Entry information : PtaPrx108 (PTA00020152 / PTA00044530)
Entry ID 16982
Creation 2021-02-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-02-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx108 (PTA00020152 / PTA00044530)
Name (synonym) PtaPrx108 (PTA00020152 / PTA00044530)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx090]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx108
start..stop
S start..stop
PtaPrx107 626 0 1..353 1..354
PabPrx90 601 0 1..355 1..356
PtaPrx73 580 0 1..348 1..348
PabPrx32 575 0 1..345 1..342
Literature and cross-references PtaPrx108 (PTA00020152 / PTA00044530)
Protein sequence: PtaPrx108 (PTA00020152 / PTA00044530)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   355
PWM (Da):   %s   38828.19  
PI (pH):   %s   4.02
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MESIYVIAIF LFVLVSFVHD VHASDLPTPV EGLSWTFYED SCPNLESIVK STLDEVLEQN ITQAPGLLRL LFHDCFVQGC DGSILLNGTS SDPSEQEATP NLTLRAEAFE IINDIKETVE  AKCSGVVSCA DILALAASYA VFVAGGPEFL VPLGRRDSLT FASQTVTVDS LPSPTSNVTV LMTLFTEKGF DSFTDLVALS GAHTFGIGHC SAFVDRLYLT QDPTLNATFA KELDETCPTN 
STVNTTNLDI LTPNVFDEKY YVDLQNGEGL FTSDEDLYND TRTQQIVNGF AVNQTYFFEQ FALSMLKMVQ LDVLTGDEGE IRKNCAIPNT NTSSSSYSII DIPVKSHRPL HAMIV* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAATCCA TATACGTTAT TGCCATCTTT CTCTTTGTTC TCGTATCATT TGTTCATGAT GTCCATGCAA GTGATCTGCC GACGCCAGTG GAGGGGCTTT CATGGACATT TTACGAGGAC  AGCTGCCCCA ACTTGGAGTC AATAGTGAAA TCCACTCTTG ATGAGGTGTT GGAACAGAAT ATTACGCAAG CACCAGGGTT GCTCAGACTC CTTTTCCACG ACTGCTTCGT GCAGGTGATC  TCTAATTATT TATTCCAATA ATGTTTAATT GAATCAGCAT TCTGCAAATT TTGAGTTTTT CCAGCATACA TTATAGTTCC GCAGATTAGT AGGAAGTTGG AACTAGTCTC AGTTAATTAG  TTGGGATTAG AGTTAGAAGT AGAATGAGGG TCAGACGATC CGTAGCAAAT TTCTGTAGTT ATATAAATGT TAAGGAAATA TTCATGATTG TAAAAATCTG AGAGCTATAT GTGAATGTAT  TTGATTGTTT TATGTGGATG AGTAAAGAAA AGGAGAACAA AGAATTCCGG GAATTTAAAT TTTAGATGTT TTTGGGTTTA ATGTTGGTAT TGCTTGTGTT TTTGTAAATA TATTTTTCTC  CTCATAACTT TCACGGAGTT ATCTGGTTTC TCTGCGTAAA AATATGCATT CAAATCATTC ACTTCCTTTC TTCTAAGAGC ATATGCATAT TTACAGTGCT TAATCTTTTG GCAGGGTTGC  GACGGCTCAA TCTTGCTGAA CGGAACGTCT AGTGACCCAA GCGAGCAGGA AGCTACTCCA AATCTCACAC TCAGAGCCGA GGCGTTTGAG ATCATCAACG ATATCAAAGA AACTGTAGAA  GCCAAATGCA GCGGAGTAGT TTCTTGTGCC GACATCTTGG CTTTAGCAGC TTCCTACGCG GTATTTGTTG TGCGTATTTA AACTCGAAAC ACCATTAAAC CTCTGATGTA TTGATACGGA  TCTTTAAGTA AGCTAAACTG GATGATGATC ATGGTCTGCA ACAAATAACC AGCTTGCGTA TAGGTCATAA ATAATCAGCA TGTTTATGAG TCATAACTGG ACGAGGTTAT ATATGCTGGT  GGTTGTTAAA TAACTGACCT GTCAAAATCT AAAAGTAAAC ATATACAGCC CCACGTATTT ATGGCCCATT TACAAACTAG CCGATTCTGC AGGCTGGTTA ATTTCACCTA TCATGTTACC  CAGAAAAGCC AGGTACTCTT TCAATGGGGG CATTTATGGC CCAATTACAA ACTAACCCAT TTGCAGGTTG GTCATTTTCA CCTATCACGG TACCCAGAAA AGCCAGGTAC TCTTTCAATT  TGTTTTATTG AACTGAGAGA GGTTAAGTAT TATTGTAGTT TGTTGCAACA ACAGGAACTA GAAATTCATA GTACTTATTA TATAAGTTGA GCAAAATATA AAGTACCATG TATAAATATT  AACGACTAAG TTAACTATTG GTTCACTGTT TTTACTTTTG GGTGGGTTGG ATTAGAATAG ACTGATATTG AATAAAGAGG