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Entry information : NnPrx28-2D(Nelnuc025003g0434510.t1)
Entry ID 18226
Creation 2023-02-20 (sebastien Cabanac)
Last sequence changes 2023-02-20 (sebastien Cabanac)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-02-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NnPrx28-2D(Nelnuc025003g0434510.t1)
Name NnPrx28-2D(Nelnuc025003g0434510.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Nelumbonaceae Nelumbo
Organism Nelumbo nucifera (sacred lotus)    [TaxId: 4432 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NnPrx28-2D
start..stop		 S start..stop
NnPrx102 524 0 1..322 1..322
NnPrx101 512 0 1..322 32..354
NnPrx27 467 3.45e-167 1..322 1..326
NnPrx17 461 3.19e-165 15..322 16..324
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '18226' 'join(81008206..81008415,81008556..81008744,81009169..81009334,81011178..81011581)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 81008206..81008415 208 N° 2 81008556..81008744 187 N° 3 81009169..81009334 164 N° 4 81011178..81011581 402
join(81008206..81008415,81008556..81008744,81009169..81009334,81011178..81011581 )


exon

Literature and cross-references NnPrx28-2D(Nelnuc025003g0434510.t1)
Protein sequence: NnPrx28-2D(Nelnuc025003g0434510.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (300)
PWM (Da):   %s   34919.39 (32555.2) Transmb domain:   %s   i5-25o (i5-25o)
PI (pH):   %s   5.64 (5.36) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MRTNLLLLVSLTVFCICGVCQGGALRKNFYQTSCPKAEETIRNVT
WKNVAADSGLVADLLRMHFHDCFVRGCDGSLLLDSADNTAEKDSSPNLTLEGFDVIDEVKTEVEKICPGVVSCADIIALAARDAVSFQFKRSVWDVFTGRRDGRVSLKSEADANIPLPSFNFDTLRQRFAAKGLTVRDLVVLSGA
HTIGHGHCKDFSNRLYNFTGKGDADPSLDSTYADSLRSQCQSLSDTTTTVPMDPQSDTTFDNHYFANLMQNKGLFQSDAALLTNPVSQNIVNVLLNSNAFFTEFGIAIQKLGSIGVLTGT
AGEIRNKCNAVN

Retrieve as FASTA  
Remarks complete from genomic
