Entry information : NtPrx88-1B(Nitab4.5_0007875g0020)
Entry ID 17678
Creation 2022-07-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-07-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx88-1B(Nitab4.5_0007875g0020)
Name NtPrx88-1B(Nitab4.5_0007875g0020)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx88-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx88-1A 694 0 1..344 1..344
StPrx300 580 0 1..344 1..344
LePrx58 575 0 1..344 1..344
CroPrx20 436 2.51e-154 9..344 8..346
Literature and cross-references NtPrx88-1B(Nitab4.5_0007875g0020)
Protein sequence: NtPrx88-1B(Nitab4.5_0007875g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344 (316)
PWM (Da):   %s   38496.39 (35376.7)  
PI (pH):   %s   9.09 (8.98) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-344
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKYLGFLVI LRPLMILALS LNSGYVNAAT FLPPEDKPLE RHYYKKLNTC ANVEPFVRHQ VKLFWDKDKT VTAKLLKLLY ADCMLNGCDA SNLLVGPNTE RNSSKNAGMG GGAYELIDRI  KKVLEIRCPR AVSCTDILSL ATRDAVHFAG GPSYPVFLGR RDGFESNAAW IDYPSPSMSW EEGLAYFESK NLDVQDFVTL LGAHSMGQAH CRFFYDRLYN FKGTGKPDPT MKRSTLVTLR 
SQCPKNSKTD SAVYFSPGYG SNYTFSNTFY GKVVAHESVL RVDQQLSYGA DTNELVNEFA HSLEQFRKAF TLSINRMGGL KVLTGKNGEI RRDCKFTNKN NPNL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Unicorrect prediction from SGN (splicing error introns 1 and 3)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ATTTAGGGTT TTTGGTGATT CTTCGTCCAT TGATGATTCT TGCACTGAGC TTGAATTCAG GTTACGTGAA TGCTGCCACG TTTTTGCCAC CAGAGGATAA GCCACTGGAG  AGGCATTACT ATAAGAAGCT GAATACATGT GCAAATGTGG AGCCATTTGT GAGACACCAA GTGAAGCTGT TTTGGGACAA AGATAAAACT GTCACTGCCA AATTGCTCAA GCTGCTCTAT  GCTGATTGCA TGCTCAATGT ACGCCTCTCT CTCTCTCTTC ACTCGATTTT TAGTATTACT CTATCCGTTT CAATTTAGAT GAGGTAGGTT GACTCGATAT GAAGTTTAAG AAGAAAAAAA  AGACTTTTGA AACTTGTGGT CTTAAAAGCG GGTAAAAGCT TTGTGGGATC ATGACACTTG TGTGAGTATA AAAGCTTCTA AAATAGATAA AATAAAAATT TAAAAATGTG TCAGTATTTT  TGGAACAGAC TAATAAGGAA AATGTGTCAT CTAAATTGAA GTAATAACCA GATCTTGTGA TTTTTATAGA CCGACTATTT TATTGACGAT CAGAAATTAT AACGATCGAA TTCATGCCTT  TCTTTACAAA GTAGTTGCTA AAAGTTTAAT TGCTTTTCTT TCTTTCTTCT TCTAATCTTC TTTAACTTAA TTAGTATATT CATTCCCCAT GTCTTCTCGT CTTTGCTATA CCAAGAATTT  TACTTTTTTC AATCGTTACC ACTTAAAACA TGGTGCAACC GCCAGAAAAT TCAATATTAC CTAATAACTA TAATTTCTAT TAACTTTATC CTGAGATTTT AACAAACCGA CTCATGCTTT  TGCTAGTGGC TTTTGCTAAA AATATCAATC TTATAATTCA AATAAGGGCA GTAGTATTAA TCTCCATTGA TTTTGGTGCG AAGAATATGA GTAAATAATA TTATGTACGT ACTCCCGGAA  TATTTATATT ACTAATATCT TATCTTATCC AGCCCTTCCC TTAGGAAAGA CGCTTGGGTA GCGTAGTAAA GGCAGATAGA TACCTTTTAC CATAAGCAAC TAACTTTAAT GCATGCCGTT  