Entry information : PtaPrx117 (PTA00060286)
Entry ID 17018
Creation 2021-04-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx117 (PTA00060286)
Name (synonym) PtaPrx117 (PTA00060286)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx063]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx117
start..stop
S start..stop
PtaPrx08 678 0 1..372 1..372
PtaPrx94 670 0 1..372 1..372
PabPrx185 588 0 10..372 4..366
PabPrx166 573 0 10..372 9..371
Literature and cross-references PtaPrx117 (PTA00060286)
Protein sequence: PtaPrx117 (PTA00060286)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372
PWM (Da):   %s   39956.54  
PI (pH):   %s   3.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTYRALQTF NLICVFLFVS VAIISTSGYD IDTDDLPTPV DGLSWTFYNE TCPDLESIVN ATLQEVLEAD ITQAAGLLRV HFHDCFVQGC DASLLLTGTS SDPGELEDPP NLTLRATAIA  IINEIKAAVE ANCSGVVSCA DIVTLAARDS VAMAGGPDYP VPLGRRDTLH YANSTVVDNN LPSPVSNLTT LQTIFYSKGF NLTDLVALSG GHTIGLGHCT SFDNRLYNLT TGDKIVDPTL  NTTFAGTLYS ICPVVNDTVN STNLDLITPN VFDNNYYVDV QNGEALFTSD ASLYTDSTDS EDIVNNFASN QTLFFENFIL GMLKMGQLDV LTGTEGEIGT NCSVVNNASS YYQKIIQPIV 
GPEERSSSSQ FT 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACCT ACAGGGCTTT ACAAACTTTT AACCTTATTT GTGTTTTTTT ATTTGTTTCT GTCGCTATTA TCTCTACCAG CGGATATGAT ATAGATACAG ATGATCTGCC AACGCCTGTG  GATGGGCTAT CATGGACATT TTACAACGAG ACTTGCCCAG ACTTGGAGTC CATTGTTAAC GCAACACTAC AAGAAGTGCT GGAGGCCGAT ATCACCCAAG CTGCAGGATT GTTGAGAGTT  CATTTTCACG ATTGTTTTGT GCAGGTAAGC AGATATTTAG CTTCGTTACT TACCTGGGTG CTTGTGAGCC TTGAGCCTGG AGATTTTAAT TAGGTTTTGT CTCTTTTGTT CAGGTTATTT  AGGTTATGAG CCTTGCTTTT TGTTTTAAAA CGATATAGCG GATTCACTTA GTATACTAGA TATATTGTTC GTTACTTACC TGGGTGCTTG TGAGCCTTGA ATCTGGAGAT TTTAATCAGG  CTTTGTCTCT TTTGTTTAGG TTATTTAGGT TATGAGCCTT GCTTTTGTTT TAAAAACGAT ATAGCGGATT CACTTAGTAT ACTAGTTATA TTGGATCGCG CTTTTAAATT TAAAGTAAGT  TCTTCCTTTT AATCTTCCCA AACTTGTTTA TGGAATGATA TAAAGTTTTC AACGAGTCCT CGATGAATTT TTTTTATTAG TTAAGATTTA TACACCTGAG TATGAAACAG CCTTATTATA  ATCTAAAGTG TATTTTGTAG GTATATATAG GTTTAGGTTT ATTGAAACTA TTATAATGTG TATTTTGTAG GTATATATAG GTTTAAGTTT ATTAAAAATA TTATTAAATT ATAGATATAG  GAATTGAGGT TAGATTATGA GCTTTGAGTG TGATTTTAAA TTGTTTTTAT