Entry information : NtPrx89-1B(Nitab4.5_0115852)
Entry ID 17688
Creation 2022-08-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-08-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx89-1B(Nitab4.5_0115852)
Name NtPrx89-1B(Nitab4.5_0115852)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx012]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx89-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx89-1A 618 0 1..317 1..319
NtPrx52-1A 603 0 1..317 1..318
NtPrx52-1B 599 0 1..316 1..317
NtPrx16-1B 599 0 1..317 1..318
Literature and cross-references NtPrx89-1B(Nitab4.5_0115852)
Protein sequence: NtPrx89-1B(Nitab4.5_0115852)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (296)
PWM (Da):   %s   34604.24 (32195.0)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-317
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSRSFLFLH VLIMFCLAVM AFSELSDDFY EDVCPEALPT INRVVKAAIQ KERRMGASLL RLHFHDCFVN GCDASILLDQ TATIDSEKTA RANNNSARGF EVIDKIKSEV DKACGRPVVS  CADILAVAAR DSVVAVHGPT WEVKLGRRDS TTASRTMANN DIPSPFMDLP ALINNFKNQG LDEEDLVALS GGHTLGFAQC FTFRDRIYSE TNIDSTFASQ RQANCPRSGG DSNLASLDPT 
PALFDSKYFS NLVSKKGILH SDQALFSGGQ TDDLVKTYST NLGTFSKDFA ESMIKMGNIK PLTGNQGQIR VNCRKVN 

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Remarks Complete sequence from genomic. No prediction from SGN. Found in a short scaffold and 3'end is missing. Completed with DNA fro TN90
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAC GTAGCTTCCT CTTCCTTCAT GTGTTGATCA TGTTTTGTTT AGCAGTCATG GCATTTTCAG AATTATCAGA TGATTTCTAC GAGGATGTTT GTCCTGAAGC TTTACCAACA  ATTAATCGGG TTGTTAAGGC TGCAATCCAG AAAGAGAGAC GAATGGGCGC TTCTCTGCTA CGTCTGCATT TTCATGATTG TTTCGTTAAT GTGAGCTTAC ATTATTTTTC TTGCACTTCC  TATTTTTTAT TTGTGAAAGC ATCTGAGTAT TTGACCTAAA ATATTGAAGT TAGGAATGAA TTCATTGAGA TGTCGTTACT AATGCATGTT TTGTTAATGA AGGGTTGTGA TGCTTCGATT  CTTCTTGATC AAACGGCTAC TATTGATAGT GAAAAGACTG CTAGAGCTAA TAACAATTCT GCTAGAGGAT TTGAGGTGAT TGATAAAATC AAATCCGAGG TTGATAAAGC TTGTGGACGT  CCGGTTGTAT CTTGTGCGGA CATCTTGGCA GTTGCAGCTC GTGATTCTGT AGTTGCTGTG CGTATTACTC CCCTTCTATC CTAACATAAG CTACAAATAT GGTTTTCACT TGTTAATATT  TTTCCTAACC ATAGTTAATG TTTAAATTAA AGTCCATCAT ACTCCAGATT AATTAGTAAA CTAGTGAACT ATTATTCAAA AACTGATCGA CTTACAAGCC CAAGTTGAGA TAGATTAAGT  AGATATTTTT AGCTGAATAC GAAATAAAGA ATTAGTATCA AGCCTCATAG TGCGTTTGAG AGTCAACGCA AAATTTGTAG ATATCCTCCA CCTATATATT AACACATGAA CCCGATAACT  TTTTGAAAAC CCTATATACG CGTATTATGA AATTCACTAA ATATTTATAA ATATTATACC GGCAAACTCA GTTACTAGTA TATATTAACT TGAGGTCGAT TTAGGAACTC ATAAACTTCA  AATAATGAAT CTGGTTATAC CTAATTGTGT ATACTGCAAA TGTTATGAAC CTTCAGTATA TAATTAAACT GAAACATTTT TACATGAACA GCTACATGGA CCAACATGGG AAGTGAAATT  GGGAAGAAGA GACTCCACTA CAGCAAGTAG AACCATGGCC AACAACGACA TCCCATCTCC ATTCATGGAC TTACCTGCAC TTATCAACAA CTTCAAGAAT CAAGGCTTGG ATGAGGAAGA  CCTCGTCGCG CTCTCGGGTG GCCACACATT AGGGTTTGCT CAGTGTTTCA CCTTTAGAGA CCGCATATAC AGTGAGACTA ACATTGATTC CACCTTTGCA AGCCAACGAC AAGCCAATTG  TCCACGTAGT GGAGGTGATT CTAACCTTGC TTCCCTTGAT CCAACACCTG CTCTTTTCGA CTCGAAATAT TTTAGTAACT TGGTGTCCAA GAAAGGGATT TTACATTCTG ATCAAGCATT  GTTTAGTGGA GGCCAGACTG ATGATCTTGT TAAGACATAT AGTACCAACC TTGGGACTTT CTCTAAAGAT TTCGCTGAGT CTATGATTAA GATGGGAAAT ATCAAGCCAT TGACTGGGAA 