ATTTTACATT TTTTTTATAT ATTACAATAA TAATGGAGAA  GAAAATATAA AGACAGTAAA TTAATGATTT GCTATAATTA ATTTGTTGCA GGGTGATTAA TGAAAAAAAT TTAAGACAAT ATAGTACATA TCATTATATC TTTAATTTTC TTAAATGCAA  TACATTTTAG ATATTTGTTC TGGCTAAAGT CGTTGCCAGT AAAGGTTCTT CTCCCTTCCA ACCCAGGTTT ATTTTCCGCA ATAGTACTTA CTAAGAAAGG TGATGTACCA TGATGTGATT  AATTTTCCTG ATGCAAACTC ATTTTGGCGT CTGCGCTCGT TGCCGTGGTT GGCAGTAGGG TATCTTTTCC CTTTCGCCCA GGTTTAATTT TCTCCCTTTC ACCGGGGTTT AATTTTTACA  AAAGCTGTTC GTTGAGGTTA AAGGATAGAA GGGTAGGGGT CCACTGAGAA GGACTTCTGG ACTTTTGCTT AATCATAAGC TTAGCTGAAG TGGTCTAAGA TCTATACGTG GACAGGATAT  CTTCAAATGT CTTGAGTTTG TTTGATACAA TTTGTTCTCT ATAGTGTCTG TCTAAAGTTT TCTAGCTTGA TTGCTTGGGA ATGTAGTTTC TTCTCCCTAC CCATATTTAA TTACTGCGAA  GTAGGCTGAC TCAAGTTAGC CCGGTATGAT CTAACCATTG AACATTATAA AAAAGAGATA CTAACCAGTG AACATGAAAA AAGAGATGCC AACTGACCAT AATTGTGTTT TTTTTTTCCA  CAAATAGGCA GGAGGACCGG AATTTCTAGT ACCACTCGGC CGCAGAGACA GCCTAACCTT TGCTAGTCAA ACCGTCACTG TGGACAGTCT ACCAAGTCCG ACTTCAAATG TGACTGTGTT  GATGACCCTC TTCACTGAAA AGGGTTTCGA TAGTTTCACG GATCTTGTGG CGCTGTCAGG TCAGTTTTTC AATGCTCGGA CCAACGATTT AAACTTTAAT CAAATTATAG GTTGAGTACA  TTTCTCCATT GTATTCCGAT GGAAGTGCTT AATGTAAACG TTGAAATTCA GGTGCGCACA CCTTCGGTAT TGGTCACTGC TCGGCCTTCG TGGACAGGCT TTATCTAACG CAGGATCCCA  CCCTCAACGC TACATTCGCA AAGGAGCTAG ACGAGACATG TCCCACAAAC TCCACCGTCA ACACGACAAA CCTAGACATA CTCACCCCAA ATGTATTCGA CGAAAAGTAT TACGTTGATC  TGCAGAACGG AGAAGGTCTC TTTACGTCCG ATGAGGATCT CTACAACGAT ACCCGCACGC AACAGATTGT TAACGGTTTT GCGGTGAACC AGACCTACTT CTTTGAACAA TTTGCTCTGA  GTATGCTTAA GATGGTTCAG CTGGATGTCC TCACAGGAGA CGAGGGGGAA ATTCGAAAAA ACTGCGCAAT TCCCAATACT AATACCTCCT CATCATCATA CTCCATCATA GATATTCCAG 
TGAAATCTCA TCGTCCTCTT CATGCTATGA TTGTGTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAATCCA TATACGTTAT TGCCATCTTT CTCTTTGTTC TCGTATCATT TGTTCATGAT GTCCATGCAA GTGATCTGCC GACGCCAGTG GAGGGGCTTT CATGGACATT TTACGAGGAC  AGCTGCCCCA ACTTGGAGTC AATAGTGAAA TCCACTCTTG ATGAGGTGTT GGAACAGAAT ATTACGCAAG CACCAGGGTT GCTCAGACTC CTTTTCCACG ACTGCTTCGT GCAGGGTTGC  GACGGCTCAA TCTTGCTGAA CGGAACGTCT AGTGACCCAA GCGAGCAGGA AGCTACTCCA AATCTCACAC TCAGAGCCGA GGCGTTTGAG ATCATCAACG ATATCAAAGA AACTGTAGAA  GCCAAATGCA GCGGAGTAGT TTCTTGTGCC GACATCTTGG CTTTAGCAGC TTCCTACGCG GTATTTGTTG CAGGAGGACC GGAATTTCTA GTACCACTCG GCCGCAGAGA CAGCCTAACC  TTTGCTAGTC AAACCGTCAC TGTGGACAGT CTACCAAGTC CGACTTCAAA TGTGACTGTG TTGATGACCC TCTTCACTGA AAAGGGTTTC GATAGTTTCA CGGATCTTGT GGCGCTGTCA  GGTGCGCACA CCTTCGGTAT TGGTCACTGC TCGGCCTTCG TGGACAGGCT TTATCTAACG CAGGATCCCA CCCTCAACGC TACATTCGCA AAGGAGCTAG ACGAGACATG TCCCACAAAC  TCCACCGTCA ACACGACAAA CCTAGACATA CTCACCCCAA ATGTATTCGA CGAAAAGTAT TACGTTGATC TGCAGAACGG AGAAGGTCTC TTTACGTCCG ATGAGGATCT CTACAACGAT  ACCCGCACGC AACAGATTGT TAACGGTTTT GCGGTGAACC AGACCTACTT CTTTGAACAA TTTGCTCTGA GTATGCTTAA GATGGTTCAG CTGGATGTCC TCACAGGAGA CGAGGGGGAA 
ATTCGAAAAA ACTGCGCAAT TCCCAATACT AATACCTCCT CATCATCATA CTCCATCATA GATATTCCAG TGAAATCTCA TCGTCCTCTT CATGCTATGA TTGTGTGA 

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