Entry information : NtPrx83-1B (Nitab4.5_0000129g0390)
Entry ID 17684
Creation 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: NtPrx83-1B (Nitab4.5_0000129g0390)
Name (synonym) NtPrx83-1B (Nitab4.5_0000129g0390)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx282]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx83-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx83-1A 594 0 6..322 17..333
NtPrx76-1A 464 2e-166 6..322 7..322
NsPrx01 463 9e-166 13..322 12..322
NtPrx76-1B 460 1e-164 12..322 8..319
Literature and cross-references NtPrx83-1B (Nitab4.5_0000129g0390)
Protein sequence: NtPrx83-1B (Nitab4.5_0000129g0390)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322
PWM (Da):   %s   35051.06  
PI (pH):   %s   9.92
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSFKSSFAAM VYAAICILLL LSFNLCEAQL TTSFYAKTCP KALSTIQKVV SRAVSRERRM AASLIRLHFH DCFVQGCDAS ILLDEASNIT SEKTAIPNQG SVRGFDVVET AKRELEKICP  GVVSCADILT VAARDASIAV CGPSWKVKLG RRDSTMANRT LANIDIPRPF DNLDTLISRF AKKGLSAKEM VALSGAHTIG QSQCSSFRNR IYNASDIDAS FASIRRRQCP RNGGNGTLAP 
LDLVTDKKFD NNYFKNLMQK KGLLQSDQVL FSGGLTDSIV SKYSKTNSAF LADFAKAMVK MADIQPLTGR NGIIRRVCNN VN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCTTCA AAAGCTCTTT TGCAGCTATG GTGTACGCCG CAATTTGTAT TCTGCTATTG CTTTCATTCA ATCTATGTGA AGCTCAGTTA ACTACATCAT TTTATGCAAA AACATGTCCT  AAGGCGCTTA GCACGATTCA GAAGGTTGTG AGTCGAGCAG TATCGCGTGA ACGTCGCATG GCAGCTTCAC TCATTCGCCT TCATTTCCAC GATTGCTTTG TCCAAGTAAC ATATATATAT  ATATATATAT TAATCCAGTA TTTTTTTGTT ATGTATTAGA AGCGGATTCA GAATTTTAAA TTGTGGTCGA TATTTAGTAT CGTTACATCT CTACTTATTT ATTTTGACAA TAGGTTTGAC  TTAATTAAAA AAAATTATCA ACTATACATA TATAGAGAGA GCTCAAACCA ATAACGGACA TGAAAAATGT AGAACCACCC TAGCTTGTTC GTTATAGCAT TTAGTGTTCA TTTGGGAGCA  TACAACAACA ACAATAATGT ATACCTAGTA TAATTCTACA TAGTGGGGCC TAAGAGGGTA CTGTGTATGT AGACCTTACC CCTACATACA ATAGACCCTC GGCCATTATT TCGAATAGAC  CCCGGCTCAA GAAAGAATAA GCTCTAATAT TGTTTCTTTT AATTTTTTTC ATTCTATTTT AGGGTTGTGA TGCATCAATC TTACTTGACG AGGCTTCAAA TATCACAAGT GAGAAGACAG  CTATACCTAA TCAAGGATCT GTAAGAGGTT TTGATGTTGT TGAGACCGCA AAGAGGGAGC TCGAAAAAAT ATGCCCTGGT GTAGTATCTT GTGCGGACAT TTTGACCGTT GCAGCACGAG  ATGCTTCTAT CGCTGTAAGT ATACTAAAAT TTCAGCAAAT ATTAGATCTG AACTCATATT TTTAAAAAGT AAACACATTA AATATTTAAA TCTTGAATTC GTCTCTCTGA CCGAGTACAT  GACATAATGA CCTACAGGTT TGCGGGCCAT CATGGAAGGT TAAACTTGGA AGAAGAGACT CCACGATGGC AAATCGTACT CTAGCAAACA