Entry information : InPrx[P]124
Entry ID 17615
Creation 2022-05-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-05-03 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-05-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: InPrx[P]124
Name InPrx[P]124
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx017]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Convolvulaceae Ipomoea
Organism Ipomoea nil    [TaxId: 35883 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value InPrx[P]124
start..stop
S start..stop
IaquPrx72 574 0 1..335 1..332
NtPrx65-1B 441 9.05e-157 14..335 11..334
EcamPrx151 439 2.74e-156 12..335 2..323
EgrPrx154 437 1.73e-155 19..335 1..315
Literature and cross-references InPrx[P]124
Protein sequence: InPrx[P]124
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   335
PWM (Da):   %s   36381.38 Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   8.41
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKSEGDYKVT RRLMLMVLLV TISTLANVST AALQVGFYHS SCPQGEAIVR KVVKKAVRRD PSLxAGLLRL HFHDCFVRVC GCDASILVDS TLNSKAEKDH PANNPSLRGF DVIDKAKYWV  ESQCPQTVSC ADIVAFAARD SAAVLGGINY DVPAGRRDGR VSLFDDPTQH LPSFLADAEE LEKNFRRKGL SLDEMVTLSG AHSVGRSHCS SFTNRLYSSN STEILQDPSL ETGLGNKLRQ 
MCPRQNSVDP TAPLDCHTPN RLDNQYYVNL MKGRGVLTSD QTLADSPLTA RIVRNNANNG GGWAKKFAAA MVKMGSIEVL TGEEGEIRKS CRVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene or sequence errors. Not predicted from NCBI but found using braker (Iponil2_g36084.t1). Frame shift in the exon 1 and extra intron in last exon.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAGTG AAGGAGATTA TAAAGTGACA AGAAGGTTAA TGTTGATGGT GCTTCTAGTT ACAATATCTA CGCTAGCAAA TGTTTCAACG GCTGCCTTAC AAGTAGGGTT CTACCACTCG  AGTTGTCCTC AGGGAGAGGC CATTGTGAGA AAGGTGGTGA AGAAAGCAGT GCGGCGAGAT CCCTCCCTCG TGCTGGCCTC CTGCGCTTGC ATTTTCACGA TTGTTTTGTT AGGGTATGCT  AATATTTTTC ATAATATATA GGCCCTGTTT GGTAAAATGA CTAGTTGTTA GCTGATTGTG TTAATTAGAA AGTATAAATA GTTGATAACA TTAGCTGATT GTAGAAAAGT GTTTGGTAAA  TTAGCTGTTA GCTGTTATCT GTTTGGTATA ATTTCTTTTC TCAAAAAGCT AATTGAAAAA GTTGCTTGGG GTAGCTTTTT CAATTTTAGC CTTTTGGAGT TGCAAAAAGC TAATTAACCA  AACATTTATA TTGATTTTTT AACTAAATCA AACAATTAAT AGTGGTCAAA TAAGCCAAAA TTGGCCTATA GGCCAATTTT TTACCAAACA GGGCCATAAT TTTTTTTTTT TTCAATTTTT  TAATATGATA CTAAGGTTGC CCTTTATTTT TGTTGAATTA TATTGGGGGT GTTTGGTAAA TAGTTGTTTA GTAGTTTGAC TTGTCTGGTA AAGTCTTTGA ATGCTACTGA CTCGTATCTG  CTCGATCTCA TGACCTCTCA TATGGGAGAG GTCACTACAT GTCATCTGAG TACAAGGTGC TTGGCGCTAT TAGCTGTTTA CATACAAAAT GATTTTTTCA AAAAGTTGAT CAAATAAGTT  ACTTTTGAAC AATTTTTTGA ATTTTTACAT TTTAGAGCAA TAAGTTGTTA CAAAAAAAAA CTAATTAATC AAACTGATTG TTTAACCAAT TCAAATAGAC ACTAATAGTG GTTAAATAAA  CCAAAATTGA CCATTTTACC AAACAGGCCA AAGGCGAAAT ATTGATTATT TTTGTTGAAT TGAATTTTGA AATGGTAAAG GGGTGTGACG CTTCAATCCT TGTGGACTCA ACACTAAACA  GCAAAGCAGA AAAGGATCAT CCGGCCAACA ACCCTAGCCT TCGCGGCTTC GACGTGATCG ACAAAGCCAA ATACTGGGTG GAATCGCAAT GCCCGCAGAC CGTTTCCTGC GCCGACATCG  TGGCGTTTGC GGCCAGAGAC AGCGCGGCGG TGCTGGGAGG GATCAATTAC GACGTGCCTG CCGGGCGGCG CGACGGCCGG GTCTCCCTCT TCGATGACCC GACCCAACAC CTGCCGTCTT  TCCTCGCCGA TGCGGAGGAG CTGGAGAAGA ACTTCCGGCG CAAAGGGCTT TCGCTGGACG AGATGGTGAC GCTCTCCGGC GCGCACTCCG TCGGGAGGTC GCATTGTTCC TCGTTTACCA  ATAGATTGTA TTCTTCCAAT TCCACTGAAA TTCTCCAGGA TCCGTCCTTG GAGACCGGAT TGGGCAACAA GCTAAGACAA ATGTGTCCCA GGCAGAACAG TGTTGATCCT ACAGCTCCGC  TTGATTGTCA TACTCCAAAC AGGTTAGCAT AAACCTCCCT ATATACTTTT CATTCTTCTT CGGAAAAAGG ATCAAATAGG CCTTCAAACT ATCTTAAAAG TCAATTAGGT TCCTAAACTT  TTTAAAAGTG CAATTACACC TATCAATAAT TCATTTAGGT GCAATGAAGC CCAAAACAAG TTAATGACCT GCTATCACAA GTCATTAGGG TTCAGGCTGA CGAATTTTCC AACAAAAAAA  TGTGACCAGC AACGGACCCA GATTTATGGA AAATTTCGCC GGTCACTTCT TTTTTCGAAA ATTTCGCCGG TCACTTTTTT TTTTTTTTCG AAAAATTCGC CGGAAGGTGG CCTGAACCCT  AATGACCTGT ATCACAGGTT ATTAATTTGT TTTTTGGGCT TCATTGCACT TAAATGAATT GTTGATGGGT GTAATTGCAC CTTTAAAAAG TTTAGAGGTC TAATTGACTT TTAAGCTAAA  GTTCGAGGGC CTATTTGACC ATTTTCCCTT CTTCTTTCTT AAAAATGAAA AATGATATTT ATGGATTATT GATCTGTGTA ACTGTCAAGA TGAAAAAATG ATAAAAATGT CAAGATGGCC  GAGTTGGTCT AAGGGACAAG ACATTTTTTC CATTCTTCAG AGGCAATTTA GGGAACCAGT AGGCCAGTAT ATATCAAGTT GGCCCAATGG CTATTCCTCT ATTCCTCTAC TGACGAAGTT  CTTTAATTTA TTGATGAAAA ACAGGTTGGA TAATCAGTAC TACGTTAATT TGATGAAAGG TCGTGGAGTG CTAACCTCGG ATCAGACGCT GGCAGACAGT CCTTTGACGG CTAGGATTGT  GCGGAATAAT GCAAACAACG GTGGTGGATG GGCTAAAAAG TTTGCCGCTG CAATGGTGAA GATGGGCTCT ATTGAGGTCT TGACTGGGGA GGAAGGAGAA ATTAGGAAGA GTTGTAGGGT 
CGTTAAT 

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