Entry information : NtPrx[P]67-1A (Nitab4.5_0014393g0010)
Entry ID 17724
Creation 2022-09-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-09-01 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: NtPrx[P]67-1A (Nitab4.5_0014393g0010)
Name (synonym) NtPrx[P]67-1A (Nitab4.5_0014393g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx[P]67-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx67-1A 721 0 1..365 1..365
NtPrx95-1B 613 0 1..365 1..359
NtPrx[P]67-1B 612 0 23..365 1..343
NtPrx70-1B 570 0 1..364 1..363
Literature and cross-references NtPrx[P]67-1A (Nitab4.5_0014393g0010)
Protein sequence: NtPrx[P]67-1A (Nitab4.5_0014393g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   364
PWM (Da):   %s   39424.45  
PI (pH):   %s   4.75
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVNKNWALMA VFSFLVASVV TTMAAQTESA PGNASQFRTP LRYDYYEEKC GNVENFARRM MLRIVQLQHN APAQLLRLLF HDCFIRGCDA SVLLADSNNE NGTVERDAIP NRTLKGFDFI  DMI*DEIDEA CPGVVSCSDI LVLATRDGIV LAGGLYYPVL TGRRDSKESF FDEAMAEIPR PNGNISETLR LFSLRGFDER ETVALLGGHN IGKIGCEFIR PRLSNFMGTG LPDPTIPSDF  LEELIQKCPD DNSTINNMFN EHTARGLSES AISYSQRLSA LSSVGTSFDx xxxxxLTRGR GLLFADQQLM ANEKTAAVVM DYALDEGAIF RTEFAHAMDK LSNIGVLTGF QGEVRHSCSH 
LNSDQ 

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Remarks Pseudogene from genomic. stop in frame (exon 2) and frame shift in last exon. Found in TN90 and BX
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAAACA AGAACTGGGC TTTAATGGCG GTTTTCTCAT TCTTGGTTGC CAGCGTTGTG ACAACAATGG CAGCGCAAAC AGAATCTGCC CCTGGTAATG CTTCTCAATT TCGTACGCCC  CTTCGATATG ATTATTATGA GGAGAAATGT GGGAATGTTG AGAACTTTGC GAGGAGAATG ATGCTGAGAA TTGTTCAGCT GCAACACAAC GCCCCAGCAC AACTCTTACG CCTTCTCTTC  CATGATTGTT TCATTCGGGT ACGTCTACTC TCCATTTTCT GAATCCTTTG ATTAAGTATA TTCAATTTCT TATTTTGTCA TTTTTTACTG TTTTACTGAT TCTTGATATG TGCATCGTTC  ATGAGTTCTT TTTACTGGGT TTTGTGGAAC TGTAAATTAT TAAAAGAGAC TAACGTCTTA TGCTGTGTAC TCTATTGTTG CATTAATGTT GTTTCACTTT TAATATTTGG AAGCAACTCC  AATTCGTATT ATCAAGAAAA TGACGATAAT TGATCTATTT TGTGTCGTTC CTTCTGTTAT TTGATGCTGC TCTTAGTTTT TTTAGGTTCT ACAATCTCAA GTGCATGTGA CCTCGATACA  CAAAATATTT ATAGTATTTT CACGGTTTGT CACTATTATT CCTCTGTTAC ACGTTCCATG CGTGTATCGA TTGTGAATTC ATTTTCTGTA TTTCTCTTAT AGATTTGTAG ACATTTCTTT  TATAATTGGG TCAGTTCCTG TTATCCTCCC AATTTTTAGA AGTGTGTCAA ATTATTTGCT CTATGCAGAC TTTTTGTACT GGTCTTGTCC ATGTAGATAT ATATTGACAA TACTTGGTGG  ATTTTGTATT