TTGGTTAAGA GTTCATTTTC TTCAAAAGAT AAAGGAACTT GTTAAAAGTT CATGACCAAA GGTATTTGGG  TACAGGTTAG TGACTCAAGA TCTAGAGGCA TCTAGGAAGA TTGAAAGCTT ATCCTCTTAA AATTTGGTTT TCCTAAAATA ACAGTAATAA ATCACCCCTT TTCTGAAATA ACAGTAATAA  GTCACCCTCA ATTCAGGGAT AACAACCTCT CATAATTGTT CGTATTATTA GTAGTTATCA CAAATTTTCC CCAAAAAATG ATTGTTTTGA ATATATTTAG AATTTTTTTC TAATTATAAT  GTTTTTAATn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnTATA TCTATTGAAT TTTTTTTATA CATATTTATA TGTATTGAAA  AAATTATATA GAATATCTAT ACATGTTAAA TTTTTTGAAA AAAATAAAAA TTATACCAAA TATCTATACA AAATATCAAG AAAGCAAAAA TATAGAACAT TCGTATACAT AAAACCACCT  TATATATCCT TCAACTTTCC CGTAGTTGTA AAACATCGAA TCTGAATACG AATTCTGAAT TAGAATGGTT GACTGTTTGA ATATTGCAAC CCTTTCTAAA TGCTATGAAT CTAATACTGT  TGCTCTTTTC TGGAAAGGGT TGCGATGCAT CTCTGTTGCT GACAGGAACA TCAAGCGATC CCGGTGAGCT GGAGGATCCT CCAAACCTCA CACTGAGAGC CACCGCCATC GCCATAATCA  ACGAAATCAA GGCCGCTGTA GAAGCCAACT GCAGCGGTGT TGTATCGTGC GCGGATATTG TGACTTTGGC TGCTCGTGAT TCCGTCGCTA TGGTTGGTAC TACGCTACTT TTGTGCCATT  ATAATTTATG GATCTGCTGT CTCTAATGGA AAATTGCAAT TGGATTGATA CAAATTGTCA TTTTGAAGGC CGGAGGTCCG GATTATCCAG TACCGCTCGG GCGCAGAGAT ACCCTACACT  ACGCCAATTC AACGGTCGTT GATAACAATT TGCCAAGTCC AGTTTCAAAC TTAACTACGC TGCAGACCAT TTTTTATTCC AAGGGATTCA ATTTGACAGA TTTGGTAGCC CTTTCAGGTT  TGATGCTTCG ACTCTTTAGT TTTTATTCTA GTGATAAATG ATTTATGTAG ATTGCAGAAT TTGTAATTTT TCCTGAATCT GACTCTCAAG ATAAATAAAA CTATTAACTT GACTTATGAC  AAATTCTGAA ATATGCAATA AACACAAAGA ATGCCCATAC AATTATATCC TATATCCTTA CTCAGATTGC CGATTTCCAA TATCCCTCTA ATGACATACC TAGTAAAAGG GTTAACGCAT  CCTTCATTGA GTTTTCAAAT ATCATAGAAT CTAAACTTAT GGCAAGTAAT AAGGTTCAAC AATTGACTAT TCATCTGATT GTGGAATATA CACCATATAG CTTCAAAATT ATGACTATGA  ATGTTATTTC AATTGACAAT TTCAATCCTA TGCTGGGTAC CTTAGTCAGA GAAGATTTTG GAATGTTCAT TAAATCTGTA ATTGAGAAGA GAAGATGAAT CAGTTGATTT ACGTGTTATA  ATTATTTTTG CATTGAGTTT GGCCGTTGAA AATATGTACA TTTTTTTCAA AATTTTATTT TTTTTTTCAA AATTTTATTT ATTAACTCAA GTCTTAATAT CACATTTAGT TGAGGATGGA  CTTCTTTAGA ATGGCAATCA AATTTTAAGG AGGTTGTTAG GGTAGACATG CTAAAATCCA GTCAGCTTAG GATGGGTGTG GCTCAATCCA GGTGACTTAG AAGGCAAGGC TGAGATCTGA  TGTTGCACTA CACATGCTAA AATCCAGTCA GCTTAGGGTT GTTCTGGCCT AGTCAGGGTG ACTTACAAGG CAGGGATGTT