CCAAGGCCAA ATTCGTGTCA ACTGCAGGAA GGTGAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAC GTAGCTTCCT CTTCCTTCAT GTGTTGATCA TGTTTTGTTT AGCAGTCATG GCATTTTCAG AATTATCAGA TGATTTCTAC GAGGATGTTT GTCCTGAAGC TTTACCAACA  ATTAATCGGG TTGTTAAGGC TGCAATCCAG AAAGAGAGAC GAATGGGCGC TTCTCTGCTA CGTCTGCATT TTCATGATTG TTTCGTTAAT GGTTGTGATG CTTCGATTCT TCTTGATCAA  ACGGCTACTA TTGATAGTGA AAAGACTGCT AGAGCTAATA ACAATTCTGC TAGAGGATTT GAGGTGATTG ATAAAATCAA ATCCGAGGTT GATAAAGCTT GTGGACGTCC GGTTGTATCT  TGTGCGGACA TCTTGGCAGT TGCAGCTCGT GATTCTGTAG TTGCTCTACA TGGACCAACA TGGGAAGTGA AATTGGGAAG AAGAGACTCC ACTACAGCAA GTAGAACCAT GGCCAACAAC  GACATCCCAT CTCCATTCAT GGACTTACCT GCACTTATCA ACAACTTCAA GAATCAAGGC TTGGATGAGG AAGACCTCGT CGCGCTCTCG GGTGGCCACA CATTAGGGTT TGCTCAGTGT  TTCACCTTTA GAGACCGCAT ATACAGTGAG ACTAACATTG ATTCCACCTT TGCAAGCCAA CGACAAGCCA ATTGTCCACG TAGTGGAGGT GATTCTAACC TTGCTTCCCT TGATCCAACA  CCTGCTCTTT TCGACTCGAA ATATTTTAGT AACTTGGTGT CCAAGAAAGG GATTTTACAT TCTGATCAAG CATTGTTTAG TGGAGGCCAG ACTGATGATC TTGTTAAGAC ATATAGTACC 
AACCTTGGGA CTTTCTCTAA AGATTTCGCT GAGTCTATGA TTAAGATGGG AAATATCAAG CCATTGACTG GGAACCAAGG CCAAATTCGT GTCAACTGCA GGAAGGTGAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTTACAATA GTTCGACATT TTTCTTACCT ATAAATGTAG CCACATTTTA CTCTCATCAT CACACAAAAT CAGAAACATC ACAAAGAAAG TGCAGAACTT CATAGACTAT CAATAATGGT  TTCACGTAGC TTCCTCTTCC TTCATGTGTT GATCATGTTT TGTTTAGCAG TCATGGCATT TTCAGAATTA TCAGATGATT TCTACGAGGA TGTTTGTCCT GAAGCTTTAC CAACAATTAA  TCGGGTTGTT AAGGCTGCAA TCCAGAAAGA GAGACGAATG GGCGCTTCTC TGCTACGTCT GCATTTTCAT GATTGTTTCG TTAATGGTTG TGATGCTTCG ATTCTTCTTG ATCAAACGGC  TACTATTGAT AGTGAAAAGA CTGCTAGAGC TAATAACAAT TCTGCTAGAG GATTTGAGGT GATTGATAAA ATCAAATCCG AGGTTGATAA AGCTTGTGGA CGTCCGGTTG TATCTTGTGC  GGACATCTTG GCAGTTGCAG CTCGTGATTC TGTAGTTGCT CTACATGGAC CAACATGGGA AGTGAAATTG GGAAGAAGAG ACTCCACTAC AGCAAGTAGA ACCATGGCCA ACAACGACAT  CCCATCTCCA TTCATGGACT TACCTGCACT TATCAACAAC TTCAAGAATC AAGGCTTGGA TGAGGAAGAC CTCGTCGCGC TCTCGGGTGG CCACACATTA GGGTTTGCTC AGTGTTTCAC  CTTTAGAGAC CGCATATACA GTGAGACTAA CATTGATTCC ACCTTTGCAA GCCAACGACA AGCCAATTGT CCACGTAGTG GAGGTGATTC TAACCTTGCT TCCCTTGATC CAACACCTGC  TCTTTTCGAC TCGAAATATT TTAGTAACTT GGTGTCCAAG AAAGGGATTT TACATTCTGA TCAAGCATTG TTTAGTGGAG GCCAGACTGA TGATCTTGTT AAGACATATA GTACCAACCT  TGGGACTTTC TCTAAAGATT TCGCTGAGTC TATGATTAAG ATGGGAAATA TCAAGCCATT GACTGGGAAC CAAGGCCAAA TTCGTGTCAA CTGCAGGAAG GTGAACTAAA TATTGCTAAT  GATGCTGATA AAATCAAGAT TCATGCGTGT GTTAAGAATT TGGTTAATTA TTTTCAATTG TAATTGTGAT TTTTGTTCAT TTAATTTGGA ATCTTTTTTT TTTTTTAGCA AATATTGTCT 
TGAACGTTAA GTAGAAACCT TGATACCGTG TTGATGTCGA AACTTAAAGA TGGTGTGCAC TGGGGCACTT GTATGATGTA ACAATAACTT TGTTCCCAAG GCACTGCGCA A 

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