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Entry information : NoffRboh05-1A(Nasoff15g0024080.t1)
Entry ID 18505
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh05-1A(Nasoff15g0024080.t1)
Name NoffRboh05-1A(Nasoff15g0024080.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh05-1A
start..stop		 S start..stop
NoffRboh05-1B 1788 0 1..947 1..950
AtRboh05 1712 0 16..947 16..952
TsRboh05 1672 0 16..947 16..951
AlyRboh05 1623 0 16..947 16..925
Literature and cross-references NoffRboh05-1A(Nasoff15g0024080.t1)
Protein sequence: NoffRboh05-1A(Nasoff15g0024080.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   947
PWM (Da):   %s   106616.84 Transmb domain:   %s   o385-407i526-548o568-590i749-766o
PI (pH):   %s   9.22
Sequence
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Remarks
Promoter►
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CAATACGGCC CAAAATAAGA TAACAATACG GCCCATTAAG ATCGTTTAGT TCTTAAGCGT AATTAGTTTC AGACTTACAG GCCTACTACG GGCAACGATG GTAACTGAGG ATTATGGACT  TGATCAGGCC TCCCTGATTG TTTTCGATAT TTTGATTCTC TTTTTAATTA CACTTTCTTC TCTCCGATTT CTTCTTTCTA TATTGTATCT ATATTTTCCT TAAAGATTCA CATACAGTAT  ATTATTCAGC TATGATATAG AGTTTGCAAC TACCAGAAAA GCACTTGAAA TATTTTAAAC AGATATATAT ATGTTTGGAA CAAGCAGTAC ATCTATCATA TTCATTTTGT CATAAGAATA  TAATGTATAT AGTTTTCAGA AGTTGATTCT ATCAGCCAAA TGGATGTATG TATATATAAT TAATAATGGA ATAAAAGTGC ACTTAAAAAG GAAGTGTGGG CTAGTCTACA TTGATTTCAA  GTGGCATGCA CGTTGTTTCT ACCGCATCAT TTTCTGTATC CATTTTAAAC TGTTGATCAG ACTTATCCTT TTTCAAAATA GCCTCTGCCC TCTGGGATTA CTCTGGTGTC TTCTTAAAAC  ATTCTAAATT CAAAGATTTG AAATCTAATT TGTTTTAATA GTGGTGAACT ATAATATTAT TTAAGTATAT ACCACGGAAG CTTAATAAAT TCATAAACTC TCTAATTCCA AAACCCCTGA  TATCATCGTA TATTATAAAA TCGTCGAACA AAAAAAGCAA TTGACTATAC TAAAATTTGG AAACAGACTC AAATGATAAA TGATAAAGTA TGACCAATGG TTGAAACTTG AAACAGATTG  GGTGAATTTC TAACTAGACT AAAAGGGCCT GTAAAAGCCC ATAAAACAAC CAGATAATAA TAAGCAACAA AGGGGAGGGA TTCTAGAAGA GGAGGTACTC AAAACTTAGG ACGTACAATA  CTTGGCTATG TAGTATGTAC TGCCTTTGCC ACAAAGCGTA GCATTTAGTT TTAATAGTCA CAAAAACACA AACCAGAAGT TTCTGTTCCT TTAAACCCTT TATATATCTC CGGTCTCCTT  TCATTATTAC TCTATAACTC TTTTAATCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCATATTTGC CTGCTCATAT CACAATTTTT AAAAATATAC ATAAACCGTA TAAAATAATA ACGTATTCTT  GTCTCCCACT CTCTCCCTTG TCCCCTAATA TTTTCATATA CTAATCTAAG GAAAGCTATA TAATTAAGTA AATGATTCTG TCATCTAGTT TATACGTGGC GTAATCTCCT GAGTTTCTGG  CAGCGTATGA GACAAGAATT CTTCCTCTTT TTCCCTTTGC ATTTTCGTTA AAGGTATCCA TAAATGTCAT TAATCCCGAT TATTATCATT AGTAGTAGTA TGCAATAATT ACTGATTTTG  TTATTATTAA TAGTTGTAGC AATAGTTAAT TCTGAATGAG TTCTTCTGAC ATTAGTTATG GCGGCTAAAC TCAAAAACTA AGATATTGTG AATTAATCAC ATACGTTAGA CCTAAACCCA  ATATTAATAA TATATTACTA TCCAATATTC TTGGTGGTAA ACAACCAGGA ACAAATAATA ATCTTTAAAG TATATATTTG ACAATAATAA AGATAGAGAA TTAGAAGAGA TGATTAGTTT  AAGTAGATAG GAAAAAAAGA AGACAGTAAT GAGTTTAAGA AGAAAGAAAC ACGACTTGGC CACAAAAATT GAAGCGTTGA AAAATGTGTG TTTGTATGAA TCGGTTGAGA AGTGCCTCTC  TTGTTTTTTT TTTCTTTTCA TTCTTTCTCT CTCTCTCTCT TTATTTAATC TATTTAATTT TCTTCGTCCC TTTCCATTTT TCTCACCTTC TTCTCTTGTC ACCTTCTTCA GTTTTCATGG 
TGATTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT AAACnCTTAC TAATGAACAA GTGTAGGCGG TTGATTAATC TTCTTCACTC 

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Terminator +►
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TTCAATGTTA CAAGTCAGCC TCCATCACAT TCCCTACAGT GAGATTTAAA TCCCGCCAGC CATTATTTTT TTATACTAAC TTCACAGTCA CTTAGCAAAA TAGATTATAT ACACTACGTC  ACAAGAAAAC ATTTGTCCTG CCTGTTTGTA TAGACCCGCC TAAAGGCATG AAAATAACAA ATATAAGTTA CTATACGAAA TAATATACGC GTCTTTTCCA AATGATCCAA ACTATTTCCA  TTACCACAAG CTACTAGTCA AAGAGGAAGA AAATTAAAAA AGATCAACAA TGTGCCTCGA ACACAGTAAA CTGGTACTGA AACATATAAA AGAAGGAGAA GAGAGTAATG GCTTTGAGCT  AACTGTACCA AAATCGGAGT GTAACGCACA ACAGAGGTTG TTGTATAATC ATCCCAGCGT CGGACCCGTC TCTTAAGCGT GTAACCCACA AAGACTCCAG CTACAAAGAA AGCACCGCAC  AGCTTTAAAC ACGTCCAGAC TGAAACTCCG CTGCCACCAA AACATAGTCC CAATATAGGA AAGATGAAAA ATCTGAACAG AATAATAGTA CCAAAACTCA TTACACAGTA TTCAAAAATC  AATCAGGATC TTAAGCCTAA ATGAGCTGAC CAAGTAAGGA TCTTAGATAA CATGCCATTA GAAAATTACA AGCTTTCACT GATGTTGAAC TGGGAAATCA TCATCACTCT CTAGGTTTTG  AGCTACAGCA AAGAATCTAC ACTCTTTTCA ATTTTATAAT TCTCTCGAGC AGACCAAATT CCTAGTTTTC CAAGTGCTTA ATCACTATTA CAACAAATTT CCGACGAAGC AGATTACCTC  GGAGGTCTGT CGACCAAAAT GCCGGATCCG TCGTATGAAG TCGAATTCAC GGAGCCTCGC TTGTCCTGCA TCCAATTTTC CGCAAATTCA GATAGAGAAG ACGAAGAAGA AGCTGCCGAT  TTCGTATCTT TCAATAACTT TCTGTAAATC TTCTGGAAGT CCTCCATTGA TCGGCAAACG AATAATTAGG GTTTAGGGTT CATTGCGATT TCCTAATTCC TACAGTGACT TGTCGTTGTC  GTTGACCAAA ACCACAAAAG GACAATATTG GAATTTCCGT AATTCTTCAG ACCGTATTAA ACAAAACAAA GGAGAATCTT TTTGCCAACA ATAAACATAA AAAACATGTG TTATTTTTTA  GTTTGCTAGT TGAAAAGAAA ATTGCCTCTT GACCAAGGTC AAATAATTAT TAAATCTTCA CACAACTATA AATTTTATTT ATCAAAAACA TTTTGTTTAT TTAACATACA TTTATTCATT  GATATGAATA TTATATTTCA TCATATAAGA ATATTTAATA CTTTTTTTGA ATCTCGTCAT ATATTCAATT AGTTGAAGCG ATCTTCTTCT TGATCGACTC GATAATCTTG AGAACCATAA  GGACTGAAAG CTTCAAGGAA CAAGTTGGAT TTACGCCAAG GATTGAGTCC CATGTCATTA CACATATCAT CGGCATGTTG GATGCTGAAT GTGGAAATGC AATGACGTTT GTAGAATCTG  CTCGATCTTC TCATCACTTC CATTTCCTTT AAGAAGATAT CAAACATCTT CTCTTTGCTC GGTAATCTGA ACTTACCATC TACCAGACGG CTTAGCCACA ACGAACGTAG CTCTGATGTA  TGCAAGTTGG AGTTGCTTTG AACGTATCCG ATGAAACCCA TATTCGGTAT CAATGGATGG ATTGTTCCCC TGAATATTTA ATTAGTTTTG TTTATATAAG AATATAGGCT TGAACTCAAA  AAAATTTATA AGATTTTTCT AGTCTGAATA CGATTTTATA TGTATATATA TATATACCTG TATAAAGGCA TGACACCGGA TGGAAACTCA AGCCAAGTTC GAAAAGGTTC AGGAACAATG 
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DNA ►
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CDS►
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GTGGCAAAGG AGTTGAAGAA GCAAGCACAA GACATGAGTC AAAAAACAAC CACCCGATTC GAGTTCCATA AAGAGCATTT CTAA 

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