Entry information : PtaPrx73 (PTA00020151)
Entry ID 16913
Creation 2021-01-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-01-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx73 (PTA00020151)
Name (synonym) PtaPrx73 (PTA00020151)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx120]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx73
start..stop
S start..stop
PabPrx90 581 0 1..353 1..353
PtaPrx108 571 0 1..348 1..348
PtaPrx107 562 0 1..353 1..353
PtaPrx39 559 0 7..341 1..333
Literature and cross-references PtaPrx73 (PTA00020151)
Protein sequence: PtaPrx73 (PTA00020151)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353
PWM (Da):   %s   38371.05  
PI (pH):   %s   4.38
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEAWYFFAMF LLVIASFVHG VHTTDLPTPV EGLSWTFYSD SCANLESIVK STLESVLEQD ITQAPGLLRL LLHDCFVQGC DASILLHGTS SEPSEQEALP NLTLRAQAFE IINEIKEAVE  DKCSGVVSCA DILALAASYA VFASGGPEFL VPLGRRDSLS FANQTVTVDS LPTPTSNVTV LMTHFAAKGF DNFTDLVALS GGHTFGIGHC ASFVDRLYPT QDATLDAAFA KQLEQTCLTS 
ATVNTTDLDI RTPNLFDKKY YIDLQNGEGL LTSDQDLYED TRTQHIVNGF AVNQTYFFEQ FALSMLKMVQ LDVLTGSQGE IRRNCAVRNT KSSSSSYSIV DIPGRSSKSS VIA 

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Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, contains two CIII ORFs).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCCACCATG TTGCCGGAGA GTCGGGGAAT AATCTGCTCA CGCTGCCCTT TAAAAGCTGG TCAAGCTGTT TTCGAACTCC TCGCCCAGTT TTCTCTAAGT ATCTTCGTGT TGCTTTGCCG  TTCTTGGGTA TAATAGAATT TTGATAGGAG AGTGAAGTGA GAGAGAATGG AAGCCTGGTA CTTCTTTGCC ATGTTTCTCC TTGTTATCGC ATCTTTTGTT CATGGTGTCC ATACGACCGA  TCTACCAACG CCGGTGGAGG GGCTTTCATG GACATTTTAC AGCGACAGTT GTGCCAACTT GGAATCGATA GTGAAATCCA CTCTTGAGTC GGTGCTGGAA CAAGATATTA CTCAGGCACC  AGGGTTGCTC AGACTCCTTT TACACGACTG CTTCGTGCAG GTAATCTCTA GATGTTCCTT TCTCTCTTCA TATAGAGACA TAGATATTCG TTAGTGTCGA ATAACATGTA AGTGGTTTTG  ATTTCTTTTT TCATATATAT ATATTTGCGC TGGGTTTGAA TATATATATT TGGGCTGGTT TCAATCAATG AGTTTGAGTT TCATATTATG TGTTTTTTTG GTATATTAAA TAATATTTTT  AATTTGATTA TATATTGGAA AATTTTTTTA AAAAATTAAA TTATCTAACT CTTATTAATA TAAACTTAAT ACACTTTCCC AAATTAAAAA ACCACTATTT TTATTAAACG GGAAAGATGT  AGTCTTATTT AATCAGCTAT TTACTTTATT TGAAAATTAT ATTGAAATCG AAGGATTCAT TCACTTTATT TGAAAATTAT ATTTAAATTT ATAATAAAGT TTATGATTAG ATTATATTTA  AAAATTTCAC TTAAAATTTA TAATAAAGTT TATGATTAGA TTTTTTTAAG TATTTATTTA TTTTTTAAAT TTCAAAACAA GCTTTTCAAA ATCACTATAC AGAGACAATC TAATAAAGAG  TGCCTGCACT AATATTTTAC TAAATTGTCC ACTTTTATAT AATACTATAT TCAAATTTAC AGTGTTTAAT CTCTGCCAGG GCTGCGACGC ATCGATATTG CTACACGGAA CGTCCAGTGA  GCCAAGCGAG CAAGAAGCTC TTCCAAACCT CACACTCAGA GCCCAGGCGT TCGAGATCAT CAACGAAATC AAAGAAGCGG TGGAAGATAA ATGCAGCGGA GTTGTTTCTT GCGCTGACAT  CTTGGCTTTA GCAGCTTCCT ACGCAGTATT TGCGGTGGGT ATCTGAATTT TACATATAGA TTATTAGTAT