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Entry information : NoffRboh08-1A (Nasoff531g0264040.t1)
Entry ID 18510
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh08-1A (Nasoff531g0264040.t1)
Name (synonym) NoffRboh08-1A (Nasoff531g0264040.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh08-1A
start..stop		 S start..stop
AtRboh08 1740 0 1..887 1..886
AlyRboh08 1740 0 1..887 1..886
TsRboh08 1705 0 1..887 1..889
ThasRboh10 1513 0 1..887 1..900
Literature and cross-references NoffRboh08-1A (Nasoff531g0264040.t1)
Protein sequence: NoffRboh08-1A (Nasoff531g0264040.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   887
PWM (Da):   %s   100597.63 Transmb domain:   %s   i317-334o401-423i447-469o499-521i693-710o
PI (pH):   %s   9.65
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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ELSSKHEACR IGVFYCGSPT LVRPLKELCQ EFSLESSTRF TFHKENF 

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Remarks
Promoter►
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ATCATAAAAA TTTCCTGTTT AAAAATACGC TATTAAGTGT TGTTTAATAA TTTTTTCTTT GTTAAAATTT GACATAAAAC ACCAACTCCC AAGTCAAAAT CTATAACAAA ATATCAAAAA  GTCAACTTAC TTTGAAAGAT ATAGTTAAAA AAAGATGTTC TTTAAATTGT GTGAAAATGT CAAAACAACA GTATATATTA TATATTTTTA GTTTTTTTTT CTATTTGACA TGACACGTTG  ATTTTGCGTG ATTGCATGTA AAAGATTTTG ATAACATCCA CTACATTTAT ATCAGTATAT CTTCTTCCTT TTGCGTCTTT ATATCAATAT CTCTACTCTG CATATAGTTT GGCAAGTTCA  CACTAAGGTT GTGTGAACGT AAAAAAACCA ACATTATTGG AACAATATAC ATAATGCTGG CGGATCATAA CACCTTATAA ATTCGGAGAA CTTTTTGGGG TTTGGTTGTT AACTTTGTGT  TTGCCGGAGT CTAAATCACA CAATTCATCA AAGTTACTCG TTTCTAGAAT ACGACCTCAC AATATCATAG ATTCGCAAAT AATGATTTAC TGGAATATTT GCTCAACTTA AGATGATTAG  TCGAGATTAG CAGGAAGGTT GATAACCCAA ACAACTAGTT ATAAGTTATA ATCCATATAA TCCATGTTTT AAATCTCGCT AGACGTTAGT CGGACGGTCG AAATGTACTT AACGTCTACA  CGATTAATCG GGATATAAAT GAAGATTAAT CGGGAATTAG TTTTCGGTTA TTTTAATGTT TTAAAAATAT ATTTATCTAT TATATTAAAC TTTTAAATAA TATTTTTTTC AAAATTATAA  TAAATACATA AAAACGTAGT ATTAATTTTT TTAATGATTT TATTTAAAAT TTAAACATAA TTTATTATGA ATATCACAAA CTCTCCATAT ATATGTCTGA ATAACAAAAA CAAAATTTTC  TTTTATACTT GCAATCTAAA AATAATCGGA TTATGCATGA CTAGACGGAA AATAATCGGA TTAAGCGGGG ATTAATTGGA TAAGGCGGGG AGTAATTGGT TGACTGATTT ATTCGAGAGA  TTAGTCATTA