Entry information : LePrx112
Entry ID 17754
Creation 2023-01-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-01-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx112
Name LePrx112
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx107]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx112
start..stop
S start..stop
LePrx111 686 0 1..332 1..332
LePrx86 684 0 1..332 1..332
StPrx31 641 0 1..332 1..335
NtPrx57-1B 579 0 1..332 1..336
Literature and cross-references LePrx112
Protein sequence: LePrx112
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (308)
PWM (Da):   %s   36136.29 (33612.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.61 (8.69) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDSKGINLAL FVCLILSFSS SILAYRTPYW PSIKVGYYRY TCPYAEHIVQ HVVNRAVSRN PGIAAGLIRL HFHDCFVRGC DASVLLDGPN SEKEGIPNKN SLRGFEVIDA AKAALEAACP  GVVSCADILA FAARDSSYKV GRIYYDVQAG RRDGRVSIDS ETLTNLPSPF VNATELIKSF ASKGMSVDEM VTLSGAHSIG IAHCGVFASR LYPQNNQQSL PIDPEYANFL KSICPPEALT 
NGTGAANPAN LDPLTPNRLD NRYYLALKSQ KGLMISDQTL MANPTTARLV NYNARFGSIW SRKFAAAMIH MGTIDVLTGR NGEIRRNCHF VN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Not predicted from Phytozome. Upstream of two other peroxidases Solyc11g007210 and Solyc11g007220.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCACGTATAT TACTAATGTC TATAAAATCA TGTCGGAAAG GGCAGACCGT GAATATTGCA ATTAAATTGT TCTCTAGTAG ATGCATCATT TTCTTTTTTG AAACAGACTA AATAGAAATT  TAGAGGTTTA ATTTATCGAT TTTAGGTGCT AGTCCTTTAG AGTTCCTCGA TGTCTATCTT AATACAAACA CAAAATTTAG ATAAAATTAT TATTTAGTTC AGTTGAATTC ATTCAGTAAC  ACATTGACCT ATGAATGTTG CATAAATTGA AACAGAAAGA ATACTAATTT GACTCGAAAC TTCTGTATGA ACATATTGTA GGTGTTGAAT CATTTGACAT CGATATAAAG GAGCAAAAAG  TGACAGTAAT AGGAAATGTG GAACCGGAAG CTGTTTTCCA AACGGTTTCA AAGACCGGAA AGAAGACATC ATATTGGGAA GAACCAGCAC CAGCATCAGC ACCAGAACCA GAAACAAAGC  CCGTGGAAGA AAAGCCCGTA GAAGAAAAGC CCACAGAAAC ACCAGCTGAG CCCGAACCAA AGCCCACAGA AGAAAAGCCT GCAGAAACTG TTGCTTAATT AATGGGCTGA AATTATAGCA  TATGATTGTG ATTTATTATT CAAGTTTTCT TGTAATGACA AACGCCAAAA TGTGAACTTA GCTGAAATAA TTGTCTTGTT TGGTTTTCTT GTAATGTTTT TGCTATCAAA TCATGTATCT  TGTATTAATA TGTTTATGGA TGTTTTGGAT CAACAAAAAT ATTAAAATTC GAAAGTAATC GAAAATATGG ATAATATCTT GATAAATATA GGTATTTGAA CATGAATTTG ATTACATGCT  GATATTTGGG TAAATAAGAT AGTTTATTAT GACATAAATA TATATTATTA TATGTGATGG TCTATTAGTG ATTTACCGAT CACTTTTATT CTCAAACCTG ATAGCTTGGT TGATTTTGCA  TATAAATTTT GGGGGTTCCT CATGAGCGTT GCCTATATAG CATCAAATTC CCTTATTATT TGAGAGTATT GACTTCTCAC GTTACAAATG TTACACCCCG ATAGCTAGTA AAGCAAACCA  CCGGAACTTA AAGTCTCGAT TGTAGACTAA AAAAAAAAAA GGGAAGAATC AAAGAGAACT TCTACTTATT TGCACTACTT GTCTTGTTAT CAATAGCGTA GCCACATATA GCTTAGGGTA  GCGAGTCAGA CATCTTTTAT AATGAGTATA TATATATATA GGTTAATAAT TATTTTTCAT ACATATATAT TGAATTTCGG ACATTTTTAT CGAAAATTCT