Entry information : PtaPrx132 (PTA00050850)
Entry ID 17027
Creation 2021-04-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-04-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx132 (PTA00050850)
Name (synonym) PtaPrx132 (PTA00050850)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx132
start..stop
S start..stop
PabPrx104 569 0 1..333 2..334
PgPrx06 566 0 1..333 1..333
PabPrx93 566 0 1..333 1..333
PsiPrx02 563 0 1..333 1..333
Literature and cross-references PtaPrx132 (PTA00050850)
Protein sequence: PtaPrx132 (PTA00050850)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333
PWM (Da):   %s   36179.25  
PI (pH):   %s   8.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSKKSAKKP LELVGLVIWV MLGMCVSQGS AQLRQNFYAA TCPNVESIVK NIVTQKFGQT FVTVPTTLRL FFHDCFVEGC DASVIIQSTP NNTAEKDFPD NLSLAGDGFD TVMKAKQAVE  NVCPNTVSCA DILVMATRDV VGLAGGPKFN VELGRRDGLI SQASRVDGKL PKPSNTLNQL NSLFSKKGLP QVDMIALSGA HTVGFSHCSQ FASRIYNFSP RRAVDPSLNS SYAAQLQQMC 
PRIVDPTIAI NMDPTTPRQF DNVYYKNLQS GEGLFSSDRV LFTDLRSQST VNTFAQSSTL FNTAFVNTMI KLGRVGVKTG TQGEIRRDCS HFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Comlete sequence from genomic. Incorrect prediction (extra seq in exon 3 and extra exon in 3'.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCTCAA AGAAATCTGC TAAGAAGCCT TTGGAGTTGG TTGGGTTAGT CATTTGGGTA ATGTTGGGTA TGTGTGTAAG CCAAGGATCA GCTCAGCTTC GTCAGAATTT TTATGCTGCA  ACCTGTCCCA ATGTGGAATC CATTGTAAAG AATATTGTTA CTCAGAAATT TGGGCAGACG TTTGTAACCG TTCCTACCAC ACTGCGGCTA TTCTTCCATG ACTGCTTTGT TGAGGTAAGG  GATATATATT GCTTGGTGGA TTCTATTCAA AATAATGAAT TTGTGTTTTT CTTTTAAAAT AGAAATGATA ACCCTTTGTT TTTCATATTT TCTTTAGTGG TTGATTTTAT TTTAATTATA  GATTTTGCAA TTTAACTAGT ATCAGCATAG ATCCATTTTA AATACAGATC TAACATAAGC TGGTTAAGAG AGATCCAATG TTTTCATGTG CAATTTTTTT TTAATGAATT TACATTATTT  AAATATTTTG TATAATTAnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTTTTTA TTTTTTAAAA TTTTATTAGC AAAAATTCAA TTTTAATAAA GAACTAACAA AATTACACAT GATTAAGACT GTAGAATGAG CATCCTAACC  CAATTAAATA AAGTTTAAAT AATGAATTTT ATTCCATAAA AACAAGATGA ACTAAATCTA CTTCATGAAA CAAAATTCTA ATAATTAACT TTGCTCACTG TCAGTTAAAT ATATTAAATG  TTGGATCTAA TGTTGATGGA GCAAAGTTTA AATAGTTGAC TTTGCTTATG TTGATGGAGC CAAGTTTAAA TAGTTGACTT TGCTCCATAT CTATTAGATG CATGGAAAGC TCCATATCCC  TCAGATACAT GGAATCTGAA ATATGTAAAG ACAAAGTTTG ATTAGTTGAG TTTGCTCCAT GTCCATTAGA TGCATGGAAT ATGGAATTGA TGTAAAAATG CTCTGTTGAG GCTAGTATTA  TTGTTAACAC ACATGATAAT ATATGGTATT TGAGCAATAT CAGTAACAAG ATTATTGAGG TGAAATGGTC TGATGCTTCC TTTGGGTCTG CACAGGGATG TGATGCTTCT GTGATTATTC  AGTCTACTCC AAACAACACA GCTGAGAAAG ATTTTCCGGA CAACTTGTCA CTAGCTGGTG ATGGATTTGA TACTGTAATG AAGGCCAAGC AAGCTGTAGA AAATGTGTGC CCCAACACGG  TCTCTTGCGC TGATATCCTA GTCATGGCTA CTAGAGATGT TGTAGGCCTG GTAAGTGATC CCGAATATCG TAAAGCTTGC CTTCTTTTCA GCGTAATCAT AGAGGAATTA ATAGTCTTGT  AGGCTAGATG CAATATGTGT CGACCTTCCA TAAAGGATTT ACGTCATGTA GTGTTCCATG ATTGGTGATT TTAAGACTTC TAATCCTGTT ACACTTTGCT GAGTTGTGCC CTTCTCTATT  TTACAGGCTG GAGGCCCCAA GTTCAACGTA GAGCTTGGGC GACGAGATGG GCTGATATCC CAAGCGTCCA GAGTCGATGG AAAGCTGCCG AAGCCTTCGA ACACTCTCAA CCAACTGAAC  TCTCTATTTT CAAAGAAGGG CTTGCCTCAG GTGGATATGA TAGCTCTCTC TGGTAATTAA CTGCGATTCT TACATTCGCA ATTGCCCTCC CAATACTTCA