Entry information : PtaPrx134 (PTA00083563)
Entry ID 17031
Creation 2021-04-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-04-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx134 (PTA00083563)
Name (synonym) PtaPrx134 (PTA00083563)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx134
start..stop
S start..stop
PtaPrx42 570 0 1..353 3..353
PabPrx303 566 0 1..353 1..353
PtaPrx135 565 0 1..353 1..351
PabPrx02 556 0 1..353 1..353
Literature and cross-references PtaPrx134 (PTA00083563)
Protein sequence: PtaPrx134 (PTA00083563)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353
PWM (Da):   %s   38669.74  
PI (pH):   %s   7.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKVVILCLI CTLGIAYASV DEILTLNPEP PLVNGLSWTF YKTSCPDLES VVRKRINFHL KEDITQAAGL LRVHFHDCFV QGCDGSVLLD GSASGPSEQD APPNLTLRAK AFEIINDIKK  HVEKACSGVV SCADLTALAA RESVRAVGGP EYRVPLGRRD SLKFATRKVT VANLPSPTFN ATTLINAFAK KKLDVTDLVS LSGGHSIGIA HCSSFANRLY PTQDSTLNKN FAKGLYTTCP 
SNTTTNTTVL DIRTPNLFDN KYYVDLVNRQ GLFTSDQDLY THSSTRAIVK KFADDQDLFF QKFAFAIVKM SQLSVLTGSK GEIRSNCSVR NPSSIVEVTT EDVMDTEPYV AFM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction ( PTA00083563 contains tow complete Prx ORFs).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAGG TTGTAATCCT TTGTTTGATA TGCACACTTG GGATCGCGTA TGCGAGCGTT GATGAAATTC TAACTTTGAA TCCTGAACCG CCCCTCGTTA ATGGACTGTC ATGGACATTT  TACAAGACGA GCTGTCCTGA TTTGGAATCT GTTGTGAGGA AAAGGATCAA CTTTCACTTA AAGGAGGACA TCACCCAAGC GGCTGGTTTG CTGCGCGTCC ATTTCCATGA CTGCTTCGTT  CAGGTACTTG TTTATTCGCT GATTTAATAA CAAATAATTT TGAGAATATG GTTTAGTTTA GGAGTCGTTT ACTTTGTTTA AAAGTGGTGG GAATTTTTTT CATGTTTAAA TTTTATTTTT  GAATGTGGAA ATAGATTCAG TACCATCAAA AATCTATAAA ACATTTAATG TATTGAAATT TAATAACTAT AACTTAAATT TAAAAAAAAT TCTTATCCAA TTTTATTAAA ATATACAAAA  ATTTCCATAA TTTTCAAAGC AAAATATAAT CTAATTAAAC TACAGCTTAA TTTTATATTA ATGATTTCTT TCGTTTTAAA AAAGATACTG AGTGATCACT AACTAACTGC TTATATTCCT  ACAAATTTAT TCCTCTTAAG TGTTACTAGC ATACCCCTCT GAATTTAAGA AAAATACATA CTCTGAATTG TTCAATTTGC GAACTGTACA TAGCCTACGC TTCGTACCTG ATCTCTTAAC  CAGAAACACT GCATCTGCTT TATTTAAGTG GTGAGGATTG ATCGTTGTTA TTGTGGGATG GATTGTTGTT ATTTTTTTAT TTAAGTTTTG GGATTGATGG TTGTTCTGTT TGGGATTGAT  TGTTGTTTGG GATTGATTGT TGTTATTGTG TTAGATGTTA GATTTTTGTG ATGAATATTG TAAATGAGAA TATTTTTTAG ATTAATTATT TTATTAAAAT TTGATGGATT TCATCAGATT  TCTATTTTTA GATTTTATTT TTAAATTGAG ACATGTTTAT TCTTGAGTAA TGTTTATTGA GTAATGTAAT ATATCGAAAT TATTTTGCTG AATTTAGGTT TCTGTGATCT ATATCAAGTT  TATAGAGAAG AGTTTTCGGT GAAAATCACA TGGTAATTCA TTTATGAGTT TCGAACCAAC AAGTATGATC TGGTTCTTTA ACTTGTGTGA GTTTCGAACC AACATGTGAT CTGGTTCTTC  AACTTATCGG ATGAACCACA CTTTGTTAGT TTGAACTACT CTGGTTGGTT CAAAATAAAT AGACAAATGA AATGTTATAT AATTTTCACC