ATCGAAGTGC CGAGGGTGAA CCTAACGACT ATACTGAGTA TAATTAGAAC TAGCCAATAT TTTTAGAACA TGAATCATAA CTAAATGCAC TATTAGAGGA CGATCGAGTG  GACGACACAC AAGTCTTTAC AGTGCGTAGC AGCTTTGTCC GGGTCGTGAA AAACGTACGG TTTCTCGTGG CTCTCTTAAC GTGTTTCGTT GTACATATAA TTTTGGTTGT AGTTACGTTT  ACGGACTAAA AGATGATTAA TAGCTAAATA TTTAGTTACG ATTAGAAATT TGTATAGGAG ATTTTGTCTT TAACAAAAAA AAAAAAAATT GTATAAGAGA TTCTGGTCTA TTACAGAAAT  TAATGAAGAT CAGTATCGGC CTATAAAAGC CCAATTCAGG CTCAAAACAA TTTGGATTGG TCCAAGTCTT GAATTTTTAC TTTCATTATT CTTCCATTAG GCGTTTATTT TTCCAGACAT  ATCCGATCTG CGAATAGACA CTTTTTCAGG ACAGAGAGAT TCTTCTAAAC AACTTCAATA TATATTTTGG AAATATTACA CAAACCGCGC CTGCTTGGTT TAATTTAATT TAAGTTCATT  AACTTTCTAG TAGCAGTAAG TCAAATTCAG AAGTTTATTT CTTATTATAG GTTTTTGATT GGTCTGTGTG TATTTGACCT CAAAAAGATG CTTTCCTTGG AACTTTCTAT TTTTAGTAAC  TCTTCATGTG TCTCTATTCG CAATTAAATA AACTAAAAAA CAATGCCTAT ACTCCTACTT TCTCTCCTCG TCGACTAATT CGATCAAACA AAGAAAAAAA AACAAAACGA TCTAAGAGGA 
AAAACGAAAG AGAATTCTAA GATCTCCGAC GATTCTTCAA TTAATTATCA GTGAAGGAGA AAGAAAATAA AATAAATAAT 

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ACAAAATTAT AATATTAATT CTATATGAAC TAAATTAAAG AAACAGATTT TGATTCTGCT CAATCAGATT GGGAGTTAAG ACTATAAGCA GATTGTAATT AGCTGATGAC TTGATGTAAT  GTAATTAACG CCGTATAGTT GTGTATAGGA ACATTTGGAT TAAAAACTTA AAGTATTGCT TATTTTGTAT TCATTTTAAC CCATTTCTTT TGTATATATC TTTGTGATGA GTATCTTTTA  ATTCAATTGT TTACAACAAT GCATATATAA AGTATTGGGT TTGTTATTTT AGCTTAGTCA AAATGTTTGA AATTGAGAAA ATTATCACAG ATGCACAAAA GCTTTTCTAA ATGTTTACAT  TTTGTTCCAA TTGATTCTTT AAATAAACTA ATATTTACAT TAGACCAGGT ACACAAATAG TTGTCAACAG TCGTGCATAT TATCATTACC ATGAAAATTA TGTAATATAG AATATGTATA  TATATAATAT AATAATTGTA AACATGTAAA TTAGATAAGT GTATCTGATG GATGATAATT AGACAAAGAA AATTTACTAT TGTAACAAAA TTTTAATGAA ACTTGTAGCA GATCCACAAA  CTTAAATAAT CATTTATCAA ACATATAAAC TTGAATTCGG TACAGATACA ATAGTGATCT TCCTAAAACA AAATGAAATT GGAGTGTTAG CAAAAAAACT ATGAATGTGG AATAGAGTAG  GTAGTATGAG AAATAAATGT ACAGAAGAGT CCAACTTGTT AAGCAAAAGG TTGTTTGGTA CGCATCATTA AATCGTGGAG ATATCAACAT TATTTATATT TGTTACACCA TTTATTCTAC  ACGAGATTCC AAAGATGAAT TAAATTAAAT AAATGAAAGA GAGGGTTTCA CCCTGAGAAA ATAAAACTAT ATAGTGATAA AGACATATTT GAAATTAATA AGTGGTAATC TGAAGGGAAT  TTGCGTTTTT TCTTACAAAG AAAATGTGTA AGAATTGTTT TCTTGGGGTT TACTTATACT TACTTTTTCT TTTTGACGTT ATTGAAGATT GGCTAATATC TTTGGCACTT AAGGTAAACC  