Entry information : NoffRboh09-1B (Nasoff301g0195800.t1)
Entry ID 18508
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh09-1B (Nasoff301g0195800.t1)
Name (synonym) NoffRboh09-1B (Nasoff301g0195800.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh09-1B
start..stop
S start..stop
TsRboh09 1659 0 1..943 1..938
AlyRboh09 1613 0 1..943 1..934
AtRboh09 1555 0 1..943 1..941
ThasRboh09 1244 0 10..943 9..918
Literature and cross-references NoffRboh09-1B (Nasoff301g0195800.t1)
Protein sequence: NoffRboh09-1B (Nasoff301g0195800.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   943
PWM (Da):   %s   107135.97 Transmb domain:   %s   o377-396i455-477o513-535i556-578o588-606i737-754o
PI (pH):   %s   9.19
Sequence
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IEMHNYLTSV YEEGDARSTL LTMIQTLNHA KNGVDIFSGT KVRTHFGRPK WKKVLSKIST KHKNARIGVF YCGVPSLGKE LSRLCHEFNK TGSSRFKFHK EHF 

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Remarks
Promoter
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TGCAAAGAAC TCGTATCCAT CTTCTACAAC CTGCACAATA AGTAGAGACA TATTTGGGAT ACCCTTTCAC TAAGTAATAT GAGAATTTAC ACCAAACAGC TAGGAATACA GTTGCTCATA  TGATTTTACC TGATGAGCTC GGCATATAAG ATCAAGGTCG TGTGTTTGAA GGAACTCAGC TACTTTATCT GCCCCAAATG TATATGAGAC ACCTCTCTCA TTCTCCCCCC AGCCTTCAAT  GTTACTGTCA GGATCAGCCC ATAGCAAATC ACAAAGAATG CCTTGATCAG GAACATCAAT AGGGCGAGGA ATTCTCCTAA TGTCATCTAA GCTCTTTATA TCAGGCGATA GTCCACCATG  CATGCAAAGG ATCTTATCAT CAATGAGAGC AGAAACAGGA AGACAGTTGA AGCACTCAGT GAAAATTTTC CATAGTCGGA CATTATATCT TCTTTTGCAT TCATCGTAGA ATCCATATAC  ACGGTTGATT GAAGCACATT CATGATTGCC TCTGAGAAGA AAAAAGTTCA ACTTGTATTT GATCTTGTAG GCAAGAAGAA GGCATACTGT CTCTATGCTC TGCTTACCAC GATCAACATA  GTCCCCGAGA AACAAGTAGT TTGCAGCTGG CGGATAGCCA CCATACTCAA ACAACCGCAA GAGGTCAGGA AACTGACCAT GAACATCTCC TGCTCATCAA CAAACAAACA TAAAAATTGT  CAACAATAAT AAACCACAGT TATAATAGAA TCATAGAGAG AGTTTAATGT AATCATACAC CAAATTCAAT AACTAGTAAA CAAAACTATG AAGCTTTATG CTATTTCTTC AAGTAATATG  TCAGGAGAGA TTCCAGAGAA TCATAAAAGT TATAAATAAT TTCTTTACTA CTCAAAAAAC CACCAATAAA CACTATTAGC TAAACAATTA ACTAACTTAA CAACATATCA TTTCACCTTA  TAGCTAAACA TCATACACAA AAAAAAAAAA GCAATTTTAT CAAAAACCCA CAATACAAGC CTACATTATA CTAAAGCAAA CAGAGAAAAA CATGTAAAGA TCAAAACTTT TGTAAATTTT  TTAGTAATAT TACCGCAAAT CTTGATAGGA GCCTCAAGCT CAAGGAGATT AGGCTGGCTG AGAAAAACTT