TAAAACTCTT CTTTATAAAC GGAATTATTT  TCTTAAATTT CTAATTATTT TCTTAAATTC TTTACTAACC AGAGCCATTA ACATTTTTTT ATTTAAGGGA AAAAAATCCA TAGAAAAAAG CATCTAACTT TCTCGGTTAC ATTTACAGGG  TTGCGACGGA TCGGTTCTGT TGGACGGTTC TGCCAGCGGT CCTAGCGAAC AAGACGCTCC ACCGAACTTA ACGCTGAGAG CAAAAGCCTT TGAAATAATT AACGACATCA AGAAACATGT  GGAAAAGGCT TGCAGCGGCG TTGTCTCTTG CGCGGACTTG ACTGCTCTCG CAGCTCGCGA GTCGGTCAGA GCAGTAAGCC ATCATAGTTC CCTTCTATTT AATTATGTTG TACTCCATTT  TGGGTCAATT CGATCCGTTT GTTTAAGGTA TTGCACTGTG CTGTTCTTAG GTTGGAGGAC CAGAGTATCG AGTGCCTCTG GGGCGCAGGG ACAGCCTGAA ATTCGCCACA CGAAAAGTGA  CCGTTGCCAA CCTCCCGTCT CCCACTTTTA ATGCGACCAC CCTCATCAAC GCTTTCGCCA AGAAGAAACT CGACGTCACA GACCTCGTTT CTCTTTCAGG TTTTGCAGTA GTTCTTTTAG  TTTTTAATAG AGAAGTCTAA CTGAGGTCAC AATTTCGCTA GAAAAATAAT GGAAATTTGG ACAAAAATTT TGAAAAAATT TCGCTGAATT TTTTGGACAA AATTTGGCTG AATTTTTTTT  GGAAATCATA GCTACCACTG AAAAAACTTC AGTATTTTGT ATTTTGTTAT GATGTTTAAC GTTGAGTTGG CATGACAGGT GGGCACAGCA TCGGCATCGC GCACTGCAGC TCCTTCGCCA  ATCGTCTATA CCCGACGCAG GACAGCACTT TGAATAAAAA CTTCGCCAAG GGTCTGTATA CCACCTGCCC TTCCAATACC ACCACCAACA CTACCGTCTT AGACATTCGT ACGCCCAACC  TGTTCGACAA CAAGTATTAC GTAGACCTCG TGAACCGCCA GGGACTCTTC ACCTCCGACC AGGATCTCTA CACCCATTCC AGCACCCGAG CAATTGTCAA GAAATTTGCT GACGATCAGG  ATCTTTTCTT CCAGAAATTT GCTTTTGCCA TTGTGAAGAT GAGCCAGCTG AGCGTCTTGA CGGGCTCCAA AGGGGAGATC AGGAGCAACT GTTCTGTTCG AAATCCTTCT TCCATTGTCG 
AAGTAACGAC AGAAGACGTC ATGGATACTG AACCTTATGT GGCCTTCATG TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAGG TTGTAATCCT TTGTTTGATA TGCACACTTG GGATCGCGTA TGCGAGCGTT GATGAAATTC TAACTTTGAA TCCTGAACCG CCCCTCGTTA ATGGACTGTC ATGGACATTT  TACAAGACGA GCTGTCCTGA TTTGGAATCT GTTGTGAGGA AAAGGATCAA CTTTCACTTA AAGGAGGACA TCACCCAAGC GGCTGGTTTG CTGCGCGTCC ATTTCCATGA CTGCTTCGTT  CAGGGTTGCG ACGGATCGGT TCTGTTGGAC GGTTCTGCCA GCGGTCCTAG CGAACAAGAC GCTCCACCGA ACTTAACGCT GAGAGCAAAA GCCTTTGAAA TAATTAACGA CATCAAGAAA  CATGTGGAAA AGGCTTGCAG CGGCGTTGTC TCTTGCGCGG ACTTGACTGC TCTCGCAGCT CGCGAGTCGG TCAGAGCAGT TGGAGGACCA GAGTATCGAG TGCCTCTGGG GCGCAGGGAC  AGCCTGAAAT TCGCCACACG AAAAGTGACC GTTGCCAACC TCCCGTCTCC CACTTTTAAT GCGACCACCC TCATCAACGC TTTCGCCAAG AAGAAACTCG ACGTCACAGA CCTCGTTTCT  CTTTCAGGTG GGCACAGCAT CGGCATCGCG CACTGCAGCT CCTTCGCCAA TCGTCTATAC CCGACGCAGG ACAGCACTTT GAATAAAAAC TTCGCCAAGG GTCTGTATAC CACCTGCCCT  TCCAATACCA CCACCAACAC TACCGTCTTA GACATTCGTA CGCCCAACCT GTTCGACAAC AAGTATTACG TAGACCTCGT GAACCGCCAG GGACTCTTCA CCTCCGACCA GGATCTCTAC  ACCCATTCCA GCACCCGAGC AATTGTCAAG AAATTTGCTG ACGATCAGGA TCTTTTCTTC CAGAAATTTG CTTTTGCCAT TGTGAAGATG AGCCAGCTGA GCGTCTTGAC GGGCTCCAAA 
GGGGAGATCA GGAGCAACTG TTCTGTTCGA AATCCTTCTT CCATTGTCGA AGTAACGACA GAAGACGTCA TGGATACTGA ACCTTATGTG GCCTTCATGT GA 

Retrieve as FASTA