AATATAGAGG ACATATTTGA CTATGATGCA AAATCTAAGC CTATAAAAAT GGCGTGTCTC CTCTTTAATA AAAGAAAATG TATAAGAAAA AAAGGTGGAG GATTAGAAAA TAAAGAATTT  GCTTACTTAA CTTTTGTTTT GGCAACACAA TGGTTGTAAC TTGTAACTAC TGATAGTGTT TTAAAATTTC TCTGCATTAA GTTTGACCAA GCTACATCTT TTAATAAACT AGTAGTATGA  TTTACAGCTC CGCCTATAAC TCCAGGATTG TGGGTTCGAG TCACCAAAGG AGCAATAACT CAAACAAAGG GGATCAAAGG GGATGGGAAT AAAAAAAAAG TAGTAGTATA TATGATTTAA  GTTATTTGCA GTGATATTGT AAATATGATC TTTTTATGGT CGGGTGTAAT TTAACTAACA ATAATTGATT ATTAAAATTT TTTATCAGGT TACTAATTTT TTTTAAAATG TGTTTCTTTA  TTATTGTCCA GGGTTGCGAT GCATCAAATC TGCTAGTGGG ACCAAACACA GAGAGAAATT CATCAAAAAA TGCAGGGATG GGAGGGGGAG CATATGAATT GATAGACAGA ATAAAAAAAG  TTCTTGAAAT TCGATGTCCC AGAGCCGTTT CTTGTACTGA TATCCTCAGT CTTGCTACCA GGGATGCTGT TCACTTTGTA ACTTCTCTCT CTTTCCTTCA GATTATTTTA ATCGACATTT  CTTAAATACT TGTTTATATG AATGGATTTA ATTAAGTTTG ATAATATAGA GAATTTATAC TATCGATTTA ACTTGCACAT CAGTACACAT AATTTAAACT TTATACAAAA TACTTGCAAT  ACATCTATTG TTTTGATATG GTGAAAATCA TTTTTTTATT AGGATTAATC ATGTGCGCGA TACATTAACT AATTAAAAAC CCCCTAATCC ATTTTTTTTT TTTTAAATTG CCTAATTGAA  AACCGTTTTT GGCTTTAATT GTGGCATATT ATAGGCAGGT GGGCCATCTT ATCCAGTGTT TTTGGGAAGA AGGGATGGAT TTGAGTCAAA TGCTGCATGG ATAGATTACC CTTCACCTTC  CATGTCTTGG GAGGAAGGCC TTGCTTACTT TGAATCCAAA AACCTTGATG TTCAGGACTT TGTCACTCTT TTAGGTATGA GTTTATCATC TTCTTTACTT ATTTTAACAG TATGTTACAA  TAGCCTTTTG ACACAACTTA ATTATGATCC TAATTAGTGT TTAGGTAGAT CACTTAAAAC TTACTTTATA ATACGCTATT AGTTGGTAAT GTGGTAAAAA CGGTAACTGA CCAGATTGGT  CTTTGCACTG TTAGTGTATA TTGTGAGGTA TTTGTCCTAA TTTTTTTATC ATATTTGATT TTGTTATTTT TTGAAGGACA ACATATTTAC CATACGAAAA GGAAAAATAT AATTCTTCCA  TATTTGGCTA TTTTATTTCT TGTAGGAAAA TATTTGGACT TCTATAAATT AAGGATCATT CCTTTTCATT TAGTAGCATC CACAATGTAG CCATATGAGG TTTGAGAGTC TTATTTAGGA  GGGAGAAGCT TTCGAGACAA GTGTTAGTGT ATTACTTGTG TTTGCCTCTT CGTGAGCTTG TTCTCTCAAT ATTTTTGTAC TCTTTTTTAC ATAGTGGATT GCTCATCTCC ACCGTGGATG  TAGCGCAATC GACTGAACCA CGTTAAATGT TTGTGTCTCT TTTGGTATAT TTCTCTTTTA TTGTCTAATT TATCGTTGTT CAAGGTTTGA TTGGCTAACT TCCGCATGAC ACCTGCTTTT  TCGGTCCTAC CATGTACAAC TTATTTTCTT CTAAAAACCA TATTCATTTA TCTTTCAGGA GCACATTCAA TGGGGCAAGC ACATTGCCGA TTCTTCTATG ACCGCCTTTA CAATTTCAAG  GGTACTGGAA AACCAGACCC CACCATGAAG AGATCTACCT TAGTAACCCT ACGATCACAG TGCCCAAAAA ATAGCAAAAC CGATTCAGCT GTCTATTTCT CACCAGGATA TGGTTCTAAC  TACACATTCT CCAATACATT CTATGGAAAA GTTGTAGCTC ACGAATCTGT TCTTAGAGTT GATCAGCAAC TATCATATGG AGCTGACACA AATGAACTAG TCAATGAATT TGCACACAGT  TTAGAGCAAT TCAGAAAGGC ATTTACATTG TCAATCAACA GGATGGGAGG TCTCAAAGTG TTGACCGGTA AAAATGGCGA AATTCGCAGA GATTGCAAGT TTACAAATAA GAACAATCCC 
AATCTC 

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