Entry information : NtPrx53-1B(Nitab4.5_0000900g0090)
Entry ID 17681
Creation 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx53-1B(Nitab4.5_0000900g0090)
Name NtPrx53-1B(Nitab4.5_0000900g0090)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx53-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx53-1A 658 0 1..327 1..327
StPrx13 581 0 10..327 5..325
LePrx102 581 0 10..327 8..328
IaquPrx62 525 0 4..327 2..329
Literature and cross-references NtPrx53-1B(Nitab4.5_0000900g0090)
EST ref. GenBank:   FS409931.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx53-1B(Nitab4.5_0000900g0090)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   36014.37  
PI (pH):   %s   8.69
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATSQFANCC FLISLFFFAF ASNHANGKEL KVGFYHKKCP HLELIVKEVI DDVISRVPSL AAPLLRMHFH DCFVRGCDGS VLLNSPTKQA EKDAIPNLSL RGYQIIDKVK TAVEKSCPGM  VSCADIVALV ARDVTVAVKG PFWEVETGRR DGRVSNITEA LFNLIPPFAN ITSLKQGFLQ KGLSVKDLVV LSGSHTIGMS HCSSFNNRLY NFTGKGDADP SLDPNYIKRL KMKCSPTDQN 
SIVEMDPGSV RTFDTSYYNI VAKRRGLFTS DSALLDDKET KGYLKEQALN HGSTFFKDFG ESMVKMGRIQ VLTGTQGEIR NVCTKIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAACTT CACAATTTGC AAATTGTTGT TTCTTGATTT CATTATTCTT CTTTGCATTT GCTTCAAACC ATGCAAATGG GAAAGAACTC AAAGTAGGTT TTTACCACAA AAAATGTCCT  CATCTCGAGT TGATAGTGAA GGAGGTTATT GATGATGTTA TTTCCAGAGT CCCCAGTCTT GCTGCTCCTT TGTTGAGAAT GCACTTTCAC GATTGTTTCG TTAGGGTATG CATGCAGAAA  ATGAATTCTC TAATTTTTAC GCTATTTAAT TTAGTGTAGA ACAACGGTAA AGTCTCTGTA TGATCTGTAT GTCATAAGTT CGAGCGGTAG AATCAGCTAT TGATACTTGC GTCAGGGTAG  ACTGCTTATA TCGTACCCTT GGGAGGCGGC CTTCCCCGAC CATATGTGAA TACATGATAC TTCATGCACC GAATTCCTCT CTCCCCCTAA GTGTATGCCA TTGGCATTAT ATATTATCTA  ACATGATTTA ATATATTCTT TATTTTATTT GACAGGGTTG TGATGGCTCA GTTCTGTTGA ATTCTCCAAC TAAACAAGCT GAGAAGGATG CAATCCCAAA TTTAAGCCTT AGAGGATATC  AAATTATTGA TAAAGTGAAG ACTGCAGTAG AAAAATCTTG CCCTGGGATG GTTTCCTGCG CCGATATTGT TGCCCTAGTT GCTAGAGATG TCACAGTTGC GGTAAATACT ATTTACATCT  TACATTTTAC CAACTTATTT TCAATTAACA TATATTTTTA CACACATATA TACATAAATT ATATGGATGT ATGCAAATAT AGACTCGTGT GCATGCACAT AGGTGCAGTG GCGGATCCGG  AGTGTAACTT ACGAGTTCAC GGGAATTCAG TAGGTTTTGT CTAAATCACG TATATATGTA TAGAGAATCT ACTAAACATT TAAATATAAT ATTTGACGGT GAAGTTCGTG AACTCACTGA  TTATGTATAT TAACAAATCC TAGATCCATC CTTGAATAGA TGCAATGTGG TATAACAATA TTTGACATAG GATAAACTAC TCTTATTTCT GCAATAGTAC GTACTCATTA TCATTCCATA  CTAGTCTCTT ACATATTACT CCATCTTATT