Entry information : PtaPrx110(PTA00061499)
Entry ID 16985
Creation 2021-02-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-02-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-04-29 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx110(PTA00061499)
Name PtaPrx110(PTA00061499)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx110
start..stop
S start..stop
PabPrx71 575 0 1..324 1..325
PabPrx72 548 0 19..324 21..327
GbPrx60 473 1e-169 10..322 14..328
GbPrx11 463 9e-166 8..322 7..326
Literature and cross-references PtaPrx110(PTA00061499)
Protein sequence: PtaPrx110(PTA00061499)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324
PWM (Da):   %s   35729.98  
PI (pH):   %s   6.61
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATLGIPLGS LSLLLLFFCC AQRSVGLKEN YYATSCPRAE HIVKEQVYNL YQEHGNTAVS WVRLIFHDCI VQSCDASILL DSSGDVQTEK QSDRNFGMRN FKYVDTIKQA IEAECPGVVS  CADIIVLAAK EAAAMLGGPR IAVKTGRRDS RKSSAAVVDK YVPLHNGSIS SLLSAFASVD IDAEGAVALL ADSVGRTHCV NLVERLYPEV DPSFDPDYAV YLKGRCPTPN RDPNEVLYAR 
NDRVTPMKLD NNYFKNLINH RGLLLVDQGL LSDSRTTPYV TKMAQDNNYF FAQFSRALTI LSENNPLTGS DGEIRNHCRF VNRP 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction (extra sequence start of exon 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACAT TAGGAATCCC TCTCGGCTCA CTCAGCCTGC TCCTCCTCTT CTTCTGCTGC GCACAACGCA GTGTGGGACT GAAGGAAAAT TACTACGCAA CGTCGTGTCC GAGAGCAGAG  CACATAGTGA AGGAGCAGGT CTACAATCTC TACCAGGAGC ACGGCAACAC TGCCGTTTCA TGGGTCAGAC TTATCTTCCA TGACTGCATA GTTCAAGTAC CCAATTTAAT CTAATTTTTC  TCAGAATTCG TATTATTAAC CTTAGGAGTT CGTATTTTTA AGCGGATTTT AACTATACGG GAATTCTCTG CACAGTCGTG CGATGCCTCC ATTCTATTAG ACAGTAGTGG AGACGTGCAG  ACAGAGAAAC AATCGGACCG AAACTTCGGA ATGCGAAACT TCAAGTATGT GGACACCATT AAGCAGGCCA TCGAGGCGGA ATGTCCTGGA GTGGTGTCGT GTGCTGACAT TATTGTTCTC  GCCGCAAAGG AGGCAGCTGC AATGGTGTGT GGTTAGCCAA TCTTCGACAG TTATATATAT ATGTGTGTGT GTGGGGGGGG TGGTATAACG GGGCGAAGGA ATGGGCCCAA TAGTCAAAAG  TAGTCCGAAT TAGGGTAATT TTTTATTTTA TTTTATTTTA TGTTATTTAT TTGTTTTAAA TTTTGGTAGA GTTAGTGTTT GAATAGTGTT TTTAATGGTG GAAATAGATT CAGCACCATC  AAACACATTT ACGACACCTA AAATTTTGAA GTTTAAAAAC TATAACTTGG ATTTACAAAG ATCCTTGCTA GATTTTCTCT CAATATTACC AGAATTTTCG