAATC AGACCCATGT TGAATCAGCA ATAAATAAAA CTAGGACCAA TTCTTGTTTC CAGAAAATTC TGAAAATAGA  CCAATAAAAA TGAATTTAAA AAATTAGTGT CGCTCTCAGC TCTGTCATAT TCCTAAATTC CTAAATATTT CCTAAATCCT TATCTGAAAT AACTTTACTC GTTTTCTTTA ATTGTAGTGA  ATCTGTAACT CTTTCCACTC ATCTAAGTGT GGCTGGTGAG AGGCTGGTGG TATACTTTTT ACTATCTTAA TTCATATTCA TATCTTAATT CACATTCATA GAGATAATTT AACTTCAACT  AGGAAATTTA TACGTCACTA CAAATTAAAA AAAAAAGTTT AAAAAATCAA TTATCTAACC CCTCTTCTAA CCATCAGAAT TCAAGATATT CCCATAATCT AGCGTGCGTG ATCATTTATA  TCAATGGTCA ACCTGGTGAT TGAATGAATA TCCTCTACAT AGCTTATGTT GGTAGCTAGA AAAGTTTCCT TCATTCAGAA ATATGTAACG AGATATCTAA TTGTGGTTAA TGGTTTATTT  TGTCGAAATT TTCTGCACAC TTTACACGTA TTGTCTAAAC TCTACACTCA GAAAAAATTG ATACTCGTTC TGTTCGTGTG CGTAGAGAAA TATTGCTTAA TGGAAGTGTT CATTAGATTT  GATCTTCAAT TTTGTTGATC GCAGTTGGGA GGCCCAACAT GGATAGTGAT GCTTGGAAGG AGAGACTCCA GGACTGCCAG CCTAAGTGCT GCAAACACCA ACATTCCGGC TCCCACTTCC  AACCTCAGCG CTCTCATCTC ATCTTTTCAA GCTAAGGGTC TTTCAACTAA GGATATGGTT GCTCTATCAG GTATATAATA TTTCCCAACA CACCTCCAAA TGTTTATATC ATGGAGATTA  AGATAGACTA ACCATATGAT CTGAAATTTT ATTTCGCAAT ATGTTATTGA ACTAGGTGCG CATACCATTG GTCAAGCGCG GTGCACAAAC TTTAGGACTC GCATCTACAA CGAATCCAAC  ATTGACGCAG CACTAGCCAC TTCCCTCAAG ACAAACTGCC CGAGTACAGG AAGCGACGAT AATCTCTCGC CTTTGGACCC CCTTACTCCA ACCACTTTTG ATAACAACTA CTACAGTAAT  CTGAGAAACC AAAAGGGACT TCTCCACTCG GACCAGCAGC TGTATAACGG AGGTTCTACA GACTCCATGG TTACTACCTA CAGCACCAAA CAGAACACCT TTTTCACGGA CTTTGCTGCT 
GCTATGGTGA ATATGGGAAA CATCAATCCT CTCACAGGCA CAAGCGGAGA GATCCGAACA AACTGTAGGA AACCTAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTGCT CTACACCGAT GAGATTTCTC GTTTGTATTG TTTTGGTTTT GTGTTCGGCA AACGCGTACG CCCAGTTGAG CTCAACGTAT TATGATACGT CGTGTCCCAA GGCCCTCTCG  ACGGTGAAGG CCGCTGTGAA GCAAGCGGTG GCCAAAGAGA AGCGCATGGG GGCATCACTC CTTCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGGTTGCG ATGGGTCTGT GCTGCTGGAC  GACTCTTCGA CTCTAACTGG AGAAAAGACC GCCGTTCCCA ACAACAATTC GGCAAGGGGT TTCGATGTGA TAGACACCAT CAAGTCTCAA GTGGAAGCAG TTTGCAGTGG AGTTGTGTCA  TGCGCAGATA TTTTGGCTAT TGCTGCTAGA GATTCTGTTG TCGAATTGGG AGGCCCAACA TGGATAGTGA TGCTTGGAAG GAGAGACTCC AGGACTGCCA GCCTAAGTGC TGCAAACACC  AACATTCCGG CTCCCACTTC CAACCTCAGC GCTCTCATCT CATCTTTTCA AGCTAAGGGT CTTTCAACTA AGGATATGGT TGCTCTATCA GGTGCGCATA CCATTGGTCA AGCGCGGTGC  ACAAACTTTA GGACTCGCAT CTACAACGAA TCCAACATTG ACGCAGCACT AGCCACTTCC CTCAAGACAA ACTGCCCGAG TACAGGAAGC GACGATAATC TCTCGCCTTT GGACCCCCTT  ACTCCAACCA CTTTTGATAA CAACTACTAC AGTAATCTGA GAAACCAAAA GGGACTTCTC CACTCGGACC AGCAGCTGTA TAACGGAGGT TCTACAGACT CCATGGTTAC TACCTACAGC 
ACCAAACAGA ACACCTTTTT CACGGACTTT GCTGCTGCTA TGGTGAATAT GGGAAACATC AATCCTCTCA CAGGCACAAG CGGAGAGATC CGAACAAACT GTAGGAAACC TAACTGA 

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