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATATTGTGCA TATGGATTTT TAGGAAGCTA GAGTTTTAGG AAGGTATTGT TTTAGGAAGT TGCTATTTTC TAGTCTTGCT ATTTTGATCA TGATGTAGTT GTCTATATAT ATGGGGCGAT  TGCCTCCATT GAAAGGTAAC ACAAAATTAT CATTCTTTTG AATATCGATC CATGCAATTA TTCTTTATGC CCCACTAATT TCACGAGAAA ACCTCTTTTT TGGCCTAAAA TTACAAATTT  TAATATTTTT TACAAATAAA ATATTAAAAA TTAAAATAAA ACATAAATTA AATATAAAAT AATACATATG TCATATATAA ATATAATTAT ATATTATTTA TTGATAAAAT ACATGTTTAT  ATATACCTAT ATACAAAGAT ATAGATATTG CTAACACATG ACACTGTCTG ACCCGTTCAA TCCAAACGAT TGAACCGATG GCCTGCGACC GAGAGGCAAA AATGGTTTGA TGGCCTCCAC  ATCAGTTTTT AAAATATTGC CAGACACTAA AAAATGAGCT GGGAGGGAAG ATAAATTGAA CAAAAAGAAG AAAATAACAG TACTAGACAA TTTCTTCTAA TTATAAACAA TCGTTGTTTT  GCTAAACTGT ATGAAAACCG GCTTGTCTCA CTTGGAAAAA ACCTTATATC TCTATCTACT TGTCTAGAAT CTAGATTCCT TGTCTCCTTC TCTGCAAGTC TTCTTATTGA GATATATATG  TGTAGTTTCT GAGTTTGGCC CTCTCCCAAT CATGTCGTCA AAAGTAATTA ATACAAATAA TATCCAATTT GCAATTTCCG GTGGAGGGGG GTTCCACACA TGCTCATCCA AGTCTGTTCA  TTGCTGACTT CGCAAAGGTT GTGTAAATGA TGACTAATCA GATAGTAATA CAAAGGGATT CCTCCACTTT GGCAAAAAAA AAACAATTGT TTTTAACCAA TCTTTTTAAA AATCGACCTA  GAATCAGAAC TGCTTTGTAA TTTAAAATTT AAAAAAAAAA TAAAAACGAC AAAAAATCAT GTCTGGATTT TATGAATCAA CAGTTCAACT GCTTGGGTCA ATGGTTTTTA ACAAAATAAC  GGTTCAAAAG GGTAAAATAG AACCAACATT GAGTCATTGA CAATTAAAAG CCATGCTTTT AACAATATTT TAATAAATAC CATAAACATA TATAAGAGAC CAGATAAGAT AGACACAACA  TGATAATCAC GTTCACTGAG CATTTGCTTC CATAAATAGG GAGAATGATG GTTCAACCCT GAGTCAGAAT TTTTAGGCTC AAAGTACAAT TGGGGTGGGT GCTAACTTGG AATTGATGTC  AATTTACAGG CCGCATTGAT GTATAAAGTG AGAATTATTG ACATTTTAAA TGTTTATAGC TCTACAGTAA AATTCAGAAA TCCGTATTAA GCTTGTCTGT ACTTTAATAT TTGGACAACT  GTCAAAAAGT TTTTTTAATC TTTTTTAAGG TTAGGGTGGG GGTATTTTAA CGAACAGGTG TAAAAGAATT TCTAATTGCT CATTGAACTG TCAGATCCGA ACTGTAAACC CAGTTTAACC  AAACCAAGTG ACTTGGATTG AGCATTGAAG ACCAGGCAAT GCTCCTCTAT CTGATGATTC TGATCAATGG TCTGACTTTT CCTTGTTAGA AAGAAGAAAA AAAAGTCATT TATTTTGTTT  GTTTCTAATA AACAGATGTT GGGCCTAACT CTCAACCACT CTGAAAACTC TCTCTACTAC TTTTGGTTCA CTGTCTTGTC TGATTTGTAA GTAGTTTATC TTTACACGTT ATCTAATCCC  TCTCTCTCTC TCAAAAGAGT CAACACATGA TTTTTGTGTA TATTTCATCT TTTAATTCTC TTACGCGGAA AAGAGTATCA TCAAATTTCT ATATAAGGAG CAGTGGCTGT GATCTGATCA 
TTCTGTCCAT CGTTGTAGCA GAGGCTGATT GAAATTAAAC CACATTTCTT TGCTTGAGAA AGGAAGTGGG GGGATCCAAT 

Retrieve as FASTA  
Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGTAGAGTG AAATGTGTTG TTATTATCAG CACAGCACAT CAAGTGATTG TTACTTGCTC CCTTTCTGAA TGAAGAAATG TACAAGTCAG ATATAGGGGC GGCTGATGAT GCATGCTTAT  CTATATCAAA TAAATTGGTC ATACAAATGT GGCCTTCCTT TCAAGTTTCA ATGCATTTTT CTATGATACG AATTCTTGTC TCACTTACAT ACATACATTT TCTTTTATAT ATAGAAAGGA  AAAGTTTAAA AGACATAGTG ACGCTTGGTT AAATGCAATC CACATTTACT ATGACAGTGT TGTAACCCTG CGCTGAAACA AGTAAATCAA AGCCATTGAT TTGTTGTCAT GGACTCACCT  TGAATTAGAT GAAGCAACTT CTTGATGGGG CCACTACAGT AGATTCAAGG CCATGATTTT CTGTTTTAGC CCTGCACTAC GATAATGTCT TAGCAAAAGT GAACTCGGTT AAATGTCCCC  AAGCATAAAA ATACAAATAT AAAGAAATTT AGGATCAGAG AAATTAAGTG AGCAATCCTG CCGCAACATT GTAACCCTCT AGGGCAGCCT AAGCTCTAGC TTCATTTATC GAGCATTCTC  CTATATCCTT ACAACTAACC CACATAACCG ATCTTACCAT AATCATCTCT CAATATAATA CCAATCGCAC ATCTTCCATA TGTTTCTTCT TCGAGATGCA TCAAAGTTAA TCTTAGCATT  GCTACTCTCT GGTTTCTTCC ACCAAATAGG ACATCCGTAG CAATGCATTG CTTCACAAGG ACAGGGGGAC AAGCTTTGGT GAACTCCCTA CACTCAGACC TAGAGCTTTA TCCATTAACC  GAGGGGGAGG AATAGATTTG TTTTTGAAAA TTTTCTCATT TCCTTTTTAA CAAAATGTTC TAAAGGGTTA TACTTGCATT TTCTAGAACG AAACAATGAT TCTCATTGGC ACCATTTGCA  AGAGAGATTC GTCTGGTATA GGTCTAGGAA TTATGCCACT AATAGGGGTG TGAGCATTAT TCGGTTAAAA CTGGAAAACT AAACCAAAAA ATTTTATTTT GGTTTTTCTG GTTTTTGGTT  AATTTGATTT TTGAAAATTT TGGTTTCAGA TTCGATTAGA ATTAGAAATT TGGTTAATCG AATTTCATTA TATAATATAT ATTCAGTTTT CATTTTTCAT TTCAACTTAT TCGATTCAAT  TTTTAACTGA ATAAACCAAA TGTTCACCCC TGATTTCTGA GAACTGTCTA GCTAGACTTG CCATGATTCC TCACAATGAA GAAAGAGGTG GTTAGCATCT TCCTCTGCTC CATAGAATGG  ATAGTCGGCA ACTCGGCATC AGTCTTCATC CCCCAATCTA ATATAAGTCT CAGTTTAGTT AAAATTCTGC CTCTTAACAC CAAATACATA AGAAAAAATA AATAAATAAA TAATCTTAGG  GGGCAGCCCA ATTTCCAAAC ACGCAGTAGC CTAGTATCGG TATTATTTTG GTCCAAGTTC GCCTCCATAA GATTGTATGC TGATTTAATG GAGTAACTCC TCTTTAGGCT TCCAGATCAG  TGTATCATTC TCATCATTAA ATGGAATTGG AATCACACAA GTAACTCCTC TTTTGAATTT TTTTTTCTTT TTCTACATTT TTTGATCATT AGTAAAATTA CTAACCATAC AATTTTGCTC  CTCCTGGGCT GTACTCATAC TATTGCCTAT AGAGGAGTTT CCAACCCAGT CAAAAGTGAA TAGATTTATC ATTCTCTAAT TTCCATCCAA TCCCCCCTTT TTTTAGGACA TCCCTAAATT  CTAGGCATGG TTTTCAAAAC TGGACTGGAT CGGACGGTTG GATCAGAAAA CTGAGAATCG ATCAGGTGAT TAATTCTGTT TTACCCTAGA ATTGTTATTT CGACAAAAAC CGTTGATTTG 
GTCAGTAAAC CACTGACCCA AGCGGTCGAA TTGTTCAAAC CATCCAACGG TTTTGACTGT TTTTTTATTT TTTATTAGAA 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGGACTAACTTGCTTCTTCTGGTCTCTCTAACAGTCTTCTGTATCTGTGGGGTTTGCCAAGGCGGAGCCCTAAGGAAGAACTTCTATCAAACTAGCTGTCCTAAGGCCGAGGAGACC