ATCTTAATTA ATCATCATTG ATCAGTTCTA TTCGAAGGTT ATATATTAAA ACGGAGATAT ACATATGATA TGTAATAATT ATGCTAATTG TGCAGTCAGA TTTTTTGGAT GTTTTTATTA  CAGTTCATTT TAGATTATAT ATATTAAGCG TAGATATCTC TTAAGAATGA GCTCGTGGCT AACATCTTCC TTTGAACGAG ACTTAGCAAC TTGTCATATG GAGTATGATA ACTCAAAGTT  TGTAGAGAAT TTCCGTCACT ATTTCTAGCT TTCTATATTC ATTATTCACC TAAAAGGTGG CAAGTAACTG TCCACACTAA TTTACATACA TATATATATA CATATATATA TATATCTATT  CGTATAATAT ACGTACTATA TATGCATACA TATGTGCACA AATTATACTA TATATTGTTA GAGCCTTAAT GAGAAATCAA GGTTTGGTGT AACTACAATG TGTATATATG TGAAAGGAAA  CAAACGAAAA CATATATACT AACACCTTAT CTAATCTAAT CAAACTCTCT CCACATACGT ACCAATCCTG TGTACATCTT ACGCGTATGT ATATAAATAA AGCATACACT TTAAAATACT  AATTGATATT TAGTGTCAAT CTAATATATA TGTGATTTTA GCATATTTTA GTTGAATGTA AGTCTAGTAA TTCCATCTTG TTCACCATAT CATTTGATGT ATTCACTTGA TAATTTCAGA  ATTCACATAA TGTTTGTAAA TTCAGATTCA TTTTGTCTTC AGATTAAAAA CGACATTTAG ATCATGGTAA GTTCGAGGTA TTTAGATAGT TTCTAAACTA GAGATCGTTG AAAATCGGTC 
TGAAGTACGA GTACCTAGAA GCTCATATGT TTTTTTAGTA AATATAATTA GATAATTATA GCCGATACCG TTAGAAATAT 

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DNA ►
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ATGAAAAATA ACACTCCTAG TCCTAGCGAG GATTCGACAA AATGGATGTT GGAGAGTGTA GCGATCGATA CAATGGGTGA TAGTTCGGCC AAAGAACCCG ATATTAACCT CAACAAGAAC  GAAGGTGGTC TGAAGAAGAA CATGTCAAGA GGCGTGGGAT CGATAATCCG AACGCTGAGC GTTTCAAACT GGAGAAAGAG CGGTAATCTC GGGTCTCCGA GCACAAGGAA AAGCGGGAAC  CTAGGGCTTC CGACCAACCC GGGGATCGAG AAGAAGACGG GTCCACAAAG AGTAGAGAGA ACAACCTCTA GCGCTGCTAG GGGACTGCAG AGCTTAAGGT TCCTTGATCG AACAGTCACC  GGACGGGAAC GAGATGCATG GAGATCGATT GAGAACCGGT TTAATCAGTT TTCCGTTGAC GGCAAGTTGC CCAAAGAGAA ATTCGGTGTC TGCATTGGTA ATTAACAAAA AAAGTACTGA  TTAATAATAA AAATATAAAT ACTCATCTTG GTTCTTTTTA CTTTTATAAA CAATAGTTAG TTTTTGTAAT TGGCCGCTTC AACTTGGATT ACTATCAGAA ATGTGAATCC AAATACGATA  TTACTAGGAA CGGGAAATGA GATTTGTTTT TTTATTTAAC AATTGTTAGT TACAAAGAAT ATTTAACGTC GATGGTATAT ATTACTAGGA ATGGGAGACA CAATGGAGTT TGCGGGAGAA  GTTTATGAGG CATTGGGTCG AAGAAGAGAA ATAGAGACAG AAAACGGTAT TGACAAAGAA CAACTCAAGC TGTTTTGGGA AGACATGATC AAGAAAGATC TTGATTGTCG TCTCCAGATC  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CDS►
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ACTTTCCACA AGGAAAACTT TTAA 

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