Entry information : NtPrx90-1A (Nitab4.5_0006212g0020)
Entry ID 17707
Creation 2022-08-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: NtPrx90-1A (Nitab4.5_0006212g0020)
Name (synonym) NtPrx90-1A (Nitab4.5_0006212g0020)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx031]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx90-1A
start..stop
S start..stop
LePrx49 573 0 1..334 1..343
NtPrx90-1B 509 0 1..280 1..279
IaquPrx04 509 0 5..338 4..339
InPrx02 494 1e-177 5..337 4..337
Literature and cross-references NtPrx90-1A (Nitab4.5_0006212g0020)
Protein sequence: NtPrx90-1A (Nitab4.5_0006212g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338
PWM (Da):   %s   36309.7  
PI (pH):   %s   4.52
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFYLASFC IMVLSFSITS ASGNSVRNKT CIDDATIVLS FGLYQNSCPE AEAIIYSWVE RAVSQDPRMA ASLLRLHFHD CFVNGCDASL LLDDTPNFTG EKTAAPNLNS LRGFEVIDSI  KADLELACPQ TVSCADILAI AARDSVVMSG GWGWQVQMGR KDSLTASRKA ANNNIPGPNS NVATLVSNFQ NIGLSLQDMV TLSGAHTIGR ARCSTFSSRL NGGSNSDMNL DFLQSLQQLC 
SVSDTNTTLA NLDDMTPSTF DNQYYVNLLS GKGLLVSDQV LATGDGNTRE IVQTYVDVPS AFFEDFKNSM LKMGSLAPPT GTTGEIRVNC RIVNQFNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect predcitio, from SGN (splicing error introns 1 and 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TCTACTTAGC TTCTTTCTGC ATAATGGTAC TGAGTTTTTC AATAACATCT GCTAGTGGAA ATAGTGTTCG CAACAAAACA TGCATTGATG ATGCAACCAT CGTATTAAGT  TTTGGTTTGT ACCAAAACAG CTGCCCAGAA GCTGAAGCTA TCATATATTC ATGGGTGGAA AGAGCAGTGT CTCAAGACCC CAGAATGGCT GCTTCTTTGC TTCGTCTTCA TTTCCACGAC  TGCTTCGTTA ATGCAAGTCC ACTTTTTCTT TTTCCTTTTT ATTTGAATAG TATATTTTAT GTTAAATAAT ATTCCATATG TAAAAGCATT TCAGGGATGT GATGCATCAT TACTGCTGGA  CGATACCCCT AATTTTACTG GAGAGAAAAC AGCTGCCCCA AACTTGAACT CATTGAGGGG TTTTGAAGTG ATTGATTCCA TCAAAGCTGA TTTAGAATTG GCTTGTCCCC AGACTGTATC  TTGTGCTGAT ATTCTTGCTA TTGCTGCTAG AGATTCTGTT GTTATGGTAT TATATTATTC CATTTACTAC TAACAAATAA GAAGGGGAGC CTTGGCGGTA ACTGATAAAG TTGCCGTCAT  GTGACCAGAA GGTCACAGGT TTAAGCCGTG GAAACAGCCT CGATCGGTCT TGCGGAAATG CAGGGTAAGG CTGCATACAA TAGACCTTTG TGGTCCGGCC CTTTTCCGGA TATTACGCAT  AGCGGAAGCT TATTACACCG GACTGCCCTT TTACTACTAA CAAATAAGTA ATTCAGAACT TTTCCAATAA TGCATGCAAC TCCAATATAA TTATTGCAGT CAGGTGGTTG GGGGTGGCAA  GTGCAAATGG GGAGAAAGGA TAGCTTAACA GCTAGCAGAA AAGCAGCAAA TAACAACATT CCTGGACCAA ACTCTAATGT TGCCACCCTT GTTTCCAACT TTCAAAACAT TGGTCTTTCT  CTTCAAGATA TGGTCACTCT CTCTGGTAAA CTTAATTTGA AGGGCTATAT GATATTATAT TAATTTAACT TATCGCGGTC TAAAAATAAA TGTAAGACTA ATTAATGTTT ATTATATTGA  AGGTGCACAT ACAATTGGAA GGGCTAGATG TTCAACATTT AGTTCCAGGC TAAATGGGGG TAGCAATTCA GACATGAACT TGGATTTCTT GCAGTCACTG CAGCAACTGT GCTCAGTTTC  TGATACAAAC ACAACACTAG CAAATCTTGA TGACATGACA CCATCAACGT TCGACAATCA GTACTACGTT AACCTTCTCT CAGGAAAAGG GTTGCTTGTT TCAGACCAGG TCTTAGCAAC  TGGGGATGGC AATACTAGAG AAATAGTGCA AACTTATGTG GATGTTCCAT CTGCTTTTTT TGAGGATTTC AAAAACTCCA TGCTCAAAAT GGGAAGCTTG GCACCACCAA CTGGAACAAC 