ATTAGGAACGTCACCTGGAAAAATGTGGCTGCCGATTCTGGGTTGGTTGCAGACCTCCTCAGGATGCATTTCCATGATTGCTTTGTTAGGGGGTAAGAATAATATATATATATATATATA
TATATATATATATGATGTCATATAATTTATCTCTGTACAAAATTCAATGCATGGAAGTTGATATTTTACGTAAACTTGGCTGGTCTTACTCCTCTCTCTCTCTGCACTGCAGGGTTGTGA
TGGATCACTGTTACTGGACTCTGCAGATAATACAGCAGAGAAGGACTCATCTCCAAACCTAACTCTGGAAGGTTTCGATGTTATTGATGAGGTCAAGACTGAAGTTGAGAAAATCTGCCC
AGGAGTTGTTTCTTGTGCGGATATCATCGCCTTGGCTGCTAGGGATGCAGTTTCTTTCCAAAAGTAAGTTGGATGGTGTTAGTGAATAAAAGCCTATTTAGGGATCTCACCTAAGAGATT
AAGATTTTAAGTTGAATGGTTATTTGATATATATGGTATTAGAGCCATTTTGATCAAGTGGTCTAATAGTGTTTCATCTTCATTACACCCATTATAATTAATTAAGTTTCAGCACAAGAT
ATAATTAGGAGTGTGTTTATCCACACTTCAAACCCAATGGACTTTCATATAACAGTATAAGTTTTTAGGTTGAATGATTCTTTGAAAAATCGTTAAAATAGCTAGACAGACAAAACCAAA
TCGCTCCATATGCACTCATTCATCAGTAGATATAGAGAAAAAATAAATAAGTTAGGCCACTAGATCAATGGATGCAGGTTTGATATATATATTCTGACGTTTGAATGATACATGTGCATG
CATGCAGTTCAAGAGATCAGTGTGGGATGTGTTCACAGGCAGAAGAGATGGGAGGGTTTCGCTTAAATCTGAAGCTGACGCCAACATCCCTTTACCTTCCTTCAACTTCGACACTCTTAG
ACAAAGGTTTGCTGCCAAAGGCCTCACAGTCCGCGACCTTGTGGTTCTATCAGAGGTGTGTGAATGTGTGTGTATTGTTTATGGTTGGACATATAATATAATATATGCTTCTACCATGCA
CGTATGTGAATAATTATATTAGCTGCATTTGATATCTGTGCTTGGGGCTGTTGAACCAAGAATAACGCCCCACATCATCCATGAATGCCAAATAAGAGGTTGGCGTTTGGATTCCGGATC
AGACATAATCTGACCTGGGGTATTTATGGCCGACTTGGGGCGCTATTATTGGTTAAGCAGCCCCTAGCACAGCCATCAAGTGCAGCCAATGACCTTTTTTTTCTACTAACTACTGATCAT
TTATGATTTATTGAAGATTCTAATTTTTACTAAGGGTTCGTTTGGTTTATAATCAGAATCAGAGTCTGGACTGAAAATTTGTCAGAATTGGAGTCGGAATGGCCTATTTCCATAATTGGA
ATTGGATTTTATTCACAAGGGAGGGAGAGTTTGAGGGAATGACCATTAATTGCACCAAGAATAAAAATGATATTTCAATTCCACCCAACCAAATAATTGGAATTGCCATTCCAATTCCAA
TTCTACACCCCTATTCCTATTTGTGTGAATCAAATAGGCCCCAAGTTATAGGACCTGTTATCTGGTTGGCCCGACCCAATCCAAAGATATCTGAATATCAAAAGGTTTAATTAGTGGTCT
AACATCACCTTAAGTAGGACATGTTTGGAATGTAAGCAAGCATAAGGAGAAAGAGAGTAAGACTAATTCGGGCCCCGTCCAACTAGTGGCCGGACATATAGTCCCAGCCTGGCCCTAAGG
TGGGCGGCCTTGGCTCAGCCAAGACTCTCTTGCATGCCGACTGAATGGATCGACCATTATTAATTGTTCTTGTTCCCACGTCACGTCATGGATGTGGACTGTGGAGGGAGCGAATTAACT
GGAGACATAATCATACACACCCCACTGAACTATCTATCACAGTTGAACAGGCCGGTGTTCAGTACAGCTGGGTCTCAGATGAGGCCCACAATGAGCACTCAATTGTGATAGGTAGTTAAA
CCGGGTGTATATGCTTTTGTCTCCAGCTCATCCGGACTGGATTATGGAAAAGTAAGCAAGCCGTCACTAGTCACAACCACAAAATTAGGGTATTCAGATGTTTTGGCCAGCTCAGTCCAT