TAACTTTCCA GGCAACTCCT  CAGCCTCCTT AAACTACTGG TACTTATATG AGCTGAATTT AATTTAATGA TTAAATAGTC TTTTCATTTT CATTTGAATT TAACAATATA ATTTTAATAA TATATTTTTG AATGTATGCT  GATGCACGAG ACGGATCACA CAGTGCTCGC CATTGATGTT TACAGCGACA AGATCCAGCA TCTCTTGGAG CCTGGTCACC CTTGGTCTGG CCGCATCGAT TTCCCCGGGA TAAATATCAA  GCACGACTCC AGGCTCGAGG GGCTCATCAA GATGGCGGAT CTGGTATTAA TTGGGTGGAT CTGGTCCCTC AATATTTCGA ACATTGAAGG AAGATCTGAT ATGGAGAAAG TGGCACATTC  CTGCTCCTGG GAAGTCAGCA AATCCAGAGA GGAAGTGGTG AAACAAATGA GCGCAGAAGC CATTCCGCAT CCGTGGTTCA AAGCAATCTG TGTGGATGGA AAGGCGGTGG GTGAGATCTC  GCTCAAACTG GGCCAAGACA ACGCCAGATG CAGAGCAGAA ATCGAGTATG TGACGGTCGC CCACTATTGG GGAAAGGGCA TCGTCAATCA AGCCGTTAAG CTGGCAGTGG CCACGGCGTT  ACAGGATCTG CCAGATTTGG AGAGGATCGA AGCGCTGGTC GAACCCCGAA AAGCGGCCTC GCAGAGAGTT TTGGAGAAAG CGGTTTCGTT AAGAAAGGGC TGCTGTCCAG AAGACTAGAT  CCAGCAAAAC AAGGGTTCCA CAAGATCGAT CCACCTCGCA TGGATGCTGA TCTCGATCAG CCAAGACTCC ACAAGACCGA TCTACCCGAT GCAGATCCAG TACAGTTCTT CATCAAATTG  ATTGAGGGCA AACACTATTG CATGCGGCTC AGTAAGGCAA TGAGCATCCA TGCGTTAAAA AAGGAAATCC AGGGTCGCCT AGGAATCCCT GCATGCATTC AAAACCTCAT AAACTCAGGG  TACAGTATGC AGGACAACAA AACCCTCCAG CACTATGGCA TTCCCAAAGA TTCAACCATT ATCTTAACTC TCCGACTGCG TGGAGGAAGC ACTGGCACCA GCTCAAAAAA TACAGGCTCC  TTTCGGGATG CAGTAAAAAG GAAGGAAAAA ATGAAAAATA AAGCAGCATC GCCACCAGAA TTACCAGGAC CCTATATTGT TGAACAAAAG TCAGAATCAC CAACTCTACA AGTATCTATG  CGAGAGGTAA CTAGTTTACA CACCGATTTA TCTAATAATG CAGTTATTTG TAGATTTAAC GGTTTCTGGC CAAAATCAGA TGCCCTGCAT CAATGGATCT ATTCAACATG GACAACTAAC  TGTGAAATTT ACCTATGCCC CAAAGGGTTT TTCATAGTTA GATTTAATAC AAAACAGGAA AGAGACAGCA TTATCAATCA AGGGCTTTGG TTATGGGGCA GTGCTGGCCT CTTTACCACC  CCTTGGTTTT CTGATTTCGA CGCCAATACA ATGACAGTCA CAACAATGCC TGTATGGGTA AGGCTACATG GGCTCCCACT ACATTTTTGG CACCACAAAG CATTAATGGC CATTGGGAAT  TCCCTTGGGA AATTCCTAAA AATGGATGAA GACAGAACTA TGAGGGGAAT ATTTACGTTT GCCAGAATAT GTGTAGAAGT GGACTTGAGT CAGGGGCTAC CTGACCACAT CACGCTGAAC  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TTACATTATA CATAAATAAA AAGGAAAAAA AATAGTAGGG TATTTTTAGA TAAATGGTCC CCTGAGATTA AGTGGATTGC AGATTTTTGG AATTTTTGAT TGCAGATTTT TCGAATTTTT  GAAATAGAAT GGACATGGCC GTTGACAAAA AATTGACTGC ACTCATGTTC GTTTAATTCC GGAAATCTGC