GCAGTACATG TGCTAAAATC CAGTCAACTT AGAGTTGTCA  TGGTCTATTC AGAGTGACTT AAAAGACCCC TAAGTCACAA TTTCTCAAAC CACAAAGTCA ACCGAGAAAC ACGATCAACT TAACAAACAA AAAAATTAAA AAAAATTATT TATTAAACTC  AATGTGATAG ACCTTGAAGA TTAAGTTTTT CTTAATATAA TGGATATGGA AGGTGAATTT CAAAAATAAA AAATGAGATT ATTTGGTTAC TTAATAACAT GAAATGTTTC AGGTGGGCAC  ACAATTGGTC TTGGTCACTG CACCTCCTTC GACAACCGAT TATATAACCT CACCACAGGA GACAAAATTG TGGATCCAAC TTTAAACACC ACTTTTGCAG GCACTCTTTA TTCAATATGT  CCAGTGGTTA ATGACACTGT CAACTCAACA AATTTGGATC TCATTACTCC AAATGTTTTC GACAACAATT ATTACGTTGA CGTGCAGAAC GGTGAAGCAC TTTTCACCTC TGACGCGAGT  CTGTACACGG ATTCCACCGA CTCTGAAGAC ATTGTGAACA ATTTTGCATC TAACCAGACC CTGTTCTTCG AGAACTTCAT TCTGGGAATG CTTAAAATGG GGCAGCTGGA CGTTTTAACG  GGAACCGAGG GAGAGATCGG TACCAACTGC TCCGTTGTCA ATAATGCTTC TTCATACTAT CAAAAAATTA TCCAGCCCAT CGTTGGTCCA GAGGAGCGGT CTTCGTCTTC ACAGTTCACA 
TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACCT ACAGGGCTTT ACAAACTTTT AACCTTATTT GTGTTTTTTT ATTTGTTTCT GTCGCTATTA TCTCTACCAG CGGATATGAT ATAGATACAG ATGATCTGCC AACGCCTGTG  GATGGGCTAT CATGGACATT TTACAACGAG ACTTGCCCAG ACTTGGAGTC CATTGTTAAC GCAACACTAC AAGAAGTGCT GGAGGCCGAT ATCACCCAAG CTGCAGGATT GTTGAGAGTT  CATTTTCACG ATTGTTTTGT GCAGGGTTGC GATGCATCTC TGTTGCTGAC AGGAACATCA AGCGATCCCG GTGAGCTGGA GGATCCTCCA AACCTCACAC TGAGAGCCAC CGCCATCGCC  ATAATCAACG AAATCAAGGC CGCTGTAGAA GCCAACTGCA GCGGTGTTGT ATCGTGCGCG GATATTGTGA CTTTGGCTGC TCGTGATTCC GTCGCTATGG CCGGAGGTCC GGATTATCCA  GTACCGCTCG GGCGCAGAGA TACCCTACAC TACGCCAATT CAACGGTCGT TGATAACAAT TTGCCAAGTC CAGTTTCAAA CTTAACTACG CTGCAGACCA TTTTTTATTC CAAGGGATTC  AATTTGACAG ATTTGGTAGC CCTTTCAGGT GGGCACACAA TTGGTCTTGG TCACTGCACC TCCTTCGACA ACCGATTATA TAACCTCACC ACAGGAGACA AAATTGTGGA TCCAACTTTA  AACACCACTT TTGCAGGCAC TCTTTATTCA ATATGTCCAG TGGTTAATGA CACTGTCAAC TCAACAAATT TGGATCTCAT TACTCCAAAT GTTTTCGACA ACAATTATTA CGTTGACGTG  CAGAACGGTG AAGCACTTTT CACCTCTGAC GCGAGTCTGT ACACGGATTC CACCGACTCT GAAGACATTG TGAACAATTT TGCATCTAAC CAGACCCTGT TCTTCGAGAA CTTCATTCTG  GGAATGCTTA AAATGGGGCA GCTGGACGTT TTAACGGGAA CCGAGGGAGA GATCGGTACC AACTGCTCCG TTGTCAATAA TGCTTCTTCA TACTATCAAA AAATTATCCA GCCCATCGTT 
GGTCCAGAGG AGCGGTCTTC GTCTTCACAG TTCACATAA 

Retrieve as FASTA