GTTTCGCAGC GGAACATAGT TGTCGTATCT CCGGATCAGT CAGATGTGCC  GATTTCAATT TCTTCCCATC ATTCGTCTCC AAAAGCCTCC GTATTATATC GTCTAGTAAA TTCTCGTTCA TCCTCGTAAC AAACCAAAAG CCCTAAACCT AAAAGTAAAT TGAATACAAT  GTCCTAAAAA TAATCTTTCC CCTTCACGAA TCCAGAGAGA TCCGACGATT ATTTCACCGC CGGCGTCTCT GGGTTCGTAT TGTCGACGGA GAAGAAGATA CAGAGGCTTT AACTAGGTGA  CCCAATTTCG TAAACCCTAG AAATTTAATT TATCTCGGTA ATTTTATCAT TTCAAAATTC AAAGGAAGCG TACCCTCAAG TGGACCCTAG CTTGTTCCCA CACGTGACAA GTTCTCATTC  GCACATGTGA ATAGTTGTTG GCTAGTCCTC CTAACTTTGG CCGTTGATGT ATTTATGAGA ATTTACAGTT ATAAGTCCTT CAAAAGTCTT TTATTTTGTA TAAATGGTCC TCTAAAATCC  AAATATACTC AGCTTTAATT TATGTTTTAT TTCAAATTAT AAGTTTACTA TAGGTAAATT CAAATATTCA CATTATTACA GTAATTTAAT ACTAAAAAAA TTCAAGATAT TCCTATTTTA  GGAAAGGACT AAACTTGTTT AAAAAAAAAA AATAGATTCA ACTCTCATTT GGTAATTTCC TTCACCATTC CTATGGCTGG CACAAACGAC ATATATTAAT AATTTAATAC ATATAAACAA 
AAAAATTCAA AAATTGTATT TATTGGCTTC TCTCCCTCCC TCGCGTCTCC TCTCTCTCTC TCTCCCCAAC CGAATTCAAA 

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Terminator +
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTAAGCCGG CCATGATTAT GATTTGTTGA ATGCATCAAA TTAAATTATA TCAGTATATA TGTAAAGTCA ACGTTCATGT CTATCTCCAT TCCTTCATTC TCATATCTTT CTTGTTGTTT  TTGTTTCTCT TTTGTGTATC ACAAATACAA CTTTTCAACC ATTTCATCTT AGAGTAGGAC TGCCAAAAAA AAAAAATCAT AGTTAAAGCT TGTGAAAAAA GAAAAAGAAA AAGAGAAGTT  CGCACAAAGT CAGATGATTT ACGAATGATT TTTGTTGTTG TCAAACACTT CAATATTTTG AATTTGATGA TTTATTTAGT CCATCTTTTT TGCATTTGCT TCAAAGTGAA TTTTCGTTTT  TTCAAAGTAA ACAACGAAAA TTGCATGAAG CGCTTATTGG GCCGGTCTTT AAACTCTTTT ATGAACAAGT CTTTAATAAC TCAGCATTCC TTTAATCAAT GTATTATTTT TTTTACCATT  ACTTTTTTTT CAAAATTGCT TTTCTTTTCT TTATTCTGAT ATCATTTTAT TGCTTCAATT AATATTCTTG TTCGCAAATT TAATTTAACA GTTTTACTTC TGATTCATCA TTTAAATCGA  TGCATTTTTT TTCTTCTTAC TTACTAATTT GTCTTCAAAG TAGAAGGTGT TTTTTTTTGT TTTATTAGTA GCCGCAAATC AAAAAATATA TCAATATCGG TTATAGATCG GTTTACGGTC  ATGGTTCCGG TTTTGATTAT CTTGATTTCC TGACATATGA GCTGGGCTTT ATCATTGTTT TAGCTCATTG GGCCCATCTT TTCCACTGGA GCTAAATGAT CTGTCAAATT ATTACCCATC  GCTGTCAAAT TTCATTTTCT AGGACATTTT TTAAAAAACT ATTTTTTAAA AAAATAAGAC GGTTCCTACT CTGGTATAAT ACTTTTTTTT CTTTTATAAT GTATAATGGA TTCCTCAGAA  AGCTAGAAGG AAAATTGAAG GATTGACAAG TTACAATTTG CTTTAATTTA TTGTCAAGAT ATAATACTGT AATATACCAT TGTTTTAAAA TTTGGTAGGT GAGTAATTGG GTGGCGAGGA  TGAGCCTAAC AGCTAGAGAA