TCTTATTTGC ATTGGTTCCT GATGCGCGCA CGTGCAAATG TATTTCTTTG ATGTACTTGT GGATGCTTCT CTCTTAATAA TTAGCCGCGT ATCTTGATTC GTGCATTGTG  CACATGTTAT TCTTCATATG TTGTCATGTG TCTTTGTGCC TTGTGTTCGT CGTTTGATTT AGATGGAGGT TTTACCTGAT CTTGGATCAG TTGCTTTCTC AGTTTTATGT TTATTGAGTT  CCGAATATTT TTTAATGTAT ATTTACCTGT AGTTATATCC CTCTATGTAT GTATCCTTTG GGTAATAAAA AGAGGGCGGG ATGGTATTAC TTCTGAAATA GAGGTGAGCT TTTAGAGTCC  TAAGGGAGTC GAGAAATGAT ATTTAGCAAA GGAGCTCACA CTGATTATGA AAACAATTCC AGACAATGAA TTTTTTTCTT TTCTTTTTGG ATAAGGCAGA GTTTCCAGAC AGTGAAGTTT  CTGTTTCATT GATTTCAGGA TTGTGATGCA TCTGTTCTGC TAGCTGACAG TAATAACGAG AATGGGACTG TTGAACGTGA CGCCATCCCA AATAGGACAT TGAAAGGCTT TGATTTCATT  GATATGATAT AAGATGAGAT TGATGAGGCA TGCCCTGGGG TTGTTTCTTG TTCTGATATC CTTGTCCTTG CAACAAGAGA TGGCATCGTT CTGGTATGAA TTTCTCCATA TCCTTTGTTT  CTTATAATCC AGCACCTTAA GTTTTTTGCT GATTTCTTCA TTCTTACTCT TAGTACTTAA TTTCTATTTT ACATGGATCT GTTCTGTGTT CCTGTTCAAG GAGCAATTGG AGAATAGAAT  TTGGCGTGAA ATGGATGTAA CTCATGCACT AGCATGCAAT CCATCTTTCT TGAAATAGTT TAGTTAAACG ATCCTAGTGT ATATTCAGAT ATTTAATACA TAACAAAACA TTTTACACCT  TCTAGTGGTA TCATTTACAT GTCAACAGGG CATTGTTCAG AAAATATGGG AATATTCTTA AACAGTGCAT TAGGGTATCT TCTATAGCTT TGCGGACTAA ATTGGCATTT CAACTCCAAG  TATTATATCT TTGAAGTAGT TTAGTTGAAT GATCTTGTAG TGCATATTCA GATATTTAGT ACATAATAGA ACATTTTACA CCTCTTAGAG GTATCATATA TATGTTAACA GGGTACAATT  CTGAAAATAT GGTACAATAT TTATAAACAG TGCATTTTGA TATCTTCTAG TTTTGCGAAC AAATTGGCAC TTTATCGTCA AGTATTATAT CTTTAAGCTT TAGTATAAAA AAGTATTATA  TCTTTAAGCT TTCCCTTTCA CATGCTACTT TTGTACATTT TAGGCTGGTG GTCTATATTA TCCTGTGCTT ACGGGCAGAA GGGACAGTAA GGAGTCATTC TTTGATGAGG CAATGGCTGA  AATTCCACGA CCAAATGGGA ATATCACTGA AACTCTTAGG CTGTTTTCGC TCAGAGGATT TGATGAGAGG GAAACAGTGG CACTACTTGG TAATCTTCTA ATCCTATACT TTAATTTTCA  TATGTTGGAG TCTGCATCCT TTTTTGGAAC ACATGTACAT CTTTTGAAAT TTCTCTTCTG TTTATTTTCT TCATCATCTG AAGGAGGACA TAACATCGGG AAGATTGGTT GTGAATTCAT  TCGGCCAAGG CTCAGTAATT TCATGGGGAC AGGTTTACCT GATCCAACGA TTCCTTCTGA TTTTCTTGAA GAGTTGATAC AGAAGTGTCC AGACGATAAC AGCACCATCA ACAATATGTT  CAACGAACAT ACAGCGAGGG GTCTGAGTGA GTCTGCTATA TCATACTCCC AGAGACTGTC AGCGCTTTCC TCGGTTGGAA CTTCATTTGA CAAGAGGACG AGGGCTGCTG TTTGCTGATC  AACAGTTGAT GGCTAATGAA AAGACGGCAG CGGTGGTGAT GGATTATGCT TTGGATGAGG GGGCTATATT TAGGACTGAG TTTGCTCATG CCATGGATAA ACTGTCAAAT ATTGGCGTTC 
TTACTGGATT CCAAGGAGAA GTTCGGCACA GTTGCTCCCA TCTCAATTCT GATCAATGA 

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