CTTTGTCCTCCCTCTAGCTTGGCTTCGGCTAGGCCGTTCACAACATTAAACCTAGGCCAAACTGCTTTGGGGCCTGTTCATCACACCAACCTCACAGCTATATCCTGGGGAATATCTCCC
CATGAATAATAAATATAAGCATAAATACATTAGTTGTTTTCAATGTACGGCCAGAACATGTTGTGAGGCCGGTGTGAAGAATGCTCTGTGAGAAGTAGATCCAGACACAGCAGAGCTACA
CCCCCAACTCCCGCTTGTTGTCAACACTTCCATGACAAGCCATGGGCATAAGGCCTGAACCTAAGGTTAAGACCAATCTTTCAACTCAGGCCCATATGGAACAAAATTTGACATACTTGG
ATTGGATTTGAGCCAATGCCGATCTTTGATTGATTGGTTGGGCTCAGGCAGGCCAATTGGGTCCAAGGCACCAAAGAAATATTTAAATCTATCTAACATCGGTAACTCTCAGATAGGAAT
ATTTGTTTGCATGTAGTTGGACCATGTTTGGGCCGGGCGAGACAAGACTAGGGGGCATTACTATAAGTATTAGGCAGGGCCGGAGCCCGGACTACCCAAGGACCGAAGATCCAAGCCCGA
CCAATATAAAAATTCAGATCCAGTCCAGGGTGGTCTGGGCCCAATGTCCAAACACTTGAAAATGTGTTAACCATGTAAAGGGATTTGTTGGTCTTCAGGTGCGCATACGATTGGACACGG
ACACTGCAAGGATTTCAGCAACAGACTATACAACTTCACAGGGAAGGGAGACGCAGATCCCTCTCTAGACTCAACCTATGCCGACTCCCTGAGAAGCCAATGCCAGAGCCTCTCCGACAC
CACAACCACGGTACCCATGGATCCCCAGAGCGACACAACCTTCGATAATCACTACTTCGCCAATCTGATGCAAAACAAGGGTCTCTTCCAATCTGATGCCGCCCTTCTCACCAACCCGGT
ATCCCAAAATATCGTCAATGTGTTGCTCAACTCAAATGCTTTCTTCACAGAGTTTGGAATTGCGATTCAAAAGTTGGGATCCATTGGAGTGCTTACTGGAACTGCGGGAGAGATCAGGAA
CAAGTGTAATGCTGTGAACTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGGACTAACTTGCTTCTTCTGGTCTCTCTAACAGTCTTCTGTATCTGTGGGGTTTGCCAAGGCGGAGCCCTAAGGAAGAACTTCTATCAAACTAGCTGTCCTAAGGCCGAGGAGACC
ATTAGGAACGTCACCTGGAAAAATGTGGCTGCCGATTCTGGGTTGGTTGCAGACCTCCTCAGGATGCATTTCCATGATTGCTTTGTTAGGGGTTGTGATGGATCACTGTTACTGGACTCT
GCAGATAATACAGCAGAGAAGGACTCATCTCCAAACCTAACTCTGGAAGGTTTCGATGTTATTGATGAGGTCAAGACTGAAGTTGAGAAAATCTGCCCAGGAGTTGTTTCTTGTGCGGAT
ATCATCGCCTTGGCTGCTAGGGATGCAGTTTCTTTCCAATTCAAGAGATCAGTGTGGGATGTGTTCACAGGCAGAAGAGATGGGAGGGTTTCGCTTAAATCTGAAGCTGACGCCAACATC
CCTTTACCTTCCTTCAACTTCGACACTCTTAGACAAAGGTTTGCTGCCAAAGGCCTCACAGTCCGCGACCTTGTGGTTCTATCAGGTGCGCATACGATTGGACACGGACACTGCAAGGAT
TTCAGCAACAGACTATACAACTTCACAGGGAAGGGAGACGCAGATCCCTCTCTAGACTCAACCTATGCCGACTCCCTGAGAAGCCAATGCCAGAGCCTCTCCGACACCACAACCACGGTA
CCCATGGATCCCCAGAGCGACACAACCTTCGATAATCACTACTTCGCCAATCTGATGCAAAACAAGGGTCTCTTCCAATCTGATGCCGCCCTTCTCACCAACCCGGTATCCCAAAATATC
GTCAATGTGTTGCTCAACTCAAATGCTTTCTTCACAGAGTTTGGAATTGCGATTCAAAAGTTGGGATCCATTGGAGTGCTTACTGGAACTGCGGGAGAGATCAGGAACAAGTGTAATGCT
GTGAACTAA

Retrieve as FASTA