AATCAACTTA AAGATGTTTT AGATGGTTAA TTTTGAAAAT ATTTTCGAAT  TTAATAATAA AAAAATTTGT GAGAAAAATA AATTATTGAC TATTTATAGA TAGTTAAAAA TTTGCACTCT TCATAAATTA TATTTATCTA TATTGCTGAT TTACTAAATA TTGAGCAATA  AGAAAGATAT GACATATTAG GCAATTGACA TAGCCCATGT CAATCTGAGT AAATGTTCTG CGAATCAATA ATCAAGATAA GTTCAATATT GTTTAGAGAA TTTTCGGCGA AATTACTTAA  ATAATCATTT GTCCATGGGT TTCGAACCAA CCACTGTGGT TCATCGTCAT CGTCAGAAAC TTGTCCTGAC GATGAACCAC ACTGGTTGGT TCCAAACGCC TTGACAAATG ATTATTTATG  TGATTTCGCC TAAAATTCTT TAAACAATGT TATGGATTAC AAAATTCCTT AATAAACTCA ATATTGTCAA CTAGTAATGG TGATGAATTT GTGGGTGCCG GAGCGGATAG TGTGGGCAGA  ACCCACTGTG TAAATCTGGT TGAGCGGCTT TACCCCGAGG TGGACCCGAG TTTTGATCCC GACTACGCTG TATACCTGAA AGGCCGATGC CCGACCCCCA ATCGGGACCC CAACGAAGTC  CTCTATGCAC GAAACGATCG CGTGACGCCC ATGAAATTGG ACAACAATTA TTTCAAGAAC TTGATTAACC ACAGGGGACT GCTGCTCGTC GATCAGGGCC TGCTCTCGGA TTCCAGAACT  ACGCCCTATG TCACTAAAAT GGCCCAAGAT AACAACTATT TCTTCGCTCA ATTCTCAAGA GCTCTCACTA TCCTGTCAGA GAACAATCCT CTTACTGGCA GCGACGGAGA AATCAGAAAC 
CATTGCCGTT TTGTGAATCG GCCCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACAT TAGGAATCCC TCTCGGCTCA CTCAGCCTGC TCCTCCTCTT CTTCTGCTGC GCACAACGCA GTGTGGGACT GAAGGAAAAT TACTACGCAA CGTCGTGTCC GAGAGCAGAG  CACATAGTGA AGGAGCAGGT CTACAATCTC TACCAGGAGC ACGGCAACAC TGCCGTTTCA TGGGTCAGAC TTATCTTCCA TGACTGCATA GTTCAATCGT GCGATGCCTC CATTCTATTA  GACAGTAGTG GAGACGTGCA GACAGAGAAA CAATCGGACC GAAACTTCGG AATGCGAAAC TTCAAGTATG TGGACACCAT TAAGCAGGCC ATCGAGGCGG AATGTCCTGG AGTGGTGTCG  TGTGCTGACA TTATTGTTCT CGCCGCAAAG GAGGCAGCTG CAATGCTAGG AGGTCCACGC ATCGCGGTGA AAACAGGGAG ACGAGACAGC AGAAAAAGCA GTGCAGCAGT GGTGGACAAA  TACGTTCCGC TGCATAATGG CAGCATCTCA TCTCTTCTCT CTGCCTTTGC CTCTGTGGAC ATCGATGCGG AAGGAGCTGT GGCCCTTTTA GCGGATAGTG TGGGCAGAAC CCACTGTGTA  AATCTGGTTG AGCGGCTTTA CCCCGAGGTG GACCCGAGTT TTGATCCCGA CTACGCTGTA TACCTGAAAG GCCGATGCCC GACCCCCAAT CGGGACCCCA ACGAAGTCCT CTATGCACGA  AACGATCGCG TGACGCCCAT GAAATTGGAC AACAATTATT TCAAGAACTT GATTAACCAC AGGGGACTGC TGCTCGTCGA TCAGGGCCTG CTCTCGGATT CCAGAACTAC GCCCTATGTC  ACTAAAATGG CCCAAGATAA CAACTATTTC TTCGCTCAAT TCTCAAGAGC TCTCACTATC CTGTCAGAGA ACAATCCTCT TACTGGCAGC GACGGAGAAA TCAGAAACCA TTGCCGTTTT 
GTGAATCGGC CCTGA 

Retrieve as FASTA