AGAACAAACT AGGTAAACCA TCTGTTATCT AAAATCTGTT ATAAATTTCT  ACGATAAATT TGTATGATTT TGATTTCAGT CGATGGGTTT TGGATTTATG GTTGTTTTAT AGATTTAAGC GGGGCGATAT ATTGTACATA ATAAAAATAT AATCTTACTA AATTTAAAAA  AACTTTTTAC CTGCGAAATT TTACACCTAA CATCTTCACT AACACATCAA ACTAAATTTC AATGCTTTTG ATACTGGTTT ATAACTTGTA TTGCACTCAG TGAGGTGACC ATGGTGGTAC  ATGTGTGAAA AAGTATACAT ATAAAAGCTC ATAGTCCCTG GTATGTTTGG ATTATGTAAA TGATTTTGGA AATATTTATG TTTGAACTCT GTAAATGAAT TTGGAAATAT TTTAGAATTT  GATGGAAAGT GAAATGGTTG TATTTGGAAT TCTGGAAACT TGTCCAAAAT AAAAGACCTT GCTAACTGTA TGGTATAAGC AATCCATCTT TTATACCTTC AATAAAGCAA GAAAAATTAA  AGTAACCTTA GTCCTTTTCT ACCAATATAG TCAGGAGGAC CGGAGTTTCT AGTACCGCTG GGTCGCAGAG ACAGCCTAAG CTTTGCGAAT CAAACTGTGA CTGTGGACAG TCTACCAACT  CCGACTTCAA ATGTGACTGT GTTGATGACC CACTTCGCTG CAAAGGGCTT TGATAATTTC ACGGATCTTG TGGCACTCTC AGGTCGGTTT TCATTTACAT CAAATTAGAG TTTTAATATA  TTCTGATCTT TCATTTACAT CAAATTAGAG TTTCAATATA TTGTGATGAA AGGGTTTGAT CGTTATTCCT ATGAATGTAT AAACTTTCAG GTGGGCACAC CTTCGGTATT GGTCACTGCG  CATCCTTCGT GGACAGGCTT TATCCAACGC AGGATGCCAC CCTCGACGCC GCCTTTGCAA AACAACTTGA GCAGACATGC CTTACGAGCG CCACCGTGAA TACCACAGAC TTAGATATTC  GCACTCCAAA TCTATTCGAC AAAAAATATT ACATTGATTT GCAGAACGGA GAAGGGCTAC TCACCTCCGA CCAGGATTTA TACGAAGACA CCCGCACGCA ACATATCGTT AACGGTTTTG  CGGTGAACCA GACTTACTTC TTCGAACAAT TTGCCCTCAG TATGCTTAAG ATGGTTCAGC TCGATGTGCT GACTGGAAGC CAAGGAGAGA TTCGAAGAAA CTGCGCAGTT CGCAATACTA 
AGAGCAGCTC CTCATCATAC TCCATTGTAG ATATTCCAGG GAGATCATCG AAGTCTTCTG TGATTGCGTG A 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAGCCT GGTACTTCTT TGCCATGTTT CTCCTTGTTA TCGCATCTTT TGTTCATGGT GTCCATACGA CCGATCTACC AACGCCGGTG GAGGGGCTTT CATGGACATT TTACAGCGAC  AGTTGTGCCA ACTTGGAATC GATAGTGAAA TCCACTCTTG AGTCGGTGCT GGAACAAGAT ATTACTCAGG CACCAGGGTT GCTCAGACTC CTTTTACACG ACTGCTTCGT GCAGGGCTGC  GACGCATCGA TATTGCTACA CGGAACGTCC AGTGAGCCAA GCGAGCAAGA AGCTCTTCCA AACCTCACAC TCAGAGCCCA GGCGTTCGAG ATCATCAACG AAATCAAAGA AGCGGTGGAA  GATAAATGCA GCGGAGTTGT TTCTTGCGCT GACATCTTGG CTTTAGCAGC TTCCTACGCA GTATTTGCGT CAGGAGGACC GGAGTTTCTA GTACCGCTGG GTCGCAGAGA CAGCCTAAGC  TTTGCGAATC AAACTGTGAC TGTGGACAGT CTACCAACTC CGACTTCAAA TGTGACTGTG TTGATGACCC ACTTCGCTGC AAAGGGCTTT GATAATTTCA CGGATCTTGT GGCACTCTCA  GGTGGGCACA CCTTCGGTAT TGGTCACTGC GCATCCTTCG TGGACAGGCT TTATCCAACG CAGGATGCCA CCCTCGACGC CGCCTTTGCA AAACAACTTG AGCAGACATG CCTTACGAGC  GCCACCGTGA ATACCACAGA CTTAGATATT CGCACTCCAA ATCTATTCGA CAAAAAATAT TACATTGATT TGCAGAACGG AGAAGGGCTA CTCACCTCCG ACCAGGATTT ATACGAAGAC  ACCCGCACGC AACATATCGT TAACGGTTTT GCGGTGAACC AGACTTACTT CTTCGAACAA TTTGCCCTCA GTATGCTTAA GATGGTTCAG CTCGATGTGC TGACTGGAAG CCAAGGAGAG 
ATTCGAAGAA ACTGCGCAGT TCGCAATACT AAGAGCAGCT CCTCATCATA CTCCATTGTA GATATTCCAG GGAGATCATC GAAGTCTTCT GTGATTGCGT GA 

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