ACTGTTCTTT TTGTATTTGT ATATCTCAGG TCAAGGGACC ATTCTGGGAA GTTGAAACTG GGAGAAGAGA TGGAAGGGTC TCAAATATAA  CTGAAGCCTT ATTTAATTTA ATTCCTCCTT TTGCAAATAT AACATCATTG AAACAAGGAT TCTTGCAAAA GGGATTAAGT GTCAAGGACC TAGTAGTATT ATCAGGTACC TGATTAATTC  TACTAGTTTT TCAACCATGT CGTGAAATAT ATGGCTTAAT TAATTGACAA AACACTTTTT TATTTACTTA ATTATAGTAC ACATTTCGAA GGGGAGCCTC AGAGCAACAA CAAAGTTGTC  TCCATGACCT ATAGGTCACG TGTTTGAGTT GTGGAAGTAG CCATTAATGC TTGCATTAGG GTAGGCTGTC TACATTATAC CCATTGGGAT ATGACGGTTC GATGGAGCCT TGAAGCAATA  GTAAAGTTGT TTCCGTATGA CCTATCTTTC ACGGGTTCGA GTTGTGGAAG CAGCCACTAA TGCATGCATT AGGGTAGACT GTCTACATTA CACCCGTGGG ATGGGCCTTC CATGGACCAT  GCGCGAATGC GGGATGCCTT GTGCATGGGC TGCCCTTTTT TATTACATAC ACATTTCAAT GCTATGACAT GCATGCAAGC AAGCTAATAT TCTTTTTTTT TTTTGGTTGT TGAAAAAACA  ACTTATATAT AGGTTCTCAC ACAATTGGAA TGTCTCATTG CTCATCATTC AACAACCGTC TTTACAACTT CACTGGGAAA GGAGATGCAG ATCCTTCTTT GGATCCAAAC TATATAAAAA  GATTGAAAAT GAAATGTTCT CCAACTGACC AAAACTCCAT TGTTGAGATG GATCCAGGAA GTGTTAGAAC ATTTGATACA TCTTATTATA ATATTGTAGC AAAAAGAAGA GGACTTTTTA  CGTCCGATTC TGCTTTACTT GATGATAAAG AAACTAAGGG CTATCTCAAA GAACAAGCAC TTAACCATGG TTCAACTTTT TTCAAGGATT TTGGTGAATC TATGGTTAAA ATGGGAAGGA 
TTCAAGTACT CACTGGTACT CAAGGTGAAA TTAGAAATGT GTGTACAAAG ATCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAACTT CACAATTTGC AAATTGTTGT TTCTTGATTT CATTATTCTT CTTTGCATTT GCTTCAAACC ATGCAAATGG GAAAGAACTC AAAGTAGGTT TTTACCACAA AAAATGTCCT  CATCTCGAGT TGATAGTGAA GGAGGTTATT GATGATGTTA TTTCCAGAGT CCCCAGTCTT GCTGCTCCTT TGTTGAGAAT GCACTTTCAC GATTGTTTCG TTAGGGGTTG TGATGGCTCA  GTTCTGTTGA ATTCTCCAAC TAAACAAGCT GAGAAGGATG CAATCCCAAA TTTAAGCCTT AGAGGATATC AAATTATTGA TAAAGTGAAG ACTGCAGTAG AAAAATCTTG CCCTGGGATG  GTTTCCTGCG CCGATATTGT TGCCCTAGTT GCTAGAGATG TCACAGTTGC GGTCAAGGGA CCATTCTGGG AAGTTGAAAC TGGGAGAAGA GATGGAAGGG TCTCAAATAT AACTGAAGCC  TTATTTAATT TAATTCCTCC TTTTGCAAAT ATAACATCAT TGAAACAAGG ATTCTTGCAA AAGGGATTAA GTGTCAAGGA CCTAGTAGTA TTATCAGGTT CTCACACAAT TGGAATGTCT  CATTGCTCAT CATTCAACAA CCGTCTTTAC AACTTCACTG GGAAAGGAGA TGCAGATCCT TCTTTGGATC CAAACTATAT AAAAAGATTG AAAATGAAAT GTTCTCCAAC TGACCAAAAC  TCCATTGTTG AGATGGATCC AGGAAGTGTT AGAACATTTG ATACATCTTA TTATAATATT GTAGCAAAAA GAAGAGGACT TTTTACGTCC GATTCTGCTT TACTTGATGA TAAAGAAACT  AAGGGCTATC TCAAAGAACA AGCACTTAAC CATGGTTCAA CTTTTTTCAA GGATTTTGGT GAATCTATGG TTAAAATGGG AAGGATTCAA GTACTCACTG GTACTCAAGG TGAAATTAGA 
AATGTGTGTA CAAAGATCAA CTAA 

Retrieve as FASTA