ATATTTCTGT TTCTTTTACT  CATTACCGTC TTTGAATTTA TCAAAAATTC AGAGGATTTA AAAGGAACTG AGTATTGAAC TTTCCAATAG TTTAAAAGTT CATGTTCAAT CTTTTCTGTT TTTTAACTGA TTACTATTCC  TAAATTTATC AAACATTCAG GATTTAAAAG TAACTGAGTA TTAAACTTTC TCATTTATTC CCTTGTTTGC TTTTAAAAAG TTTAGGTATT AAAATGAATT TTTATTAAGA ATAAATATTA  TAATGAAAAT TGATGTTTTT TGGTATAAAA CTTATATGTT TTATTTTTAT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTGATGA GTATGCAGAT GAAACTTCAG ACCAGCATTC TGATGACGAT GAGTCTCTTC  CTGTGACCCC TGTTAGACCA CTGCTTGTTG AACATCGAAA TCATACTTCT GCACGTAGTT CGGAAGATTA TCTTGAGCCG TTCCAGATGC AAGTGATCCC TGGCCGTGAC CAGACTCTGG  CGGCCATGGC TTCGGAAGCC GACTCTTCGT CATCTAATTC GTTCTCGGGG GTCCAAGTCC TCATTAATTG CAGGGCACCG GTACAATTTT CCTACGATTA TCGTGGCGGC CACATGATGC  AGGTTCCCTC AGGCTTGGCG AACTTCAGTT CTGTGGACCA GAAGTCCGTC GGCGATCGGG TTTTTCAACC GGTCTTAATG AGCATATCGG CATTGGAAAT GAGCAAAATG ACGGCGCAGG  AGATCGTGGA AGCCAAGGCC CTTGCGGCGT CCAAGAGCCA CAGTGAAGCG GAGCGGAGGC GGCGTGAACG GATAAACAAC CATCTTGCCA CCCTTCGCAG CTTGCTTCCT AACACAACCA  AGACGGACAA AGCTTCTTTG CTGGCAGAGG TCATCGATCA TGTTAGAGAG CTGAAATGCA TGGTGGACGA CATAGGGCAG GCAAGCCCGG TGCACAGCGA AGCTGACGAA GTAAGCCTAG  AATATCTTGA TCTGAACGAA GAAGGCAAGT CGGTCATACG CGCTTCCCTG TGCTGCGAAG ACTGCCCCGA ACTCCTGTCG GATCTCATTA AAACCCTAAG ATCACTTCGG CTCCGAGCAA  TCAAGGCGGA GATCGCAACC CTCGGCGGTA GGGTGAAGAA TGTGTTAGTT GTGACTAGTG GTGACTCACA GGACCCCAAT GACGTGAGCG AAACCCCCTC CGCTTCCAGC ATTAAGGAGG  CACTCAAGGC GGTGATGGAA AAGCAGAATT TTGGTGATCT TTCGCCTGCA AGTTCTTCCG GTGGGAATAA AAGACAGCAT CAGGTGGATA TGATAGCTCT CTCTGGAGCC CACACCGTGG  GATTTTCTCA CTGCAGCCAA TTTGCAAGCA GAATCTATAA TTTCAGTCCT CGTAGAGCTG TGGACCCAAG TCTGAATTCT TCGTATGCCG CCCAACTGCA ACAGATGTGT CCCAGGATCG  TAGATCCGAC AATTGCCATC AACATGGATC CAACAACTCC TCGTCAGTTC GATAACGTTT ATTACAAGAA TTTGCAGTCC GGCGAAGGAC TCTTCTCATC TGATCGGGTT CTATTTACAG  ACCTACGCTC ACAGAGCACA GTGAACACAT TTGCACAGAG TTCAACATTG TTTAATACGG CCTTCGTAAA CACCATGATT AAATTGGGTC GTGTGGGAGT TAAGACGGGC ACACAGGGTG 
AAATTAGACG AGACTGCAGT CACTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCTCAA AGAAATCTGC TAAGAAGCCT TTGGAGTTGG TTGGGTTAGT CATTTGGGTA ATGTTGGGTA TGTGTGTAAG CCAAGGATCA GCTCAGCTTC GTCAGAATTT TTATGCTGCA  ACCTGTCCCA ATGTGGAATC CATTGTAAAG AATATTGTTA CTCAGAAATT TGGGCAGACG TTTGTAACCG TTCCTACCAC ACTGCGGCTA TTCTTCCATG ACTGCTTTGT TGAGGGATGT  GATGCTTCTG TGATTATTCA GTCTACTCCA AACAACACAG CTGAGAAAGA TTTTCCGGAC AACTTGTCAC TAGCTGGTGA TGGATTTGAT ACTGTAATGA AGGCCAAGCA AGCTGTAGAA  AATGTGTGCC CCAACACGGT CTCTTGCGCT GATATCCTAG TCATGGCTAC TAGAGATGTT GTAGGCCTGG CTGGAGGCCC CAAGTTCAAC GTAGAGCTTG GGCGACGAGA TGGGCTGATA  TCCCAAGCGT CCAGAGTCGA TGGAAAGCTG CCGAAGCCTT CGAACACTCT CAACCAACTG AACTCTCTAT TTTCAAAGAA GGGCTTGCCT CAGGTGGATA TGATAGCTCT CTCTGGAGCC  CACACCGTGG GATTTTCTCA CTGCAGCCAA TTTGCAAGCA GAATCTATAA TTTCAGTCCT CGTAGAGCTG TGGACCCAAG TCTGAATTCT TCGTATGCCG CCCAACTGCA ACAGATGTGT  CCCAGGATCG TAGATCCGAC AATTGCCATC AACATGGATC CAACAACTCC TCGTCAGTTC GATAACGTTT ATTACAAGAA TTTGCAGTCC GGCGAAGGAC TCTTCTCATC TGATCGGGTT  CTATTTACAG ACCTACGCTC ACAGAGCACA GTGAACACAT TTGCACAGAG TTCAACATTG TTTAATACGG CCTTCGTAAA CACCATGATT AAATTGGGTC GTGTGGGAGT TAAGACGGGC 
ACACAGGGTG AAATTAGACG AGACTGCAGT CACTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA