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Entry information : NoffRboh05-1B(Nasoff5g0007520.t1)
Entry ID 18506
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh05-1B(Nasoff5g0007520.t1)
Name NoffRboh05-1B(Nasoff5g0007520.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh05-1B
start..stop		 S start..stop
NoffRboh05-1A 1788 0 1..950 1..947
AtRboh05 1711 0 16..950 16..952
TsRboh05 1695 0 16..950 16..951
AlyRboh05 1625 0 16..950 16..925
Literature and cross-references NoffRboh05-1B(Nasoff5g0007520.t1)
Protein sequence: NoffRboh05-1B(Nasoff5g0007520.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   950
PWM (Da):   %s   107092.82 Transmb domain:   %s   o388-410i469-491o524-546i572-594o
PI (pH):   %s   9.15
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLSPLSFST GSSFSHTDGI DDGGGQLSQS PVSGGAMLPA FLKDLSRKGD SGSGSSNWER EVVEVTLEVD VGDDSIVVCG MSETADVASV DSRPRSVDVS GRLSRNLSTA SSRIRQKLGK  LLRSESWKTT SSSITGERDI ERQTVETGIM TARDKRKENA KLQRSTSSAQ RALKGLQFIN KTTRANSCDC DCDRDQMWNK VEKRFVSLSK QGLLARDDFG ECVGMVDSKE FAVSVFDALA  RRRRQKLEKI TKDELHDFWL QISDQSFDAR LQIFFDMADS NEDGKITRKE IKELLMLSAS ANKLSKLKEQ AEEYASLIME ELDPENFGYI ELWQLETLLL QRDAYMNYSR PLSTTSVAMS  TPGRSLVRPR HVVRKCRQKL QCLVLDNWQR CWVILLWIMV MAILFVWKFL QYRDKAAFKV MGYCLTTAKG AAETLKLNMA LVLLPVCRNT LTWLRSTRIR ACVPFDDNIN FHKIIACAIA  IGILVHAGTH LACDFPRLIN SSPEDFALIA DSFNGTKPTF KDLMTGAEGI TGISMVILTA IAFTLASTHF RRNRVRLPAP LDRLTGFNAF WYTHHLLVVV YIMLIVHGTF LFFVDKWYQK  TTWMYISVPL VLYVAERSLR ACRSKHYSVK ILKVSMLPGE VLSIIMSKPP GFKYKSGQYI FLQCPTISRI EWHPFSITSA PGDDQLSVHI RILGDWTEEL RRVLTVGKDL STCVIGRSKF  SAYCNIDTSQ RPKLLADGPY GAPAQDYRSY DVLLLIGLGI GATPFISILK DLLNNSREEQ TDNEFSRSDF SWNSYTSSYT TTTPTSTQGG KKKAVKAHFY WVTREPGSVE WFRGVMEEIS 
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Remarks
Promoter►
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CAGGTTCACA CACATTAAAT TATTCAGACA TGATATAGAG TTTGCAACTA CCAGAAAAGC ACTTGAAATA TTTTTAATAT ATATATATAT GGAACTAGTA GTACATCTAT CATATTCATT  TGCCTTTTTA TTTATTTTGT TTGTAAATGA TATATTCATT TGTCATACGA ATATAATGTA TATTGTTTTT AGAAATTGAT TTTTTCAGCC AAAAGGGATG TACATATATA ATTATTAATG  GAAGAAATGT GCACTTAAAA AGGAAGCGTG GGCTAGTCTA CATGGATTTC TAAGTGGCAT GCACGTTATT GCTAATGCTA CCTCATCATT TTCTATATTC ATGTGCTCTC CTCCCATTTA  AACTGTTGAC TTAATTTAGT TTTAGTGTTT TTCTGCCTTT GCAAGGTTCT GTATATATAT TGGCAGGTTG ATATGTTTTT TTTAAATCAC CACACGTTTT GAAATTGTGA ATCTCTCTAT  TGAGTTTAAA AAGGAAACAA GGTTAAAACT TTTTAGTTTA AATGATCAAA AGAGTATGGA AGTGATTCTT TTTTTAAATA GCATCAGCCT CAGGGATTAC TTTGGTATCT TATTAAAACA  TTAAGACTAA GTTTAAACGA TTTAAAATCT AATTTGGTTT AAATAGTGGT GGACTTTAAT ATTATTTAAT CAAATAACAC GTAAGCTTAA TAGATTTATA AACTCTCTAA TTCCAAAACA  CCTCATATCA TCGTAGATTA TAGAATCGTA AAATAAAAAG CAATTGACTA TACTAAAAAT TGGAAACCGG CTCAAATGCT AAATGATAGG TGGTTGATTG GATGGATGGA TTTCTTAGTC  TAAAGGGCCC GTAAAAAGCC CATAAACAAC CAGATAATAA TAATAAGCAA CAAAAGGGTG AGATTCTAGA AGAGGAGGTA CTCAAAACTT AGGACGTACA ACACTTGGCA ATGTACTACC  TTTGCGACAA AGCGTAGCAT TTAGATTTAA TAGTCACAAA ACACAAACCC GAAGTTTCTG TTCCTTGAAG CCCTTTATAT ATATCTCCGG TCTCCTTTCA TTACTCTATA AATCTTTGAC  CTTATTCTTC TTCATACTTG CCAGCTCATA TCATATATCC ATTTTTTAAA TTACAGAAAA CGTATAAAAT AAATACGTAT TCTTGTCGCC CACTCTCTCG GTCTCCCCTA ATATTTCATA  TTAGTAATCT CAAGAAAGGC TATATAATTA AGTAATTGAT TCTGTCATCT AGTTTATACG TGGCGTGATC TCCTGAGTTT CTGCCAGCGG CTGAGACAAC AATTCTTGAT TTATTTCTCT  TCCCTTTGCA GTTTGCATAT TCATTAAAGG TACCCACAAA TCACGATTAC TGTTATCATT TGTAGTAGTA ATAGTATGCA ATAATTACTT TGTGATTGCT GATTTGATTA TCATTAGTAC  TAGTAGTGGT AATAGTTAAT TCTGAACGTG TTCTTCTGAC ATTAAGTTAG TTTGGCGGCT AAACTAAAAA AACTAAGATA TTGTGAAGTA ATTACATACG TTAGACCTTA ACCCAATATA  AATATATTCC CATCCAATAT TATTTGTGGT AAACAACCAA CAACAAATAC TCTTTATACT ATTTATTTAA TAATAATAAA AATTGACAAT TAGAAGAGGT GATTAGTTTA AGTAGACAGG  AAAATAAAAA GAACACACTA ATAAAAGTTA AATTAGATCA AGAAGAAAGG CAACAACTGT AAAACACGAC TTGGCCACAA AAATTTAAGC GTTGAAAAAT GTGTGTTAGT GTTTGTATCA  ATCGGTTGAG AAGTGCCTCT CTTGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTCn CTTTAATCTT TTAATTTTCT TCGTGTCTTT TCCATTATTC TCACCTTCTT CTCTTGTCTC 
TTTGTTCAGT TTTTGTATTT AATCTAATTT AAAATCTAAT TTATGTACAA GTGTAGGCGG TTGATTAATC TTCTTCACTC 

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Terminator +►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCAATGTTA CAAGTCAGCT TCCATCACTT TCCCTAAAGT GAGACTTAAA TCCCGGCAGC CATTTTTTCA TACTAACTAC ACAGTCACTT AGCAAAGTAG ATTATATACA CTATGTCACA  ATGAAACATT TGTCCTGGCT GTTTGTATAG ACCCGACTAA ACGCATGAAA ATAACAAATA TAAGTTACTA TACAAAATAA TATACAAGTC TTTTTCCAAG ATGATCCAAA CTCTATTTCC  ATTACCACAA GCTACTAGTC ACAGTGGAAA AAAAATTAAA CAACAAAGTC TCATCGACAA TGTGCCACGA ACATGGTGAA CTAGTAATGA AACATATTGA AGAAGGAGAA GAGAGTAATG  CCTTTGTTCT AACTGTAACA AAATTCGCAG TGGAAAGCAA AACAGAGATT GTAGTTTAAT CATCCTTTAT TCTTCTCAGC AGTTTGGAAG CCCAGCGTCG GACACGTCTC TTAAGCGTAT  AACCCACAAA CACTCCAGCT ACAAAGAAAA CACCGCACAG CTTTGAACAC GTCCAGACTG AAACTCCGCT GCCACCAAAA CATAGTCCCA ATATAGGAAA GATGAAAAAT TTGAATAGAG  TGATAGTAAA AAAAACAAGT AAACTCATTA CATATTAGTC AAATCAATCA AGAACAACCC TAGTCTCCTC CTCGATCGTC TATAATTGAC CTGCAGGGTT CTGTTCTTGG GTATCTAAGC  CTAAATGTGC TGGGAAAGTA AGGATCTTAT ATCATTTTAA CGAACCATTA CAAATTTACA AGCTTTCACT GATGTGTAAT TGGGAATCAT CATAGTCTAT ATGTTTCCAG CTACAACAAA  AAAATCGCAC TCTTTTCAAT TTGTTCCATC ATTTTATAAT TCTCTCGAGC AGATCAAATT CCCGACGATC TACAAACCAG AATTTCAAAA CCAGGAACAG AAGCAGATTA CCTCGGAGGT  CTGTTGACCA AAATGCCGGA TCCATAGTAT GAAGTCAAGT TGCCGGAGCC TCGTTTGTCC TGCACCCAAT TTTCCGCAAT TTCAGATAGA GAAGACGAAG AAGAAACTCC AGATTTCGTA  TCTTTCGATA ACTTGCTGTA AATCTTCTGT AAACCCTCCA TTGCTCGCCG ATGATCGGAA AACGAAGAAT TAGAGTTTAG GGTTCACTGC GATTTCCTAT AGTGACTTGT CGTTGACCAA  AACCAAAAAG GGACAAAATT GGAATTTCCA TAACTGTCAA GACCGTATTT TAATTTTTAA ACATTAAAAG TACATATGTT CTATTTTAGT TTGCTCGTTG AAAAGAAAAA TGCCTATTGA  CCAAGGTCAA ATAATTATAT CTTCATATAA TAATAATACT ACTATAAAAT TTATTATTTA AAACATTTTT TTAACATAAC ATTAATTCAT TGATATAATA TTATATTTCA TCACATAACA  ATATTCGTTA TACTTTTTTT TTTTTTTTAT CTCGTAATAT ATCCAATTAG TTGAAGCGGT CTTTTTCTTG ATCGAGTCGA TAATCTTGAG AACCATAAGG ACTAAAAGCT TCAAGGAACA  AGTTGGATTT ACGCCAAGGA TTGAGTCCCA TGTCATTACA CATATCATCG GCATGTTGGA TGCTGAAAGT GGAAATGCAA TGGCGTTTGT AGAATCTGCT CGATCTTCTC ATCACTTCCA  TTTCCTTTAA GAAGATATCA AACATCTTCT CTTTGCTCGG TAACCTGAAT TTATCATCCA CCAGACGGCT TAGCCACAAT GAACGTAGCT CTGATGTGTG TAAGTTCGAG TTGCTTTGAA  CGTATCCGAT GAAACCCATA TTTGGTATCA ATGGATGGAT TGTTCCCCTG AATGTTTTTT GGTTAGTTAA TATAATTATG TAATATAAAA AGATAGGCCG CTATTCGAAC TCAATATTTT 
CATAAGATTT TTAAATACGA TTTTACAAGT GTATGTTTAT ACCTGTACAA AGGCATGACA CCGGAGGGAA ACTCAAGCCA 

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DNA ►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTAT CTCCTCTGAG TTTCTCCACC GGGTCGAGTT TTAGTCACAC CGATGGAATC GACGACGGTG GTGGTCAGCT AAGCCAAAGT CCAGTTTCCG GTGGCGCAAT GCTGCCGGCG  TTTCTCAAAG ATTTGAGTCG TAAAGGAGAC TCTGGAAGCG GAAGCAGCAA CTGGGAAAGG GAGGTAGTGG AGGTGACGTT GGAGGTCGAC GTCGGCGATG ACTCCATTGT TGTTTGCGGA  ATGTCCGAGA CGGCGGATGT TGCGTCTGTT GATTCTCGGC CGAGATCGGT TGATGTAAGT GGAAGACTAT CGAGGAATCT ATCGACGGCG TCTTCGAGGA TAAGGCAGAA ACTGGGGAAG  TTACTGAGGT CGGAGTCGTG GAAAACGACG TCTTCTTCAA TCACAGGTGA GAGAGATATT GAACGCCAGA CGGTGGAGAC GGGGATTATG ACGGCGAGAG ATAAACGGAA AGAAAACGCG  AAATTACAGC GATCAACGTC AAGTGCACAG AGAGCGTTGA AAGGTTTACA ATTCATCAAT AAAACCACAA GAGCAAATAG TTGCGATTGC GATTGCGATC GCGATCAGAT GTGGAATAAA  GTTGAGAAGC GATTCGTTTC GCTTTCTAAA CAAGGATTGC TCGCAAGAGA TGATTTTGGA GAATGCGTTG GTATGTTTTT ATTTTAAAAA GATATAAACA AACATATATA TTATATATAA  TATAACGTAA AAAAGTTACA TTTTTTTTGG AAAAAAAGGG ATGGTGGATT CGAAGGAGTT CGCAGTGAGT GTATTCGACG CTTTGGCTAG ACGAAGGAGA CAGAAACTGG AGAAGATAAC  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CDS►
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ATACCAACCG TGGCTAAGGA GTTGAAGAAG CAAGCACAAG ACATGAGTCA AAAAACAACC ACCAGATTCG AGTTCCATAA AGAGCATTTC TAA 

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