Entry information : NtPrx96-1A(Nitab4.5_0001315g0150)
Entry ID 17722
Creation 2022-08-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-08-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx96-1A(Nitab4.5_0001315g0150)
Name NtPrx96-1A(Nitab4.5_0001315g0150)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx96-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx96-1B 630 0 1..329 1..329
CclPrx58 401 2e-141 3..329 4..322
GbPrx53 361 2e-125 1..329 1..331
PtaPrx97 355 5e-123 14..329 7..327
Literature and cross-references NtPrx96-1A(Nitab4.5_0001315g0150)
Protein sequence: NtPrx96-1A(Nitab4.5_0001315g0150)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (304)
PWM (Da):   %s   36397.62 (33706.2)  
PI (pH):   %s   7.61 (7.36) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-329
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTGLKGILVL VFFCTFCCLF SVIVGDSKEE KSPRLELNFY RNSCPNAEQV VKDEVSRSML IDPSSAAALL RLAFHDCQVD GCDGSVMLSY SNGSLTETES DMNFGVRKLD LIDGIKRSLE  RICRQTVSCA DIIQLAARDG VHLAGGPYIE ILTGRRDSKL SRKERADKQL PAADISVDKF IKLFQQKNIT LQEGVALIGA HTLGIGHCRN FEKRLQPPGD PTLSTSFKLT LLVICSDPFL 
SNVTFATNDA TTFAFDNRYF TDILNGRGLL KIDSEISSDQ RTKPYVLGFA SDQQQFFNSF TSGFLKLSNH KVLLGKEGEI RKDCRFVNN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect prediction from SGN (splicinf error introns 1 and 3).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAGGTT TAAAAGGAAT TTTAGTGCTT GTTTTTTTCT GCACGTTCTG TTGTTTATTT TCAGTTATTG TAGGAGATTC TAAAGAAGAA AAAAGTCCAA GACTTGAGCT TAATTTCTAT  AGGAACAGTT GTCCAAATGC AGAACAAGTT GTGAAAGATG AAGTGAGTAG GTCTATGCTA ATTGATCCTT CTTCAGCTGC AGCCCTCCTA AGACTCGCTT TCCACGACTG CCAAGTAGAT  GTACAATTCT CTCTTTCCTC TTTTAGCAAT TAGCAACGGT CAAGTTGTAT TTATGCATGC GACCTATTGG TTACGGGTTC GAGTCGTGGA ATCGGCCACT GATGCTTGCA TCAGGATAGT  ACATCACACC CCTTGGGTTG CGACCTTTAC CCGGATTCTG AGTGAATGTG GGAGTTTTGT GCACCGGGCT GTCCTTTTAT CATCATATTC CGTGCTATTT ATATCGGGGG AATCACATCT  CAAGAGTCTG AAATCATGCG CGTCTGAGTT CTGCCCTAGC AACATATTTC AGTTATATAG AAATATTAAT AGCTCTCTAA TACTTGCTTG ATCTTCCATT AGTTGTTTTA ACCCGGTATT  TAATTTCCTT TTTTTTTTTT TTTTnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnTTTCC TTTTTTTTTT TTTTTTGCAG GGTTGTGATG GTTCAGTAAT  GCTAAGTTAT TCAAATGGTT CATTGACTGA AACAGAGTCA GACATGAACT TTGGAGTACG CAAACTTGAC TTAATCGATG GAATAAAGAG ATCTTTGGAG AGAATTTGCC GTCAAACTGT  TTCTTGTGCT GATATCATTC AGTTAGCAGC TCGTGATGGT GTACATCTGG TACCTATTAG GAGTACTGTT TTTCTTGTTT CTTTACTCTT ATGATCTATA ACTATGGTTT ATTTTTTGAA  AAAATAGGGC ATCTCATAAT AATTGTCATG CAATATTGAC CAACAGATAC