GATTTCACAA CTCCGTAGAT  AAAGCCACTA AATTTCAATA TACAAGTACT AACAAGATGA AAGAGGAAAG TTCAAACATG TATTTATAAA TTAAGAAAGC TAACATAATG AGTTGACATA TAACAAATAG GCCATGCACA  AAGATATTGG CAACCAACTA ATGAAATAAA CAAGCTAATT CAATCTCCAA GTGGGATTTA TTTTATCTTT TAACAAAGTA GTAAGATGAG TCTCAATGAG AAGCTTTCAT AACTACACAA  ATATTAAAGG ATATATAAGA CGATAAATTT TAGTTTTATA GCCACACAGA TGCTATGACG TGTTTAATAT CATGACAAGG TTAAAAGATA TTCATTTCTT TTTTTTGAAC TCTGTATAAA  TTCAAACTAT GTCACGTAAA ATTTTAATTA TAGCACAAGT GATTCTCAAG GAAATAGAAT AGTTCACCAA TCACATCACT AGTAAAAATT AAGAAAAAAA AAGTGTGTCA ACCTATTCAT  GGATGCCATA ATGTAGTAGT TGTTGAGTTC TTCAAAGGTC AGATAAGCTG AAGAATACAT CAACTATACA CTTTGGTATT ATACAAACAA TCATGTTTTT GTTCCTTCAA GAATTTCTCA 
AACTATAAAT ACTTCAATAT GTTCCTTAAG TTATATCCAT CAAAATCATA GTGTCTTTTG AGTCTCAAAA AAATTAAAAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATATCTATC ATTTGCCTTT CGAAAAAAAT TTCAGTATTC TTTCAACTTT TCCATCCTAT TCAAGCTATA AGGATGGCTC AATGCGTGTC CAATTGTTTT TTTTTTTCAT CACATTGTTT  GTCCAATTGA ATTGTATTTG ATTTTCCCTG CCAATGTTTG CCTAATTAAT GATTGAAATA TATATTTTTT TTAATAATTT TATAAATGAT TCATGAAGTT CATATGTGTT AAAAGCAGAA  CAGATAGAGT TTATATAATT GGCTTCAACT ACAAACATAA GATGACTAGT ATAATGGTAG CTACTCTTGT AAATCATGTA TTGAAACCGG GGCGTCTAAC CTGGTTCAAC AACTTAGAGG  TTTTCTTATT GCCATACTTC TTAAAACAGT TAAAAGTATT GATGGTTTGT GTTGATCCAC CAAGTGTCAA GGAACAGAAG ATGTTTACGT GGAAAACCTT CTTGCTCAAA GAAGGAAAAA  ATCATGACCT ATCGTAGTAT TTACAACCTT AATTGGTCAA GTCCCTTTAG TAGATTTGTC GATCATCAAA ATCATCATTA CTGCATTACA ACAAGTATGT TTGTATCAAA AGATCAACCG  AAAGGCTACA AGCTTCCATT AAAATAGATT CTTAGGCAGA ATACAATGAT ATTATCTCAA ATTTATCAAA AAAGTTTCAT TTAAATACCC TAAACTTAGA TTTTATACCT ATATATTGGA  ATTTTTAACC AAACTAAGTC ATTATATAAA ACAATTTACC AAAGTAATAC ATTTTTCTAA AATTTTACAA AACTAGTATA AACGTATTTC ATGGTAACGT TTTAGGGTAT ATTTTATTTT  TAAAAAATTA ACAGCATTAG GTTGATATTC GTCACTGTAA GTAACGTTTT ACTCCTAAAA CGTTACTACT ATGAGTAACG TTTTAGGAGT AAAACGTTAC TTACAGTAAC GCATATCAAT  CTGACGCCAT CATCTTTTAA AAAGTAAAAT ATATCCTAAA ACGTTACTGT GGAATACGTT TATACTAGTT TTGTAAAATT TTAGAAAAAC ATATTATTTT GGTGAATGAC TTTATATAAT  GGCTTAGTTT GGTTAAAACC TCTATATATT GAACATTTAT ATTAGAGTAA AATTATGCTA ATTGAATACA TATTATTAAC TTATCGCATG GTGTAATACA ACAATTTGGA GTTTGTTTTA  CCTATTTTTT TTAGCTTTTC TTCATCTTCA GTCAAATCTG AATATGCATC AAACCATTCC ATAATATGGA TCTTTTATTG TTTGAGATTG AACTTGTCTC ATTGTTATAC AAATCTGAAT  AGCAATGTAT GGTATGTTTT TTCATATTCG CATAGTTTAA GGATATTTTT GATCATTTTC CGTTTATAAA TTCAAAAAAA TCTTTCAATC AATTGGACAA ACAATGGGAG AAATGAAATA  CAATTCAATT GAACAAAAAA TGTGAAGAAA AAAGCAAAAA CAATTCGACT CGCATTAAAC CATCCTTGCA GCTTGAATTG GATGGAGAAG TTGAAATAAT ACCGAAAAAT TTCTCAAAAG  GCAAATGATA GATATGTTAG TTGACGAAAT GACAGTTCCT TCTGATCTCT CCGTTTCGAC CTGTCAGGAC ATCTATAGTA CCCATGTGAA TCATTGCAGC TGCAAACTTC CTTGACCAAA  TGGAACCAAA TCTAGCATTG TAGTTCACCA ATCTAGCTGT TGTCGGGTTT GCCATCAACG TCTGATCTGA AATCATAAGT CCCTTTTGAC TCTTTAAAGC CAAGTAATAT CTGTTATCCA  ACCTGTTTGG TGTCAGGGGA TCAAGGTTCG CGGGATTAGC AGCTCCCGTC CCATTTGTAA GTGCTTCTGG TGGACAAATG GACTTCAAGA AGTTCACGTA TTCAGGATCA ATTGGAAGAC 