TTGATATTCC TAGGCCCTTT GATAATCTTG  ACACTCTTAT TTCTAGATTT GCTAAGAAAG GACTTAGCGC AAAGGAAATG GTTGCCTTGT CAGGTACGTA TGTAAAAAAT TCTACAGCTT ATTTAAGTTG AATTTAACTT CTATGCAGTA  CGGTGTATAT ATACAATCGG ATCATTTATA TGGTAATTAC AAATATATTA ATTGATAAGC TAATAAAAAT GGTTAATAGA TTAAATTGCA TTACTGATAA TATAATGTAA GAAATCTTAT  ATTGTCATCA TAATCTACCA AACTCATGTT TTTCTCCTTA GATCATGTAT AGTAAGTTAG TAACGTGATA TCTTTTCAAA ACATGTTATA TGTGTGTGCG CATGCACGAT CGCGCCAGCG  CACCTAAGTT CAAAGAGTCC TATGATGCAA TAATTAATGA TTCTTGGGTG CATCTTTACA AGTGAAATCG GGTTTCAAAT TTCATGTTGA TCTTGTTGTT TTTCATTGAG CTTGAGGTGT  ATAGGATTCA TGATAAGAAT CTAAAGATTA AACCAGCCAA ATGTATATTC TAGATCCACT TCTTAGTGTA CGGTGCACTC ATCTTCTTAA AATCGTGGAT ACGCCTCTGC CGGTAATGTT  GGAATATATA TATATATATC CATCTATGAC ATATTTCATT TTCCAAACAA CGTTCTCATT ACTTGCTATA AATCAAACTC AATTATTTGC AGGGGCACAC ACCATTGGCC AATCACAATG  CTCTTCATTT CGGAACAGAA TATACAATGC ATCAGATATA GATGCAAGTT TTGCTAGCAT TAGAAGACGT CAATGTCCAA GAAATGGAGG GAATGGAACT TTAGCACCAC TTGATTTGGT  CACAGACAAA AAATTTGACA ACAATTATTT CAAGAACCTA ATGCAGAAGA AAGGCCTACT TCAATCTGAT CAAGTTCTTT TCAGTGGAGG ATTAACAGAT AGTATTGTTT CAAAATATAG 
CAAAACTAAT AGTGCGTTTT TAGCGGACTT TGCTAAAGCT ATGGTTAAAA TGGCAGATAT TCAACCTCTA ACTGGTCGAA ACGGGATCAT AAGGAGGGTC TGTAACAATG TCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCTTCA AAAGCTCTTT TGCAGCTATG GTGTACGCCG CAATTTGTAT TCTGCTATTG CTTTCATTCA ATCTATGTGA AGCTCAGTTA ACTACATCAT TTTATGCAAA AACATGTCCT  AAGGCGCTTA GCACGATTCA GAAGGTTGTG AGTCGAGCAG TATCGCGTGA ACGTCGCATG GCAGCTTCAC TCATTCGCCT TCATTTCCAC GATTGCTTTG TCCAAGGTTG TGATGCATCA  ATCTTACTTG ACGAGGCTTC AAATATCACA AGTGAGAAGA CAGCTATACC TAATCAAGGA TCTGTAAGAG GTTTTGATGT TGTTGAGACC GCAAAGAGGG AGCTCGAAAA AATATGCCCT  GGTGTAGTAT CTTGTGCGGA CATTTTGACC GTTGCAGCAC GAGATGCTTC TATCGCTGTT TGCGGGCCAT CATGGAAGGT TAAACTTGGA AGAAGAGACT CCACGATGGC AAATCGTACT  CTAGCAAACA TTGATATTCC TAGGCCCTTT GATAATCTTG ACACTCTTAT TTCTAGATTT GCTAAGAAAG GACTTAGCGC AAAGGAAATG GTTGCCTTGT CAGGGGCACA CACCATTGGC  CAATCACAAT GCTCTTCATT TCGGAACAGA ATATACAATG CATCAGATAT AGATGCAAGT TTTGCTAGCA TTAGAAGACG TCAATGTCCA AGAAATGGAG GGAATGGAAC TTTAGCACCA  CTTGATTTGG TCACAGACAA AAAATTTGAC AACAATTATT TCAAGAACCT AATGCAGAAG AAAGGCCTAC TTCAATCTGA TCAAGTTCTT TTCAGTGGAG GATTAACAGA TAGTATTGTT  TCAAAATATA GCAAAACTAA TAGTGCGTTT TTAGCGGACT TTGCTAAAGC TATGGTTAAA ATGGCAGATA TTCAACCTCT AACTGGTCGA AACGGGATCA TAAGGAGGGT CTGTAACAAT 
GTCAACTAA 

Retrieve as FASTA