TGGTGAAATC CGTGTTAACT GTAGGATTGT TAATCAATTT AATTCTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TCTACTTAGC TTCTTTCTGC ATAATGGTAC TGAGTTTTTC AATAACATCT GCTAGTGGAA ATAGTGTTCG CAACAAAACA TGCATTGATG ATGCAACCAT CGTATTAAGT  TTTGGTTTGT ACCAAAACAG CTGCCCAGAA GCTGAAGCTA TCATATATTC ATGGGTGGAA AGAGCAGTGT CTCAAGACCC CAGAATGGCT GCTTCTTTGC TTCGTCTTCA TTTCCACGAC  TGCTTCGTTA ATGGATGTGA TGCATCATTA CTGCTGGACG ATACCCCTAA TTTTACTGGA GAGAAAACAG CTGCCCCAAA CTTGAACTCA TTGAGGGGTT TTGAAGTGAT TGATTCCATC  AAAGCTGATT TAGAATTGGC TTGTCCCCAG ACTGTATCTT GTGCTGATAT TCTTGCTATT GCTGCTAGAG ATTCTGTTGT TATGTCAGGT GGTTGGGGGT GGCAAGTGCA AATGGGGAGA  AAGGATAGCT TAACAGCTAG CAGAAAAGCA GCAAATAACA ACATTCCTGG ACCAAACTCT AATGTTGCCA CCCTTGTTTC CAACTTTCAA AACATTGGTC TTTCTCTTCA AGATATGGTC  ACTCTCTCTG GTGCACATAC AATTGGAAGG GCTAGATGTT CAACATTTAG TTCCAGGCTA AATGGGGGTA GCAATTCAGA CATGAACTTG GATTTCTTGC AGTCACTGCA GCAACTGTGC  TCAGTTTCTG ATACAAACAC AACACTAGCA AATCTTGATG ACATGACACC ATCAACGTTC GACAATCAGT ACTACGTTAA CCTTCTCTCA GGAAAAGGGT TGCTTGTTTC AGACCAGGTC  TTAGCAACTG GGGATGGCAA TACTAGAGAA ATAGTGCAAA CTTATGTGGA TGTTCCATCT GCTTTTTTTG AGGATTTCAA AAACTCCATG CTCAAAATGG GAAGCTTGGC ACCACCAACT 
GGAACAACTG GTGAAATCCG TGTTAACTGT AGGATTGTTA ATCAATTTAA TTCTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTAGGAATA CAATGGCTTC CTTCTACTTA GCTTCTTTCT GCATAATGGT ACTGAGTTTT TCAATAACAT CTGCTAGTGG AAATAGTGTT CGCAACAAAA CATGCATTGA TGATGCAACC  ATCGTATTAA GTTTTGGTTT GTACCAAAAC AGCTGCCCAG AAGCTGAAGC TATCATATAT TCATGGGTGG AAAGAGCAGT GTCTCAAGAC CCCAGAATGG CTGCTTCTTT GCTTCGTCTT  CATTTCCACG ACTGCTTCGT TAATGGATGT GATGCATCAT TACTGCTGGA CGATACCCCT AATTTTACTG GAGAGAAAAC AGCTGCCCCA AACTTGAACT CATTGAGGGG TTTTGAAGTG  ATTGATTCCA TCAAAGCTGA TTTAGAATTG GCTTGTCCCC AGACTGTATC TTGTGCTGAT ATTCTTGCTA TTGCTGCTAG AGATTCTGTT GTTATGTCAG GTGGTTGGGG GTGGCAAGTG  CAAATGGGGA GAAAGGATAG CTTAACAGCT AGCAGAAAAG CAGCAAATAA CAACATTCCT GGACCAAACT CTAATGTTGC CACCCTTGTT TCCAACTTTC AAAACATTGG TCTTTCTCTT  CAAGATATGG TCACTCTCTC TGGTGCACAT ACAATTGGAA GGGCTAGATG TTCAACATTT AGTTCCAGGC TAAATGGGGG TAGCAATTCA GACATGAACT TGGATTTCTT GCAGTCACTG  CAGCAACTGT GCTCAGTTTC TGATACAAAC ACAACACTAG CAAATCTTGA TGACATGACA CCATCAACGT TCGACAATCA GTACTACGTT AACCTTCTCT CAGGAAAAGG GTTGCTTGTT  TCAGACCAGG TCTTAGCAAC TGGGGATGGC AATACTAGAG AAATAGTGCA AACTTATGTG GATGTTCCAT CTGCTTTTTT TGAGGATTTC AAAAACTCCA TGCTCAAAAT GGGAAGCTTG 
GCACCACCAA CTGGAACAAC TGGTGAAATC CGTGTTAACT GTAGGATTGT TAATCAATTT AATTCTTAAG ACTCCATGAA AATCAT 

Retrieve as FASTA