TTTGTTGATT GTTTTGAGGA TACAAACGGC TAGCAAATAC ACCGCAATGT GCAATGCCAA TGGAATGCGC GCCAGAGAGA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCCA AAGGCATCAA TCTTGCACTT TTTGTTTGCC TCATTTTGTC ATTTTCATCG TCTATACTTG CTTATCGAAC ACCATATTGG CCATCGATTA AAGTAGGTTA CTATCGATAT  ACTTGCCCCT ATGCAGAACA CATTGTTCAA CATGTCGTAA ACAGAGCTGT CTCTCGTAAT CCAGGCATTG CTGCTGGACT TATCAGGTTA CATTTCCACG ATTGCTTTGT CAGGGTACGT  ATGAATATAA TACTTGCATT TTTCTTTTAT AAATTTGAAG ATTACGTTAT GTTCTTATAA CGGTTTAACC TGTCCTGTAC TTTAATCAGG GGTGTGATGC ATCCGTGTTA TTGGATGGAC  CAAATTCCGA GAAGGAAGGT ATTCCAAACA AGAACAGTTT ACGAGGTTTT GAGGTGATTG ATGCTGCAAA AGCTGCACTT GAGGCTGCAT GTCCTGGAGT TGTTTCGTGT GCAGACATAC  TTGCATTTGC TGCTCGGGAC AGTTCTTACA AAGTTGGGAG AATATACTAT GATGTCCAAG CAGGACGTCG TGATGGTCGT GTTTCTATTG ACTCTGAAAC ATTGACTAAT CTTCCTTCTC  CTTTCGTCAA TGCCACCGAA CTCATCAAGA GTTTTGCAAG CAAAGGTATG TCCGTTGATG AAATGGTGAC TCTCTCTGGC GCGCATTCCA TTGGCATTGC ACATTGCGGT GTATTTGCTA  GCCGTTTGTA TCCTCAAAAC AATCAACAAA GTCTTCCAAT TGATCCTGAA TACGCGAACT TCTTGAAGTC CATTTGTCCA CCAGAAGCAC TTACAAATGG GACGGGAGCT GCTAATCCCG  CGAACCTTGA TCCCCTGACA CCAAACAGGT TGGATAACAG ATATTACTTG GCTTTAAAGA GTCAAAAGGG ACTTATGATT TCAGATCAGA CGTTGATGGC AAACCCGACA ACAGCTAGAT  TGGTGAACTA CAATGCTAGA TTTGGTTCCA TTTGGTCAAG GAAGTTTGCA GCTGCAATGA TTCACATGGG TACTATAGAT GTCCTGACAG GTCGAAACGG AGAGATCAGA AGGAACTGTC 
ATTTCGTCAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCCA AAGGCATCAA TCTTGCACTT TTTGTTTGCC TCATTTTGTC ATTTTCATCG TCTATACTTG CTTATCGAAC ACCATATTGG CCATCGATTA AAGTAGGTTA CTATCGATAT  ACTTGCCCCT ATGCAGAACA CATTGTTCAA CATGTCGTAA ACAGAGCTGT CTCTCGTAAT CCAGGCATTG CTGCTGGACT TATCAGGTTA CATTTCCACG ATTGCTTTGT CAGGGGGTGT  GATGCATCCG TGTTATTGGA TGGACCAAAT TCCGAGAAGG AAGGTATTCC AAACAAGAAC AGTTTACGAG GTTTTGAGGT GATTGATGCT GCAAAAGCTG CACTTGAGGC TGCATGTCCT  GGAGTTGTTT CGTGTGCAGA CATACTTGCA TTTGCTGCTC GGGACAGTTC TTACAAAGTT GGGAGAATAT ACTATGATGT CCAAGCAGGA CGTCGTGATG GTCGTGTTTC TATTGACTCT  GAAACATTGA CTAATCTTCC TTCTCCTTTC GTCAATGCCA CCGAACTCAT CAAGAGTTTT GCAAGCAAAG GTATGTCCGT TGATGAAATG GTGACTCTCT CTGGCGCGCA TTCCATTGGC  ATTGCACATT GCGGTGTATT TGCTAGCCGT TTGTATCCTC AAAACAATCA ACAAAGTCTT CCAATTGATC CTGAATACGC GAACTTCTTG AAGTCCATTT GTCCACCAGA AGCACTTACA  AATGGGACGG GAGCTGCTAA TCCCGCGAAC CTTGATCCCC TGACACCAAA CAGGTTGGAT AACAGATATT ACTTGGCTTT AAAGAGTCAA AAGGGACTTA TGATTTCAGA TCAGACGTTG  ATGGCAAACC CGACAACAGC TAGATTGGTG AACTACAATG CTAGATTTGG TTCCATTTGG TCAAGGAAGT TTGCAGCTGC AATGATTCAC ATGGGTACTA TAGATGTCCT GACAGGTCGA 
AACGGAGAGA TCAGAAGGAA CTGTCATTTC GTCAACTAA 

Retrieve as FASTA