ATAGAGACAG GAATTCTAAA AGGGATTTAA AAAGATGCAA AAAAACTATA CCTAGGATTT GACCTTTTGA  CGGAGGAGAT TCAATTGAAC CCTTTTGCGT TCACGTCTGG GGCGGAACTA GAAAATAGGT TACGGGTTCG GCCGAACCCA GTAGCTTTAA TCCAAACCAA CCTGATATAT GTCTTAACAA  ATCTATTGAA TATCTATAAA TTATTAATTT AGAGTCCAGT AACTTAAATG GACTACAATT CTGAACCCAT AAATTTTAAA TTCTGGCTCC GACTCTGGTT CACGTAGCTC CTCCCTAGAT  TGAATCCAAA AGGACCGTCA AAATATGAGG TCAAAAACAA TGTAATGTAA CCCGAAATGG CTCAATTGTG TTTTTGTGTT ATTTCAAGGA ATGTTTTGTG TTTTCAGGCA GGAGGACCCT  ATATAGAGAT TTTGACCGGA CGAAGAGATA GTAAATTGTC AAGGAAGGAG AGAGCTGACA AACAGCTTCC AGCTGCAGAC ATTTCTGTTG ATAAATTCAT TAAACTTTTC CAGCAGAAGA  ATATCACTCT CCAAGAAGGA GTAGCCCTTA TTGGTACAAA CTACCACCTT TCTTTCAACA TTATATGACA CTCGTTCCAT TTTAGTCTTG ACTCATTTCT ATATTTATTT GGCATAAAAT  TGCCGTAGTA CATTTAAGAC TATAAGTTCT ACAGTACTTT TGGTATGTTG CAAAAGTCGT AATTATTTCT AAAACTCTAT GTCCAATCAA ATACTGTCAT ATTATAGACC GAAATTTTGA  CAGATTGAGC AATTTTGATG CAGGTGCACA CACTCTAGGC ATCGGCCATT GCCGGAACTT TGAGAAGAGG TTGCAGCCTC CAGGGGATCC TACATTGTCA ACATCATTCA AACTCACTTT  ACTGGTGATT TGCAGCGATC CTTTTTTATC TAATGTCACT TTTGCAACCA ATGATGCTAC TACTTTTGCA TTTGATAATC GTTACTTCAC TGATATCCTT AATGGAAGAG GACTACTCAA  GATTGATTCT GAGATTTCCA GTGATCAAAG AACAAAGCCT TATGTCCTTG GATTTGCAAG CGATCAGCAG CAGTTTTTTA ACAGTTTTAC ATCAGGATTC TTAAAACTCT CGAACCATAA 
AGTTTTGCTT GGTAAAGAGG GAGAAATTCG CAAGGACTGT AGGTTTGTGA ATAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAGGTT TAAAAGGAAT TTTAGTGCTT GTTTTTTTCT GCACGTTCTG TTGTTTATTT TCAGTTATTG TAGGAGATTC TAAAGAAGAA AAAAGTCCAA GACTTGAGCT TAATTTCTAT  AGGAACAGTT GTCCAAATGC AGAACAAGTT GTGAAAGATG AAGTGAGTAG GTCTATGCTA ATTGATCCTT CTTCAGCTGC AGCCCTCCTA AGACTCGCTT TCCACGACTG CCAAGTAGAT  GGTTGTGATG GTTCAGTAAT GCTAAGTTAT TCAAATGGTT CATTGACTGA AACAGAGTCA GACATGAACT TTGGAGTACG CAAACTTGAC TTAATCGATG GAATAAAGAG ATCTTTGGAG  AGAATTTGCC GTCAAACTGT TTCTTGTGCT GATATCATTC AGTTAGCAGC TCGTGATGGT GTACATCTGG CAGGAGGACC CTATATAGAG ATTTTGACCG GACGAAGAGA TAGTAAATTG  TCAAGGAAGG AGAGAGCTGA CAAACAGCTT CCAGCTGCAG ACATTTCTGT TGATAAATTC ATTAAACTTT TCCAGCAGAA GAATATCACT CTCCAAGAAG GAGTAGCCCT TATTGGTGCA  CACACTCTAG GCATCGGCCA TTGCCGGAAC TTTGAGAAGA GGTTGCAGCC TCCAGGGGAT CCTACATTGT CAACATCATT CAAACTCACT TTACTGGTGA TTTGCAGCGA TCCTTTTTTA  TCTAATGTCA CTTTTGCAAC CAATGATGCT ACTACTTTTG CATTTGATAA TCGTTACTTC ACTGATATCC TTAATGGAAG AGGACTACTC AAGATTGATT CTGAGATTTC CAGTGATCAA  AGAACAAAGC CTTATGTCCT TGGATTTGCA AGCGATCAGC AGCAGTTTTT TAACAGTTTT ACATCAGGAT TCTTAAAACT CTCGAACCAT AAAGTTTTGC TTGGTAAAGA GGGAGAAATT 
CGCAAGGACT GTAGGTTTGT GAATAACTGA 

Retrieve as FASTA