TTAATTGGGG AGTAAACAGA GATTAATCGA AAATTAGTTT TAAGTTATTT TAATATTTTA AAAATATATT TATCTATTAA ATTAAATTTT TAAATAGTAT  TATTTTAAAA ATTATAGTAA ATATATGAAA ATGTAGTACT AATAATTTAT TTTATAATTT TAATATAATT TATTATAAAA CATTACAAAA TCTCAATATA AATGTTTTAA TAATAAAAAT  AATTTTTTTA TTTTTTAAAA TTAAAAATAA TTGGATTATA GATGATTATG CAGAAAATAA TTGGATTAGA CGGTATTAAT TGGATTAGGT AAAGGATAAT CGGTTCAACC AAATAGCATT  TCACAAAAGC TAATGGGTAT AACTCTACCA CGTTTCACTC GATCAGTGGT TCGACCGTAA CATCACGTGA CACCTTAACG GTTCAAAAAT AAGCATACAT TTTAAAGTGT TTGATGACGG  AGCCGTTAAA TACACGTGGC CTTCAGTAGA AATGGAATCC TCATTTTCAG GATTCATTCT CTACTTGGAT TTCGTAAGAG ATTCCTTTAA TTCCATTTTT TATTCAATTG TTTTAATTTT  CTTAATTAGA TCCAAATGTA TTAAAGGTTT GTTAAATTTT GTCCTTGAAA CATAATAGTT TTTTTAAATT GTTTTTGGTT TTAGATTTCT AAATATATAA CTTATTGTTA TTCATGATTT  TAGAAAATTC TCCACATATC TTATAGATCC TAGTTAGATG TGCCCATCTT TAGTTCATCT CTGCCGATCG CACCTTTGAC GACGACGGAG ACGTTAAATA CAAGTGGCTT TCAATCTGAC 
GGCGTCTATT CTTGGCCCTA AAGAAAAATA CAAAATGGGT TGTGTCCAAA TCCCCATGCC TTTTCTATTT TCCCCAAGTG 

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DNA
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ATGTCAATAT CAGTTTCCGG TGAAACTAGT CACGACGATC GTTGGGGTTC CGATTTGGCT TCCGCAAGAG AATTCACCCA AAGCTTCTCA TCGTTACCGG TGACATATTC ACCTTCCTCA  GGTGAGGAGC TTCTAGAAGT GACGATTGAA TTCCCGAGCG GCATGATATT AAACATCGAC TCCATCACAG GCACAGAAGT TTCCGGCACC GATCTAGAGA TCACCTCCAA CTCAGCTTCC  GGTTCAGCAT CAAGATCACG TAGCTTAGGG TGGAGCGCAT CAACTAGTCA TCGAATCTCA GAGTTTCAAG TAGTGACGAA CGCAAAACAA TTCTCAAGAG ATCTGAAAGA AAAGCTTAAG  AGTATCTCAC GGAAAGATAT CGGTTATTCA ACTCGATCTG CGCCGGAGAC GGTGGTTCCA TTTACCGATC CGGCTATTTT ACCTCGACCG TCATCTCACC GATTAACAGG TTCTTCTCAT  CGGAATAAAT CGTGTACGGA GAGAGCGATT CATGGTTTGA AATTTATTAG CAGTAAAGAA AATGGAATCG GTGGTTGGAA AGAAGTTGGA AACAAATTCG CTAATCTCTC TAAAGATGGT  CATCTTCACC GAAGTGATTT TGCTCATTGC ATAGGTTCGT TCGTATTGGA ACTCAATTTT GAAATACTCC CAGAGATTTA TCTCGCCTCG TATAATTCAT ACATAGATTC AAATTGATGG  AGATTTGTAA AATATTTAGT TTTGACATTT TTGTTGTTGT TGTTGTTTTT TGTGTTTAAG GTATGGAAAA TGAAAACTCG AAAGAGTTTG GGGAAGAGTT GTTCGATGCA TTGTGTAGGA  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CDS
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CTTTCAAGAC TATGCCACGA ATTTAACAAG ACGGGATCTT CTAGGTTCAA GTTTCACAAA GAACATTTCT AA 

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